Diagnóstico microbiológico de las enfermedades infecciosas Flashcards
El diagnóstico de enfermedades infecciosas se sustenta en
Diagnóstico clínico (historia, examen físico)
Analíticas
Pruebas de imagen (abscesos, etc)
Diagnóstico microbiológico
Calidad de los resultados depende de
La calidad de la muestra (también del transporte y las técnicas)
Una muestra debe ser
Representativa (y no se debe contaminar)
Ante una infección de piel y partes blandas, con abscesos de pus y tejido necrótico, podemos coger muestras de varias formas:
➢ Bastoncillo (hisopo) y algodón, manera superficial
➢ Con un punch, para hacer una biopsia profunda
Es especialmente importante en biopsias de zonas no estériles
Tener en cuenta que lo que crece en el cultivo = patógeno de infección + agentes de la microbiota del paciente
(con un punch aislamos mejor al patógeno que con un hisopo)
En abscesos
Pensar en bacterias anaerobias
Tomar muestra mediante punción percutánea que sirve tanto para coger la muestra como para drenaje
Técnicas de diagnostico directo
Microscopía y tinciones
Cultivos
Técnicas moleculares (PCR)
Técnicas de diagnóstico indirecto
Pruebas serológicas (buscamos Ab)
Fines microscopía
Detección inicial de microorganismos
Identificación definitiva
Tipos de microscopía
Tinciones simples
Tinciones diferenciales
Tinciones fluorescentes
Tinciones simples
Preparaciones en fresco
Yodo de lugol
KOH al 10%
Tinta china
Preparaciones en fresco
Para mirar muestras sin teñir mediante microscopía de campo claro, oscuro o de contraste de fases.
Yodo de lugol
Se añade yodo a preparaciones en fresco de muestras de parasitología para mejorar contraste de estructuras internas —> facilita diferenciación entre amebas y leucocitos del huésped
KOH al 10%
Facilitar la detección de elementos fúngicos
(Disolver material proteináceo y facilitar detección de elementos fúngicos que no se ven afectados por la solución alcalina fuerte)
Tinta china
Basado en que hay organismos con pared celular tan grande (criptococos) que no dejan que pase la tinta china —> halo alrededor de la célula de la levadura
En LCF y otros líquidos corporales
(estructuras redondas blancas, no teñidas = orientativo de criptococo)
Tinciones diferenciales
Tinción de Gram
Tinción de metenamina de plata
Tinción de Wright-Giemsa
Tinción de Ziehl-Neelsen
Tinción de Gram
Más utilizada
Azul→ Gram + (cristal)
Rosa→ Gram - (safranina)
Tinción de metenamina de plata (Grocott)
Detcción de hongos, tiñendo de negro los elementos fúngicos.
Neumocistis solo se puede diagnosticar mediante esta tinción
Tinción de Wright-Giemsa
Parásitos sanguíneos (sobre todo en trópico: Plasmodium)
Cuerpos de inclusión víricos y Clamidias
Géneros Borrelia, Toxoplasma, Pneumocystis y Rickettsia.
Tinción de Ziehl-Neelsen
Para ver bacterias ácido-alcohol resistentes
Único microorganismo gram + que puede causar neumonía
Neumococo (diplococo Gram positivo)
Tinciones fluorescentes
Tinción directa con Ab (mono o policlónales) fluorescentes
Sensibilidad y especificidad dependen del nº de microorg en muestra y calidad de los Ab utilizados en reactivos
Tinción directa con Ab fluorescentes
Ab con especificidad para la x bacteria (ej Legionella) se marca con un fluorocromo. Si la bacteria está presente, los Ab se unirán e iluminarán.
100% específica, identificación específica del microorganismo
Tinción de blanco de calcoflúor
Para detectar elementos fúngicos. El colorante se une a la quitina de las paredes celulares.
(No indica cúal, solo que es hongo)
Cultivos in vitro
Muestra del foco de infección —> se inocula en medio de cultivo —> se deja crecer durante 24h (generalmente) o hasta que aparezca una colonia.
Si no se utilizan los medios de cultivo adecuados = colonias nunca crecerán = no detectaremos patógenos
Legionella en cultivo in vitro
Patógeno respiratorio, VIP
No se pudo cultivar hasta que se descubrió que necesitaba carbón activo para crecer, tarda hasta 5 días
Causa la enfermedad Legionelosis / “Enfermedad del legionario”
Campylobacter en cultivo in vitro
Patógeno entérico
No se consiguió recuperar de las muestras de heces hasta que se incubó en medios a una Tº de 42ºC, en atmósfera microaerófila.
