Viro : Norovirus Flashcards

1/10/24 => Bousargin

1
Q

Définition d’une TIAC ?

A
  • Affection de nature infectieuse (bactéries ou virus) ou toxique
  • Par le biais d’aliments ingérés de toute nature
  • apparition d’au moins 2 cas d’une symptomatologie similaire
  • rapporter la cause à une même origine alimentaire
  • déclaration obligatoire depuis 1987
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2
Q

Quels sont les contextes fréquent de TIAC virale ?

A
    • fréquente que TIAC bactérienne
  • Familiale ++
  • Entreprise +
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3
Q

Localisation des virus responsables des TIAC virales ?

A

Coquillages (huitres…)

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4
Q

A quelle périodes les TIAC virales sévissent le + ?

A

Décembre/Janvier => Fêtes de fin d’année => consommation de coquillages

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5
Q

Infection aux norovirus en Fr ?

A

Depuis 2023 => Norovirus sévissent en Fr bcp (2ème cause gastro après rotavirus)

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6
Q

Réservoir des Norovirus ?

A

=> Ho infecté seul (pour norovirus humains)

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7
Q

Comment/pourquoi la transmission du norovirus est multiple et rapide ?

A
  • faible quantité de virus peut provoquer l’infection (- de 100 particules virales) → très contagieux
    -Virus survivant dans les selles jusqu’à 4 sem
  • Virus stable dans l’environnement
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8
Q

Quels sont les modes de transmission du norovirus ?

A

❖ de personne à personne
❖ par voie alimentaire ou hydrique
❖ par gouttelettes projetées

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9
Q

Caractéristiques de la transmission de personne à personne des norovirus ?

A
  • par contact direct (voie fécale orale)
  • par contact indirect avec l’environnement contaminé (matières
    fécales ou vomies)
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10
Q

Caractéristiques de la transmission par voie alimentaire ou hydrique des norovirus ?

A
  • ingestion d’aliments contaminés : préparation par une personne excrétant le virus (consommés crus ou sans réchauffage)
  • ingestion d’eau de boisson ou de distribution ou d’aliments contaminés par des rejets : norovirus présents
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11
Q

Caractéristiques de la transmission par gouttelette projetés des norovirus ?

A

=> Par les vomissement
*peuvent pénétrer dans la bouche et être ingérées ou contaminer les surfaces
* pourraient se disperser au delà d’1 m et demeurer suspendues dans l’air d’une façon prolongée

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12
Q

Localisation des norovirus ?

A
  • crustacé ; coquillage
  • Salade
  • Fruits frais
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13
Q

Taxonomie des norovirus ?

A

– Ordre : Picornavirales
– Famille : Caliciviridae
– Genre : Norovirus

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14
Q

Pourquoi les norovirus font partie des caliciviridae ?

A

forme observée en ME de ces virus qui possèdent à leur surface des dépressions en forme de calice

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15
Q

Structure générale du norovirus ?

A

– Virus à ARN monocaténaire de polarité +
– Capside icosaédrique
– Virus nu => résistant dans l’environnement
– Taille de 28-35 nm (petit)

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16
Q

Organisation du génome viral du norovirus ?

A
  • Génome de 7,5 kb
  • ARN simple brin positif
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17
Q

Quelles sont les protéines codées par le génome des norovirus ?

A
  • protéines non structurales
  • Protéines structurales
    • VP1 : majoritaire de capside, classification des norovirus
    • VP2 : minoritaire de capside
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18
Q

Quel est le rôle (hypothétique) de VP2 chez les norovirus ?

A

D’augmenter l’expression de VP1 et de stabiliser les particules

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19
Q

Quels sont les mécanismes qui engendre la diversité génétiques des norovirus ?

A
  • dérive génétique
  • Recombinaison
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20
Q

Caractéristiques de la dérive génétiques des norovirus ?

A

=> Antigeni drift
➢ RdRp (polymérase) n’a pas de fonction d’édition = taux d’erreur par génome et par cycle de réplication comparativement + élevé que virus à ADN

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21
Q

Impact de la dérive génétique du norovirus ?

A

mutations nucléotidiques → substitutions fixes au niveau de la population virale → élément clé de l’adaptation

22
Q

Caractéristiques de la recombinaison chez les norovirus ?

A

Co-infection d’une cellule avec 2
calicivirus → 2 ARN génomiques se répliquent à proximité → événements de recombinaison peuvent facilement se produire → probablement en raison du changement de matrice par le RdRp

23
Q

Pourquoi les épidémie de norovirus engendre des mutant ?

A

+ le virus se multiplie + il engendre des mutations/mutants => épidémie = bcp réplication = bcp mutation

24
Q

Caractéristiques des génogroupes des norovirus ?

