Viro : ROTAVIRUS Flashcards
24/09/24 => Bousarghin
Je te dis rotavirus tu dis :
1ère cause de gastro-entérite infectieuse aiguës chez les enfants de moins de 5 ans +++, diarrhées très sévères
Réservoir des rotavirus ?
l’Ho mais virus présent en quantité importante dans l’environnement et les eaux usées
Transmission du rotavirus ?
- féco-orale
- interhumaine
- véhiculée par les mains
- indirecte par les surfaces et objets contaminés par des fèces ou des vomissures
Epidémiologie des rotavirus ?
- responsables d’environ 20 000 hospitalisations chaque année (Fr)
- 1ère cause d’infections nosocomiales dans les services pédiatriques pdt la saison épidémique
- infections saisonnières et surviennent durant les mois d’hiver
Quelles sont les principales combinaison génotypique de rotavirus présents en Fr ?
1) G1 P[8]
2) G9 P[8]
3) G3 P[8]
4) G2 P[4]
=> abs pour la 5ème saison consécutive de la circulation du génotype G4P[8]
Taxonomie des rotavirus ?
Ordre : Reovirales
Famille : Sedoreoviridae
Genre : Rotavirus
Quels sont les genres de la sous-famille Sedoreoviridae ?
· Cardoreovirus
· Mimoreovirus
· Orbivirus
· Phytoreovirus
· Rotavirus (ABCDFGHIJ)
· Seadornavirus
Structure générale des rotavirus ?
· Virus à ARN double brin segmenté en 11 segments d’ARN bicaténaires
· Capside icosaédrique composée de 3 couches concentriques
· Virus nu en forme de roue, sans enveloppe donc résistant dans le milieu extérieur
· Taille de 100 nm
Caractéristiques du génomes des rotavirus ?
- 11 segments de génome
- possibilité de réassortiment génétique entre ces segments
- mélange d’une souche à l’autre : réassortiment entre des rotavirus bovins et des rotavirus humains
Variabilité génétique des Rotavirus ?
= Réassortiment de segments d’ARN entre les ≠ souches d’un même groupe ou réarrangement des séq d’un même segment
Pour quoi codent les segments du génome des Rotavirus ?
· 6 protéines structurales (VP 1, 2, 3, 4, 6, 7)
· 6 protéines non structurales (NSP1 à 6) impliquées dans la multiplication du virus: la + importante = NSP4 qui correspond à l’entérotoxine virale : protéine majeure de virulence
Organisation de la capsides des rotavirus ?
=> Prot VP : 3 couches
· capside externe : Glycoprotéine VP7 et la protéine VP4 (attachement du virus aux cellules)
· capside intermédiaire : protéine VP6 ++ = Ag permettant de faire une classification en groupes et en sous-groupes de rotavirus, importante pour le typage
· capside interne ou core : protéine VP2 (majoritaire) et 2 autres protéines minoritaires : VP1 (activité ARN polymérase) et VP3 (protéine qui va se lier à ses ARN polymérase) → protéines du core permettent la transcription et la réplication du virus
Propriétés antigéniques des protéines VP des rotavirus ?
9 sérogroupes de rotavirus de A à J :
* groupes A, B et C = responsables d’infections humaines et animales
* groupe A est responsable de la plupart des gastro- entérites à Rotavirus
* différenciation en sérotype implique des protéines de capsides : VP4 et VP7
Comment sont classées les génotypes des rotavirus ?
analyse la séquence codant VP4 et VP7, on parle de génotypes :
· génotype G (Glycoprotéine) (VP7)
· génotype P (Protéase) (VP4)
Il y a concordance entre le sérotype et génotype pour G mais ce n’est pas toujours le cas pour P : on définit (P) génotype et [P] phénotype
Caractéristiques des protéines non structurales des rotavirus ?
=> NSP1 à NSP6
* apparaissent durant le cycle de multiplication du virus, dans le virus elles ne sont pas mature
* Rôle important dans la pathogénie de la maladie
Caractéristiques de la protéine NSP 4 des rotavirus ?
- rôle important dans le mécanisme de la diarrhée => entérotoxine
- augmentation du calcium intracellulaire → provoque l’ouverture d’un canal Cl-/Ca2+ → fuite de Cl- et d’eau à l’extérieur de la lumière donc entraîne une diarrhée
Cycle de multiplication des rotavirus ?
- Attachement du virus à la protéine VP4 + pénétration dans la cellule par endocytose : clivage de VP4 en 2 fragments VP5 et VP8 → augmente la perméabilité de la membrane et la pénétration du virus
- Décapsidation partielle dans le cytoplasme
- Activation de l’ARN polymérase virale (VP1) → transcrit chaque segment d’ARN à l’intérieur du virus partiellement encapsidé → obtenir plusieurs brins d’ARN
- ARN+ → sortir par les canaux de la capside → utilisés comme ARNm pour la synthèse du brin d’ARN - ou pour la synthèse de prot virales après traduction directement au niveau des ribosomes
- Synthèse des protéines virales qui vont se concentrer dans des inclusions = viroplasmes où aura lieu la réplication et l’assemblage du génome et des protéines virales. Les particules virales ainsi formées vont ensuite se retrouver dans le cytoplasme
- particules virales en formation vont ê internalisées dans le RE grâce à la protéine transmembranaire NSP4
- Les nouvelles particules virales sont libérées par lyse cellulaire ou transport vésiculaire spécialisé indépendant du Golgi, et vont pouvoir aller infecter d’autres cellules
Période d’incubation des rotavirus ?
