VL 10 Nukleäre Rezeptoren II Flashcards
Wie sind nukleäre Rezeptoren aufgebaut?
A/B
C
D
E
F
A/B: N-terminal Domain
C: DNA binding Domain (DBD)
D: Hinge Region
E: Ligand binding Domain (LBD)
F: C-terminal Domain
Wodurch kommen die Unterschiede zwischen den Rezeptoren:
RAR Alpha, RAR Beta, RAR Gamma
Unterschiede kommen durch unterschiedliche AS in der LBD
Was ist die Aufgabe von Zinkfingerproteinen?
Vermitteln die Bindung an DNA
Die Polypeptidkette nimmt durch den Einbau des Zinkatoms eine schleifenförmige Struktur – den sogenannten Zinkfinger – ein, welche spezifisch mit der DNA oder auch RNA interagieren kann
Welche Aufgabe erfüllt das Zink Ion am Zinkfinger?
Die Polypeptidkette nimmt durch den Einbau des Zinkatoms eine schleifenförmige Struktur – den sogenannten Zinkfinger – ein, welche spezifisch mit der DNA oder auch RNA interagieren kann
Wie ist der Zinkfinger aufgebaut? (Sekundärstruktur)
α-Helix und antiparallele β-Faltblatt-Struktur
Über welche AS wird das Zink komplexiert?
Cystein und Histidin
Mittels welches Proteins kann die DBD mit der DNA wechselwirken?
Zinkfingerprotein
Wie findet ein Nukleärer Rezeptor Monomer seine richtige DNA Sequenz?
Muss nur die korrekte DNA Sequenz eines DNA Einzelstranges finden
Wie findet ein Nukleärer Rezeptor Heterodimer seine richtige DNA Sequenz?
Richtige DNA Abfolge auf einem DNA Einzelstrang
Wie findet ein Nukleärer Rezeptor Homodimer seine richtige DNA Sequenz?
Erkennt Palindromische Sequenzen
Wie ist die LBD normalerweise aufgebaut?
3-lagiges Sandwich aus a-Helices
-> Unpolare Kavität für den Liganden
Welches Enzym und welche AS ist meist bei der Repressionskontrolle betroffen?
Histon Deacetylase (HDAC)
Lysin besitzt positive Ladung und kann deshalb mit negativ geladener DNA interagieren -> Wenn acetyliert wird, geht diese Interaktion verloren
Wie liegt bei der “Ligand-abhängigen Aktivierung” der nukleäre Rezeptor (Heterodimer) OHNE Ligand an der DNA gebunden vor?
-> Effekt?
Heterodimer ist an HDAC co-repressor complex gebunden
-> Repression
Wie liegt bei der “Ligand-abhängigen Aktivierung” der nukleäre Rezeptor (Heterodimer) MIT Ligand an der DNA gebunden vor?
-> Effekt?
CBP und SRC lagern sich am Heterodimer an
-> Transkription
Wie liegt bei der “Ligand-UNabhängigen Aktivierung” der nukleäre Rezeptor (Monomer) inaktiv an der DNA gebunden vor?
-> Effekt?
Nur Monomer gebunden
-> Keine Repression, aber inaktiv
Wie liegt bei der “Ligand-UNabhängigen Aktivierung” der nukleäre Rezeptor (Monomer) aktiv an der DNA gebunden vor?
-> Effekt?
PGC muss binden!
-> Dann lagern sich CBP und SRC an und wirken aktivierend
Welche Eigenschaft der DNA ist für die Funktion eines Nukleären Rezeptor DIMERS entscheidend wichtig?
Der Spacer muss die richtige Länge (n) haben.
-> Wenn nur ein Nukleotid fehlt/zu viel ist, ist die DNA bereits um 36° weiter gedreht und das Dimer kann nicht mehr binden
