VL 13 Gimpl Zellzyklus 2 Flashcards
Wie sind Cycline aufgebaut?
-> Welches Strukturmotiv?
Bestehen aus 5 Alpha Helices
(Besitzen nur Alpha Helices)
Cycline werden auf und abgebaut.
-> Dafür müssen diese Sequenzen besitzen, die ihren Abbau steuern.
Cycline D und E besitzen deshalb was?
Was besitzen Cycline A und B?
Cycline D und E: Besitzen “PEST” Sequenzen, die phosphoryliert und dann vom Proteasom abgebaut werden können
Cycline A und B: Besitzen “Destruction Box”, das Ubiquitinyliert und vom Proteasom abgebaut werden kann
Wie sieht die HECT-domain E3 aus und wie überträgt sie ein Ubiquitin?
Wie sieht der monomere Ringfinger (U-box E3) aus und wie überträgt er ein Ubiquitin?
Wie sieht die E3 Ligase Cullin-based Komplex aus und wie überträgt er ein Ubiquitin?
In grün: Langes gestrecktes Protein Cullin
Welche drei verschiedenen E3 Ligasen existieren?
HECT
Monomerer Ringfinger
Cullin basiert (SCF: Skp1, cullin, F-box)
Der Cullin basierte Komplex einer E3 Ligase besitzt eine F-Box. Was ist die Aufgabe davon?
-> Vorteil?
Die F-Box trägt ein spezifisches Arginin Muster
-> Kann damit Phosphorylierungsmuster erkennen und verschiedene Substrate unterscheiden
Welche zwei E3 Ligase Komplexe regulieren den Zellzyklus?
APC (Anaphase Promoting Complex) sieht wie Monomerer Ringfinger aus
SCF (Skp1, cullin, F-box)
Wie ist die Cdk aufgebaut (Inaktiv)? (4 Punkte nennen)
Alpha Helix
Beta Faltblatt
T-Loop
PSTAIRE Helix
Wo liegt bei der Cdk der T-Loop und warum heißt er so?
T: Threonin
Welche AS ist bei der PSTAIRE Helix wichtig und wohin zeigt es in der inaktiven und in der aktiven Cdk?
Glutamat
Inaktiv: Zeigt aus aktivem Zentrum raus
Aktiv: Zeigt ins aktive Zentrum rein
Welche zwei Schritte müssen zur Aktivierung der Cdk ablaufen?
Cyclin bindet an Cdk
-> T-Loop verändert seine Lage (Aktives Zentrum freigelegt) und Threonin wird phosphoryliert
-> PSTAIRE Helix Glutamat zeigt nicht mehr nach außen, sondern ins aktive Zentrum
Welche Aufgabe hat der phosphorylierte T-Loop in der Cdk?
Das phosphorylierte Threonin fungiert als ein Organisationszentrum und überbrückt verschiedene Bereiche der Cdk
Welche zwei Proteinfamilien stellen Inhibitoren der Cdk dar?
Ink4 (Inhibitors of kinase)
Cip/Kip
Was ist Ink4?
-> Wie groß?
-> Wie wirkt es?
Ist ein Cdk Inhibitor
Kleines Protein
Bindet an die Cdk und verhindert damit die Bindung an Cyclin
Was ist Cip/Kip
-> Wie groß ist es?
-> Wie wirkt es?
Ist ein Cdk Inhibitor
Großes Protein
Bindet an Cdk, welche Cyclin gebunden hat und blockiert die ATP Bindetasche
E2F muss für die Überwindung des Restriktionspunktes aktiviert werden.
-> Wodurch wird es inaktiviert?
pRB (Retinoblastoma Protein)
pRB inaktiviert E2F. Wie kann pRB von E2F für dessen Aktivierung entfernt werden?
pRB phosphorylieren mittels Cdk4
-> pRB dissoziiert ab
-> E2F aktiv
-> Transkription
