Mutaciones que afectan a regiones codificantes Flashcards
Sustituciones
Mutaciones puntuales donde un nucleótido es sustituido por otro. Transiciones y transversiones
Transiciones
Mutaciones que cambian un nucleótido de un grupo a otro del mismo grupo
A <—> G
C <—> T (U)
Transversiones
Cambio de nucleótido a uno de distinto grupo
Frecuencia transiciones y transversiones
Hay el doble de transiciones que de transversiones (es tremendamente frecuente la transición C → T)
¿Por qué es tan frecuente la transición C —>T?
Muchas regiones del genoma: nucleótidos C seguidos de G (CpG islands). A menudo, en estas islas CpG, la C está metilada.—> desaminaciones espontáneas:
- C: U = error detectable (no hay U en ADN), se cambia por C
- C metilada: T = no se repara, no es “raro”
Mutaciones sinónimas
Mutación resultante codificará para la = proteína, por la redundancia del código genético. En general son neutras, pero puede haber perjudiciales.
Mutaciones no sinónimas
Mutación da lugar a que se exprese una proteína distinta. El codón que se genera da lugar a un Aa diferente.
Pueden ser “min-sense” o “non-sense”
“Mis-sense mutations”
Con cambio de significado, alterado.
Cambio de nucleótido —> Aa distinto.
Lo + habitual es que cambie la conformación de la proteínas / plegamiento —> pierde su función.
“Non-sense mutations”
Mutaciones sin sentido
Cambio de nucleótido —> Aa resultante = codón de stop (UAA, UAG, UGA)
Proteína queda truncada
Cómo una mutación sinónima puede resultar patológica
Nuestras células tienen mucha < concentración de ARNt para ese codón raro —> no hay suficientes moléc de ARNt para producir la prot a la velocidad necesaria.
La velocidad de traducción disminuye = plegamiento de prot se ve afectada
Lo que se encuentra delante de “ : “ es
La secuencia de referencia
Lo que viene tras “ : “ es
La descripción de lo que es la mutación en sí
Cuando nos describen la mutación a nivel del DNA codificante (c), el nucleótido de coordenada +1 siempre es
La “A” del codón de inicio, ATG (codifica para metionina).
Cuando nos describen la mutación a nivel del DNA codificante (c), los nucleótidos que se encuentren upstream, en 5 ́ UTR
Se marcan con el signo negativo (-)
Cuando nos describen la mutación a nivel del DNA codificante (c), los nucleótidos que se encuentren downstream, en 3 ́UTR
Se marcan con un asterisco (*)
Cómo se indica una inserción
prefijo “ins”
Indicar el rango, entre qué nucleótidos se ha introducido
(14_15insT)
Cómo se indica una deleción
Prefijo “del”
Indicar el rango que se elimina (indicando 1º y últ que se eliminan)
(1997_1998del)
Si solo se eliminan dos, se especifican que dos: 1997_1998delTG
Mutaciones “frameshift”
Conllevan desplazamiento del marco de lectura.
Marco de lectura abierta (ORF)
Secuencia de ADN entre un codón de inicio (AUG) y un codón de terminación.
Es el marco en el que el gen se puede traducir (grande = prot importante)
Posibles marcos de lectura para un gen
3 (el 4º sería igual que el 1º pero con un Aa menos)
- +1 (empezamos por 1º nucleótido)
- +2 (empezamos por 2º nucleótido)
- +3 (empezamos por 3º nucleótido)
Mutaciones que desplazan este marco de lectura
Inserciones y deleciones —> Frameshift mutations = prot truncadas (aparecen codones de parada)
(Solo si se insertan 1 o 2; si son 3 o múltiplos cambia la prot pero no el marco de lectura)
Nomenclatura frameshift mutations
Añadimos “fs” al final
Es bueno decir también cuántos Aa después de que se inicie el frameshift, está el codón de parada, designado con prefijo “Ter” / asterisco (*).
(p.Tyr97SerfsTer23 o p.Tyr97Serfs*23)
