Virologie: les pathogènes viraux 1 Flashcards
quels sont les virus responsables d’infections aigües?
rhinovirus, rhume, grippe, rotavirus
quels sont les virus avec infection persistante à réplication continue (1)? et ceux avec une infection latente non réplicative qui peuvent provoquer des réactivations (2)?
1: VIH, VHC et VHB
2: polyomaviridae et herpesviridae
quels sont les virus responsables d’infections lentes?
le VIH qui évolue en SIDA (Syndrome d’Immuno-Déficience Acquise)
pour les pathogènes du pharynx et de l’arbre respiratoire, quelles sont les formes de contamination par la voie respiratoire?
- contamination par aérosols
- par contacts rapprochés avec sujets infectés
- infection localisée au tractus respiratoire
quel est le virus respiratoire assez résistant qu’on peut récupérer quand on est enrhumé en touchant des objets qui vont être véhiculés par d’autres?
rhinovirus (petit virus non enveloppé)
quels sont les signes cliniques d’une infection par virus respiratoire? ils dépendent de quel facteur par ex?
hyperthermie (pas toujours), toux, dyspnée, dysphagie, nez qui coule = rhinite…
l’âge
par quels tests on va poser le diagnostic d’infection respiratoire? (il doit être rapide car virus disparaissent vite)
- prélèvements respiratoires pour détecter Ag: méthodes immuno-chromatographiques et test antigénique
- immunofluorescence: recherche protéines virales (mucoviscidose)
- recherche génome viral (cher)
- méthodes de PCR
quel sont les virus possibles de la rhinite?
rhinovirus ou Sars Cov2
quels sont les virus possibles pour la pharyngite?
adénovirus, virus para-influenza, virus influenza (grippe), VRS, EBV, VIH, HSV, coxsackievirus A et autres entérovirus
quel est le virus de la laryngite (enfant ++)?
virus para-influenza de type 3
quel est le virus de la bronchite?
virus influenza (de la grippe)
quels sont les virus possibles pour la bronchiolite?
VRS, adénovirus, rougeole, rhinovirus, Sar Cov2
quels sont les virus possibles pour les pneumopathies communautaires (ne sont souvent pas graves, n’amènent pas à l’hôpital)?
virus influenza, adénovirus, VRS, virus para-influenza, rhinovirus
quels sont les virus possibles pour les pneumopathies dans des circonstances particulières?
rougeole, varicelle, CMV, virus de Hantaan
quels sont les caractéristiques de la contamination des virus respiratoires?
se font par contact direct interhumain, prédominance hivernale, incubation courte (le virus arrive directement au niveau du site touché et se multiplie rapidement)
quelles pathologies peuvent provoquer les rhinovirus (bcp de sérotypes = 100 connus)? pourquoi ils touchent la plupart du temps les voies respiratoires hautes?
rhumes (rhinite, rhino-pharyngite); bronchites; pneumopathies chez les + fragiles
la Tº des voies respiratoires hautes est de 33-35º, qui est la Tº optimale de multiplication des rhinovirus
quelles pathologies peuvent provoquer les adénovirus? combien de sérotypes connus?
pharyngites, adénopathies, conjonctivites, bronchites, syndrome APC (adéno-pharyngo-conjonctivite), pneumopathies
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le virus para-influenza peut provoquer quelles pathologies? combien de sérotypes?
laryngite (sérotype 3) > enfants! et pneumopathies
4: 1, 2 et 3 prédominants
le coronavirus peut provoquer quelle pathologie?
rhinopharyngite
l’EBV (qui n’est pas en soit un virus respiratoire, infecte cellules épithéliales) peut provoquer quelles maladies?
pharyngite, angine
quel est le symptôme provoqué par le coxsackievirus A?
peut atteindre le pharynx provoquant l’herpangine avec des vésicules
le Virus Respiratoire Syncytial (VRS), responsable d’épidémies, atteint surtout quelle catégorie de la population? il provoque quoi?
les enfants, très peu chez les adultes
dyspnées aigües
il y a combien de sérotypes pour le virus influenza (grippe)? quel est le sérotype pour lequel il y a des variations antigéniques importantes? les infections seront problématiques chez quel sujets? quels sont les traitements possibles?
