Virologie: les pathogènes viraux 1

Question 1

quels sont les virus responsables d’infections aigües?

Answer 1

rhinovirus, rhume, grippe, rotavirus

Question 2

quels sont les virus avec infection persistante à réplication continue (1)? et ceux avec une infection latente non réplicative qui peuvent provoquer des réactivations (2)?

Answer 2

1: VIH, VHC et VHB
2: polyomaviridae et herpesviridae

Question 3

quels sont les virus responsables d’infections lentes?

Answer 3

le VIH qui évolue en SIDA (Syndrome d’Immuno-Déficience Acquise)

Question 4

pour les pathogènes du pharynx et de l’arbre respiratoire, quelles sont les formes de contamination par la voie respiratoire?

Answer 4

• contamination par aérosols
• par contacts rapprochés avec sujets infectés
• infection localisée au tractus respiratoire

Question 5

quel est le virus respiratoire assez résistant qu’on peut récupérer quand on est enrhumé en touchant des objets qui vont être véhiculés par d’autres?

Answer 5

rhinovirus (petit virus non enveloppé)

Question 6

quels sont les signes cliniques d’une infection par virus respiratoire? ils dépendent de quel facteur par ex?

Answer 6

hyperthermie (pas toujours), toux, dyspnée, dysphagie, nez qui coule = rhinite…
l’âge

Question 7

par quels tests on va poser le diagnostic d’infection respiratoire? (il doit être rapide car virus disparaissent vite)

Answer 7

• prélèvements respiratoires pour détecter Ag: méthodes immuno-chromatographiques et test antigénique
• immunofluorescence: recherche protéines virales (mucoviscidose)
• recherche génome viral (cher)
• méthodes de PCR

Question 8

quel sont les virus possibles de la rhinite?

Answer 8

rhinovirus ou Sars Cov2

Question 9

quels sont les virus possibles pour la pharyngite?

Answer 9

adénovirus, virus para-influenza, virus influenza (grippe), VRS, EBV, VIH, HSV, coxsackievirus A et autres entérovirus

Question 10

quel est le virus de la laryngite (enfant ++)?

Answer 10

virus para-influenza de type 3

Question 11

quel est le virus de la bronchite?

Answer 11

virus influenza (de la grippe)

Question 12

quels sont les virus possibles pour la bronchiolite?

Answer 12

VRS, adénovirus, rougeole, rhinovirus, Sar Cov2

Question 13

quels sont les virus possibles pour les pneumopathies communautaires (ne sont souvent pas graves, n’amènent pas à l’hôpital)?

Answer 13

virus influenza, adénovirus, VRS, virus para-influenza, rhinovirus

Question 14

quels sont les virus possibles pour les pneumopathies dans des circonstances particulières?

Answer 14

rougeole, varicelle, CMV, virus de Hantaan

Question 15

quels sont les caractéristiques de la contamination des virus respiratoires?

Answer 15

se font par contact direct interhumain, prédominance hivernale, incubation courte (le virus arrive directement au niveau du site touché et se multiplie rapidement)

Question 16

quelles pathologies peuvent provoquer les rhinovirus (bcp de sérotypes = 100 connus)? pourquoi ils touchent la plupart du temps les voies respiratoires hautes?

Answer 16

rhumes (rhinite, rhino-pharyngite); bronchites; pneumopathies chez les + fragiles
la Tº des voies respiratoires hautes est de 33-35º, qui est la Tº optimale de multiplication des rhinovirus

Question 17

quelles pathologies peuvent provoquer les adénovirus? combien de sérotypes connus?

Answer 17

pharyngites, adénopathies, conjonctivites, bronchites, syndrome APC (adéno-pharyngo-conjonctivite), pneumopathies
51

Question 18

le virus para-influenza peut provoquer quelles pathologies? combien de sérotypes?

Answer 18

laryngite (sérotype 3) > enfants! et pneumopathies
4: 1, 2 et 3 prédominants

Question 19

le coronavirus peut provoquer quelle pathologie?

Answer 19

rhinopharyngite

Question 20

l’EBV (qui n’est pas en soit un virus respiratoire, infecte cellules épithéliales) peut provoquer quelles maladies?

Answer 20

pharyngite, angine

Question 21

quel est le symptôme provoqué par le coxsackievirus A?

Answer 21

peut atteindre le pharynx provoquant l’herpangine avec des vésicules

Question 22

le Virus Respiratoire Syncytial (VRS), responsable d’épidémies, atteint surtout quelle catégorie de la population? il provoque quoi?

