DNA & RNA Flashcards
Was ist ein Nukleosid? Was für eine Bindung liegt vor?
Base + Zucker
N-glykosidische Bindung
Was ist ein Nukelotid? Welche Bindung liegt vor?
Base + Zucker + Phosphatrest = Nukleosid + Phosphatrest
Esterbindung
Wie sind die zuckerreste der Nukleinsäuren verknüpft?
Über Phosphodiesterbrücken
Wie sieht ein Cytosin aus? Was ist das Grundgerüst?
Pyrimidin
Ein Ring, Aminogruppe
Was für ein Grundgerüst hat Thymin und wie unterscheidet es sich von anderen Basen?
Pyrimidin
Ein Ring, Methylgruppe
Was ist das Grundgerüst von Adenin und wie unterscheidet es sich von anderen Basen?
Purin
2 Ringe, Aminogruppe auf 12 Uhr
Was ist das Grundgerüst von Guanin und wie unterscheidet es sich von anderen Basen?
Purin
2 Ringe, Aminogruppe auf 8 Uhr
Was ist das Grundgerüst von Uracil und wie unterscheidet es sich von den anderen Basen?
Pyrimidin
1 Ring, 2 C=O und 2 NH
Wie heißt das Nukleosid von Hypoxanthin?
Inosin
Wie heißt das Nukleosid von Xantin?
Xanthosin
Wo kommt Hypoxanthin vor?
Seltene Base in RNA, bspw. Beim RNA-Editing
Wie unterscheidet sich die Desoxyribose von der Ribose?
Kein OH am C2’-Atom
Wie sind Pentose und Base verknüpft?
C1’-Atom der Pentose mit N9-Atom von Purinen bzw. N1-Atom von Pyrimidinen
Welche Bindungen bestehen zwischen
- Ribose und Phosphatrest
- Zwischen Phosphatresten
- Phosphorsäureesterbindung
2. Phosphorsäureanhydridbindung
Welcher Zucker ist in ATP enthalten?
Ribose
Eigenschaften der B-DNA
Rechtsgängige Doppelhelix
10 Bp / Helixwindung —> 3,4 nm
Basen stehen senkrecht zur Achse
Eigenschaften A-DNA
Rechtsgängige Doppelhelix
Breiter und kürzer als B-DNA
Basenpaare schräg zur Achse
Eigenschaften Z-DNA
Linksgänginge Doppelhelix
Geringerer Druchmesser
Phosphatgruppen des Rückgrats bilden Zickzacklinie
Mit welcher Sequenz endet das 3’OH Ende der tRNA? Warum ist dies immer gleich?
CCA
Bindestelle für Aminosäure
besondere Strukturmerkmale der tRNA
3’OH Ende mit Sequenz CCA
Dihydrouridinschleife
TPsiC-Schleife (Pseudouridin)
65-110 Nukleotide
Bestandteile der rRNA
18S: kleine Untereinheit
5S, 5,8S, 28S: große Untereinheit des Ribosoms
Welche rRNA ist für die Bildung der Peptidbindung am Ribosom zuständig? Wie wird sie daher bezeichnet?
28S-rRNA ist ein Ribozym
Was sind snRNA?
Bestandteile des Spleißosoms
Was sind snoRNA?
Small nucleolar RNA
Modifizieren RNA-Moleküle
Was ist die Aufgabe der miRNA?
Regulieren Genexpression durch bindung an komplementäre mRNA —> Abbau
Was sind siRNA?
Regulatorisch, binden exakt komplementäre mRNA und bauen sie dadurch ab
Small interfering RNA, werden von außen in Zelle eingebracht
Was sind die Mechanismen der RNA-Interferenz?
Inhibition der Translation
Destabilisierung der mRNA durch Entfernung von Poly-A-Schwanz / 5’Cap
Abbau der mRNA
Wie viel % des Kerngenoms machen Exons aus?
1 % kodiert für Proteine
Wofür sind die Anteile des Kerngenoms, die nicht für gene kodieren?
45 % Wiederholungssequenzen: Makro-/ Mini-/Mikrosatelliten-DNA
Eigenschaften von Histonproteinen
Positiv geladen durch Arginin und Lysin
—> ionische Wechselwirkung mit DNA
Was ist die Aufgabe der Histone?
Setuerung der Genexpression durch posttranslationale Modifikation der Histone, z.B. durch Acetylierung von Lysin —> Ablösung von DNA
Was ist ein Nukleosom?
DNA + Histonoctamer
Woraus besteht Chromatin?
DNA, Histonproteinen, Nicht-Histonproteinen
Was kenzeichnet konstitutives heterochromatin?
Nicht-kodierende, repititive DNA-Sequenzen, kondensiert
Was kennzeichnet fakultatives Heterochromatin?
Kodierendierende DNA-Sequenzen, liegen optional als Heterochromatin vor, können zu Euchromatin entpackt werden
Was sind pseudoautosomale Regionen (PAR)?
DNA-Abschnitte, die sowohl auf X-/Y-Chromosom liegen, wobei sich PAR1 auf dem kurzen Arm und PAR2 auf dem langen Arm befindet
Wodurch werden Schwesterchromatiden verbunden?
Am Zentromer mittels Cohesinen
Welche Arten von Chromosomen gibt es bezüglich der Lage des Zentromers?
Submetazentrisch: kurzer p-Arm, langer q-Arm
Metazentrisch: Zentromer mittig
Akrozentrisch; Zentromer fast endständig
