Vorlesung 5: Threonin Protease (Proteasom)

Question 1

Welcher Typ Protease ist das Proteasom?

Answer 1

Threonin

Question 2

Wo ist das Threonin, welches für die Protease Aktivität verantwortlich ist lokalisiert?

Answer 2

Threonin ist terminal am N-terminus lokalisiert

Question 3

Welche weitere Protease Funktionen finden sich in den Untereinheiten des Proteasoms?

Answer 3

Trypsin-Aktivität (b2-UE)

Chymotrypsin-Aktivität (b5-UE)

Caspase-Aktivität (b1-UE)

Question 4

Wie viele katalytische Zentren besitzt das Proteasom?

Answer 4

6

Question 5

Welches Pharmakophor wird gegen das Proteasom eingesetzt?

Answer 5

Bortezomib:

Boronsäure

Question 6

Welches neue Pharmakophor ist neben Boronsäure für das Proteasom einsetzbar?

Answer 6

Epoxiketon

Question 7

Welchen Namen haben Proteasom Inhibitoren?

Answer 7

Enden auf -zomib, z.B. Carfilzomib

Question 8

Welche Stuktur bilden Stoffe wie Carfilzomib, die ein Epoxiketon besitzen, durch Bindung an das Threonin des Proteasoms?

Answer 8

Bilden entweder Morpholin Ring oder Siebenring

Question 9

Ist die Bindung einer Boronsäure an Threonin kovalent reversibel oder irreversibel?

Answer 9

Kovalent Reversibel

Question 10

Welche dieser elektrophilen Peptidomimetika binden kovalent reversibel und welche kovalent irreversibel?

Answer 10

Peptidyl:

• Aldehyd reversibel
• Methylketon reversibel
• Trifluormethylketon reversibel
• Nitril reversibel
• Chlormethylketon irreversibel
• Diazomethylketon irreversibel
• Ketocarbonsäure reversibel
• Epoxid irreversibel

Question 11

Protease Funktion

Substratspezifizität (P1) für

Trypsin-ähnliche Enzyme?

Chemotrypsin-ähnliche Enzyme?

Caspase-ähnliche Enzyme?

Answer 11

Trypsin-ähnlich : basische AS

Chemotrypsin-ähnlich: hydrophobe AS

Caspase-ähnlich: sauere AS

Question 12

Wie ist das 20S Proteasom aufgebaut? (Alpha und Beta Untereinheiten)?

Welcher Teil ist für Proteolyse verantwortlich?

Answer 12

• Alpha
• Beta
• Beta
• Alpha

Beta ist für Proteolyse verantwortlich

Question 13

Wie ist der Aufbau des 26S Proteasom?

Answer 13

• 19S
• Alpha
• Beta
• Beta
• Alpha
• 19S

Question 14

Was ist die Aufgabe von 19S des 26S Proteasoms?

Answer 14

Erkennung ubiquitinilyter Proteine

Question 15

Was ist c20S?

Was ist i20S?

Wie kommt man von c20S zu i20S? (Molekül)?

Answer 15

Konstitutives Proteasom

Immunproteasom

Interferon Gamma

Question 16

Wie viele Beta Untereinheiten die proteolytisch aktiv sind hat das Proteasom?

Welche Wirkung hat das Immunproteasom (Nur den Stichpunkt)

Answer 16

3

“Tryptisch”

Question 17

Welchen Terminus generiert das Proteasom?

Answer 17

Den C-Terminus

Question 18

Wie ist die HWZ von Proteinen im Zytosol?

Warum ist es so?

Answer 18

Ca. 5 Sekunden

Peptidasen schneiden Peptide

Question 19

Wie heißt die Aminopeptidase im ER?

Durch was wird sie induziert? (Molekül)

Was ist ihre Aufgabe?

Answer 19

ERAP1

Interferon Gamma induziert

MHC Peptid auf die richtige Länge bringen

Question 20

Wie lang ist das Peptid zu diesen Zeitpunkten:

Nach Proteasom

Cytosolische Aminopeptidase + Protease

Aminopeptidase im ER

Answer 20

Nach Proteasom: 15-10 AS

Nach Cytosol: Ungefähr 10 AS

Nach Aminopeptidase im ER: 10-8 AS

Question 21

Wie viele Peptidfragmente bildet das Proteasom pro Sekunde?

Wie viele werden davon auf der Oberfläche exprimiert?

Answer 21

2*10⁶

Davon 100-150 auf Oberfläche exprimiert