Answer 22

les enfants, très peu chez les adultes
dyspnées aigües

Question 23

il y a combien de sérotypes pour le virus influenza (grippe)? quel est le sérotype pour lequel il y a des variations antigéniques importantes? les infections seront problématiques chez quel sujets? quels sont les traitements possibles?

Answer 23

3: A, B et C
A
fragiles: ceux avec d’autres pathologies respiratoires, cardiaques, sujet diabétique
vaccins et inhibiteurs de neuraminidase

Question 24

quel est le principe des inhibiteurs neuraminidase pour le virus influenza? donner un exemple de médicament

Answer 24

le virus infecte une cellule en se fixant à son acide sialique par l’hémagglutinine > le virus rentre dans la cellule > il revient à la surface pour sortir et infecter d’autres cellules > il vient se refixer par l’hémagglutinine à l’acide sialique, et la neuraminidase coupe la liaison entre l’hémagglutinine et l’acide sialique, libérant ainsi la particule virale.
=> l’inhibiteur de neuraminidase va donc l’empêcher d’agir et donc diminuer la quantité de virus
TAMIFLU

Question 25

le virus de la grippe est-il enveloppé ou non enveloppé? quelles sont ses deux protéines de surface? comment est son génome viral?

Answer 25

enveloppé
neuraminidase et hémagglutinine
virus à ARN négatif, monocaténaires segmentés (8) = a besoin d’être transcrit pour être positif

Question 26

le virus de la grippe appartient à quelle famille? et à quel genre?

Answer 26

famille: orthomyxoviridae
genre: influenzavirus

Question 27

le virus de la grippe a une coiffe en…? pourquoi?

Answer 27

5’ car il se multiplie dans le noyau et doit acquérir ses protéines de surface par traduction

Question 28

pour les sérotypes de la grippe, quels sont ceux qui sont pathogènes pour l’Homme et quel est celui qui est peu ou pas et comment se manifeste-t-il? quel est le sérotype le + virulent?

Answer 28

A et B: pathogènes
C: peu ou pas pathogène (se manifeste par une rhinite ou trachéo-bronchite)
sérotype A le + virulent car dispose le + de variations antigéniques

Question 29

à l’origine, le virus de la grippe A était présent chez quel animal? et à l’origine le virus de la grippe B était présent chez quel animal?

Answer 29

l’oiseau
les phoques

Question 30

quel est le récepteur du virus de la grippe? chez l’homme, il est lié au galactose par une liaison osidique de quel type? et chez l’oiseau (et aussi chez l’homme mais + en profondeur)?

Answer 30

acide sialique
l’homme: liaison osidique de type alpha 2.6
l’oiseau: liaison osidique de type alpha 2.3

Question 31

si on est exposé à des virus de grippe d’oiseaux de manière massive, le virus va avoir une atteinte sur nos voies plus profondes où il y a des liaison alpha 2.3, et donc on a la possibilité d’infecter les individus et de provoquer des pathologies graves: quelle maladie par ex?

Answer 31

H1N1

Question 32

quel animal est plus susceptible d’être infecté par un virus recombiné entre sous-types animal et humain de la grippe (car ses cellules possèdent les 2 types de liaisons osidiques) et donc le transmettre à l’homme?

Answer 32

le cochon

Question 33

quels sont les 2 grands types de variations antigéniques du virus de la grippe? lequel n’est pas reconnu par les cellules T et B mémoire?

Answer 33

• cassure antigénique (réassortiment de segments d’ARN de virus humain et de virus animaux chez un animal) => pas reconnu par LT et LB mémoire
• glissement antigénique (mutations ponctuelles de l’ARN)

Question 34

pour quelles épidémies de grippe il y a eu cassure antigénique du virus (maladies sévères car modifications majeures de l’hémagglutinine/neuraminidase)?

Answer 34

grippe espagnole, grippe asiatique, H1N2 et H1N1

Question 35

pour le diagnostic biologique de l’infection, on va utiliser plutôt diagnostic direct ou indirect?

Answer 35

direct (indirect seulement pour diagnostic rétrospectif = sérologie)

Question 36

l’immunochromatographie, la méthode ELISA et l’immunofluorescence vont permettre de détecter quoi? le PCR? la culture virale?

Answer 36

• immunochromatographie, ELISA et immunofluorescence: Ag
• PCR: ARN
• culture: déterminer souches virales en circulation

Question 37

parmi les antiviraux, quel est le mécanisme d’action des virostatiques?

Answer 37

inhibent réplication virus

Question 38

quel est le mécanisme d’action de l’antiviral AMANTADINE?

Answer 38

empêche le virus d’entrer dans la cellule

Question 39

quel est le mécanisme d’action de l’antiviral TAMIFLU (molécule de synthèse)?