Clamidia en cultivos in vitro
VIP bacteria
ETS, uretritis por chlamydia.
Patógeno intracelular obligado que debe cultivarse en células vivas.
No responde a los medios de cultivo tradicional. Para diagnóstico: detección molecular o cultivos con células vivas
Treponema pallidum en cultivos in vitro
Causante de sífilis
No se puede cultivar en ningún medio, ni celulares ni artificiales.
Antes de pedir un cultivo es muy importante
Sospechar qué bacterias pueden ser las causantes de la enfermedad para decirle al microbiólogo cómo crecer las muestras, en qué condiciones
Staphylococcus aureus es la causa de
Síndrome del shock tóxico estafilocócico, mediante liberación de toxina al sis circulatorio.
Detectar esa toxina = diagnosticar la enfermedad
Shock tóxico estafilocócico es causado por
Staphylococcus aureus, mediante liberación de toxinas al sistema circulatorio
Hemocultivo
Cultivo de sangre
En hemocultivos de infecciones en las que existen relativamente pocos microorganismos
La rentabilidad del cultivo dependerá de la cantidad de sangre que saquemos.
Factores que limitan la eficacia de un hemocultivo
- Si el paciente está tomando antibiótico: probabilidad de que salga negativo
- Depende del V de sangre que extraiga. Puede dar falsos neg (+ rentabilidad cuantos + hemocultivos saquemos)
Qué significa que pite un hemocultivo
Significa que contiene bacterias que están produciendo CO2, de forma que baja el pH y el culo del bote cambia de color a amarillo a verde
Medios de cultivo enriquecidos
Aquellos en los que puede crecer casi cualquier cosa. Permiten el crecimiento de la mayoría de microorg que no requieren condiciones exigentes.
Ejemplos de medios de cultivo enriquecidos más empleados
Agar sangre, Agar chocolate, Caldo tioglicolato,…
Problema de los medios de cultivo enriquecidos
En muestras de esputo, heces,.. crecerá también la microbiota. No seremos capaces de diferenciar qué está causando enfermedad.
Medios de cultivo selectivos
Aquellos que permiten suprimir estos microorg existentes en condiciones normales y facilitan la detección de los que tienen importancia clínica.
Qué se emplea para un medio de cultivo selectivo
Un medio cultivo rociado con sust químicas inhibidoras de bacterias u otros microorg que no queremos que crezcan.
Medios de cultivo selectivos y diferenciales
Tiñen de un color u otro en función de una propiedad del microorganismo
Ejemplos de medios de cultivos selectivos y diferenciales
Agar de MacConkey
Agar sal manitol
Agar de MacConkey
Agar selectivo para bacterias Gram - y diferencial para distinguir las bacterias que fermentan lactosa y las que no (marcador ph: se tiñe de rosa si hay fermentación o se queda amarillo si no hay)
Agar sal manitol
Medio de cultivo selectivo diferencial empleado para el aislamiento de estafilococos.
Medios de cultivo especiales
Tienen un montón de sustancias específicas que si no incluimos, la bacteria no crece
Ejemplo medio de cultivo especial
Medio de Lowenstein-Jensen usado para el aislamiento y crecimiento de Mycobacterium tuberculosis
Medios de cultivo cromogénicos
Agares selectivos diferenciales utilizados para aislar e identificar especies distintas de bacterias y levaduras (según las sust que utilice cada especie, su colonia saldrá de un color concreto)
Son incluso capaces de detectar si una bacteria es resistente al antibiótico. Si la bacteria hidroliza el antibiótico y lo destruyem = colorante se libera al medio y nos indica que es resistente. “Chromagar”
Ejemplo medios de cultivo cromogénicos
Para el género Candida. Este medio contiene cloranfenicol para inhibir las bacterias y una mezcla de sustratos cromogénicos especiales.
MALDI-TOF
Tecnología que se utiliza ahora ampliamente para la identificación de bacterias, micobacterias, levaduras y mohos, y ha sustituido a las pruebas bioquímicas y morfológicas
En qué consiste MALDI-TOF?
- Cultivo de colonia —> muestra —> bacteria en pocillo —> congelador gigante.
- Aparato lanza un láser sobre bacteria, la pulveriza y lo dispara hacia arriba, proyectándose sobre un detector.
- Se genera un espectrofotómetro de todos los componentes del patógeno —> se van proyectando en detector = informa si se trata de un patógeno u otro.
