Viro : ROTAVIRUS

Question 1

Je te dis rotavirus tu dis :

Answer 1

1ère cause de gastro-entérite infectieuse aiguës chez les enfants de moins de 5 ans +++, diarrhées très sévères

Question 2

Réservoir des rotavirus ?

Answer 2

l’Ho mais virus présent en quantité importante dans l’environnement et les eaux usées

Question 3

Transmission du rotavirus ?

Answer 3

• féco-orale
• interhumaine
• véhiculée par les mains
• indirecte par les surfaces et objets contaminés par des fèces ou des vomissures

Question 4

Epidémiologie des rotavirus ?

Answer 4

• responsables d’environ 20 000 hospitalisations chaque année (Fr)
• 1ère cause d’infections nosocomiales dans les services pédiatriques pdt la saison épidémique
• infections saisonnières et surviennent durant les mois d’hiver

Question 5

Quelles sont les principales combinaison génotypique de rotavirus présents en Fr ?

Answer 5

1) G1 P[8]
2) G9 P[8]
3) G3 P[8]
4) G2 P[4]
=> abs pour la 5ème saison consécutive de la circulation du génotype G4P[8]

Question 6

Taxonomie des rotavirus ?

Answer 6

Ordre : Reovirales
Famille : Sedoreoviridae
Genre : Rotavirus

Question 7

Quels sont les genres de la sous-famille Sedoreoviridae ?

Answer 7

· Cardoreovirus
· Mimoreovirus
· Orbivirus
· Phytoreovirus
· Rotavirus (ABCDFGHIJ)
· Seadornavirus

Question 8

Structure générale des rotavirus ?

Answer 8

· Virus à ARN double brin segmenté en 11 segments d’ARN bicaténaires
· Capside icosaédrique composée de 3 couches concentriques
· Virus nu en forme de roue, sans enveloppe donc résistant dans le milieu extérieur
· Taille de 100 nm

Question 9

Caractéristiques du génomes des rotavirus ?

Answer 9

• 11 segments de génome
• possibilité de réassortiment génétique entre ces segments
• mélange d’une souche à l’autre : réassortiment entre des rotavirus bovins et des rotavirus humains

Question 10

Variabilité génétique des Rotavirus ?

Answer 10

= Réassortiment de segments d’ARN entre les ≠ souches d’un même groupe ou réarrangement des séq d’un même segment

Question 11

Pour quoi codent les segments du génome des Rotavirus ?

Answer 11

· 6 protéines structurales (VP 1, 2, 3, 4, 6, 7)
· 6 protéines non structurales (NSP1 à 6) impliquées dans la multiplication du virus: la + importante = NSP4 qui correspond à l’entérotoxine virale : protéine majeure de virulence

Question 12

Organisation de la capsides des rotavirus ?

Answer 12

=> Prot VP : 3 couches
· capside externe : Glycoprotéine VP7 et la protéine VP4 (attachement du virus aux cellules)
· capside intermédiaire : protéine VP6 ++ = Ag permettant de faire une classification en groupes et en sous-groupes de rotavirus, importante pour le typage
· capside interne ou core : protéine VP2 (majoritaire) et 2 autres protéines minoritaires : VP1 (activité ARN polymérase) et VP3 (protéine qui va se lier à ses ARN polymérase) → protéines du core permettent la transcription et la réplication du virus

Question 13

Propriétés antigéniques des protéines VP des rotavirus ?

Answer 13

9 sérogroupes de rotavirus de A à J :
* groupes A, B et C = responsables d’infections humaines et animales
* groupe A est responsable de la plupart des gastro- entérites à Rotavirus
* différenciation en sérotype implique des protéines de capsides : VP4 et VP7

Question 14

Comment sont classées les génotypes des rotavirus ?

Answer 14

analyse la séquence codant VP4 et VP7, on parle de génotypes :
· génotype G (Glycoprotéine) (VP7)
· génotype P (Protéase) (VP4)
Il y a concordance entre le sérotype et génotype pour G mais ce n’est pas toujours le cas pour P : on définit (P) génotype et [P] phénotype

Question 15

Caractéristiques des protéines non structurales des rotavirus ?

Answer 15

=> NSP1 à NSP6
* apparaissent durant le cycle de multiplication du virus, dans le virus elles ne sont pas mature
* Rôle important dans la pathogénie de la maladie

Question 16

Caractéristiques de la protéine NSP 4 des rotavirus ?

Answer 16

• rôle important dans le mécanisme de la diarrhée => entérotoxine
• augmentation du calcium intracellulaire → provoque l’ouverture
  d’un canal Cl-/Ca2+ → fuite de Cl- et d’eau à l’extérieur de la lumière donc entraîne une diarrhée

Question 17

Cycle de multiplication des rotavirus ?

Answer 17

1. Attachement du virus à la protéine
   VP4 + pénétration dans la cellule par endocytose : clivage de VP4 en 2 fragments VP5 et VP8 → augmente la perméabilité de la membrane et la pénétration du virus
2. Décapsidation partielle dans le
   cytoplasme
3. Activation de l’ARN polymérase
   virale (VP1) → transcrit chaque
   segment d’ARN à l’intérieur du virus
   partiellement encapsidé → obtenir
   plusieurs brins d’ARN
4. ARN+ → sortir par les canaux de
   la capside → utilisés comme ARNm pour la synthèse du brin d’ARN
   négatif ou pour la synthèse de prot virales après traduction directement au niveau des ribosomes
5. Synthèse des protéines virales qui vont se concentrer dans des inclusions = viroplasmes où aura lieu la réplication et l’assemblage du génome et des protéines virales. Les particules virales ainsi formées vont ensuite se retrouver dans le cytoplasme
6. particules virales en formation vont ê internalisées dans le RE grâce à la protéine transmembranaire NSP4
7. Les nouvelles particules virales sont libérées par lyse cellulaire ou transport vésiculaire spécialisé indépendant du Golgi, et vont pouvoir aller infecter d’autres cellules

Question 18

Période d’incubation des rotavirus ?

