Vorlesung 5: Proteasen Grundlagen Flashcards
Exopeptidasen/Endopeptidasen (Proteinasen)
Wo schneidet eine Exopeptidase?
Wo schneidet eine Endopeptidase?
Exopeptidase schneidet die letzte AS eines Peptidstrangs
Endopeptidase schneidet an einer bestimmten Erkennungssequenz im Peptidstrang
Wo schneidet eine Dipeptidylpeptidase?
Wo schneidet eine Peptidyldipeptidase?
Ist eine Exopeptidase und schneidet die zwei letzten AS am N-Ende ab
Ist eine Exopeptidase und schneidet die zwei letzten AS am C-Ende ab
Wo schneidet eine Aminopeptidase?
Wo schneidet eine Carboxypeptidase?
Ist eine Exopeptidase und schneidet die letzte AS am N-Ende ab
Ist eine Exopeptidase und schneidet die letzte AS am C-Ende ab
Wie wird ein Peptidstrang gezeichnet? (Richtung von N- und C-Terminus nennen)
Beginne links mit dem N-Terminus und zeichne die Peptidkette, ende rechts mit C-Terminus
Wie wird die Stelle an der eine Endopeptidase schneidet bezeichnet?
-> Einmal die einzelnen AS und einmal die Bindetaschen des Enzyms
links N-Terminus
rechts C-Terminus
Sequenzierung Peptidase
Was ist der Clan?
Wofür steht z.B. “CA”?
Selbe evolutionäre Herkunft
Ähnliche Proteinfaltung
Erster Buchstabe zeigt die katalysierte Reaktion. C = Cystein-Protease
Zweiter Buchstage ist eine Sequenz A-Z
Sequenzierung Peptidase
Was ist die Familie?
Wofür steht z.B. “C1”?
Ähnliche AS Sequenz
Familien sind um typische Beispiele gebildet, denen die Proteasen ähneln
Erster Buchstabe zeigt die katalysierte Reaktion. C = Cystein-Protease
Das zweite ist eine zugeordnete Nummer
Sequenzierung Peptidase
Was ist die Peptidase?
Wofür steht z.B. “C01.001”?
Eine Peptidase ist ein einzelnes Enzym
Die Zahl ist eine Identifikationsnummer