H4.4: Epigenetica en kanker Flashcards
MDS: myodysplastisch syndroom
- is niet hetzelfde als MDN
- klonale ziekte van de hemopoietische stamcel
- cytopenie in 1 of meer cellijnen eventueel met dysplastische kenmerken, max 20% blasten (>20% is AML)
- beenmerg met dysplastische kenmerken in 1 of meer cellijnen, max 20% blsten
- vaak ineffectieve hematopoiese
- komt vooral voor bij ouderen; eerst bekend als ‘ouderdomsleukemie’
behandeling MDS
- meestal palliatief
- ARA-C; oud en werkt niet super
- 5-azacytidine; het nieuwe, goed werkende middel
epigenetica
gaat over het mechanisme dat ervoor zorgt dat genen aan of uit staan
2 vormen van epigenetische regulatie
- DNA-methylering
- histon-modificatie
chromatine kan zich in twee vormen bevinden
- open chromatine : euchromatine
- gesloten chromatine : heterochromatine
waar kan transcriptie plaatsvinden?
alleen bij euchromatine
waar kan methylering plaatsvinden?
alleen bij cytosine. dus alleen C kan worden gemethyleerd
wat is het gevolg van methylering?
je krijgt opnieuw een bindingsplaats voor een eiwit; CpG binding proteins. deze zorgt ervoor dat het DNA heel compact wordt.
wat kan er gebeuren met een histon?
kan worden geacetyleerd; dan raakt hij open
als een histon zijn acetylering verliest,
is hij gesloten
waar vindt methylering van cytosine plaats?
op plaats 5 van de ringstructuur
welk enzym verzorgt de DNA-methylering?
DNMT
bij kanker
hypermethylering
wanneer kan een C gemethyleerd worden?
alleen als hij naast een G is
komt C naast G vaak voor?
nee, relatief het minst
waar komen C’s naast G’s het meest / alleen maar voor?
in de promotor: liggen in specifieke CG-eilanden
wat gebeurt er als de promotor gemethyleerd is?
dan vindt er geen transcriptie meer plaats. in plaats van transcriptiefactoren is de methylated CpG binding protein gebonden en deze zorgt ervoor dat het eiwit in elkaar krimpt
oncogen
een gen wat door een fout achter elkaar de hele tijd maar afgeschreven wordt
tumor suppressorgen
een gen dat aan hoort te staan maar uitgezet wordt
1 manier waarop tumorsuppressor genen worden uitgeschakeld
door methylering
twee vormen van methylering
- de novo methylering
- maintenance methylering
de novo methylering
iets wordt gemethyleerd wat nog niet gemethyleerd is
maintenance methylering
omdat de moedercel gemethyleerd was wordt dta doorgegeven. maar er worden geen gemethyleerde C’s ingebouwd bij replicatie, alleen normale. maar dan is er een enzym dat er een methylgroep aan zet. de informatie wordt van cel tot cel overgebracht bij replicatie : epigenetica
maintenence methylering =
epigenetica
de nieuwe streng die wordt ingebouwd is niet gemethyleerd, maar omdat de oude het nog wel is komt er een enzym dat de nieuwe ook methyleert zodat het symmetrisch is
5-azacytidine
een cytidine homoloog dat niet kan worden gemethyleerd; er zit een extra stikstof op de 5de plek waardoor methylering niet mogelijk is
hiermee kan je genen uitzetten
5-azacytidine kan in kweek worden gebracht en vervangt dan in bv promotor de gemethyleerde versie