Answer 18

3 jours

Question 19

Physiopathologie du rotavirus ?

Answer 19

Entrée du virus par voie orale
virus résiste au pH acide de l’estomac et aux enzymes digestives → se réplique dans l’intestin → infecte les entérocytes (villosités de l’intestin grêle) → Changements structuraux et fonctionnels

Question 20

Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez le nouveau-né ?

Answer 20

• infections nosocomiales sporadiques dans les maternités
• souvent asymptomatiques
• rares cas d’entérocolites nécrosantes

Question 21

Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez le nourrisson et jeune enfant ?

Answer 21

• gastro-entérites aiguës avec des vomissements importants
• déshydratation importante
• peut nécessiter une hospitalisation
• fièvre fréquente, inconstante et souvent > à 38°C

Question 22

Rétablissement d’une infection à rotavirus chez les nourrissons et jeunes enfant ?

Answer 22

• virus normalement éliminé en 10 j en moyenne
• l’enfant est guéri spontanément sans séquelle sauf dans les pays où les enfants sont malnutris → complications → maladie perdure car on a une mauvaise réhydratation → excrétion du virus est souvent prolongée

Question 23

Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez les enfants immunodéprimés ?

Answer 23

• infections prolongées → excrétion chronique du virus (6 sem à 2 ans)
• diarrhées intermittentes
• diffusion générale du virus, atteintes hépatiques (rare)
• nausées/vomissements
• fièvre
• fatigue
• malaises
• déshydratation sévère

Question 24

Quels sont les prélèvements utilisés pour le diagnostic des infection à rotavirus ?

Answer 24

• prélèvements dans les selles (diarrhéiques)
• possibilité de conserver à 4 °C (ou congeler) pendant quelques jours → virus très résistant

Question 25

Diagnostic du rotavirus par utilisation d’anticorps monoclonaux ?

Answer 25

• AC anti-VP6 pour détecter le groupe A
  => Ag les + fqt

Question 26

Comment sont mis en évidence les Ag des rotavirus ?

Answer 26

a) ELISA
b) Les agglutinations de latex
c) Chromatographie sur membrane (immunochromatographie)

Question 27

Caractéristiques de la technique ELISA pour le diagnostic des rotavirus ?

Answer 27

• Technique immuno-enzymatique rapide
• Réalisé sur une microplaque
• Le résultat sera positif si on a un puits coloré (l’anticorps s’est fixé
  à l’antigène)
• possibilité de semi-quantifier le virus avec cette technique car + le puit est coloré + il y a de virus

Question 28

Caractéristiques de la technique d’agglutination de latex pour le diagnostic des rotavirus ?

Answer 28

• particules de latex avec des AC anti-rotavirus (anti-VP6), puis on ajoute les selles
• S’il y a agglutination des billes de latex = fixation à l’antigène
• Méthode rapide pour un diagnostic rapide

Question 29

Caractéristiques de la technique de chromatographie sur membrane pour le diagnostic des rotavirus ?

Answer 29

• prélèvement de selle placé dans la cupule et va migrer le long de la plaque
• Cette dernière est greffée avec des AC anti rotavirus
• s’il y a présence du virus, les AC vont se fixer avec l’antigène et on aura apparition d’une bande colorée

Question 30

Diagnostic des rotavirus par ME ?

Answer 30

rotavirus car ils ont une forme de roue (peut utilisé en routine)

Question 31

Comment peut se faire la détection du génome viral des rotavirus ?

Answer 31

• PCR pour les virus à ADN
• virus à ARN = RT-PCR (rotavirus)
• Electrophorétype : très long à faire, sur gel de polyacrylamide, mise en évidence des protéines structurales ou non structurales

Question 32

TTT curatif des infections à rotavirus ?

Answer 32

• pas de traitement spécifique
• lutter contre la déshydratation : solutés de réhydratation orale (SRO)

Question 33

Prophylaxie des infection a rotavirus ?

Answer 33

• Mesure d’hygiène
• Vaccins

Question 34

Quelles sont les mesure d’hygiènes à suivre pour limiter les infection à rotavirus ?

Answer 34

• bien se laver les mains et les plans de travail, particulièrement après tout passage aux toilettes, et en période d’épidémie
  => multiplier les précautions.
• signaler les cas de rotavirus pour suivre l’évolution de l’épidémie

Question 35

Caractéristiques des vaccins contre les rotavirus ?

Answer 35

• 2 vaccins oraux (virus vivants atténués) contre les rotavirus, destinés aux nourrissons en dessous de 6 mois
• Rotarix® (Monovalent) : Nourrissons de 6 à 24 sem, Suspension buvable
• Rotateq® (Pentavalent) : Nourrissons de 6 à 32 sem Solution buvable, (Rotavirus G1, G2, G3, G4, P1A)

Question 36

Calendrier vaccinal recommandé contre le rotavirus ?

Answer 36

nourrissons âgés de 6 semaines à 6 mois sauf contre-indications (recommandée)

Question 37

Quelles sont les contres indication à la vaccination contre les rotavirus ?

Answer 37

• Hypersensibilité aux substances actives ou à l’un des excipients ou suite à une précédente administration de vaccin rotavirus
• Nourrissons ayant une immunodépression connue ou suspectée ne doivent pas être des sujets candidats
• Antécédent d’invagination intestinale, nourrissons ayant une malformation congénitale de l’appareil gastro-intestinal pouvant prédisposer à une invagination intestinale