3: A, B et C
A
fragiles: ceux avec d’autres pathologies respiratoires, cardiaques, sujet diabétique
vaccins et inhibiteurs de neuraminidase
quel est le principe des inhibiteurs neuraminidase pour le virus influenza? donner un exemple de médicament
le virus infecte une cellule en se fixant à son acide sialique par l’hémagglutinine > le virus rentre dans la cellule > il revient à la surface pour sortir et infecter d’autres cellules > il vient se refixer par l’hémagglutinine à l’acide sialique, et la neuraminidase coupe la liaison entre l’hémagglutinine et l’acide sialique, libérant ainsi la particule virale.
=> l’inhibiteur de neuraminidase va donc l’empêcher d’agir et donc diminuer la quantité de virus
TAMIFLU
le virus de la grippe est-il enveloppé ou non enveloppé? quelles sont ses deux protéines de surface? comment est son génome viral?
enveloppé
neuraminidase et hémagglutinine
virus à ARN négatif, monocaténaires segmentés (8) = a besoin d’être transcrit pour être positif
le virus de la grippe appartient à quelle famille? et à quel genre?
famille: orthomyxoviridae
genre: influenzavirus
le virus de la grippe a une coiffe en…? pourquoi?
5’ car il se multiplie dans le noyau et doit acquérir ses protéines de surface par traduction
pour les sérotypes de la grippe, quels sont ceux qui sont pathogènes pour l’Homme et quel est celui qui est peu ou pas et comment se manifeste-t-il? quel est le sérotype le + virulent?
A et B: pathogènes
C: peu ou pas pathogène (se manifeste par une rhinite ou trachéo-bronchite)
sérotype A le + virulent car dispose le + de variations antigéniques
à l’origine, le virus de la grippe A était présent chez quel animal? et à l’origine le virus de la grippe B était présent chez quel animal?
l’oiseau
les phoques
quel est le récepteur du virus de la grippe? chez l’homme, il est lié au galactose par une liaison osidique de quel type? et chez l’oiseau (et aussi chez l’homme mais + en profondeur)?
acide sialique
l’homme: liaison osidique de type alpha 2.6
l’oiseau: liaison osidique de type alpha 2.3
si on est exposé à des virus de grippe d’oiseaux de manière massive, le virus va avoir une atteinte sur nos voies plus profondes où il y a des liaison alpha 2.3, et donc on a la possibilité d’infecter les individus et de provoquer des pathologies graves: quelle maladie par ex?
H1N1
quel animal est plus susceptible d’être infecté par un virus recombiné entre sous-types animal et humain de la grippe (car ses cellules possèdent les 2 types de liaisons osidiques) et donc le transmettre à l’homme?
le cochon
quels sont les 2 grands types de variations antigéniques du virus de la grippe? lequel n’est pas reconnu par les cellules T et B mémoire?
- cassure antigénique (réassortiment de segments d’ARN de virus humain et de virus animaux chez un animal) => pas reconnu par LT et LB mémoire
- glissement antigénique (mutations ponctuelles de l’ARN)
pour quelles épidémies de grippe il y a eu cassure antigénique du virus (maladies sévères car modifications majeures de l’hémagglutinine/neuraminidase)?
grippe espagnole, grippe asiatique, H1N2 et H1N1
pour le diagnostic biologique de l’infection, on va utiliser plutôt diagnostic direct ou indirect?
direct (indirect seulement pour diagnostic rétrospectif = sérologie)
l’immunochromatographie, la méthode ELISA et l’immunofluorescence vont permettre de détecter quoi? le PCR? la culture virale?
