VL 2 Ribosomenbiogenese II Flashcards
Ribosomen müssen prozessiert werden
Wie viele Uridine werden in Ribosomen in Pseudouridine überführt?
Wie heißt das Enzym für diese Umwandlung?
Ca. 100
Pseudouridinsynthase (Psi-Synthase)
Was passiert bei dieser Reaktion?
Was ist der Vorteil davon Uridin in Pseudouridin zu überführen?
Beachte die neue H-Donorfunktion
-> Bessere Stabilisierung der Tertiärstruktur
Wie viele verschiedene Pseudouridin Synthasen existieren?
Es gibt nur eine!
Wie ist es möglich Selektivität für die Pseudouridin Synthase zu erhalten, obwohl es nur eine einzige Pseudouridin Synthase existiert?
Nicht jedes Uridin wird umgewandelt und nicht jedes Uridin befindet sich in der selben Basensequenz!
Es existieren snoRNAs -> Diese legen fest an welcher Stelle eine Uridin in ein Pseudouridin überführt werden soll
Wofür steht snoRNA?
Small nucleolar RNA
Wie kann die snoRNA der Pseudouridin Synthase zeigen, an welcher Stelle diese ihre Wirkung zu vermitteln hat?
- snoRNA erkennt die rRNA über ihre komplementären Sequenzen (Pseudouridinylierungstaschen)
- In den Pseudouridinylierungstaschen kann die Pseudouridin Synthase die Umsetzung durchführen
Wie nennt man die snoRNA, die als Guide für die Pseudouridin Synthase fungiert?
H/ACA box snoRNA
rRNA wird methyliert.
An welcher Stelle findet diese Methylierung statt?
Wie heißt das Enzym, welches diese Umsetzung vermittelt?
Wie viele Enzyme gibt es hiervon für die rRNA?
-> Warum?
Methylierung findet an 2’O Stelle statt
Methyltransferase
Es gibt nur eine Methyltransferase hierfür
-> Wieder gelenkt über snoRNAs
Wie nennt man die snoRNA, die als Guide für die Methyltransferase bei rRNA fungiert?
C/D box snoRNA
Was ist ein Apoprotein?
(gr.: apo - von, prōton - das erste) bezeichnet man denjenigen Teil eines Proteins, der nur aus Aminosäuren besteht.
Besitzt noch keine prosthetische Gruppe!
Was ist ein Holoprotein?
Ein vollständiges Protein (gr. holos = ganz; Holoprotein)
Proteins aus Aminosäuren PLUS die Prosthetische Gruppe.
Wo findet man in der Natur neben der Modifikation von Ribosomen noch snoRNA, also guide bzw. tracer RNA?
Bei Crispr Cas9 (Tracer RNA)
Wo findet man snoRNAs?
Wo findet man CRISPR/Cas9?
snoRNAs: In Eukaryoten
CRISPR/Cas9: In Bakterien
Bakterien haben keine snoRNAs wie lösen sie das Problem der Uridine und der Pseudouridin Synthase?
Bakterien besitzen verschiedene Pseudouridin Synthasen, die jeweils ein einzelnes Uridin erkennen können
Die rRNA Basen werden durch Methyltransferasen methyliert
Wie viele Basenmethylierungen existieren?
Wie viele Methyltransferasen für Basen sind dafür notwendig?
20 Basen die methyliert werden
Jede Stelle im Ribosom besitzt ihre eigene Methyltransferase, also 20
Im Ribosom wird die rRNA an einer Base acp-yliert
Wofür steht acp?
Amino carboxy propyl transferase
Eine Base in der rRNA wird mehrfach modifiziert
- > Welche Modifikationen sind dies?
- > Was ist das Produkt?
- An N1 methyliert
- Uridin in Pseudouridin umgewandelt
- an der Base ACPyliert
Welchen Cofaktor benötigt die Methyltransferase und auch die Amino carboxy propyl transferase?
SAM
Wie sieht SAM aus?
Welche zwei Reste kann SAM übertragen?
Woher kommt die jeweilige Selektivität welche Gruppe jeweils übertragen wird?
Es hängt davon ab, welche Gruppe jeweils aus dem entsprechenden Enzym herausragt und angegriffen werden kann
Wie läuft eine Methylierung von Adenin in der N1 Position ab?
-> Welche AS ist hier für das Enzym wichtig?
Hier liegt bereits ein freies Elektronenpaar zum Angriff an SAM vor
Wie läuft eine Methylierung von Guanin in der N1 Position ab?
-> Welche AS ist hier für das Enzym wichtig?
Hier wird das freie Elektronenpaar durch Angriff eines Glutamats erzeugt
Wie läuft eine Methylierung von Cytosin in der C5 Position ab?
-> Welche AS ist hier für das Enzym wichtig?
Cystein bildet Intermediat
-> Ermöglicht dem Kohlenstoff den Angriff an SAM
