Mutación como causa de enfermedad

Question 1

Polimorfismo

Answer 1

Variante genética que aparece en distintas formas (alelos), pero siempre en la misma posición de un cromosoma

Question 2

Mutación

Answer 2

Variante genética (posición x de un cromosoma que codifica x proteína) que da lugar a enfermedad

Question 3

SNPs

Answer 3

“single nucleotide polymorphism”
Variaciones de nucleótidos
(Actualmente se utiliza en lugar de polimorfismo)

Question 4

SNPs de una persona a otra

Answer 4

4-5 millones de letras diferentes

Question 5

Características de los SNP

Answer 5

Algunas variantes serán + o - frecuentes (distintas frecuencias alélicas)

Question 6

Distinción tradicional entre polimorfismo y mutación; invalidez

Answer 6

Por su efecto: mutación causa enfermedad, polimorfismo es neutro

Polimorfismos no son totalmente neutros, y pueden dar predisposición a enfermedad —> distinción inválida

Question 7

Frecuencias alélicas

Answer 7

• Mutaciones, al ser variantes genéticas que causan enfermedad, su frecuencia alélica es < abundante.
• Polimorfismos, al ser “neutros”, tienen > frecuencia alélica ( > del 1%)

Question 8

Cómo pueden ser las variantes (SNVs)

Answer 8

○ Variantes raras o variantes comunes
○ Dentro de estas, variantes benignas o patogénicas

Question 9

Variantes raras, benignas

Answer 9

No preocupan mucho.
Baja frecuencia alélica, no peligrosas

Question 10

Variantes raras, patogénicas

Answer 10

Peligrosas, predisponen a enfermedad, pero de baja frecuencia alélica (antiguamente mutación)

Question 11

Variantes comunes, benignas

Answer 11

No preocupan

Question 12

Variantes comunes, patogénicas

Answer 12

Tienen una gran repercusión en la población. Predisponen

Question 13

Cómo se distingue si es patológico o benigno

Answer 13

Dependiendo del efecto que tenga la variante sobre la proteína para la que codifica.

Question 14

¿Qué es raro y que es común?

Answer 14

Variantes raras = MAF < 1%
Variantes de baja frecuencia = 1% - 5%
Variantes comunes = MAF > 5%

Question 15

¿Todas las variantes patogénicas son realmente patogénicas?

Answer 15

Hay muchas + mutaciones, que en personas causan enfermedades y en otras no, ya que no son mutaciones 100% penetrantes —> qué mutación tiene uno, y cuáles son mejores o peores (penetrancia)

Question 16

Proyecto Exac

Answer 16

1º Secuenciación de exomas de personas sanas, en vez de todo el genoma (más fácil, rápido y barato).

2º Secuenciación los genomas de personas con enfermedades priónicas

3º Analizando genomas de 60.000 personas sanas: hasta 52 mutaciones en gen PNRT (enf priónicas). Personas no diagnosticadas pero que llevaban mutaciones —> penetrancia

Question 17

Mutaciones de novo

Answer 17

Se producen durante la gametogénesis, en la formación de la línea germinal

Question 18

Tasa mutacional en la línea germinal

Answer 18

1,2 x 10-8 /nucleótido/generación

Question 19

Número de nucleótidos en el genoma humano (VIP)

Answer 19

3 mil millones (3 x 10^9 nucleótidos)

Question 20

Número de mutaciones de novo que cada uno de nosotros lleva

Answer 20

40 - 60 mutaciones de novo,

Question 21

¿Vienen por igual las mutaciones de novo del padre y de la madre?

Answer 21

Línea paterna presenta muchas + mutaciones de novo que en la materna (4:1)

Nº mutaciones aumenta sobre todo con el aumento de la edad del padre.

Question 22

Por qué proceden más las mutaciones de novo de la línea paterna que de la materna?

Answer 22

La espermatogénesis = proliferación constante = muchas + divisiones = mucha + probabilidad de error.

(Principal causa / proceso celular que da lugar a mutaciones = replicación ADN)

Question 23

CDS

Answer 23

Coding sequence.

Question 24

Mecanismo de splicing

Answer 24

Corta intrones y une los exones uno detrás de otro

Question 25

5’ UTR

Answer 25

Si el codón de inicio de la traducción está en x sitio, la región previa a él, que se transcribe pero no se traduce

Question 26

3’ UTR

Answer 26

La región tras el codón de parada, hasta el fin del mRNA

Question 27

5’UTR y 3’UTR

Answer 27

Se excluyen durante la traducción del mARN a proteína

Question 28

¿Cómo se puede “romper” este gen haciendo que se altere?

Answer 28

CDS: desde el codón de inicio al codón de parada —> proteína. Mutaciones en CDS = alteración prot resultante

CT y AG = secuencias de consenso de splicing. Sin ellas = no splicing regulado. Estas mutaciones pueden afectar severamente la función de este gen. Cambia el mRNA resultante

Question 29

Coordenadas a nivel de los genes

Answer 29

A de ATG sería la coordenada número 1, lugar de inicio de la traducción (en ARN = AUG, metionina).

Más frecuente

Question 30

Coordenadas a nivel de la mARN y la proteína

Answer 30

El 1º Aa será siempre la metionina, AUG (coordenada: no 1)