VL 3 RNA und Viren Flashcards
Was ist der Unterschied zwischen RNA und Retrovirus?
-> Welches Problem wird damit vom jeweiligen Virus gelöst?
Der Retrovirus wandelt seine RNA in DNA um und integriert es ins Wirtsgenom
-> Die durch Transkription erhaltene RNA durchläuft sämtliche Prozessierungsschritte wie eine humane RNA, auch das Capping!
RNA Virus kann direkt Translatiert werden
- > Sieht damit den Zellkern nie von innen.
- > Für das Virus zu lösende Problem: Wie erreicht es das Capping seiner RNA?
Wie löst das Hepatitis C Virus das Problem des Cappings?
Besitzt eine lange 5’ UTR mit einer 3D Struktur, mit der sie an das Ribosom binden kann
Wie lösen Corona Viren wie SARS und SARS-CoV-2 das Problem des Cappings?
Sie bringen ihre eigenen Enzyme mit und können damit eine Cap bauen
Hepatitis C besitzt eine lange 5’ UTR mit einer 3D Struktur, mit der sie an das Ribosom binden kann.
-> Wie nennt man solche Bereiche der RNA?
IRES: Internal Ribosomal Entry Site
Was versteht man unter Cap-Snatching?
Virus schneidet das Cap von einer zellulären RNA ab und setzt sie seiner eigenen RNA auf
Wie kann ein Virus dafür sorgen, dass seine RNA bevorzugt abgelesen wird?
Es existieren virale Proteasen, die Wirts-Translations-Iniationsfaktoren zerschneiden
-> Translation von Wirtsproteinen unterdrückt
Wie baut das Corona Virus die eigene Guanosin Cap?
- Ein Phosphat von viraler RNA abspalten
- Guanosin Cap aufsetzen
- Methylierung mittels Methyltransferase
Was ist an nsp14 besonders?
Es ist sowohl eine N7-Methyltransferase, als auch eine Exonuklease
Exonuklease Funktion betreibt “proof-reading” von neu gebildeter RNA (durch RNA abhängige RNA Polymerase)
-> SARS-CoV-2 mutiert relativ wenig im Vergleich zu anderen RNA-Viren
Wo findet Capping beim RNA Virus statt?
Wo findet Capping von humaner RNA statt?
Beim RNA Virus: Im Cytoplasma
Bei humaner RNA: Im Kern
Wie kann nach dem Capping die fertige RNA aus dem Kern transportiert werden?
Die fertige RNA bindet an RNA-bindende Proteine, die eine NES (Nukleäre Export Sequenz) besitzen.
Die NES wird erkannt und die RNA exportiert
Was lässt sich über den Export von RNA abhängig von Proteinen sagen?
Welcher Cofaktor ist sehr häufig?
Für unterschiedliche RNAs (tRNA, mRNA, siRNA etc.) existieren unterschiedliche Proteine mit unterschiedlichen Cofaktoren
Häufiger Cofaktor: Ran GTP
