H2.2: DNA-schade en reparatie: deel 2

Question 1

hoe worden DNA-beschadigingen herstel?

Answer 1

a.d.h.v. templates => nauwkeurig herstel

Question 2

wat voor templates?

Answer 2

complementaire DNA-streng:
- zuster chromatide (alleen in S- of G-fase van de cyclus)
- homologe chromosoom (tijdens meiose)

Question 3

wanneer gebruik je complementaire DNA-streng als template?

Answer 3

• mismatched baseparen
• intrastreng DNA crosslinks
• enkelstrengs DNA breuken

;geschikt voor het herstel van DNA schade waarbij alleen 1 van beide strengen is beschadigd

Question 4

wanneer gebruik je zusterchromatide/homologe chromosoom?

Answer 4

• intrastrengs DNA crosslinks
• dubbelstrengs DNA breuken

;wanneer beide strengen zijn beschadigd

Question 5

voorbeelden van DNA schade reparatie mechanismen

Answer 5

• base excisie reparatie (herstel van kleine adducten)
• nucleotide excisie reparatie voor herstel van grote adducten (UV licht geinduceerde DNA schade)
• niet-homologe DNA-eind verbinding en homologe recombinatie (herstel van dubbelstrengs DNA-breuken)

Question 6

twee mechanismen om dubbelstrengs DNA breuken te repareren

Answer 6

• niet homologe DNA-eindverbinding; direct aan elkaar ligeren van de 2 uiteinden van de breuk: gebruikt geen template: onnauwkeurig
• homologe recombinatie: uitwisseling van DNA strengen tussen DNA moleculen: gebruikt vnl het zusterchromatide: nauwkeurig

Question 7

mechanisme niet-homologe DNA eindverbinding

Answer 7

KU70/80 dimeer herkent breuk.
m.b.v. DNA-PKcs en ligase brengt de twee uiteinden weer aan elkaar. dit leidt dus tot een kleine deletie. (ten koste van nauwkeurigheid van DNA code)

Question 8

een defect in niet-homologe DNA eindverbinding van resulteren in

Answer 8

radiosensitiviteit;

bv SCID patienten; die kunnen die breuken niet herstellen

Question 9

niet-homologe DNA eindverbinding is vooral ook belangrijk voor

Answer 9

recombinatie van DNA die nodig is voor het genereren van antilichamen. het verbindt verschillende fragmenten van antilichamen.

Question 10

antilichamen verbinding blah blah werking

Answer 10

een B-cel specifiek eiwit, RAG1/RAG2 introduceert DNA dubbelstrengs breuken in het immunoglobuline locus.

niet-homologe DNA eindverbinding koppelt D en J segment bv. de hele tijd worden allerlei breuken aan elkaar gemaakt waardoor je een formatie van een rna krijgt voor een antilichaam. en hierdoor krijg je dus zo veel verschillende soorten antilichamen.

Question 11

voordeel onnauwkeurigheid

Answer 11

de onnauwkeurigheid van niet-homologe DNA eindverbinding vergroot de diversiteit aan antilichamen

Question 12

homologe chromosomen

Question 13

twee vergelijkbare maar niet identieke kopieën van elk chromosoom: homologe chromosomen

Answer 13

1 van vader, 1 van moeder.

na replicatie per chromosoom 2 identieke zusterchromatide. dus pas na S-fase. dat is dus het verschil tussen zusterchromatiden en homologe chromosomen

Question 14

werking van herstel dubbelstrengse DNA-breuk door homologe recombinatie

Answer 14

bv x-ray, daardoor ontstaat dubbelstrengs DNA-breuk.
zusterchromatide wordt gebruikt als template.
eerst wordt een klein stukje bij elke streng weggehaald.
dit maakt het mogelijk dat de enkelstrengs stukjes van het DNA dat nu afwezeig is kunnen homologie zoeken in de zusterchromatide en dat zo gebruiken als template.

Question 15

belangrijkste eiwitbij dubbelstrengs DNA breukherstel door homologe recombinatie

Answer 15

RAD51:
- dat bindt na de breuk aan enkelstrengs DNA om dit te stabiliseren.
- dit helpt ook bij het zoeken naar homologie bij zusterchromatide.

BRCA1 en BRCA2; zijn bv betrokken bij borstkanker. zijn belangrij voor het verder herstel van de breuk

Question 16

als RAD51 aan de breuk bindt..

Answer 16

dat kan worden gezien in de kern als kleine stipjes

Question 17

borsttumor =

Answer 17

BRCA2-deficient. hierdoor sterven ze af bij bestraling.

Question 18

BRCA2 is belangrijk voor

Answer 18

genomische stabiliteit

Question 19

fouten bij dubbelstrengs DNA-breuk herstel kunnen leiden tot

Answer 19

genomische instabiliteit;
bij homoloog chromosomen, als dat gebeuert voor de DNA-replicatie, dan krijg je die exchange ook wel, maar omdat ze niet gelijk zijn, leiden tot mogelijk verleis van heterozygositeit (LOH).

het wordt ook een probleem wanneer je bijvoorbeeld als template een mutatie gebruikt, want dan zijn beide allelen gemuteerd en kunnen ook recessieve tot uiting komen

Question 20

fouten bij niet-homologe

Answer 20

je kan de verkeerde strengen verbinden met elkaar, waardoor translocatie. bijvoorbeeld: chronische myeloide leukemie