H2.3: Gevolgen van fouten bij DNA replicatie Flashcards
twee grote oorzaken waardoor er replicatiefouten kunnen ontstaan
- DNA polymerase proofreading fouten; DNA polymerase merkt niet dat er een fout is ingebouwd
- translesie synthese: komt in actie als de DNA polymerase zelf tijdens de replicatie een blokkade heeft en niet verder kan. maar deze is onnauwkeurig.
mechanisme DNA replicatie
incorporatie van deoxyribonucleoside trifosfaten door DNA-polymerase
3 mechanismen die voor nauwkeurigheid van DNA-replicatie zorgen
- base selectie
- proofreading
- mismatch reparatie
base selectie
selecteren voor het correcte nucleotide en het inbouwen
proofreading
DNA-polymerase checkt of het wel klopt.
soms kan een nucleotide instabiel worden, dan verplaatst een proton zich. dan ga je van een amino tautomeer naar een imino tautomeer. hierdoor verandert de baseparing.
twee functies van DNA-polymerase
- nucleotiden inbouwen; polymerizing
- kan ook een nucleotide weghalen en een nieuwe inbouwen; proofreading
mismatch reparatie
DNA-polymerase heeft niet gemerkt dat bv een A tegenover een G staat en is verder gegaan met inbouwen.
bepaalde eiwitten recruteren een enzym (EXO1) en die knipt het gemuteerde stuk. dan komt er een DNA-polymerase om de goede volgorde te synthetiseren.
lynch syndroom pathogenese
mismatch reparatie is defect
hoe kun je een mismatch reparatie defect aantonen?
1: immunohistochemische kleuring
2: microsatellite instability assay (MSI)
immunohistochemische kleuring
om die betrokken eiwitten aan te kleuren en op aanwezigheid te cheken
microsatellite instability assay (MSI)
omdat je misschien de aanwezigheid van dat eiwit wel hebt aangetoond, maar de functionaliteit nog niet:
dit is een soort test om mismatch op te sporen in bepaalde eiwit gevoelige ‘sequenties’. deze zijn meestal di of tri.
defecte mismatchreparatie leidt tot microsatellite instabiliteit
dit doe je dmv PCR. de tumorcel heeft op heel veel plekken banden/streepjes, terwijl een normale cel er maar 1 heeft. dit omdat een tumor grotere of kleine repeats heeft van die MSI.
tijdens replicatie, komt de nieuwe strand eventjes los. hierdoor kunnen fouten ontstaan:
- er kan een lusje ontstaan in de nieuwe streng waardoor een deel niet is ingebouwd
- er kan een lusje ontstaan in de oude streng waardoor een deletie
hoe jonger iemand is (<50) wanneer hij/zij darmkanker krijgt…
hoe groter de kans dat het erfelijk is
andere oorzaken dan sporadisch voor darmkanker
- FAP: syndroom met heel veel darmpoliepen (autosomaal dominant)
- IBD
- Lynch syndroom
- familiair belast
wanneer moet je denken dat er sprake zou kunnen zijn van erfelijke colorectaal carcinoom?
- < 50 jaar
- twee keer CRC of CRC icm andere lynch geassocieerde tumor
- wanneer MSI is aangetoond (<60jaar)
- CRC bij een pt met 1 of meer eerste/tweedegraads familieleden met lynch syndroom geassocieerde tumor (ten minste eenmaal <50jaar)
- CRC bij een pt met 2 of meer eerste/tweedegraads familieleden met een lynch syndroom geassocieerde tumor