VL 2 Proteasom

Question 1

Ubiquitin

Aus wie vielen AS besteht dieses Protein?

An welche AS bindet Ubiquitin?

Answer 1

76 AS

Bindet an Lysine, die sich im Targetprotein befinden

Question 2

Wie wird Ubiquitin aktiviert?

Answer 2

1. Ubiquitin unter ATP Verbrauch auf ein Ubiquitin aktivierendes Enzym übertragen
2. Ubiquitin auf ein Ubiquitin konjugierendes Enzym übertragen
3. Ubiquitin konjugiertes Enzym bindet an Ubiquitin Ligase
4. Ligase ermöglicht Übertragung von Ubiquitin auf das Substrat

Question 3

Welche Bedeutung hat die Monoubiquitinylierung?

Welche Bedeutung hat die Multiubiquitinylierung?

Welche Bedeutung hat die Polyubiquitinylierung?

Answer 3

Question 4

Welcher Typ Protease ist das Proteasom?

Answer 4

Threonin

Question 5

Wo ist das Threonin, welches für die Protease Aktivität verantwortlich ist lokalisiert?

Answer 5

Threonin ist terminal am N-terminus lokalisiert

Question 6

Welche weitere Protease Funktionen finden sich in den Untereinheiten des Proteasoms?

Answer 6

Trypsin-Aktivität (b2-UE)

Chymotrypsin-Aktivität (b5-UE)

Caspase-Aktivität (b1-UE)

Question 7

Wie viele katalytische Zentren besitzt das Proteasom?

Answer 7

6

Question 8

Welches Pharmakophor wird gegen das Proteasom eingesetzt?

Answer 8

Bortezomib:

Boronsäure

Question 9

Welches neue Pharmakophor ist neben Boronsäure für das Proteasom einsetzbar?

Answer 9

Epoxiketon

Question 10

Welche Stuktur bilden Stoffe wie Carfilzomib, die ein Epoxiketon besitzen, durch Bindung an das Threonin des Proteasoms?

Answer 10

Bilden entweder Morpholin Ring oder Siebenring

Question 11

Welchen Namen haben Proteasom Inhibitoren?

Answer 11

Enden auf -zomib, z.B. Carfilzomib

Question 12

Ist die Bindung einer Boronsäure an Threonin kovalent reversibel oder irreversibel?

Answer 12

Kovalent Reversibel

Question 13

Protease Funktion

Substratspezifizität (P1) für

Trypsin-ähnliche Enzyme?

Chemotrypsin-ähnliche Enzyme?

Caspase-ähnliche Enzyme?

Answer 13

Trypsin-ähnlich : basische AS

Chemotrypsin-ähnlich: hydrophobe AS

Caspase-ähnlich: sauere AS

Question 14

Wie ist das 20S Proteasom aufgebaut? (Alpha und Beta Untereinheiten)?

Welcher Teil ist für Proteolyse verantwortlich?

Answer 14

• Alpha
• Beta
• Beta
• Alpha

Beta ist für Proteolyse verantwortlich

Question 15

Wie ist der Aufbau des 26S Proteasom?

Answer 15

• 19S
• Alpha
• Beta
• Beta
• Alpha
• 19S

Question 16

Was ist die Aufgabe von 19S des 26S Proteasoms?

Answer 16

Erkennung ubiquitinilyter Proteine

Question 17

Was ist c20S?

Was ist i20S?

Wie kommt man von c20S zu i20S? (Molekül)?

Answer 17

Konstitutives Proteasom

Immunproteasom

Interferon Gamma

Question 18

Wie viele Beta Untereinheiten die proteolytisch aktiv sind hat das Proteasom?

Welche Wirkung hat das Immunproteasom (Nur den Stichpunkt)

Answer 18

3

“Tryptisch”

Question 19

Welchen Terminus generiert das Proteasom?

Answer 19

Den C-Terminus

Question 20

Wie ist die HWZ von Proteinen im Zytosol?

Warum ist es so?

Answer 20

Ca. 5 Sekunden

Peptidasen schneiden Peptide

Question 21

Wie heißt die Aminopeptidase im ER?

Durch was wird sie induziert? (Molekül)

Was ist ihre Aufgabe?

Answer 21

ERAP1

Interferon Gamma induziert

MHC Peptid auf die richtige Länge bringen

Question 22

Wie lang ist das Peptid zu diesen Zeitpunkten:

Nach Proteasom

Cytosolische Aminopeptidase + Protease

Aminopeptidase im ER

Answer 22

Nach Proteasom: 15-10 AS

Nach Cytosol: Ungefähr 10 AS

Nach Aminopeptidase im ER: 10-8 AS

Question 23

Wie viele Peptidfragmente bildet das Proteasom pro Sekunde?

Wie viele werden davon auf der Oberfläche exprimiert?

Answer 23

2*10⁶

Davon 100-150 auf Oberfläche exprimiert