CenB: ZSO10 AZ en peptiden (deel 1) Flashcards
structuur van alfa-L-AZ
- alfa: alfa-c-atoom bevat een aminogroep
- L: NH2 groep staat links
teken de algemene structuur van een aminozuur
- alfa-L-AZ
- NH2 - CH (-R naar onder) - COOH
Hoe verschillen AZ van elkaar?
Door de R-groep
Wat is het alfa-C-atoom
C-atoom naast carbonylgroep
hoe worden de aminogroep en carboxylgroep genoemd die gebonden zijn aan de alfa-C
alfa-aminogroep, alfa-carboxylgroep
pH onder fysiologische omstandigheden
7,4
pKa van NH2 groep
9-10
pKa van COOH groep
2-3
Hoe komt de NH2-groep onder fysiologische omstandigheden voor?
Geprotoneerd
Hoe komt de COOH-groep onder fysiologische omstandigheden voor?
Gedeprotoneerd
Hoe worden AZ ingedeeld?
Op basis van polariteit en lading van de R-groep
Hoezo heeft proline een beperkte conformationele flexibiliteit in peptideketens?
Cyclisch, komt dus vaak voor in bochten van secundaire eiwitstructuren
Gevolg van het feit dat cysteïne een dissocieerbare thiolgroep heeft
Kan onder oxiderende omstandigheden een disulfidebrug vormen => extra stevigheid.
Wat voor soort AZ zijn AZ met een negatief geladen R-groep
Zure AZ, onder fysiologische omstandigheden zijn ze gedeprotoneerd
Wat voor soort AZ zijn AZ met een positief geladen R-groep
Basische AZ, onder fysiologische omstandigheden zijn ze geprotoneerd
Sikkelcelanemie, oorzaak
6de AZ wordt vervangen door valine
Sikkelcelanemie, gevolg
er ontstaat een instulping en uitsteeksel in beta-ketens, 2 van die structuren passen in elkaar waardoor er lineaire ketens gevormd worden die zich organiseren en sterke vezels vormen
Iso-elektrisch punt
pH waar AZ niet in het elektrisch veld migreert, netto lading is 0
Oplosbaarheid van een AZ op het iso-elektrisch punt
laagst ooit
Zwitterion
Een molecule dat gelijktijdig een positieve en negatieve lading draagt maar geheel elektrisch neutraal is.