A
  • 10 génogroupes (GI to GX)
  • Via VP1
  • Affectant l’Ho : GI, GII, GIV, GVIII and GIX
  • Très épidémique chez l’Ho : GI (9 génotypes) and GII (23 génotypes)
25
Caractéristiques des P-type ?
Classification des norovirus via la polymérase
26
Quel est le génotype de norovirus le + présent dans le monde ?
GII.4
27
Origine de l'émergence du variant GII.4 du norovirus ?
* associée à des modifications des épitopes A-I : sous-domaine P2 exposé en surface de VP1 * affecte es interactions avec les Ag tissulaires de groupes sanguins sur les cellules hôtes
28
Quel est le variant de norovirus qui se propage de + en + dans le monde ?
GII.17
29
Cycle de multiplication du norovirus ?
1) Attachement virion à la cellule hôte via la protéine VP1 du virion et l’Ag de surface HBGA de la cellule 2) Internalisation 3) Décapsidation et d’un désassemblage du virion 4) L’ARN (+) transcrit et traduit dans le cytoplasme de la cellule hôte 5) Durant la réplication du génome, l’ARN (+) est transcrit en ARN (-) → utilisé pour la synthèse de nouveaux brins d’ARN (+) génomiques et subgénomiques 6) Encapsidation : ARN (+) assemblés en nouveaux virions, qui sont ensuite relargués de la cellule hôte
30
Pourquoi il y a-t-il un tropisme des norovirus au niveau du tractus gastro-intestinal ?
R cellulaires: antigènes tissulaires de groupes sanguins ou HBGA → exprimés entre autres sur les C du tractus gastro-intestinal
31
Physiopathologie d'une infection à norovirus ?
- Modifications structurelles et fonctionnelles → vacuolisation et desquamation des C épithéliales - Diminution de la résistance de l’épithélium et réduction de la surface des villosités - Altération de la barrière intestinale → malabsorption et diarrhée - Ralentissement de la motricité gastrique → nausées et vomissements
32
Temps d'incubation du norovirus ?
10-50h
33
Quels sont les facteurs de pathogénicité des norovirus ?
* diminution de la vidange gastrique * lésion du jéjunum * diminution de la production de tréhalase * Diminution de la production de phosphatase alcaline
34
Pathologie causées par les norovirus ?
Gastro-entérite aiguë et épidémies de gastro-entérite
35
Population touchées par les infection à norovirus ?
presque toute la population => en particulier parce qu'il n'existe pas d'immunité à long terme contre le virus
36
Symptôme d'une infection à norovirus ?
* diarrhée aiguë mais spontanée * vomissements * crampes abdominales * fièvre * fatigue
37
Comment récupère-t-on d'une infection à norovirus ?
* Patients se remettent des symptômes aigus en 2 à 3 j * peuvent être + graves chez les populations vulnérables
38
Quelles sont les possibles complication d'une infection à norovirus ?
* Déshydratation * perte de poids * perturbation électrolytique
39
Quels sont les patients qui font les complications à norovirus ?
* Personnes âgées * Patient atteints de pathologie chronique * Immunodéprimés * nourrissons
40
Infection à norovirus chez le sujet immunodéprimé?
- possibles infections chroniques parfois sévères - excrétion virale pouvant persister pendant plusieurs mois, voire + de 2 ans - infection chronique => graves conséquences : pertes pondérales importantes, dénutrition et déshydratation sévères, hospithalisations prolongées, voire décès
41
Quelles sont les populations à risque d'épidémie à norovirus ?
* Prisonniers * crèches * Ecoles * Maisons de retraites
42
Norovirus et personne âgée ?
* Norovirus = 83% épidémies gastro-entérite en établissement de soin pour personnes âgées * Taux d'attaque élevé * Morbidité importante * Mortalité non négligeable
43
Quels sont les moyens de diagnostiquer une infection à norovirus ?
* Symptômes typiques = suffisants * Détection des Ag * Détection du génome viral
44
Caractéristiques des techniques de détection des Ag dans une infection à norovirus ?
* Trousses commerciales sous forme d’ELISA ou tests rapides immunochromatographique * à partir d’une suspension de selles à 10 % dans un tampon dédié * spécificités sont proches de 100% * faciles et rapides * particulièrement adaptée au coup par coup et aux situations d’urgence
45
Pour quel objectif utilise-t-on chaque méthode de détection du génome viral dans le diagnostic d'une infection à norovirus ?
* Séquençage : quel génotype * RT-PCR : contaminé ? oui/non * RT-qPCR : Charge virale
46
Condition de prélèvement d'échantillon pour le diagnostic d'une infection à norovirus ?
- Prélèvement de selles doit être réalisé à la phase aiguë de la maladie : 2 à 3 g dans un récipient Stérile - Excrétion de virions pouvant ê observée jusqu’à 3 sem après le début de la maladie - Peut être transmis au laboratoire à T° ambiante
47
A partir de quels prélèvement peut on réalisé une PCR lors d'une infection à norovirus ?
selles, vomissures, aliments ou encore l’eau
48
Quelles sont les séquences du génome des norovirus recherché pour e diagnostic ?
ciblent les régions conservées de la polymérase (ORF1) et de la protéine de capside VP1
49
TRAITEMENT CURATIF d'une infection à norovirus ?
* aucun traitement antiviral spécifique contre les norovirus * réhydratation orale ou intraveineuse + prise en charge nutritionnelle * nombreuses pistes thérapeutiques proposées : vaccins prototypes, élaborés à partir de particules virales de synthèse (VLP)
50
Prévention des infection à norovirus ?
* l’observance de règles d’hygiène simples * lavage des mains systématique à l’aide de savon liquide, antiseptique ou non après être passé aux toilettes, le nettoyage des fesses d’un nourrisson diarrhéique ou le contact avec des vomissures * désinfection des objets et des surfaces souillés ou manipulés compte-tenu de la résistance de norovirus sur les surfaces