Génétique: cytogénétique partie 1

Question 1

lors de quelle phase du cycle cellulaire il y a + grande condensation de l’ADN?

Answer 1

métaphase => caryotype

Question 2

pour voir une anomalie génétique sur le caryotype il faut qu’elle soit de quelle taille?

Answer 2

grande taille = minimum 10 Mb (400 bandes)

Question 3

quelles sont les techniques de cytogénétique les + résolutives?

Answer 3

cytogénétique moléculaire (ADN - condensé)

Question 4

pour la technique pangénomique de CGH array les anomalies doivent être de quelle taille pour être visibles?

Answer 4

150 000 pdb

Question 5

lors de quelle phase du cycle cellulaire l’ADN commence à se condenser, l’enveloppe nucléaire à se désagréger et le fuseau mitotique à se mettre en place?

Answer 5

prophase

Question 6

lors de quelle phase du cycle cellulaire le fuseau mitotique est prêt et les chromosomes y sont attachés?

Answer 6

prométaphase (en métaphase les chr sont alignés et sous leur forme la + condensée)

Question 7

lors de quelle phase du cycle cellulaire les chromatides sœurs migrent pour former les 2 cellules filles?

Answer 7

anaphase

Question 8

quelle est la chromatine (ADN + histones) accessible à la transcription? et la non accessible?

Answer 8

accessible = euchromatine
non accessible = hétérochromatine

Question 9

comment est constitué le chromosome?

Answer 9

2 chromatides reliées au centromère + télomères aux extrémités (rôle protection) + bras court (p) au dessus et bras long (q) au dessous

Question 10

quels sont les 3 types cellulaires (pour caryotype)?

Answer 10

• cellules avec division active spontanée à culture courte = cellules de la MO, cytotrophoblastes
• cellules ayant culture courte + mitogène (lymphocytes sanguins)
• cellules avec culture de quelques jours - semaines (cellules du liquide amniotique ou fibroblastes)

Question 11

pour obtenir le caryotype quels sont les 3 types de prélèvements sur cellule nuclée possibles?

Answer 11

• prénatal: cellules du liquide amniotique, du sang fœtal
• postnatal: lymphocytes sanguins, fibroblastes
• onco-hémato: cellules de la MO, ganglions, tumeurs, sang

Question 12

quelles sont les conditions pour obtenir un caryotype en postnatal? les résultats sont obtenus dans quel délai?

Answer 12

prélèvement sur du sang stérile sur héparine > mise en culture stérile à 37º avec 5% CO2 avec 1mL de sang pour 10mL de culture stérile ayant SVF (sérum de veau fœtal = FdC) + antibiotiques + mitogène
48-72h min pour résultats

Question 13

quelles sont les conditions pour obtenir un caryotype fœtal? les résultats dans quel délai?

Answer 13

mettre en culture du liquide amniotique (>16 SA) ou des cellules trophoblastiques (12-14 SA) dans milieu culture stérile (SVF + antibiotiques) à 37º avec qté CO2 précise
10-15j

Question 14

pour caryotype onco-hémato, le temps de culture des cellules est variable selon la pathologie suspectée et les lignées cellulaires mais elle est en moyenne de…?

Answer 14

24-96h

Question 15

quelles sont les étapes pour obtenir un caryotype, un branding chromosomique?

Answer 15

• arrêter culture par colchicine (poison du fuseau)
• faire choc hypotonique au KCI
• fixer au méthanol / acide acétique
• étaler sur lame de verre
• dénaturer par trypsine (bande G) ou chaleur (bande R)
• coloration au Giemsa

Question 16

quelles sont les caractéristiques du G Banding, R Banding et C Banding (+ rare)?

Answer 16

G: dénaturation par trypsine + marquage de chaque chr
R: dénaturation par chaleur + marquage télomères
C: dénaturation par solution chauffée d’hydroxyde de barium + marquage hétérochromatine (centromères)

Question 17

les coloration en bandes G et R sont quoi l’une de l’autre?

Answer 17

colorations réserves: régions claires en bande R = régions foncées en bande G + bande G marque zones riches en A-T et bande R marque zones riches en G-C

Question 18

quelle forme du chr permet d’obtenir le + d’infos? qu’est-ce qui définit donc la résolution du chr?

Answer 18

chr étiré
nombre de bandes (position des bandes > idéogramme)

Question 19

comment sont classés les chromosomes?

Answer 19

en fonction de leur taille (du + grand au + petit), leur banding (spécifique à chaque chr) et leur indice centromérique

Question 20

quels sont les 3 types de chromosomes en fonction de leur centromère?

Answer 20

métacentriques: centromère au milieu (bras court et long de même taille)
sub métacentriques: centromère haut (bras court + petit)
acrocentriques: centromère très haut sans bras court = chr 13,14,15,21 et 22 (il peut avoir télomère)

Question 21

quelles sont les variations non pathologiques du caryotype normal = polymorphismes?

Answer 21

• variations hétérochromatine des chr 1, 9, 16 et Y (régions non codantes)
• variations taille satellites chr 13, 14, 15, 21 et 22
• fragilités chromosomiques