VL 3 RNA Allgemein Flashcards
Wie lautet das zentrale Dogma der Molekularbiologie?
DNA -> RNA -> Protein
Informationsfluss geht nur von DNA zu Protein, aber nicht zurück
D.h. aus DNA Sequenz kann die Proteinsequenz abgeleitet werden, aber nicht umgekehrt. Man kann nicht die Basentripplets vorhersagen.
Wie viel % macht RNA an der Biomasse (Trockenmasse!) einer Zelle aus?
Wie viel % des Körpergewichts macht RNA aus?
20 % der Zelle
5 % des Körpergewichts
Wie verhält sich der Anteil an nicht für Proteine codierende DNA abhängig von der Komplexität der Lebewesen?
Anteil an nicht Protein codierender DNA nimmt zu
Von was ist die Struktur von DNA und RNA abhängig?
DNA macht immer Alpha Helix -> Unabhängig von Sequenz
RNA macht komplexe räumliche Struktur -> Abhängig von Sequenz
Wie sieht die Auto Hydrolyse der RNA aus? (Reaktionsgleichung)
Welchen Zucker Pucker bevorzugt die DNA?
B-Form der DNA bevorzugt die C2’ endo Konformation
Welchen Zucker Pucker bevorzugt die RNA?
RNA bevorzugt die C3’ endo Konformation
Wie sieht ein Nukleosid aus?
Wie sieht ein Nukleotid aus?
Warum verwendet DNA Thymin und RNA Uracil?
Angenommen in der DNA würde anstatt Thymin Uracil verwendet werden:
- Cytosin desaminiert und wird zu Uracil (Dies kann immer auftreten)
- Cytosin war mit Guanin gepaart und da Cytosin jetzt ein Uracil ist, wird dieses Guanin als falsch erkannt
- Reparatur Mechanismen tauschen das eigentlich korrekte Guanin durch ein falsches Adenin aus
- > Mutation
Welches Kation wird meist zur Abschirmung der negativen Ladung der DNA verwendet?
Wofür verwendet RNA diese Kationen?
Magnesium
RNA verwendet die Kationen um die Sekundär, bzw. Tertiärstruktur zu stabilisieren
Welche Basenpaarung macht DNA und welche RNA?
DNA: Nur Watson-Crick-Basenpaare
RNA: Watson-Crick Basenpaare und non standard Basenpaare (Wobble und Hoogsteen)
Was ist das Wobble-Basenpaar?
-> In welchem Biomolekül ist es sehr wichtig?
G-U
- > Ist wichtig für Ioneninteraktionen und Ligandenbindung.
- > Damit können andere Proteine und Nukleinsäuren erkannt werden
Sehr wichtig für die tRNA -> Zur Erkennung der richtigen tRNA Synthetase -> Richtige AS koppeln
Wie sehen die Hoogsteen Basenpaare aus?
CGC
UAT
-> Erlauben der RNA Trippelstrukturen einzunehmen
Wer wird mehr modifiziert. Die DNA oder die RNA?
RNA wird deutlich mehr posttranskriptional modifiziert als DNA
Wie sieht ein Pseudoknoten bei der RNA aus?
Wie sehen Duplexe bei der RNA aus?
Praktisch Helixstruktur, aber hat auch nichtbindende Bereiche die “Loops” genannt werden
Wie sehen Tetraloops bei der RNA aus?
Wie sieht eine 4-stem junction bei der RNA aus?
Wie sieht tRNA aus?
-> 4 Bereiche der tRNA beschreiben