Answer 39

se place au niveau du site de la neuraminidase pour empêcher liaison entre l’acide sialique et le galactose: la particule virale n’est pas libérée et est donc éliminée

Question 40

le SARS COV2 est un virus enveloppé ou non enveloppé? c’est un virus à ARN ou ADN? comment est son génome viral?

Answer 40

enveloppé
virus à ARN simple brin positif, grand génome de 30 kb

Question 41

quels sont les 4 groupes dans la famille des coronavirus? qui infectent-ils?

Answer 41

gamma et delta: infectent poissons + oiseaux
alpha et béta: infectent mammifères dont l’homme

Question 42

les alphas provoquent quelles pathologies? et les bétas?

Answer 42

• alphas: pathologies respiratoires et intestinales bénignes (en général), chez enfants ++ > adaptation humaine
• bétas: pathologies + sévères (SARS Cov1, MERS-cov, SARS Cov2) > virus chez animaux qui peuvent passer chez l’homme = zoonoses

Question 43

quels sont les principaux virus gastro-entériques?

Answer 43

rotavirus (ARN double brin = 11 segments), calicivirus (ARN simple brin), adénovirus (ADN double brin), astrovirus (ARN simple brin), coronavirus (ARN enveloppés), aichi

Question 44

les calicivirus (gastro-entériques) appartient à quelle famille et à quels genres? quel genre est prédominant?

Answer 44

famille: caliciviridae
genre: norovirus (90%) et sapovirus

Question 45

quels sont les principaux virus gastro-entériques?

Answer 45

rotavirus (ARN), calicivirus, adénovirus, astrovirus, coronavirus (ARN enveloppés), aichi (picornaviridae; kobuvirus)

Question 46

quels virus retrouve-t-on au niveau du tube digestif chez les immunodéprimés?

Answer 46

CMV > ulcérations, HSV, VIH ou adénovirus (se diffusent dans l’organisme)

Question 47

quels sont les 4 virus non entéropathogènes retrouvés dans les selles non associés à des gastro-entérites?

Answer 47

• entérovirus (rare): se multiplie dans les entérocytes (cellules intestinales) => méningite, myocardite, atteinte pancréas, détresse respiratoire, œdème cutané…
• virus hépatite A: se multiplie dans hépatocytes => anorexie, vomissements
• réovirus
• adénovirus

Question 48

aujourd’hui, quels sont les virus gastro-entériques les + inquiétants? pk?

Answer 48

rotavirus, calicivirus, astrovirus et virus digestifs car ils affectent les entérocytes et donc perturbent l’absorption

Question 49

pourquoi les gastro-entérites chez le nouveau-né sont + préoccupantes? pourquoi l’atteinte de leurs entérocytes est + grave?

Answer 49

• faible taux de multiplication des cellules des cryptes
• faible taux de migration d’entérocytes et gravité des diarrhées (plus prolongée)

Question 50

les gastro-entérites sont très ou peu fréquentes? comment est leur temps d’incubation? et leur durée?

Answer 50

très fréquentes ++
incubation courte: 24-72h
durée courte: 1-7j

Question 51

quels sont les troubles digestifs aigus présents dans les gastro-entérites?

Answer 51

diarrhée ++, nausées / vomissements, douleurs abdominales et +/- signes généraux (hyperthermie, maux de tête, fatigue…)

Question 52

quel est le virus qui peut atteindre les ganglions mésentériques et provoquer fortes douleurs abdominales pouvant conduire à une appendicectomie?

Answer 52

adénovirus = adénites mésentériques

Question 53

quels sont les principaux moyens de transmission des gastro-entérites virales? quelles sont les principales sources de contamination? qui sont les principaux réservoirs des infections?

Answer 53

voie féco-orale et voie aérienne (aérosols) lors des vomissements (calicivirus)
sources: eau et aliments
réservoirs: hommes et animaux

Question 54

les virus des gastro-entérites touchent surtout quels sujets?

Answer 54

les enfants de moins de 5 ans

Question 55

quels sont les virus gastro-entériques qui provoquent des épidémies? et ceux qui sont endémo-épidémiques?

Answer 55

épidémies: rotavirus (hiver) et astrovirus (toutes saisons)
endémo-épidémiques: adénovirus et calicivirus (hiver, croisières = cruzeiros)

Question 56

comment est le ARN des rotavirus? ses segments donnent origine à quelles 4 protéines et quels sont leurs rôles?

