BIO / PHY - ANALYSES BIOCHIMIQUES - MODULE 1 Flashcards

1
Q

Citer les différentes propriétés physico-chimiques utilisées dans les méthodes d’analyses

A

Les méthodes les plus utilisées reposent sur des propriétés physico-chimiques : solubilité, taille,
densité, charges. Ce sont :
* la précipitation ; solubilite
* la dialyse ; masse moleculaire
* l’ultracentrifugation ; densite
* la chromatographie ;
* l’électrophorèse ;
* la réaction du biuret.

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2
Q

Définir la précipitation

A

La précipitation permet d’isoler des molécules au sein d’une solution. Elles perdent leur solubilité, ce qui
permet de les séparer des autres substances de la solution.

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3
Q

Citer 2 réactifs chimiques pouvant entraîner la précipitation de molécules

A

Elle peut être obtenue par :
* des sels (procédé appelé relargage) : on utilise très souvent le sulfate d’ammonium ;
* des solvants organiques (acétone, TCA - acide trichloracétique).

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4
Q

Définir la dialyse

A

Principe : c’est une méthode d’analyse qui permet la séparation des constituants d’une solution en
fonction de leur masse moléculaire.

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5
Q

Présenter le principe de la dialyse

A

un échantillon est placé dans une membrane à pores connus, puis immergé dans un tampon pour permettre la diffusion des ions ou molécules à travers la membrane. Les molécules trop grosses pour passer à travers les pores restent piégées. Bien que ce soit efficace, le processus est lent car il dépend de la diffusion pour établir l’équilibre des concentrations entre les deux compartiments.

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6
Q

Définir l’ultracentrifugation

A

C’est une méthode d’analyse permettant de séparer des molécules placées dans un
champ de force centrifuge, en fonction de leur densité : les molécules les moins
denses sont dans le surnageant, les plus denses dans le culot.

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7
Q

Citer une application importante de l’ultracentrifugation

A

L’ultracentrifugation est une méthode très utilisée pour :
* séparer les différentes fractions à partir d’un broyat cellulaire ;
* séparer les lipoprotéines plasmatiques (voir cours sur les lipoprotéines).

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8
Q

Définir la chromatographie

A

Principe : la chromatographie est une technique analytique qui permet la séparation des constituants
d’un mélange, en phase liquide ou gazeuse.

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9
Q

Différencier phase mobile et stationnaire

A

Il y a :
* une phase mobile dans laquelle la substance à analyser peut se dissoudre (s’il s’agit d’une phase
liquide) ou se vaporiser (s’il s’agit d’une phase gazeuse) ;
* une phase stationnaire, emprisonnée dans la colonne, avec laquelle la substance aura plus ou
moins d’affinité, donc d’interactions.

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10
Q

Définir le terme “temps de rétention”

A

Le “temps de rétention” désigne la durée pendant laquelle un composant reste dans le système de chromatographie avant d’être détecté ou sorti du système.

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11
Q

Faire le lien entre la structure des molécules à séparer et le temps de rétention

A

Les molécules de l’échantillon parcourent la colonne avec des temps de rétention proportionnels à leurs
propriétés (taille, structure, …) et à leur affinité avec la phase stationnaire : si les interactions entre les
molécules à analyser au sein de la phase mobile et la phase stationnaire sont faibles, les molécules seront
éluées (= éliminées de la phase stationnaire) rapidement (et inversement).
A leur arrivée en bout de colonne, un détecteur mesure la quantité de chacun des constituants du mélange.

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12
Q

Citer une application importante, illustrer avec cette application la compétence précédente (Faire le lien entre la structure des molécules à séparer et le temps de rétention)

A

Application : chromatographie en phase gazeuse (CPG) des acides gras.
les acides gras ont un temps de
rétention qui varie en fonction de leur structure.

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13
Q

Présenter simplement le principe de la chromatographie d’exclusion et de la chromatographie
échangeuse d’ions

A

Chromatographie d’exclusion :

La phase stationnaire est composée de billes perforées de pores de taille similaire à celle des molécules à séparer. Les molécules plus grandes que les pores se déplacent plus rapidement en se faufilant entre les billes. En revanche, les molécules plus petites pénètrent dans les pores du gel, ce qui les retarde, et elles sont éluées plus lentement. Les molécules émergent dans l’ordre des masses moléculaires décroissantes.

