Viro : ROTAVIRUS Flashcards
24/09/24 => Bousarghin
Je te dis rotavirus tu dis :
1ère cause de gastro-entérite infectieuse aiguës chez les enfants de moins de 5 ans +++, diarrhées très sévères
Réservoir des rotavirus ?
l’Ho mais virus présent en quantité importante dans l’environnement et les eaux usées
Transmission du rotavirus ?
- féco-orale
- interhumaine
- véhiculée par les mains
- indirecte par les surfaces et objets contaminés par des fèces ou des vomissures
Epidémiologie des rotavirus ?
- responsables d’environ 20 000 hospitalisations chaque année (Fr)
- 1ère cause d’infections nosocomiales dans les services pédiatriques pdt la saison épidémique
- infections saisonnières et surviennent durant les mois d’hiver
Quelles sont les principales combinaison génotypique de rotavirus présents en Fr ?
1) G1 P[8]
2) G9 P[8]
3) G3 P[8]
4) G2 P[4]
=> abs pour la 5ème saison consécutive de la circulation du génotype G4P[8]
Taxonomie des rotavirus ?
Ordre : Reovirales
Famille : Sedoreoviridae
Genre : Rotavirus
Quels sont les genres de la sous-famille Sedoreoviridae ?
· Cardoreovirus
· Mimoreovirus
· Orbivirus
· Phytoreovirus
· Rotavirus (ABCDFGHIJ)
· Seadornavirus
Structure générale des rotavirus ?
· Virus à ARN double brin segmenté en 11 segments d’ARN bicaténaires
· Capside icosaédrique composée de 3 couches concentriques
· Virus nu en forme de roue, sans enveloppe donc résistant dans le milieu extérieur
· Taille de 100 nm
Caractéristiques du génomes des rotavirus ?
- 11 segments de génome
- possibilité de réassortiment génétique entre ces segments
- mélange d’une souche à l’autre : réassortiment entre des rotavirus bovins et des rotavirus humains
Variabilité génétique des Rotavirus ?
= Réassortiment de segments d’ARN entre les ≠ souches d’un même groupe ou réarrangement des séq d’un même segment
Pour quoi codent les segments du génome des Rotavirus ?
· 6 protéines structurales (VP 1, 2, 3, 4, 6, 7)
· 6 protéines non structurales (NSP1 à 6) impliquées dans la multiplication du virus: la + importante = NSP4 qui correspond à l’entérotoxine virale : protéine majeure de virulence
Organisation de la capsides des rotavirus ?
=> Prot VP : 3 couches
· capside externe : Glycoprotéine VP7 et la protéine VP4 (attachement du virus aux cellules)
· capside intermédiaire : protéine VP6 ++ = Ag permettant de faire une classification en groupes et en sous-groupes de rotavirus, importante pour le typage
· capside interne ou core : protéine VP2 (majoritaire) et 2 autres protéines minoritaires : VP1 (activité ARN polymérase) et VP3 (protéine qui va se lier à ses ARN polymérase) → protéines du core permettent la transcription et la réplication du virus
Propriétés antigéniques des protéines VP des rotavirus ?
9 sérogroupes de rotavirus de A à J :
* groupes A, B et C = responsables d’infections humaines et animales
* groupe A est responsable de la plupart des gastro- entérites à Rotavirus
* différenciation en sérotype implique des protéines de capsides : VP4 et VP7
Comment sont classées les génotypes des rotavirus ?
analyse la séquence codant VP4 et VP7, on parle de génotypes :
· génotype G (Glycoprotéine) (VP7)
· génotype P (Protéase) (VP4)
Il y a concordance entre le sérotype et génotype pour G mais ce n’est pas toujours le cas pour P : on définit (P) génotype et [P] phénotype
Caractéristiques des protéines non structurales des rotavirus ?
=> NSP1 à NSP6
* apparaissent durant le cycle de multiplication du virus, dans le virus elles ne sont pas mature
* Rôle important dans la pathogénie de la maladie
Caractéristiques de la protéine NSP 4 des rotavirus ?
- rôle important dans le mécanisme de la diarrhée => entérotoxine
- augmentation du calcium intracellulaire → provoque l’ouverture d’un canal Cl-/Ca2+ → fuite de Cl- et d’eau à l’extérieur de la lumière donc entraîne une diarrhée
Cycle de multiplication des rotavirus ?
- Attachement du virus à la protéine VP4 + pénétration dans la cellule par endocytose : clivage de VP4 en 2 fragments VP5 et VP8 → augmente la perméabilité de la membrane et la pénétration du virus
- Décapsidation partielle dans le cytoplasme
- Activation de l’ARN polymérase virale (VP1) → transcrit chaque segment d’ARN à l’intérieur du virus partiellement encapsidé → obtenir plusieurs brins d’ARN
- ARN+ → sortir par les canaux de la capside → utilisés comme ARNm pour la synthèse du brin d’ARN - ou pour la synthèse de prot virales après traduction directement au niveau des ribosomes
- Synthèse des protéines virales qui vont se concentrer dans des inclusions = viroplasmes où aura lieu la réplication et l’assemblage du génome et des protéines virales. Les particules virales ainsi formées vont ensuite se retrouver dans le cytoplasme
- particules virales en formation vont ê internalisées dans le RE grâce à la protéine transmembranaire NSP4
- Les nouvelles particules virales sont libérées par lyse cellulaire ou transport vésiculaire spécialisé indépendant du Golgi, et vont pouvoir aller infecter d’autres cellules
Période d’incubation des rotavirus ?
3 jours
Physiopathologie du rotavirus ?
Entrée du virus par voie orale virus résiste au pH acide de l’estomac et aux enzymes digestives → se réplique dans l’intestin → infecte les entérocytes (villosités de l’intestin grêle) → Changements structuraux et fonctionnels
Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez le nouveau-né ?
- infections nosocomiales sporadiques dans les maternités
- souvent asymptomatiques
- rares cas d’entérocolites nécrosantes
Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez le nourrisson et jeune enfant ?
- gastro-entérites aiguës avec des vomissements importants
- déshydratation importante
- peut nécessiter une hospitalisation
- fièvre fréquente, inconstante et souvent > à 38°C
Rétablissement d’une infection à rotavirus chez les nourrissons et jeunes enfant ?
- virus normalement éliminé en 10 j en moyenne
- l’enfant est guéri spontanément sans séquelle sauf dans les pays où les enfants sont malnutris → complications → maladie perdure car on a une mauvaise réhydratation → excrétion du virus est souvent prolongée
Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez les enfants immunodéprimés ?
- infections prolongées → excrétion chronique du virus (6 sem à 2 ans)
- diarrhées intermittentes
- diffusion générale du virus, atteintes hépatiques (rare)
- nausées/vomissements
- fièvre
- fatigue
- malaises
- déshydratation sévère
Quels sont les prélèvements utilisés pour le diagnostic des infection à rotavirus ?
- prélèvements dans les selles (diarrhéiques)
- possibilité de conserver à 4 °C (ou congeler) pendant quelques jours → virus très résistant
