Maladies infectieuses Flashcards
On dit que la flore microbactérienne ____ un site anatomique
On dit que la flore microbienne colonise un site anatomique.
Sites du corps humains colonisés par une flore
- Muqueuses du tube digestif (intestin ++)
- Muqueuse urogénitale (vagin ++)
- Muqueuse respiratoire supérieure (bouche ++)
- Peau (zones humides ++ = aisselles, haines, etc.)
Système du corps humain entièrement stériles
Les systèmes suivants sont entièrement stériles, c’est-à-dire qu’ils ne sont pas colonisés par une flore :
- Cardiovasculaire : sang, tissus
- Musculo-squelettique : muscles, os, articulations
- Neurologique : liquide céphalo-rachidien
Sites profonds: Colonisation?
La plupart des sites anatomiques « profonds », ou loin de la surface du corps, sont stériles (sauf l’intestin!) :
- ORL : sinus, oreille moyenne et profonde
- Respiratoire : bronches distales + alvéoles, plèvre
- Génito-urinaire : urètre proximal, vessie, utérus, prostate, uretère, reins
- Digestif : foie, rate, pancréas, cavité péritonéale
Distribution des principaux micro-organismes de la flore selon le site anatomique: ORL
Distribution des principaux micro-organismes de la flore selon le site anatomique: Grêle + côlon
Distribution des principaux micro-organismes de la flore selon le site anatomique: Génito-urinaire
Distribution des principaux micro-organismes de la flore selon le site anatomique: Bouche
Distribution des principaux micro-organismes de la flore selon le site anatomique: Peau
Cystite: Définir
Infection urinaire basse
Cystite: Investigation
Investigation microbiologique : sommaire microscopique des urines (SMU) et décompte-culture-antibiogramme (DCA)
SMU-DCA: Quand les prescrire?
- Habituellement chez tous les patients qui se présentent avec des symptômes urinaires compatibles
- Exception : jeunes femmes non enceintes avec symptômes typiques, sans fièvre et sans facteur de risque d’infection résistante
- On ne prescrit pas de culture d’urine chez un patient asymptomatique (sauf exceptions – ex : femmes enceintes)
SMU-DCA: Comment les prescrire?
- Avant les antibiotiques
- Habituellement sur une urine mi-jet, après désinfection
SMU-DCA: Comment les interpréter? (grandes considérations)
3 grandes considérations :
1. L’urine est stérile.
2. Mais, pour la plupart des prélèvements, dont le mi-jet qui le plus répandu, elle peut se contaminer au passage par les flores digestive, génito-urinaire et cutanée.
3. L’interprétation du résultat dépend du sommaire d’urine, de la bactérie identifiée et de la quantité retrouvée.
Principales bactéries causant l’infection urinaire basse
Principales bactéries causant l’infection urinaire :
- Entérobactéries dont : Escherichia coli (E.Coli), Klebsiella sp., Proteus mirabilis, Citrobacter, etc.
- Enterococcus faecalis
- Staphylococcus saprophyticus : à coagulase négative, cause des infections urinaires basses classiquement chez les jeunes femmes
- Streptocoque B-hémolytique du groupe B
- Pseudomonas aeruginosa
- Etc
Cystite: Quantité de bactéries dans l’échantillon urinaire nécessaire au diagnostic
La quantité habituellement retrouvée en infection urinaire dans un mi-jet est supérieure à 10 à la 7 ou 8 UFC/L et la bactérie sera identifiée par le laboratoire seulement si elle est un pathogène reconnu en quantité suffisante
Principales bactéries représentant de la contamination dans l’urine + leur interprétation
- Streptocoque viridans
- Corynébactéries
- Staphylocoques à coagulase négative (sauf S. saprophyticus)
- Micrococcus sp.
- Etc.
*Parfois, s’il y a beaucoup de ces bactéries, le laboratoire peut sortir un résultat que l’on doit nous-mêmes interpréter: ce n’est pas parce qu’une bactérie ressort de l’analyse qu’elle est la cause de l’infection.
Cystite: Quand y a-t-il présence de nitrites au SMU?
- Infection urinaire causée par des entérocoques : absence de nitrites au SMU, car ces bactéries ne possèdent pas la capacité de transformer les nitrates en nitrites
- vs
- Infection urinaire causée par des entérobactéries (dont E. Coli) : nitrites positifs, car possèdent la capacité de transformer les nitrates en nitrites.
Que signe la présence de leucocytes au SMU?
Leucocytes dans l’urine : signent une réaction inflammatoire
Pneumonie: Quelle est l’investigation nécessaire?
- hémoculture x2
- culture des expectoration
- radiographie pulmonaire
Pneumonie: Culture d’expectorations - Quand la demander?
- Pneumonie acquise en communauté : en externe, habituellement pas recommandée
Recommandée si : pneumonie nécessitant une hospitalisation/sévère, histoire de colonisation par des germes plus résistants, détérioration sous antibiotiques, hospitalisation récente et utilisation d’antibiotique dans les 3 derniers mois - Pneumonie nosocomiale : recommandée