Answer 56

11 segments d’ARN double brin
- VP4: porte Ag P (variable) qui permet l’attachement
- VP7: Ag G selon variabilité de ce segment
- VP6: Ag produit des Ac monoclonaux qui détectent tous les virus de ce groupe
- NSP4: protéine non structurale qui a un rôle dans la virulence et pathogénicité vis-à-vis des cellules voisines

Question 57

le rotavirus (potentiellement fatal dans les pays en développement) se multiplie où? réduit quoi? dérégule quoi? quelle protéine est surtout responsable de l’infection et elle provoque quoi?

Answer 57

multiplication dans entérocytes matures (intestin)
réduit surface d’absorption (atrophie villositaire)
dérégule l’absorption des aliments
NSP4 provoque perte d’eau et ions > participe à la diarrhée

Question 58

quels sont les 2 genres de calicivirus qui affectent les animaux? et les 2 genres qui affectent les hommes?

Answer 58

animaux: Lagovirus et Vesivirus
hommes: Norovirus et Sapovirus

Question 59

combien de sérotypes humains pour l’astrovirus? quel est le sérotype prédominant chez le sujet jeune?

Answer 59

8
1

Question 60

chez les sujets âgés (on perd progressivement notre immunité vis à vis des astrovirus de type 1 avec l’âge) la mortalité par astrovirus ou calicivirus est possible grâce à quoi?

Answer 60

la déshydratation

Question 61

pour les adénovirus, est-il enveloppé ou non enveloppé est leur génome est à ADN ou ARN? quels sont les 2 principaux sérotypes? comment est leur durée? ils peuvent être responsables aussi d’infection respiratoires et grave polyviscérales chez quel sujet?

Answer 61

non enveloppé et à ADN
40 et 41 (non cultivables)
durée souvent + élevée = 5-12j
immunodéprimé

Question 62

quels sont les principaux sujets infectés par les rotavirus? les calicivirus? les adénovirus? et les astrovirus?

Answer 62

• rotavirus: enfants -3 ans++, adultes immunodéprimés ou qui n’ont pas les Ac
• calicivirus: adultes (épidémies explosives d’origine alimentaire)
• adénovirus: adulte et personnes âgées
• astrovirus: personnes âgées et immunodéprimés (VIH)

Question 63

est-ce qu’il y a un signe clinique qui permet de distinguer une infection à rotavirus ou à un autre virus?

Answer 63

non

Question 64

quelles sont les 4 méthodes en pratique pour faire la détection rapide d’Ag de rotavirus / adénovirus…?

Answer 64

ELISA (détection protéines>astrovirus); agglutination, immunochromatographie (calicivirus) et biologie moléculaire (cher) = PCR

Question 65

les éruptions maculeuses (lésions cutanées) accompagnées de fièvre éruptive peuvent être retrouvées dans les virus à ARN ou ADN? lesquels surtout?

Answer 65

les 2
rougeole, rubéole ou l’herpès virus HHV6

Question 66

quels sont les signes cutanés d’infection par rougeole (systémique)?

Answer 66

• signe de Koplick (tâche blanche) au niveau de la muqueuse buccale
• exanthème (tâches rouges) éruption cutanée par réaction virus <=> Ac

Question 67

pour le virus de la rougeole (famille paramyxoviridae) du genre morbillivirus, l’éruption va dans quel sens chez l’enfant? et chez l’adulte? quels sont les 2 moyens de faire le diagnostic? le sujet immunodéprimé peut-il être asymptomatique?

Answer 67

enfant: tête => périphérie
adulte: périphérie => tête
diagnostic par prélèvement sanguin (IgM spécifiques) ou par prélèvement salivaire (ARN RT PCR ou IgM > enfant)
oui

Question 68

comment est le génome du parvovirus B19? il est responsable de quelle pathologie?

Answer 68

génome à ADN simple brin non enveloppé
mégalérythème épidémique

Question 69

quels sont les signes cliniques de mégalérythème épidémique chez l’enfant? et chez l’adulte?

Answer 69

enfant: exanthème maculo-papuleux au visage (aspect en ailes de papillon) peu ou non fébrile, en 48h racine des membres en aspect carte de géographie, tronc épargné
adulte: éruption cutanée parfois inexistante ou très fugace, arthralgies ++ et parfois fébrile

Question 70

que faut-il rechercher en cas de suspecte d’infection au parvovirus B19?

Answer 70

IgM anti parvovirus B19

Question 71

le parvovirus B19 peut-il atteindre le foetus? si oui, en quel cas cela est grave?

Answer 71

oui: grave si anasarque (grand œdème) foeto-placentaire

Question 72

le parvovirus B19 est un virus qui affecte les érythroblastes (GR) que peut-il provoquer?

