Viro : Norovirus Flashcards
1/10/24 => Bousargin
Définition d’une TIAC ?
- Affection de nature infectieuse (bactéries ou virus) ou toxique
- Par le biais d’aliments ingérés de toute nature
- apparition d’au moins 2 cas d’une symptomatologie similaire
- rapporter la cause à une même origine alimentaire
- déclaration obligatoire depuis 1987
Quels sont les contextes fréquent de TIAC virale ?
- fréquente que TIAC bactérienne
- Familiale ++
- Entreprise +
Localisation des virus responsables des TIAC virales ?
Coquillages (huitres…)
A quelle périodes les TIAC virales sévissent le + ?
Décembre/Janvier => Fêtes de fin d’année => consommation de coquillages
Infection aux norovirus en Fr ?
Depuis 2023 => Norovirus sévissent en Fr bcp (2ème cause gastro après rotavirus)
Réservoir des Norovirus ?
=> Ho infecté seul (pour norovirus humains)
Comment/pourquoi la transmission du norovirus est multiple et rapide ?
- faible quantité de virus peut provoquer l’infection (- de 100 particules virales) → très contagieux
-Virus survivant dans les selles jusqu’à 4 sem - Virus stable dans l’environnement
Quels sont les modes de transmission du norovirus ?
❖ de personne à personne
❖ par voie alimentaire ou hydrique
❖ par gouttelettes projetées
Caractéristiques de la transmission de personne à personne des norovirus ?
- par contact direct (voie fécale orale)
- par contact indirect avec l’environnement contaminé (matières
fécales ou vomies)
Caractéristiques de la transmission par voie alimentaire ou hydrique des norovirus ?
- ingestion d’aliments contaminés : préparation par une personne excrétant le virus (consommés crus ou sans réchauffage)
- ingestion d’eau de boisson ou de distribution ou d’aliments contaminés par des rejets : norovirus présents
Caractéristiques de la transmission par gouttelette projetés des norovirus ?
=> Par les vomissement
*peuvent pénétrer dans la bouche et être ingérées ou contaminer les surfaces
* pourraient se disperser au delà d’1 m et demeurer suspendues dans l’air d’une façon prolongée
Localisation des norovirus ?
- crustacé ; coquillage
- Salade
- Fruits frais
Taxonomie des norovirus ?
– Ordre : Picornavirales
– Famille : Caliciviridae
– Genre : Norovirus
Pourquoi les norovirus font partie des caliciviridae ?
forme observée en ME de ces virus qui possèdent à leur surface des dépressions en forme de calice
Structure générale du norovirus ?
– Virus à ARN monocaténaire de polarité +
– Capside icosaédrique
– Virus nu => résistant dans l’environnement
– Taille de 28-35 nm (petit)
Organisation du génome viral du norovirus ?
- Génome de 7,5 kb
- ARN simple brin positif
Quelles sont les protéines codées par le génome des norovirus ?
- protéines non structurales
- Protéines structurales
- VP1 : majoritaire de capside, classification des norovirus
- VP2 : minoritaire de capside
Quel est le rôle (hypothétique) de VP2 chez les norovirus ?
D’augmenter l’expression de VP1 et de stabiliser les particules
Quels sont les mécanismes qui engendre la diversité génétiques des norovirus ?
- dérive génétique
- Recombinaison
Caractéristiques de la dérive génétiques des norovirus ?
=> Antigeni drift
➢ RdRp (polymérase) n’a pas de fonction d’édition = taux d’erreur par génome et par cycle de réplication comparativement + élevé que virus à ADN
Impact de la dérive génétique du norovirus ?
mutations nucléotidiques → substitutions fixes au niveau de la population virale → élément clé de l’adaptation
Caractéristiques de la recombinaison chez les norovirus ?
Co-infection d’une cellule avec 2
calicivirus → 2 ARN génomiques se répliquent à proximité → événements de recombinaison peuvent facilement se produire → probablement en raison du changement de matrice par le RdRp
Pourquoi les épidémie de norovirus engendre des mutant ?
+ le virus se multiplie + il engendre des mutations/mutants => épidémie = bcp réplication = bcp mutation
Caractéristiques des génogroupes des norovirus ?
- 10 génogroupes (GI to GX)
- Via VP1
- Affectant l’Ho : GI, GII, GIV, GVIII and GIX
- Très épidémique chez l’Ho : GI (9 génotypes) and GII (23 génotypes)
Caractéristiques des P-type ?
Classification des norovirus via la polymérase
Quel est le génotype de norovirus le + présent dans le monde ?
GII.4
Origine de l’émergence du variant GII.4 du norovirus ?
- associée à des modifications des épitopes A-I : sous-domaine P2 exposé en surface de VP1
- affecte es interactions avec les Ag tissulaires de groupes sanguins sur
les cellules hôtes
Quel est le variant de norovirus qui se propage de + en + dans le monde ?
GII.17
Cycle de multiplication du norovirus ?