Chromatographie échangeuse d’ions :

Dans cette méthode, la phase stationnaire contient des groupements ionisés (+ ou -) fixés sur la colonne. Les molécules ionisées à séparer, telles que les acides aminés ou les protéines, sont retenues près des charges fixées sur la colonne. Elles peuvent ensuite être séparées en utilisant un éluant qui modifie le pH et donc les charges des molécules à séparer.

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14
Q

Définir l’électrophorèse

A

L’électrophorèse est une méthode d’analyse qui permet de séparer des molécules chargées, placées dans
un champ électrique.

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15
Q

Citer une application importante de l’électrophorèse

A

Une application importante de l’électrophorèse est la séparation des acides nucléiques, tels que l’ADN et l’ARN, ainsi que des protéines.

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16
Q

Présenter l’électrophorèse des protéines plasmatiques

A

Cette technique s’effectue sur un support (acétate de cellulose, gel de polyacrylamide) à un pH alcalin.
Les protéines sont des molécules amphotères, c’est-à-dire qu’elles sont chargées + ou -, en fonction
du pH du milieu dans lequel elles se trouvent.
Dans un milieu basique, les protéines ont une charge globale négative et se comportent donc comme des
anions. Dans le champ électrique, elles vont donc se migrer vers l’anode chargée positivement.
La vitesse de migration dans le support dépend de la taille (masse moléculaire) et du pHi (=
charge) ® + les protéines sont petites et chargées négativement, plus elles se déplacent
rapidement vers l’anode.
Le pHi est le facteur qui influence le plus la migration.
On arrête la migration quand la séparation des protéines est suffisante. Ensuite, on fait une révélation
grâce à un colorant : on obtient un protéinogramme.
L’intensité de la coloration est proportionnelle à la concentration des protéines.
Les différentes protéines sont ensuite dosées par une méthode optique, basée sur l’absorbance : on
obtient un densitogramme.

17
Q

Définir les termes suivants : pHi, amphotérie, masse moléculaire, anode, cathode, protéinogramme,
densitogramme

A

pHi : Le pHi, ou point isoélectrique, est le pH auquel une molécule est électriquement neutre, c’est-à-dire qu’elle ne migre pas dans un champ électrique lors de l’électrophorèse.
Amphotérie : Capacité d’une substance à se comporter comme un acide ou une base, selon le milieu dans lequel elle se trouve.
Masse moléculaire : La masse moléculaire est la somme des masses atomiques de tous les atomes présents dans une molécule.
Anode : L’électrode positive où les électrons quittent la cellule pendant l’électrophorèse.
Cathode : L’électrode négative où les électrons entrent dans la cellule pendant l’électrophorèse.
Protéinogramme : Représentation graphique ou électrophorétique des différentes protéines présentes dans un échantillon biologique.
Densitogramme : Représentation graphique de l’intensité des bandes de protéines ou d’acides nucléiques obtenues par électrophorèse.

18
Q

Justifier le fait que le tampon soit à un pH basique lors d’une électrophorèse des protéines
plasmatiques

A

Dans un milieu basique, les protéines ont une charge globale négative et se comportent donc comme des
anions. Dans le champ électrique, elles vont donc se migrer vers l’anode chargée positivement.

19
Q

Citer les 2 facteurs influençant la migration protéique lors d’une électrophorèse

A

La vitesse de migration dans le support dépend de la taille (masse moléculaire) et du pHi (=
charge) -> + les protéines sont petites et chargées négativement, plus elles se déplacent
rapidement vers l’anode

20
Q

Citer l’intérêt d’employer le réactif du Biuret

A

On utilise le réactif du biuret, qui permet de mettre en évidence les liaisons peptidiques, donc la
présence de protéines dans un échantillon, par une coloration bleue violette.
L’intensité de la coloration dépend du nombre de liaisons peptidiques.