VL 3 RNA Modifikation Flashcards

1
Q

Wie hat man Splicing nachgewiesen?

A

Gebe resultierende virlae mRNA, die den Zellkern verlässt und virale DNA zusammen

  • > Sollte perfekt annealen
  • > Aber DNA schlägt Bögen!
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2
Q

Wie nennt man das erste Produkt der Transkription?

Wie nennt man den Prozess, der diese mRNA verändert?

Wie heißen die Bereiche, die den Zellkern verlassen?

Wie heißen die Bereiche, die im Zellkern verbleiben?

A

pre-mRNA

Splicing

Exons

Introns

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3
Q

Wie heißt das Enzym welches Splicing durchführt?

Aus welchen Komponenten besteht das Splicosom?

Wo findet das Splicing statt?

A

Splicosom, ist riesiger Ribonukleopartikel

  • Ribonukleotide (snRNAs): Small nuclear RNAs
  • Proteine

Ort des Splicings: Nukleus

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4
Q

Wofür steht snRNA?

Wo findet man diese?

A

Small nuclear RNA

Ist Bestandteil von Splicosom

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5
Q

Was ist “Alternatives Splicing”?

A

Spliceosom kann unterschiedliche RNA Abschnitte aus der pre-mRNA herausschneiden.

  • > Die unterschiedliche Rekombination von Exons führt zu verschiedenen Genprodukten
  • > Größere Variation des Proteasoms
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6
Q

Welches sind die Schritte mit denen das Spliceosom die Introns von den Exons trennt?

A

Der Teil zwischen Exon 1 und Exon 2, also das Intron soll herausgeschnitten werden

  1. Adenosin auf dem Intron in der Nähe von Exon 2 führt einen nukleophilen Angriff auf das 5’-Ende des Exon 1 aus
  2. Es entsteht ein ringförmiger RNA Strang, während Exon 1 vom Spliceosom festgehalten wird
  3. Am Adenosin wird geschnitten und es entsteht ein zirkuläres RNA Stück (Lariat)
  4. Exon 1 und Exon 2 werden fusioniert
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7
Q

Wie nennt man ein ringförmiges RNA Stück?

Wie entsteht es?

A

Lariat

Entsteht beim Splicing

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8
Q

Wie nennt man Enzyme, die RNA spalten können?

A

Ribonuklease

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9
Q

Wie sieht die Reaktion aus, die Ribonukleasen katalysieren?

Welche AS?

Wie sieht die Reaktionsgleichung aus?

A
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10
Q

Wie nennt man RNA die katalytisch aktiv sein kann?

A

Ribozyme

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11
Q

Aus welchen Untereinheiten besteht eine fertige mRNA?

A

5’ cap

5’ UTR

coding sequence

3’ UTR

3’ polyA tail

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12
Q

Wie sieht die 5’ cap aus?

A

7 Methyl Guanosin

Triphosphat Linker

2’ Methylierung an der zweiten Base

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13
Q

Was für einen Sinn hat die 5’ cap?

A

Schutz von Exonukleasen

Transport aus Zellkern möglich

Kann an Cap Binding Complex binden und damit Ribosomen rekrutieren

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14
Q

Wo findet Capping statt?

A

Im Zellkern!

-> Deshalb gibt es dies nur bei Eukaryoten

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15
Q

Wofür steht 5’ UTR?

Welche Aufgabe besitzt dieser Bereich allgemein

-> Welche zwei wichtige Bereiche existieren hier für Prokaryoten?

A

Untranslated Region

Dient allgemein als Bindestelle für Proteine, die die Transkription beeinflussen

Bei Prokaryoten befinden sich hier die Shine-Dalgaro Sequenz und Riboswitches

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16
Q

Was macht die Shine-Dalgaro Sequenz in der 5’ UTR?

A

Ist komplementär zur 16S RNA des Ribosoms

-> Kann damit das Ribosom für die Translation rekrutieren

17
Q

Was ist die Aufgabe von Riboswitches?

  • > Aus was bestehen sie?
  • > Was binden sie?
  • > Was bewirken sie damit?
A

Sind komplexe RNA Strukturen

Können Liganden wie SAM/SAH oder andere Nukleotide oder AS binden

Dienen der Genregulation und können an oder aus “switchen”

18
Q

Erkläre Riboswitche am Beispiel eines Cofaktors (z.B. Vitamin)

A

Wenn ein Cofaktor Mangelware ist, kann kein Cofaktor an die RNA binden

  • > Proteine die diesen Cofaktor aufnehmen werden gebildet
  • > Cofaktor wird in die Zelle aufgenommen und bindet an RNA (Riboswitches)
  • > Konformationsänderung der RNA, es bildet sich ein Hairpin aus
  • > Hairpin deckt Shine-Dalgaro Sequenz ab
  • > Translation wird gestoppt
19
Q

Was für einen Sinn hat das 3’ poly A tail?

  • > Wo befindet sie sich?
  • > Was passiert wenn die RNA “altert”?
A

Befindet sich am Ende der RNA

Verkürzt sich, umso älter die RNA wird -> Damit wird die HWZ der RNA festgelegt

Ihre Aufgabe: Schutz vor Abbau