Tiempo de obtención resultados MALDI-TOF
1 minuto (+24h del cultivo)
Problema MALDI-TOF
Se proyectará hacia arriba la bacteria + todos los componentes del paciente = espectro “sucio”
Determinación de la susceptibilidad antibiótica
Aunque se logre hacer MALDI TOF directamente usando muestras biológicas, seguimos necesitando el cultivo para poder hacer antibiogramas: detectar qué antibióticos funcionan y a qué dosis (CMI).
Diagnóstico molecular
Técnicas como la secuenciación de ác nucleicos y análisis de prot mediante espectrometría están reemplazando rápidamente a los métodos tradicionales
Componentes de agentes infecciosos que se analizan en pruebas moleculares
DNA, RNA o proteínas
Importancia pruebas moleculares (diagnóstico sindrómico)
Los procedimientos para el análisis genómico y antigénico se han abaratado y están disponibles para muchos patógenos.
Pueden no requerir muestras con microorg viables.
Son muy sensibles y específicos y pueden acelerar el diagnóstico
Para que se emplean las pruebas serológicas
- Estudios epidemiológicos (quien ha pasado la infección)
- Para patógenos que no se pueden cultivar o enfermedades de evolución lenta
Ejemplo de patógeno que se detecta mediante serología (EXAMEN)
Treponema pallidum
Características diagnóstico serológico
Diagnóstico lento
(no somos capaces de detectar Ab en sangre hasta la 2º semana de infección)
“Periodo de ventana”
Periodo desde que el paciente se infecta hasta que somos capaces de detectar anticuerpos en sangre.
(En este periodo con pruebas serológicas no veremos nada, hay que hacer PCR)
Consecuencias pruebas serológicas sarampión vs Covid
Sarampión: puedes tener Ab = no te vuelves a infectar
Covid: puedes tener Ab = no exento de volverte a infectar
Características del liquido cefalorraquídeo normal
Glucosa: 40-80 mg/dL
Proteína total: 15-60 mg/dL
Linfocitos: 0-5 linf/mcL
Proteína básica de mielina: <1,5 ng/mL
Microorganismos detectables con tinción directa con Ab fluorescentes
Streptococcus pyogenes
Bordetella
Francisella
Legionella
Chlamydia
Pneumocystis
Cryptosporidium, Giardia
Virus gripe
Virus herpes simple
Tinción de naranja acrimina
Para bacterias y hongos en muestras clínicas.
Colorante se intercala en ác nucleico (natural y desnatur) —> pH neutro: hongos y mat celular se tiñen de naranja
Tinción de auramina-rodamina
Igual que las tinciones acidorresistentes
Tinción de blanco calcoflúor
Se utiliza para detectar elementos fúngicos y Pneumocistis.
El colorante se une a celulosa y quitina en paredes celulares.
Qué requieren las determinaciones de la sensibilidad a los antimicrobianos
Aislamiento de microorganismos viables y representativos
Métodos de laboratorio para diagnosticar infecciones virales
- Examen citológico
- Microscopia electrónica
- Aislamiento y cultivo del virus
- Detección de proteínas víricas (Ag y enzimas)
- Detección de material genético vírico
- Serología
Tabla diagnostico de las infecciones virales
Muestras para el diagnóstico de las infecciones virales
Se deben obtener en una etapa precoz de la fase aguda de la infección, antes de que deje de eliminarse el virus
Muestras virus respiratorio
Solo se pueden aislar 3-7 días y diseminación se puede interrumpir con anterioridad a la desaparición de síntomas
Muestras de VHS y VVZ o ADN del virus
No se pueden obtener de las lesiones 5 días después de aparecer la sintomatología
Muestras enterovirus del LCR
Solo se puede aislar 2-3 días después de la aparición de las manifestaciones del SNC. Además, el Ab producido como respuesta a la infección puede impedir la detección del virus.
Cultivo celular de virus
Muchos virus producen efectos citopatológicos (ECP) característicos en medios de cultivo celular
(modificaciones de morfología celular, lisis, formación de vacuolas, sincitios y cuerpos de inclusión)
Sincitios
Células gigantes multinucleadas formadas como consecuencia de la fusión vírica de células individuales.
Paraximovirus, VHS, VVZ, VIH estimulan su formación
Cuerpos de inclusión
Cambios histológicos de las células provocados por componentes víricos o bien alteraciones de las estructuras celulares inducidas por los virus
Título de Ab
Concentración relativa de Ab se considera como un título.
Un título es el inverso de la mayor dilución, o menor concentración de Ab