- immunochromatographie, ELISA et immunofluorescence: Ag
- PCR: ARN
- culture: déterminer souches virales en circulation
parmi les antiviraux, quel est le mécanisme d’action des virostatiques?
inhibent réplication virus
quel est le mécanisme d’action de l’antiviral AMANTADINE?
empêche le virus d’entrer dans la cellule
quel est le mécanisme d’action de l’antiviral TAMIFLU (molécule de synthèse)?
se place au niveau du site de la neuraminidase pour empêcher liaison entre l’acide sialique et le galactose: la particule virale n’est pas libérée et est donc éliminée
le SARS COV2 est un virus enveloppé ou non enveloppé? c’est un virus à ARN ou ADN? comment est son génome viral?
enveloppé
virus à ARN simple brin positif, grand génome de 30 kb
quels sont les 4 groupes dans la famille des coronavirus? qui infectent-ils?
gamma et delta: infectent poissons + oiseaux
alpha et béta: infectent mammifères dont l’homme
les alphas provoquent quelles pathologies? et les bétas?
- alphas: pathologies respiratoires et intestinales bénignes (en général), chez enfants ++ > adaptation humaine
- bétas: pathologies + sévères (SARS Cov1, MERS-cov, SARS Cov2) > virus chez animaux qui peuvent passer chez l’homme = zoonoses
quels sont les principaux virus gastro-entériques?
rotavirus (ARN double brin = 11 segments), calicivirus (ARN simple brin), adénovirus (ADN double brin), astrovirus (ARN simple brin), coronavirus (ARN enveloppés), aichi
les calicivirus (gastro-entériques) appartient à quelle famille et à quels genres? quel genre est prédominant?
famille: caliciviridae
genre: norovirus (90%) et sapovirus
quels sont les principaux virus gastro-entériques?
rotavirus (ARN), calicivirus, adénovirus, astrovirus, coronavirus (ARN enveloppés), aichi (picornaviridae; kobuvirus)
quels virus retrouve-t-on au niveau du tube digestif chez les immunodéprimés?
CMV > ulcérations, HSV, VIH ou adénovirus (se diffusent dans l’organisme)
quels sont les 4 virus non entéropathogènes retrouvés dans les selles non associés à des gastro-entérites?
- entérovirus (rare): se multiplie dans les entérocytes (cellules intestinales) => méningite, myocardite, atteinte pancréas, détresse respiratoire, œdème cutané…
- virus hépatite A: se multiplie dans hépatocytes => anorexie, vomissements
- réovirus
- adénovirus
aujourd’hui, quels sont les virus gastro-entériques les + inquiétants? pk?
rotavirus, calicivirus, astrovirus et virus digestifs car ils affectent les entérocytes et donc perturbent l’absorption
pourquoi les gastro-entérites chez le nouveau-né sont + préoccupantes? pourquoi l’atteinte de leurs entérocytes est + grave?
- faible taux de multiplication des cellules des cryptes
- faible taux de migration d’entérocytes et gravité des diarrhées (plus prolongée)
les gastro-entérites sont très ou peu fréquentes? comment est leur temps d’incubation? et leur durée?
très fréquentes ++
incubation courte: 24-72h
durée courte: 1-7j
quels sont les troubles digestifs aigus présents dans les gastro-entérites?
diarrhée ++, nausées / vomissements, douleurs abdominales et +/- signes généraux (hyperthermie, maux de tête, fatigue…)
quel est le virus qui peut atteindre les ganglions mésentériques et provoquer fortes douleurs abdominales pouvant conduire à une appendicectomie?
adénovirus = adénites mésentériques
quels sont les principaux moyens de transmission des gastro-entérites virales? quelles sont les principales sources de contamination? qui sont les principaux réservoirs des infections?
voie féco-orale et voie aérienne (aérosols) lors des vomissements (calicivirus)
sources: eau et aliments
réservoirs: hommes et animaux
les virus des gastro-entérites touchent surtout quels sujets?
les enfants de moins de 5 ans
quels sont les virus gastro-entériques qui provoquent des épidémies? et ceux qui sont endémo-épidémiques?
épidémies: rotavirus (hiver) et astrovirus (toutes saisons)
endémo-épidémiques: adénovirus et calicivirus (hiver, croisières = cruzeiros)
comment est le ARN des rotavirus? ses segments donnent origine à quelles 4 protéines et quels sont leurs rôles?