3 jours
Physiopathologie du rotavirus ?
Entrée du virus par voie orale virus résiste au pH acide de l’estomac et aux enzymes digestives → se réplique dans l’intestin → infecte les entérocytes (villosités de l’intestin grêle) → Changements structuraux et fonctionnels
Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez le nouveau-né ?
- infections nosocomiales sporadiques dans les maternités
- souvent asymptomatiques
- rares cas d’entérocolites nécrosantes
Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez le nourrisson et jeune enfant ?
- gastro-entérites aiguës avec des vomissements importants
- déshydratation importante
- peut nécessiter une hospitalisation
- fièvre fréquente, inconstante et souvent > à 38°C
Rétablissement d’une infection à rotavirus chez les nourrissons et jeunes enfant ?
- virus normalement éliminé en 10 j en moyenne
- l’enfant est guéri spontanément sans séquelle sauf dans les pays où les enfants sont malnutris → complications → maladie perdure car on a une mauvaise réhydratation → excrétion du virus est souvent prolongée
Symptomatologie d’une infection à rotavirus chez les enfants immunodéprimés ?
- infections prolongées → excrétion chronique du virus (6 sem à 2 ans)
- diarrhées intermittentes
- diffusion générale du virus, atteintes hépatiques (rare)
- nausées/vomissements
- fièvre
- fatigue
- malaises
- déshydratation sévère
Quels sont les prélèvements utilisés pour le diagnostic des infection à rotavirus ?
- prélèvements dans les selles (diarrhéiques)
- possibilité de conserver à 4 °C (ou congeler) pendant quelques jours → virus très résistant
Diagnostic du rotavirus par utilisation d’anticorps monoclonaux ?
- AC anti-VP6 pour détecter le groupe A
=> Ag les + fqt
Comment sont mis en évidence les Ag des rotavirus ?
a) ELISA
b) Les agglutinations de latex
c) Chromatographie sur membrane (immunochromatographie)
Caractéristiques de la technique ELISA pour le diagnostic des rotavirus ?
- Technique immuno-enzymatique rapide
- Réalisé sur une microplaque
- Le résultat sera positif si on a un puits coloré (l’anticorps s’est fixé à l’antigène)
- possibilité de semi-quantifier le virus avec cette technique car + le puit est coloré + il y a de virus
Caractéristiques de la technique d’agglutination de latex pour le diagnostic des rotavirus ?
- particules de latex avec des AC anti-rotavirus (anti-VP6), puis on ajoute les selles
- S’il y a agglutination des billes de latex = fixation à l’antigène
- Méthode rapide pour un diagnostic rapide
Caractéristiques de la technique de chromatographie sur membrane pour le diagnostic des rotavirus ?
- prélèvement de selle placé dans la cupule et va migrer le long de la plaque
- Cette dernière est greffée avec des AC anti rotavirus
- s’il y a présence du virus, les AC vont se fixer avec l’antigène et on aura apparition d’une bande colorée
Diagnostic des rotavirus par ME ?
rotavirus car ils ont une forme de roue (peut utilisé en routine)
Comment peut se faire la détection du génome viral des rotavirus ?
- PCR pour les virus à ADN
- virus à ARN = RT-PCR (rotavirus)
- Electrophorétype : très long à faire, sur gel de polyacrylamide, mise en évidence des protéines structurales ou non structurales
TTT curatif des infections à rotavirus ?
- pas de traitement spécifique
- lutter contre la déshydratation : solutés de réhydratation orale (SRO)
Prophylaxie des infection a rotavirus ?
- Mesure d’hygiène
- Vaccins
Quelles sont les mesure d’hygiènes à suivre pour limiter les infection à rotavirus ?
- bien se laver les mains et les plans de travail, particulièrement après tout passage aux toilettes, et en période d’épidémie
=> multiplier les précautions. - signaler les cas de rotavirus pour suivre l’évolution de l’épidémie
Caractéristiques des vaccins contre les rotavirus ?
- 2 vaccins oraux (virus vivants atténués) contre les rotavirus, destinés aux nourrissons en dessous de 6 mois
- Rotarix® (Monovalent) : Nourrissons de 6 à 24 sem, Suspension buvable
- Rotateq® (Pentavalent) : Nourrissons de 6 à 32 sem Solution buvable, (Rotavirus G1, G2, G3, G4, P1A)
Calendrier vaccinal recommandé contre le rotavirus ?
nourrissons âgés de 6 semaines à 6 mois sauf contre-indications (recommandée)
Quelles sont les contres indication à la vaccination contre les rotavirus ?
- Hypersensibilité aux substances actives ou à l’un des excipients ou suite à une précédente administration de vaccin rotavirus
- Nourrissons ayant une immunodépression connue ou suspectée ne doivent pas être des sujets candidats
- Antécédent d’invagination intestinale, nourrissons ayant une malformation congénitale de l’appareil gastro-intestinal pouvant prédisposer à une invagination intestinale
