Genexpression Und Transkription Flashcards
Transkripte der RNA-Pol I
5,8S, 18S, 28S rRNA
Transkripte der RNA-Pol II
hnRNA (Vorläufer von mRNA)
miRNA
snRNA
snoRNA
Transkripte der RNA-Pol III
tRNA
rRNA
snRNA
snoRNA
Nenne DNA-bindende Transkriptionsfaktoren
Zinkfinger: Zn durch 2 Histidin- und 2 Cysteinresten gebunden
Leucin-Zipper
Helix-Loop-Helix
Homöobox-Domäne mit Helix-Turn-Helix-Motiv
Über welches Strukturmotiv binden Transkriptionsfaktoren an die DNA?
Alpha-Helix mit basischen Aminosäureresten
Woraus besteht der Präinitiationskomplex?
Allgemeine Transkriptionsfaktoren, RNA-Pol binden an TATA-Box, CAAT-Box, GC-Box
Was ist hnRNA?
Vorläufer von mRNA, wird posttranslational modifiziert (Cappping, Splicing, Polyadenylierung, RNA-Editing)
Wie ist die Cap der mRNA aufgebaut und an welchem Ende befindet sie sich?
am 5’Ende
7-Methylguanylat = Guanosin mit Methylgruppe am N7 ist über 3 Phosphatreste an 5’-Ribose gebunden
Was für Reaktionen finden beim Spleißen statt?
Umesterungsreaktionen
Woraus besteht ein Spleißosom?
- snRNAs an Proteine gebunden —> bilden snRNPs
- Kleine Proteine
- hnRNA
Was ist die Verzweigungsstelle beim Spleißen?
Adenin im Intron, an dem sich eine lassoähnliche Struktur ausbildet
Beschreibe die Umesterungsreaktionen beim Spleißen
- Nukleophiler Angriff der 2’OH-Gruppe am Adeninnukleotid der Verzweigungsstelle auf die Phosphadiesterbindung an der 5’-Spleißstelle
- lassoähnliche Struktur mit 2’—>5’-Phosphodiesterbindung - Öffnung der Exon-Intron-Grenze an 3’-Spleißstelle, Exon-Enden werden zusammengefügt
Nenne Beispiele des RNA-Editings
A zu I-Editing: Adenin wird durch Desaminierung zu Hypoxanthin umgewandelt
C-zu-U-Editing: Cytosin wird zu Uracil desaminiert
—> statt Apo-B100 wird Apo-B48 hergestellt
Wo liegen Enhancer? Was ist ihre Aufgabe?
Sind distal regulatorische Elemente, erhöhen Transkriptionsrate wenn spezifische Transkriptionsfaktoren an sie binden
Beispiel Enhancer-Sequenz: HRE
Was sind die Folgen?
Hypoxia-induzierter Faktor = spezifischer Transkriptionsfaktor, bindet bei Sauerstoffmangel an HRE—Sequenz —> Expression von EPO und VEGF
Bei Normoxie: alpha-UE von HIF-1 wird durch HIF-Prolylhydrolyase hydroxyliert —> ubiqitiniert —> Abbau