Mutación como causa de enfermedad Flashcards
Polimorfismo
Variante genética que aparece en distintas formas (alelos), pero siempre en la misma posición de un cromosoma
Mutación
Variante genética (posición x de un cromosoma que codifica x proteína) que da lugar a enfermedad
SNPs
“single nucleotide polymorphism”
Variaciones de nucleótidos
(Actualmente se utiliza en lugar de polimorfismo)
SNPs de una persona a otra
4-5 millones de letras diferentes
Características de los SNP
Algunas variantes serán + o - frecuentes (distintas frecuencias alélicas)
Distinción tradicional entre polimorfismo y mutación; invalidez
Por su efecto: mutación causa enfermedad, polimorfismo es neutro
Polimorfismos no son totalmente neutros, y pueden dar predisposición a enfermedad —> distinción inválida
Frecuencias alélicas
- Mutaciones, al ser variantes genéticas que causan enfermedad, su frecuencia alélica es < abundante.
- Polimorfismos, al ser “neutros”, tienen > frecuencia alélica ( > del 1%)
Cómo pueden ser las variantes (SNVs)
○ Variantes raras o variantes comunes
○ Dentro de estas, variantes benignas o patogénicas
Variantes raras, benignas
No preocupan mucho.
Baja frecuencia alélica, no peligrosas
Variantes raras, patogénicas
Peligrosas, predisponen a enfermedad, pero de baja frecuencia alélica (antiguamente mutación)
Variantes comunes, benignas
No preocupan
Variantes comunes, patogénicas
Tienen una gran repercusión en la población. Predisponen
Cómo se distingue si es patológico o benigno
Dependiendo del efecto que tenga la variante sobre la proteína para la que codifica.
¿Qué es raro y que es común?
Variantes raras = MAF < 1%
Variantes de baja frecuencia = 1% - 5%
Variantes comunes = MAF > 5%
¿Todas las variantes patogénicas son realmente patogénicas?
Hay muchas + mutaciones, que en personas causan enfermedades y en otras no, ya que no son mutaciones 100% penetrantes —> qué mutación tiene uno, y cuáles son mejores o peores (penetrancia)
Proyecto Exac
1º Secuenciación de exomas de personas sanas, en vez de todo el genoma (más fácil, rápido y barato).
2º Secuenciación los genomas de personas con enfermedades priónicas
3º Analizando genomas de 60.000 personas sanas: hasta 52 mutaciones en gen PNRT (enf priónicas). Personas no diagnosticadas pero que llevaban mutaciones —> penetrancia
Mutaciones de novo
Se producen durante la gametogénesis, en la formación de la línea germinal
Tasa mutacional en la línea germinal
1,2 x 10-8 /nucleótido/generación
Número de nucleótidos en el genoma humano (VIP)
3 mil millones (3 x 10^9 nucleótidos)
Número de mutaciones de novo que cada uno de nosotros lleva
40 - 60 mutaciones de novo,
¿Vienen por igual las mutaciones de novo del padre y de la madre?
Línea paterna presenta muchas + mutaciones de novo que en la materna (4:1)
Nº mutaciones aumenta sobre todo con el aumento de la edad del padre.
Por qué proceden más las mutaciones de novo de la línea paterna que de la materna?
La espermatogénesis = proliferación constante = muchas + divisiones = mucha + probabilidad de error.
(Principal causa / proceso celular que da lugar a mutaciones = replicación ADN)
CDS
Coding sequence.
Mecanismo de splicing
Corta intrones y une los exones uno detrás de otro
5’ UTR
Si el codón de inicio de la traducción está en x sitio, la región previa a él, que se transcribe pero no se traduce
3’ UTR
La región tras el codón de parada, hasta el fin del mRNA
5’UTR y 3’UTR
Se excluyen durante la traducción del mARN a proteína
¿Cómo se puede “romper” este gen haciendo que se altere?
CDS: desde el codón de inicio al codón de parada —> proteína. Mutaciones en CDS = alteración prot resultante
CT y AG = secuencias de consenso de splicing. Sin ellas = no splicing regulado. Estas mutaciones pueden afectar severamente la función de este gen. Cambia el mRNA resultante
Coordenadas a nivel de los genes
A de ATG sería la coordenada número 1, lugar de inicio de la traducción (en ARN = AUG, metionina).
Más frecuente
Coordenadas a nivel de la mARN y la proteína
El 1º Aa será siempre la metionina, AUG (coordenada: no 1)