Answer 72

anémies chez les sujets avec anomalies des GR et peut aggraver les anémies hémolytiques acquises, les anémies par hémorragie ou par carence martiale

Question 73

pour le virus de la rubéole (famille togaviridae) comment sont les éruptions maculeuses 16j après contage? quel est l’autre signe clinique? pendant quelle période le sujet est-il contagieux? quel est le problème avec l’éruption atypique de la femme enceinte au 1er trimestre?

Answer 73

éruptions maculeuses (+ pâles et petites que celles de la rougeole) sur les joues, pourtour buccal, ensemble du corps, fièvre parfois
adénopathies cervico-occipitales (cou)
1 semaine avant et 1 semaine après l’éruption
cela peut provoquer des malformations du fœtus

Question 74

l’enfant peut être infecté par l’HHV6 (famille herpesviridae) à quel âge? l’incubation dure combien de temps? comment est l’éruption maculeuse?

Answer 74

entre 6 mois et 2 ans (fièvre pendant quelques jours)
10j
discrète, fugace, surtout au tronc

Question 75

les éruptions vésicules (généralisées ou localisées) sont des signes de multiplication virale active et peuvent provoquer quoi à l’inverse des vésicules maculeuses? existent-elles uniquement à niveau cutané?

Answer 75

sources de contamination
non: présentes aussi aux muqueuses digestives, certains organes et peuvent être transmis par voie respiratoire (varicelle)

Question 76

les entérovirus (famille picornaviridae) sont responsables de quelle syndrome? ils provoquent quel type d’éruption?

Answer 76

syndrome pied-main-bouche
éruptions vésicules

Question 77

parmi les entérovirus, le poliovirus donne quelle pathologie spécifique?

Answer 77

poliomyélite antérieure aigüe

Question 78

parmi les entérovirus, le coxsackievirus A donne quelles pathologies spécifiques? et le coxsackievirus B?

Answer 78

A: herpangine, syndrome pied main bouche (A16) et conjonctivite hémorragique (A24)
B: myocardite, maladie de Bornholm (pleurodynie) et hépatite

Question 79

parmi les entérovirus, l’échovirus donne quelle pathologie spécifique?

Answer 79

exanthème de Boston (E16)

Question 80

parmi les entérovirus, l’entérovirus 68 donne quelle pathologie spécifique? et l’entérovirus 70? et l’entérovirus 71?

Answer 80

68: bronchiolite
70: conjonctivite hémorragique
71: paralysie et syndrome pied main bouche

Question 81

quel est le trajet des entérovirus?

Answer 81

ils arrivent au niveau des muqueuses digestives (oropharynx, intestin) et se multiplient, arrivent par la circulation lymphatique aux Plaques de Peyer pour enfin atteindre les organes cibles par le sang
obs: certains atteignent directement l’organe cible (conjonctivite pour les yeux)

Question 82

les entérovirus sont-ils présents dans les selles?

Answer 82

oui car se multiplient dans les muqueuses digestives

Question 83

le herpès simplex virus est un virus à vésicules: on a HSV1 au-dessus ou en dessous de la ceinture? et HSV2?

Answer 83

HSV1: au-dessus de la ceinture
HSV2: en dessous de la ceinture

Question 84

quels sont les genres de la sous famille alphaherpes virinae des herpesviridae? ils sont latents où?

Answer 84

simplex virus HSV1 et HSV2 + varicellovirus VZV
latence dans ganglions nerveux sensitifs

Question 85

quels sont les genres de la sous famille betaherpes virinae des herpesviridae? ils sont latents où? provoquent souvent des infections asymptomatiques chez quel sujet?

Answer 85

cytomegalovirus CMV + roseolovirus HHV6 et HHV7
latence dans sang, tissu lymphoïde et réticulo-endothéliale glandes sécrétoires, rein
immunodéprimé

Question 86

quels sont les genres de la sous famille gammaherpes virinae des herpesviridae? ils sont latents où?

Answer 86

lymphocryptovirus EBV et rhadinovirus HHV8
latence dans lymphocytes, cellules épithéliales et endothéliales

Question 87

quelle est la structure des virus de la famille herpesviridae?

Answer 87

ADN linéaire, capside icosaédrique, enveloppe avec glycoprotéines de surface + spicules

Question 88

quel est le signe pathognomonique de la primo-infection orale à HSV1?

Answer 88

gingivo-stomatite: gencive douloureuse, inflammée, avec vésicules > signe infection cellules épithéliales

Question 89

quel est le virus responsable d’épidémies de bronchiolite aiguë du nourrisson en hiver?

Answer 89

le VRS