Vortrag Transkription Prokaryoten Flashcards
Was benötigt die RNA-Polymerase im Gegensatz zur DNA-Polymerase nicht?
RNA-Polymerase braucht keinen Primer
Welche Aufgabe hat die RNA-Polymerase?
Kopplung von Ribonucleosidtriphosphaten (NTPs) um damit RNA zu bilden
Wie lange ist die Promotor Region ungefähr?
Ca. 40 bp lang
Wo ist die Promotor Region lokalisiert?
Stromaufwärts (5‘-Richtung) von Transkriptionsstartpunkt lokalisiert
Was ist die Pribnow-Box?
-> Anderer Namen bei Eukaryoten?
Höchst konservierte Promotor Region
Bei Prokaryoten ist es die Abfolge: 5’-TATAAT-3’
Bei Eukaryoten wird sie TATA-Box genannt
Was bezeichnet man bei der Transkription als “Holoenzym”?
Eine vollständige bakterielle Polymerase mit gebundenem Sigma-Faktor.
Aus wie vielen Untereinheiten besteht ein bei der Transkription funktionelles “Holoenzym”?
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Welche Untereinheit des “Holoenzyms” bei der Transkription ist für seine Wirkung essentiell wichtig und was ist seine Aufgabe?
Sigma-Faktoren (σ-Faktoren)
-> Ermöglichen die Bindung der RNA-Polymerase und dann die Transkription
-> Ohne σ-Faktor nur Bindung, aber keine Transkription
Wie groß (bp) ist eine Transkriptionsblase?
12-14 bp
Prokaryotische RNA-Transkription
Wie kommt es zur Bildung der Transkriptionsblase?
RNA-Polymerase bindet an Sigma Faktor -> Bildet Holoenzym
Holoenzym bindet an Promotor Bereich -> Doppelhelix wird aufgespalten und Basen freigelegt
In welche Richtung erfolgt die RNA Kettenverlängerung?
Von 5’ zu 3’
-> Heißt: Nukleophiler Angriff des 3‘-OH am anzufügenden NTP
Prokaryotische RNA-Transkription
Was macht ein Bakterium, wenn es RNA in größerer Menge benötigt?
Wenn RNA in großen Mengen benötigt wird z.B. rRNA dann wird die Transkription so oft es sterisch möglich ist initiiert (einmal pro Sekunde). Dies verursacht das pfeilspitzenähnliche Erscheinungsbild der transkribierten RNA.
Prokaryotische RNA-Transkription
Wie viele Fehler werden bei der Elongation der neu gebildeten RNA im Durchschnitt gemacht?
Fehlerrate ist 1:10.000
-> Aber ist meist unwichtig, da viele RNAs vorhanden und oft wirkt sich eine veränderte Base nicht stark auf die Funktion eines Proteins aus
Intrinsische Termination der prokaryotischen RNA-Transkription.
Nenne zwei Merkmale der Terminationssequenz.
1) G- /C-reiche palindromische Sequenz
2) Poly-Uracil Region d (3–8 Nukleotide)
(Hinweis: Die RNA-Polymerase kommt hier von links)
Rho-abhängige Termination der prokaryotischen RNA-Transkription.
Wie läuft dies ab?
Während die RNA-Polymerase in der Transkriptionsblase an der DNA entlang geht wird RNA neu synthetisiert.
1. Bildung von Erkennungssequenz auf RNA (Poly Cytosin)
2. Rho Monomere binden an Erkennungssequenz und bilden Hexamer
3. Unter ATP Verbrauch läuft das Rho Hexamer in Richtung der RNA-Polymerase (also 5’->3’)
4. Wenn das Rho Hexamer auf die Transkriptionsblase trifft wird die RNA freigesetzt und Polymerase, sowie Rho diffundieren ab
-> Beachte: Die RNA-Polymerase hält freiwillig an und das Rho Hexamer holt diese ein. Sonst würde Rho niemals die Polymerase erreichen können (zu langsam).
