VL 3 RNA Modifikation Flashcards
Wie hat man Splicing nachgewiesen?
Gebe resultierende virlae mRNA, die den Zellkern verlässt und virale DNA zusammen
- > Sollte perfekt annealen
- > Aber DNA schlägt Bögen!
Wie nennt man das erste Produkt der Transkription?
Wie nennt man den Prozess, der diese mRNA verändert?
Wie heißen die Bereiche, die den Zellkern verlassen?
Wie heißen die Bereiche, die im Zellkern verbleiben?
pre-mRNA
Splicing
Exons
Introns
Wie heißt das Enzym welches Splicing durchführt?
Aus welchen Komponenten besteht das Splicosom?
Wo findet das Splicing statt?
Splicosom, ist riesiger Ribonukleopartikel
- Ribonukleotide (snRNAs): Small nuclear RNAs
- Proteine
Ort des Splicings: Nukleus
Wofür steht snRNA?
Wo findet man diese?
Small nuclear RNA
Ist Bestandteil von Splicosom
Was ist “Alternatives Splicing”?
Spliceosom kann unterschiedliche RNA Abschnitte aus der pre-mRNA herausschneiden.
- > Die unterschiedliche Rekombination von Exons führt zu verschiedenen Genprodukten
- > Größere Variation des Proteasoms
Welches sind die Schritte mit denen das Spliceosom die Introns von den Exons trennt?
Der Teil zwischen Exon 1 und Exon 2, also das Intron soll herausgeschnitten werden
- Adenosin auf dem Intron in der Nähe von Exon 2 führt einen nukleophilen Angriff auf das 5’-Ende des Exon 1 aus
- Es entsteht ein ringförmiger RNA Strang, während Exon 1 vom Spliceosom festgehalten wird
- Am Adenosin wird geschnitten und es entsteht ein zirkuläres RNA Stück (Lariat)
- Exon 1 und Exon 2 werden fusioniert
Wie nennt man ein ringförmiges RNA Stück?
Wie entsteht es?
Lariat
Entsteht beim Splicing
Wie nennt man Enzyme, die RNA spalten können?
Ribonuklease
Wie sieht die Reaktion aus, die Ribonukleasen katalysieren?
Welche AS?
Wie sieht die Reaktionsgleichung aus?
Wie nennt man RNA die katalytisch aktiv sein kann?
Ribozyme
Aus welchen Untereinheiten besteht eine fertige mRNA?
5’ cap
5’ UTR
coding sequence
3’ UTR
3’ polyA tail
Wie sieht die 5’ cap aus?
7 Methyl Guanosin
Triphosphat Linker
2’ Methylierung an der zweiten Base
Was für einen Sinn hat die 5’ cap?
Schutz von Exonukleasen
Transport aus Zellkern möglich
Kann an Cap Binding Complex binden und damit Ribosomen rekrutieren
Wo findet Capping statt?
Im Zellkern!
-> Deshalb gibt es dies nur bei Eukaryoten
Wofür steht 5’ UTR?
Welche Aufgabe besitzt dieser Bereich allgemein
-> Welche zwei wichtige Bereiche existieren hier für Prokaryoten?
Untranslated Region
Dient allgemein als Bindestelle für Proteine, die die Transkription beeinflussen
Bei Prokaryoten befinden sich hier die Shine-Dalgaro Sequenz und Riboswitches
Was macht die Shine-Dalgaro Sequenz in der 5’ UTR?
Ist komplementär zur 16S RNA des Ribosoms
-> Kann damit das Ribosom für die Translation rekrutieren
Was ist die Aufgabe von Riboswitches?
- > Aus was bestehen sie?
- > Was binden sie?
- > Was bewirken sie damit?
Sind komplexe RNA Strukturen
Können Liganden wie SAM/SAH oder andere Nukleotide oder AS binden
Dienen der Genregulation und können an oder aus “switchen”
Erkläre Riboswitche am Beispiel eines Cofaktors (z.B. Vitamin)
Wenn ein Cofaktor Mangelware ist, kann kein Cofaktor an die RNA binden
- > Proteine die diesen Cofaktor aufnehmen werden gebildet
- > Cofaktor wird in die Zelle aufgenommen und bindet an RNA (Riboswitches)
- > Konformationsänderung der RNA, es bildet sich ein Hairpin aus
- > Hairpin deckt Shine-Dalgaro Sequenz ab
- > Translation wird gestoppt
Was für einen Sinn hat das 3’ poly A tail?
- > Wo befindet sie sich?
- > Was passiert wenn die RNA “altert”?
Befindet sich am Ende der RNA
Verkürzt sich, umso älter die RNA wird -> Damit wird die HWZ der RNA festgelegt
Ihre Aufgabe: Schutz vor Abbau