11 segments d’ARN double brin
- VP4: porte Ag P (variable) qui permet l’attachement
- VP7: Ag G selon variabilité de ce segment
- VP6: Ag produit des Ac monoclonaux qui détectent tous les virus de ce groupe
- NSP4: protéine non structurale qui a un rôle dans la virulence et pathogénicité vis-à-vis des cellules voisines
le rotavirus (potentiellement fatal dans les pays en développement) se multiplie où? réduit quoi? dérégule quoi? quelle protéine est surtout responsable de l’infection et elle provoque quoi?
multiplication dans entérocytes matures (intestin)
réduit surface d’absorption (atrophie villositaire)
dérégule l’absorption des aliments
NSP4 provoque perte d’eau et ions > participe à la diarrhée
quels sont les 2 genres de calicivirus qui affectent les animaux? et les 2 genres qui affectent les hommes?
animaux: Lagovirus et Vesivirus
hommes: Norovirus et Sapovirus
combien de sérotypes humains pour l’astrovirus? quel est le sérotype prédominant chez le sujet jeune?
8
1
chez les sujets âgés (on perd progressivement notre immunité vis à vis des astrovirus de type 1 avec l’âge) la mortalité par astrovirus ou calicivirus est possible grâce à quoi?
la déshydratation
pour les adénovirus, est-il enveloppé ou non enveloppé est leur génome est à ADN ou ARN? quels sont les 2 principaux sérotypes? comment est leur durée? ils peuvent être responsables aussi d’infection respiratoires et grave polyviscérales chez quel sujet?
non enveloppé et à ADN
40 et 41 (non cultivables)
durée souvent + élevée = 5-12j
immunodéprimé
quels sont les principaux sujets infectés par les rotavirus? les calicivirus? les adénovirus? et les astrovirus?
- rotavirus: enfants -3 ans++, adultes immunodéprimés ou qui n’ont pas les Ac
- calicivirus: adultes (épidémies explosives d’origine alimentaire)
- adénovirus: adulte et personnes âgées
- astrovirus: personnes âgées et immunodéprimés (VIH)
est-ce qu’il y a un signe clinique qui permet de distinguer une infection à rotavirus ou à un autre virus?
non
quelles sont les 4 méthodes en pratique pour faire la détection rapide d’Ag de rotavirus / adénovirus…?
ELISA (détection protéines>astrovirus); agglutination, immunochromatographie (calicivirus) et biologie moléculaire (cher) = PCR
les éruptions maculeuses (lésions cutanées) accompagnées de fièvre éruptive peuvent être retrouvées dans les virus à ARN ou ADN? lesquels surtout?
les 2
rougeole, rubéole ou l’herpès virus HHV6
quels sont les signes cutanés d’infection par rougeole (systémique)?
- signe de Koplick (tâche blanche) au niveau de la muqueuse buccale
- exanthème (tâches rouges) éruption cutanée par réaction virus <=> Ac
pour le virus de la rougeole (famille paramyxoviridae) du genre morbillivirus, l’éruption va dans quel sens chez l’enfant? et chez l’adulte? quels sont les 2 moyens de faire le diagnostic? le sujet immunodéprimé peut-il être asymptomatique?
enfant: tête => périphérie
adulte: périphérie => tête
diagnostic par prélèvement sanguin (IgM spécifiques) ou par prélèvement salivaire (ARN RT PCR ou IgM > enfant)
oui
comment est le génome du parvovirus B19? il est responsable de quelle pathologie?
génome à ADN simple brin non enveloppé
mégalérythème épidémique
quels sont les signes cliniques de mégalérythème épidémique chez l’enfant? et chez l’adulte?
enfant: exanthème maculo-papuleux au visage (aspect en ailes de papillon) peu ou non fébrile, en 48h racine des membres en aspect carte de géographie, tronc épargné
adulte: éruption cutanée parfois inexistante ou très fugace, arthralgies ++ et parfois fébrile
que faut-il rechercher en cas de suspecte d’infection au parvovirus B19?