1) Attachement virion à la cellule hôte via la protéine VP1 du virion et l’Ag de surface HBGA de la cellule
2) Internalisation
3) Décapsidation et d’un désassemblage du virion
4) L’ARN (+) transcrit et traduit dans
le cytoplasme de la cellule hôte
5) Durant la réplication du génome, l’ARN (+) est transcrit en ARN (-) → utilisé pour la synthèse de nouveaux brins d’ARN (+) génomiques et
subgénomiques
6) Encapsidation : ARN (+) assemblés en nouveaux virions, qui sont ensuite relargués de la cellule hôte
Pourquoi il y a-t-il un tropisme des norovirus au niveau du tractus gastro-intestinal ?
R cellulaires: antigènes tissulaires de groupes sanguins ou HBGA → exprimés entre autres sur les C du tractus gastro-intestinal
Physiopathologie d’une infection à norovirus ?
- Modifications structurelles et fonctionnelles → vacuolisation et desquamation des C épithéliales
- Diminution de la résistance de l’épithélium et réduction de la surface des villosités
- Altération de la barrière intestinale →
malabsorption et diarrhée - Ralentissement de la motricité gastrique → nausées et vomissements
Temps d’incubation du norovirus ?
10-50h
Quels sont les facteurs de pathogénicité des norovirus ?
- diminution de la vidange gastrique
- lésion du jéjunum
- diminution de la production de tréhalase
- Diminution de la production de phosphatase alcaline
Pathologie causées par les norovirus ?
Gastro-entérite aiguë et épidémies de gastro-entérite
Population touchées par les infection à norovirus ?
presque toute la population => en particulier parce qu’il n’existe pas d’immunité à long terme contre le virus
Symptôme d’une infection à norovirus ?
- diarrhée aiguë mais spontanée
- vomissements
- crampes abdominales
- fièvre
- fatigue
Comment récupère-t-on d’une infection à norovirus ?
- Patients se remettent des symptômes aigus en 2 à 3 j
- peuvent être + graves chez les populations vulnérables
Quelles sont les possibles complication d’une infection à norovirus ?
- Déshydratation
- perte de poids
- perturbation électrolytique
Quels sont les patients qui font les complications à norovirus ?
- Personnes âgées
- Patient atteints de pathologie chronique
- Immunodéprimés
- nourrissons
Infection à norovirus chez le sujet immunodéprimé?
- possibles infections chroniques parfois sévères
- excrétion virale pouvant persister pendant plusieurs mois, voire + de 2 ans
- infection chronique => graves conséquences : pertes pondérales importantes, dénutrition et déshydratation sévères, hospithalisations prolongées, voire décès
Quelles sont les populations à risque d’épidémie à norovirus ?
- Prisonniers
- crèches
- Ecoles
- Maisons de retraites
Norovirus et personne âgée ?
- Norovirus = 83% épidémies gastro-entérite en établissement de soin pour personnes âgées
- Taux d’attaque élevé
- Morbidité importante
- Mortalité non négligeable
Quels sont les moyens de diagnostiquer une infection à norovirus ?
- Symptômes typiques = suffisants
- Détection des Ag
- Détection du génome viral
Caractéristiques des techniques de détection des Ag dans une infection à norovirus ?
- Trousses commerciales sous forme d’ELISA ou tests rapides immunochromatographique
- à partir d’une suspension de selles à 10 % dans un tampon dédié
- spécificités sont proches de 100%
- faciles et rapides
- particulièrement adaptée au coup par coup et aux situations d’urgence
Pour quel objectif utilise-t-on chaque méthode de détection du génome viral dans le diagnostic d’une infection à norovirus ?
- Séquençage : quel génotype
- RT-PCR : contaminé ? oui/non
- RT-qPCR : Charge virale
Condition de prélèvement d’échantillon pour le diagnostic d’une infection à norovirus ?
- Prélèvement de selles doit être réalisé à la phase aiguë de la maladie : 2 à 3 g dans un récipient Stérile
- Excrétion de virions pouvant ê observée jusqu’à 3 sem après le
début de la maladie - Peut être transmis au laboratoire à T° ambiante
A partir de quels prélèvement peut on réalisé une PCR lors d’une infection à norovirus ?
selles, vomissures, aliments ou encore l’eau
Quelles sont les séquences du génome des norovirus recherché pour e diagnostic ?
ciblent les régions conservées de la polymérase (ORF1) et de la protéine de capside VP1
TRAITEMENT CURATIF d’une infection à norovirus ?
- aucun traitement antiviral spécifique contre les norovirus
- réhydratation orale ou intraveineuse + prise en charge nutritionnelle
- nombreuses pistes thérapeutiques proposées : vaccins prototypes, élaborés à partir de particules virales de synthèse (VLP)
Prévention des infection à norovirus ?
- l’observance de règles d’hygiène simples
- lavage des mains systématique à l’aide de savon liquide, antiseptique ou non après être passé aux toilettes, le nettoyage des fesses d’un nourrisson diarrhéique ou le contact avec des vomissures
- désinfection des objets et des surfaces souillés ou manipulés compte-tenu de la résistance de norovirus sur les surfaces
