CenB: ZSO11 (deel 1)

Question 1

samengestelde proteïnen

Answer 1

eiwitten die geassocieerd zijn met andere (bio)moleculen om bio-actief te zijn.

Question 2

Apo-proteïnen

Answer 2

Proteïnen die alleen uit AZ bestaan

Question 3

Holo-proteïnen

Answer 3

Proteïnen waar nog andere (an)organische verbindingen aan verbonden zijn => cofactor/prostetische groep

Question 4

Cofactor

Answer 4

Verbinding die enkel tijdens de bio-activiteit reversibel geassocieerd is met het eiwit.

Question 5

Coënzymen

Answer 5

= Een cofactor die een kleine organische molecule is zoals NAD+, FADH, …

Question 6

prostetische groep

Answer 6

Verbinding die permanent geassocieerd is met het eiwt

Question 7

Primaire structuur

Answer 7

AZ-sequentie van de polypeptideketen die vastgelegd is in genetische informatie.

Question 8

Welke is de functie-bepalende 3D structuur

Answer 8

tertiaire structuur

Question 9

opvouwing tot tertiaire structuur

Answer 9

• Fase 1: associatie van secundaire structuurelementen tot motieven of supersecundaire structuren
• Fase 2: verdere vouwing tot eiwitdomeinen

Question 10

Wie bepaalt de 3D structuur van eiwitten

Answer 10

de primaire structuur

Question 11

is rotatie rond een peptidebinding mogelijk?

Answer 11

Nee, door resonantie heeft de peptidebinding partieel dubbelbindingskarakter (delokalisatie van vrije e-paren)

Question 12

Gevolg van het feit dat er geen rotatie mogelijk is rond de peptidebinding

Answer 12

atomen liggen in 1 vlak => peptidevlak, dus een polypeptideketen is een opeenvolging van peptidevlakken waarbij het alfa-C-atoom het gemeenschappelijk scharnierpunt is

Question 13

Conformationele mobiliteit van een peptidebinding (mogelijkheid)

Answer 13

Beperkt tot de mobiliteit rond een scharnierpunt (= alfa-C).

Question 14

mobiliteit van een peptidebinding

Answer 14

• Rond de alfa-C-N binding met draaiingshoek fi
• Rond de alfa-C-C binding met draaiingshoek psi

Question 15

Ramachandran plot

Answer 15

• visuele voorstelling van de fi en psi combinaties

Question 16

conformatiepatroon

Answer 16

wanneer een fi-psi combinatiezich herhaalt voor een reeks op elkaar volgende peptidevlakken

Question 17

wanneer is een conformatiepatroon gunstig?

Answer 17

fi-psi combinaties die leiden tot een maximaal aantal H-bruggen en een minimale sterische hinder

Question 18

Secundaire structuurelementen

Answer 18

• alfa helix
• beta vouwbladstructuur
• bèta turn/haarspeldbocht

Question 19

alfa helix

Answer 19

• Rechtsdraaiende spiraal
• 3,6 AZ/winding
• H-bruggen tussen groepen van dezelfde keten = interne H-bruggen

Question 20

waartussen worden H-bruggen in een alfa-helix gevormd?

Answer 20

C = O en N-H van een AZ 4 posities verder