Vortrag Transkription Eukaryoten Flashcards
Wie viele verschiedene RNA-Polymerasen besitzt ein Prokaryot und wie viele ein Eukaryot?
Prokaryot: Eine
Eukaryot: Drei (RNAP I,II und III)
Wie ist die RNA-Polymerase bei Eukaryoten aufgebaut?
1) Wie viele Untereinheiten?
2) Was befindet sich im aktiven Zentrum?
-> Ladung des aktiven Zentrums ist damit?
3) Wie ist die Oberfläche der RNA-Polymerase geladen?
1) 2 große und 12 kleine
2) Zwei Magnesiumionen -> Positiv geladenes aktives Zentrum
3) Negativ geladen
Die RNA-Polymerase bei Eukaryoten trägt eine C-terminale Domäne (CDT).
-> Woraus besteht sie?
-> Wie hilft sie in der Regulation von Transkriptions- und Elongationsstart?
52 hochkonservierte Repeats
-> Die Konsensussequenz (Pro-Thr-Ser-Pro-Ser-Tyr-Ser) besitzt sehr viele OH-Gruppen und es kann viel zu Phosphorylierungen/Dephosphorylierungen kommen
Bedingung Transkriptionsstart: CTD dephosphoryliert
Bedingung Elongationsstart: CTD phosphoryliert
Wie sieht der Elongationskomplex, der sich durch Verbindung von RNA-Polymerase II und DNA bildet aus?
Beschreibe die Funktion des Elongationskomplexes.
-> Klammer
-> Wand
-> Ruder
Klammer: Fixierung der DNA in der Spalte der RNA-Polymerase
Wand: Umlenkung des Matrizenstranges um 90° „nach oben“
-> Matrizenbasen werden damit zum aktiven Zentrum gerichtet
Ruder: RNA-DNA-Hybridhelix Trennung
Über welche zwei Wege kann bei Eukaryoten die Transkription initiiert werden?
CpG-Inseln: GC-reiche Abschnitte stromaufwärts vom Transkriptionsstartpunkt -> Analog zu prokaryotischen Promotoren
Kernpromotor: Die Kernpromotorsequenzen interagieren mit ihren zugehörigen Proteinen, die wiederrum an der Initiationsstelle die RNA-Polymerase II rekrutieren.
Was sind Enhancer und Silencer?
Der typische Enhancer kann bis zu mehrere tausend Basen vor (upstream) oder hinter (downstream) dem Promoter liegen und trotzdem durch die Ausbildung von DNA-Schlaufen (loops) in die räumliche Nähe der Promotersequenz gebracht werden und die Transkription fördern.
Silencer hat den gegenteiligen Effekt
Wie heißen die Proteine, die mit der TATA-Box im Promotorbereich in der DNA der Eukaryoten wechselwirken können?
Transkriptionsfaktoren
Wofür steht TFII?
TF: Transkriptionsfaktor
II: Für RNA-Polymerase II
Wie wird der Präinitiationskomplex (PIC) aufgebaut?
-> Beachte die Eselsbrücke
- TFIID bindet über TBD (TATA-Box Bindedomäne) an TATA-Box
- Rekrutiert TFIIA und dann TFIIB
- TFIIF rekrutiert RNA-Polymerase II
- Es binden TFIIE und dann TFIIH
-> Präinitiationskomplex fertig
Wie lautet die Eselsbrücke für den Präinitiationskomplex?
- The Dog (D) eats the Apple (A)
- And plays with the Ball (B)
- He gets tired and sits in front of the Fan (F)
- Then he sees an Elephant (E)
- And runs away in the Helicopter (H)
Welche Funktion hat TFIIH im Präinitiationskomplex?
Besitzt Kinase Aktivität und phosphoryliert den C-Terminus der RNA-Polymerase II
-> RNA-Polymerase II wird von Komplex getrennt und kann an der DNA entlang laufen (Elongation)
Wie heißen die zwei Elongationsfaktoren?
TFEb (Transkriptions Faktor Elongation)
TFIIS
Welche Aufgabe hat TFEb?
Kinase -> Phosphoryliert den C-Terminus der RNA-Polymerase II -> Fördert Elongation. (Ähnlich wie TFIIH)
Welche Aufgabe hat TFIIS?
TFIIS fördert die Bewegung der RNA-Polymerase II und verhindert deren Stop.
