CenB: ZSO 11 (deel 3) Flashcards
Voorbeelden motieven
- Helix-bocht-helix
- bèta haarspeld
- bèta-alfa-bèta
helix-bocht-helix
2 helices verbonden door een korte bocht
bèta haarspeldbocht
2 antiparallelle vouwbladen verbonden door een korte bocht
bèta-alfa-bèta
2 bèta-ketens gescheiden door een alfa-helix
2de stap in de vorming van de tertiaire structuur
Ontstaan van domeinen
domeinen
- compact gevouwen gebieden van ruimtelijke structuur
- Zelfstandig functionerend deel van een eiwit
- combinatie van meerdere motieven, resterende secundaire structuurelementen en niet-gestructureerde ketenfragmenten
vb. van een globulaire proteïne
- myoglobine
- heemgroep als prostetische groep
Quaternaire structuur
meerdere polypeptideketens die in hun tertiaire structuur associëren tot een functionele oligomere eenheid
Oligomere proteïnen
Proteïnen die bestaan uit 2 of meer polypeptideketens
Zijn oligomere proteïnen permanent
Sommige wel, deze worden samengehouden door covalente disulfidebruggen
Opbouw insuline
- 2 ketens
- A keten en B keten verbonden door SS-bruggen
Opbouw immunoglobuline
- 2 paar ketens
- 2 korte ketens die via een SS-brug verbonden zijn aan de lange ketens
- 2 lange ketens die onderling verbonden zijn door 2 supplementaire SS-bruggen
Opbouw Hemoglobine
- 4 polypeptideketens
- 2 alfa ketens
- 2 bèta ketens
- samen vormen de alfa en bèta ketens een bolvormig tetrameer dat 4 moleculen O2 kan binden
Denaturatie
Proteïne gaat over in een inactieve, flexibele lineaire conformatie die vaak onoplosbaar is
Oorzaak denaturatie
Factoren die zwakke interacties verbreken:
- Hitte
- Reagentia die in competitie gaan met H-bruggen
Wanneer treedt volledige denaturatie op?
Indien ook alle SS-bruggen verbroken worden.
Welk experiment bewijst dat de natieve conformatie van een proteïne vastligt in de primaire structuur
Het denaturatie/renaturatie experiment van Christian Anfinsen.
Renaturatie
Het spontaan herstellen van de natieve, bio-actieve structuur van een eiwit nadat het gedenatureerd is.
Verloop experiment van Anfinsen
- Ribonuclease werd volledig gedenatureerd door het te behandelen met 8M ureum in de aanwezigheid van bèta-mercapto-etahnol
- Alle zwakke interacties en disulfidebruggen werden verbroken
- Toen de denaturerende reagentia weggenomen worden werd de denaturatie reversibel
- De natieve, bio-actieve structuur wordt spontaan hersteld.
Conclusie van het experiment van Anfinsen
Een eiwit heeft geen externe factoren nodig om correct te vouwen, enkel de juiste omstandigheden. Dus de karakteristieke 3D-structuur van een eiwit ligt vast in de primaire structuur.
Vb. van vezelproteïnen
keratine en collageen => structuureiwitten
Vezelproteïnen
- Bestaan volledig uit secundaire structuurelementen
- meestal niet wateroplosbaar
- Ze bieden mechanische ondersteuning aan cellen en weefsels