IgM anti parvovirus B19
le parvovirus B19 peut-il atteindre le foetus? si oui, en quel cas cela est grave?
oui: grave si anasarque (grand œdème) foeto-placentaire
le parvovirus B19 est un virus qui affecte les érythroblastes (GR) que peut-il provoquer?
anémies chez les sujets avec anomalies des GR et peut aggraver les anémies hémolytiques acquises, les anémies par hémorragie ou par carence martiale
pour le virus de la rubéole (famille togaviridae) comment sont les éruptions maculeuses 16j après contage? quel est l’autre signe clinique? pendant quelle période le sujet est-il contagieux? quel est le problème avec l’éruption atypique de la femme enceinte au 1er trimestre?
éruptions maculeuses (+ pâles et petites que celles de la rougeole) sur les joues, pourtour buccal, ensemble du corps, fièvre parfois
adénopathies cervico-occipitales (cou)
1 semaine avant et 1 semaine après l’éruption
cela peut provoquer des malformations du fœtus
l’enfant peut être infecté par l’HHV6 (famille herpesviridae) à quel âge? l’incubation dure combien de temps? comment est l’éruption maculeuse?
entre 6 mois et 2 ans (fièvre pendant quelques jours)
10j
discrète, fugace, surtout au tronc
les éruptions vésicules (généralisées ou localisées) sont des signes de multiplication virale active et peuvent provoquer quoi à l’inverse des vésicules maculeuses? existent-elles uniquement à niveau cutané?
sources de contamination
non: présentes aussi aux muqueuses digestives, certains organes et peuvent être transmis par voie respiratoire (varicelle)
les entérovirus (famille picornaviridae) sont responsables de quelle syndrome? ils provoquent quel type d’éruption?
syndrome pied-main-bouche
éruptions vésicules
parmi les entérovirus, le poliovirus donne quelle pathologie spécifique?
poliomyélite antérieure aigüe
parmi les entérovirus, le coxsackievirus A donne quelles pathologies spécifiques? et le coxsackievirus B?
A: herpangine, syndrome pied main bouche (A16) et conjonctivite hémorragique (A24)
B: myocardite, maladie de Bornholm (pleurodynie) et hépatite
parmi les entérovirus, l’échovirus donne quelle pathologie spécifique?
exanthème de Boston (E16)
parmi les entérovirus, l’entérovirus 68 donne quelle pathologie spécifique? et l’entérovirus 70? et l’entérovirus 71?
68: bronchiolite
70: conjonctivite hémorragique
71: paralysie et syndrome pied main bouche
quel est le trajet des entérovirus?
ils arrivent au niveau des muqueuses digestives (oropharynx, intestin) et se multiplient, arrivent par la circulation lymphatique aux Plaques de Peyer pour enfin atteindre les organes cibles par le sang
obs: certains atteignent directement l’organe cible (conjonctivite pour les yeux)
les entérovirus sont-ils présents dans les selles?
oui car se multiplient dans les muqueuses digestives
le herpès simplex virus est un virus à vésicules: on a HSV1 au-dessus ou en dessous de la ceinture? et HSV2?
HSV1: au-dessus de la ceinture
HSV2: en dessous de la ceinture
quels sont les genres de la sous famille alphaherpes virinae des herpesviridae? ils sont latents où?
simplex virus HSV1 et HSV2 + varicellovirus VZV
latence dans ganglions nerveux sensitifs
quels sont les genres de la sous famille betaherpes virinae des herpesviridae? ils sont latents où? provoquent souvent des infections asymptomatiques chez quel sujet?
cytomegalovirus CMV + roseolovirus HHV6 et HHV7
latence dans sang, tissu lymphoïde et réticulo-endothéliale glandes sécrétoires, rein
immunodéprimé
quels sont les genres de la sous famille gammaherpes virinae des herpesviridae? ils sont latents où?
lymphocryptovirus EBV et rhadinovirus HHV8
latence dans lymphocytes, cellules épithéliales et endothéliales
quelle est la structure des virus de la famille herpesviridae?
ADN linéaire, capside icosaédrique, enveloppe avec glycoprotéines de surface + spicules
quel est le signe pathognomonique de la primo-infection orale à HSV1?
gingivo-stomatite: gencive douloureuse, inflammée, avec vésicules > signe infection cellules épithéliales
quel est le virus responsable d’épidémies de bronchiolite aiguë du nourrisson en hiver?
le VRS
