Biomédecine Quantitative: tests diagnostiques Flashcards
parmi les digitaliques et les béta bloquants, lesquels augmentent la survie des insuffisants cardiaques? démontré par quelle démarche?
béta bloquants
démarche empirique (expérimentation)
dans la description univariée (analyse tableau données) on s’intéresse à 1 colonne ou à plusieurs colonnes?
1 colonne
pour les analyses univariées, quelle est la différence entre les variables discrètes et continues (quantitatives)?
- discrètes: nombre de valeurs limité (nombres entiers, précis)
- continues: infinité de valeurs possibles (imprécises)
en pratique, on va considérer que toutes les valeurs quantitatives sont discrètes ou continues?
discrètes
les variables quantitatives discrètes avec peu de valeurs sont traitées comme quantitatives ou qualitatives?
qualitatives
quels sont les 2 types de variables qualitatives?
nominales (couleur des cheveux) ou ordonnée (niveau d’études)
les variables binaires (oui / non) sont-elles qualitatives ou quantitatives?
qualitatives
les variables qualitatives multivaluées deviennent un ensemble de valeurs…?
binaires (moyens de transport par ex: plusieurs colonnes oui / non)
pour les variables symétriques, les variables quantitatives sont exprimées en…?
moyenne et écart type (DS)
pour les variables asymétriques, les variables quantitatives sont exprimées en…?
médiane, 1er et 3e quartile
les intervalles de confiance des moyennes à 95% (IC95) sont calculés à l’aide de quoi? sont-elles faites systématiquement?
loi de Student
non
quelle est la formule de IC?
IC = X ± t (𝛔 / √n)
les variables qualitatives, binaires ou discrètes avec très peu de variables sont exprimées en…?
effectif et (%)
l’intervalle de confiance d’une proportion à 95% (IC95) sont calculées à l’aide de quoi? c’est systématique? pas adapté pour quels événements?
loi normale ou binomiale
non
événements temps dépendants
sur les événements temps dépendants on utilise quelles variables? avec quel estimateur?
variables de survie
estimateur Kaplan-Meier
les intervalles de confiance de survie (IC95) sont calculés à l’aide de quoi?
loi normale
par quoi on représente les effectifs (vrai positif, vrai négatif, faux positif et faux négatif)?
tableau de contingence
pour la validité intrinsèque (labo), pour la proportion des bien classés, qu’est-ce que la sensibilité et quelle est sa formule?
probabilité que le test soit positif en sachant que le patient est malade
Se = VP / (VP + FN)
pour la validité intrinsèque (labo), pour la proportion des bien classés, qu’est-ce que la spécificité et quelle est sa formule?
probabilité que le test soit négatif en sachant que le patient n’est pas malade
Sp = VN / (VN + FP)
quelle est la différence entre la validité intrinsèque et extrinsèque?
- intrinsèque: on sait si la personne est malade ou pas et on veut savoir si test est conforme
- extrinsèque: on sait si test est négatif ou positif et on veut savoir si personne est malade ou non malade = probabilités post test
pour la validité extrinsèque, parmi la proportion des bien classés, qu’est-ce que la valeur prédictive positive (VPP) et quelle est sa formule?
VPP: sachant que test est positif, quelle est la probabilité que la personne soit malade
VPP = VP / (VP + FP)
pour la validité extrinsèque, parmi la proportion des bien classés, qu’est-ce que la valeur prédictive négative (VPN) et quelle est sa formule?
VPN: sachant que le test est négatif, quelle est la probabilité que la personne ne soit pas malade
VPN = VN / (VN + FN)
qu’est-ce que le taux de prévalence (P)?
proportion de malades = nombre malades / nombre total de patients
quelle est la formule de Bayes pour la VPP?
VPP = (Se x P) / ((Se x P) + (1-Sp) x (1-P))
quelle est la formule de Bayes pour la VPN?
VPN = Sp x (1-P) / (Sp x (1-P) + (1-Se) x P)
pour les maladies rares (sauf diabètes type 2), le VPP augmente ou diminue? et le VPN? la valeur intrinsèque (Se et Sp) est-elle modifiée?
VPP diminue fortement: risque faux diagnostic ++
VPN augmente
non
pour augmenter la prévalence d’une maladie on fait 2 tests: on dit que le test est positif ou négatif quand…?
- positif: 2 tests positifs
- négatif: 1 des 2 tests négatif
en dépistage, quelles sont les caractéristiques du 2e test?
VPP élevée et nature très différente (imagerie vs biologie)
pour la courbe ROC si on prend un seuil infiniment élevé (tous les patients sont négatifs) combien vaut la Sp et la Se?
Sp = 1
Se = 0
pour la courbe ROC si on prend un seuil infiniment négatif (tous les patients sont positifs) combien vaut la Sp et la Se?
Sp = 0
Se = 1
l’aire sous la courbe (AUC) de la courbe ROC est comprise entre quelles valeurs? le test est meilleur si AUC se rapproche de quelle valeur?
0,5 et 1
1
comment peut-on choisir géométriquement le meilleur seuil de la courbe ROC? quelle est la formule? (pas la meilleure méthode)
point le + près du point parfait (1)
(1-Se)² + (1-Sp)²
la courbe ROC est utile pour représenter les critères intrinsèques ou extrinsèques? d’une réponse quantitative ou qualittaive?
intrinsèques
quantitaive
la courbe ROC est utile pour représenter les critères intrinsèques ou extrinsèques? d’une réponse quantitative ou qualitative?
intrinsèques
quantitative
pour estimer la sensibilité d’un test diagnostique, on compare les résultats à un test de quel type?
gold standard
la courbe ROC est-elle modifiée par la proportion de malades?
non
