Vorlesung 5: Threonin Protease (Proteasom) Flashcards
Welcher Typ Protease ist das Proteasom?
Threonin
Wo ist das Threonin, welches für die Protease Aktivität verantwortlich ist lokalisiert?
Threonin ist terminal am N-terminus lokalisiert
Welche weitere Protease Funktionen finden sich in den Untereinheiten des Proteasoms?
Trypsin-Aktivität (b2-UE)
Chymotrypsin-Aktivität (b5-UE)
Caspase-Aktivität (b1-UE)
Wie viele katalytische Zentren besitzt das Proteasom?
6
Welches Pharmakophor wird gegen das Proteasom eingesetzt?
Bortezomib:
Boronsäure
Welches neue Pharmakophor ist neben Boronsäure für das Proteasom einsetzbar?
Epoxiketon
Welchen Namen haben Proteasom Inhibitoren?
Enden auf -zomib, z.B. Carfilzomib
Welche Stuktur bilden Stoffe wie Carfilzomib, die ein Epoxiketon besitzen, durch Bindung an das Threonin des Proteasoms?
Bilden entweder Morpholin Ring oder Siebenring
Ist die Bindung einer Boronsäure an Threonin kovalent reversibel oder irreversibel?
Kovalent Reversibel
Welche dieser elektrophilen Peptidomimetika binden kovalent reversibel und welche kovalent irreversibel?
Peptidyl:
- Aldehyd reversibel
- Methylketon reversibel
- Trifluormethylketon reversibel
- Nitril reversibel
- Chlormethylketon irreversibel
- Diazomethylketon irreversibel
- Ketocarbonsäure reversibel
- Epoxid irreversibel
Protease Funktion
Substratspezifizität (P1) für
Trypsin-ähnliche Enzyme?
Chemotrypsin-ähnliche Enzyme?
Caspase-ähnliche Enzyme?
Trypsin-ähnlich : basische AS
Chemotrypsin-ähnlich: hydrophobe AS
Caspase-ähnlich: sauere AS
Wie ist das 20S Proteasom aufgebaut? (Alpha und Beta Untereinheiten)?
Welcher Teil ist für Proteolyse verantwortlich?
- Alpha
- Beta
- Beta
- Alpha
Beta ist für Proteolyse verantwortlich
Wie ist der Aufbau des 26S Proteasom?
- 19S
- Alpha
- Beta
- Beta
- Alpha
- 19S
Was ist die Aufgabe von 19S des 26S Proteasoms?
Erkennung ubiquitinilyter Proteine
Was ist c20S?
Was ist i20S?
Wie kommt man von c20S zu i20S? (Molekül)?
Konstitutives Proteasom
Immunproteasom
Interferon Gamma
Wie viele Beta Untereinheiten die proteolytisch aktiv sind hat das Proteasom?
Welche Wirkung hat das Immunproteasom (Nur den Stichpunkt)
3
“Tryptisch”
Welchen Terminus generiert das Proteasom?
Den C-Terminus
Wie ist die HWZ von Proteinen im Zytosol?
Warum ist es so?
Ca. 5 Sekunden
Peptidasen schneiden Peptide
Wie heißt die Aminopeptidase im ER?
Durch was wird sie induziert? (Molekül)
Was ist ihre Aufgabe?
ERAP1
Interferon Gamma induziert
MHC Peptid auf die richtige Länge bringen
Wie lang ist das Peptid zu diesen Zeitpunkten:
Nach Proteasom
Cytosolische Aminopeptidase + Protease
Aminopeptidase im ER
Nach Proteasom: 15-10 AS
Nach Cytosol: Ungefähr 10 AS
Nach Aminopeptidase im ER: 10-8 AS
Wie viele Peptidfragmente bildet das Proteasom pro Sekunde?
Wie viele werden davon auf der Oberfläche exprimiert?
2*106
Davon 100-150 auf Oberfläche exprimiert
