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{P3} µbiologie > Bactério : Entérobactéries > Flashcards

Bactério : Entérobactéries Flashcards

23/09/24 => Thomas GAUTIER

1
Q

Définition des entérobactéries ?

A

bactéries colonisant naturellement le tube digestif de l’Homme ou l’animal

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2
Q

Réservoir des entérobactéries ?

A

l’Homme et/ou l’animal

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3
Q

Habitat possible des entérobactéries ?

A

Dans différents environnements :
* aliments
* eau,
* milieu hospitalier

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4
Q

Devenir des entérobactérie après l’entrée dans l’organisme ?

A
  • Dissémination
  • inflammation
  • pathologie
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5
Q

Taxonomie des entérobactéries ?

A
  • Embranchement : Pseudomonadota
  • Ordre : Entereobacteriales
  • Famille : Enterobacteriaceae
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6
Q

Quels sont les principaux genres infection des entérobactéries ?

A
  1. Escherichia : Escherichia coli
  2. Salmonella : Salmonella enterica
  3. Shigella : Shigella dysenteriae, S. flexneri, S. boydii, S. sonnei
  4. Yersinia : Yersinia pestis, Yersinia enterolitica
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7
Q

De quelle pathologie Escherichia est elle l’agent ?

A

Infections intestinales et extra-intestinales

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8
Q

De quelle pathologie Salmonella est-elle l’agent ?

A

Agents de la typhoïde et des salmonellose

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9
Q

De quelle pathologie Shigella est-elle l’agent ?

A

Dysenterie bacillaire (Shigellose)

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10
Q

De quelle pathologie Yersinia est-elle l’agent ?

A

Peste et des infections gastro-intestinales

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11
Q

Quels sont les “autres” genres d’entérobactéries ?

A
  • Klebsiella
  • Enterobacter
  • Proteus
  • Serratia
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12
Q

Caractéristiques des agents du groupe 2 ?

A
  • agents biologiques pouvant provoquer une maladie chez l’homme
  • Propagation peu probable
  • Prophylaxie ou ttt existants et efficaces
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13
Q

Caractéristiques des agents biologiques du groupe 3 ?

A
  • Agents biologiques pouvant provoquer une maladie grave chez l’homme
  • Propagation dans la collectivité possible,
    *Existe généralement une prophylaxie
    ou un traitement efficace
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14
Q

Exemple d’entérobactérie du groupe 3 des agents biologiques ?

A
  • Escherichia coli entérohémorragiques
  • Salmonella Typhi
  • Shigella dysenteriae type 1
  • Yersinia pestis
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15
Q

Caractéristiques morphologiques et structurales des entérobactéries ?

A
  • Bacilles à Gram négatif
  • 2-4 µm (L)
  • Immobiles ou mobiles ++ (ciliature péritriche)
  • Aérobie-Anaérobie facultative
  • Se cultive sur milieu minimum
  • Fermente le glucose
  • Réduisent les nitrates (NO3-) en nitrites (NO2-)
  • Oxydase -
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16
Q

Quels sont les caractères antigéniques des entérobactéries ?

A
  • Paroi (O)
  • Flagellaire (H)
  • Capsulaire (K, Vi = salmonelle)
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17
Q

Variation des Ag O des entérobactéries ?

A

varie énormément en fonction des souches, certains sérovars sont + dangereux que
d’autres

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18
Q

Quels sont les facteurs de virulence des entérobactéries ?

A
  • Capsule
  • LPS (endotoxine)
  • Production de toxines
  • Sidérophores
  • Adhérence / Invasion
  • Capacité de dissémination vers le sang ou la lymphe
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19
Q

Rôle de la capsule des entérobactéries ?

A
  • résister à un certain nombre de stress dans l’environnement
  • camouflage
    => N’existe pas chez toute les souches mais peut s’échanger via transfert de gène
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20
Q

Caractéristiques du LPS (entérobactérie) ?

A
  • endotoxine commune à toutes les entérobactéries
  • Elément toxique du LPS : Lipide A
  • Peut provoquer choc septique et donc la mort
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21
Q

Caractéristiques des endotoxines produites par les entérobactéries ?

A
  • Protéines solubles, thermolabiles (inhibées entre 60 et 80°C)
  • Libérées par la bactérie pathogène en croissance
  • Gènes portés par les plasmides ou chromosomes
  • Certaines exotoxines sont classées parmi les substances les plus létales
  • Type de toxine fréquemment retrouvé : la toxine AB
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22
Q

Caractéristiques des sidérophores ?

A
  • molécules synthétisées et sécrétées par µorganismes
  • Permet de puiser le fer essentiel à leur développement
  • Fer de l’hôte chélaté au profit de la bactérie
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23
Q

Sidérophore caractéristiques d’Escherichia Coli ?

A

entérochéline

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24
Q

Quelles sont les facteurs d’adhérence et d’invasion des entérobactéries ?

A
  • capables d’adhérer à la surface des cellules épithéliales Grâce aux pili ou fimbriae
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25
Q

Importance de l’adhésion pour les entérobactérie ?

A

Nécessaire pour activer les facteurs de virulence

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26
Q

Caractéristiques de la dissémination des entérobactéries ?

A
  • capable d’effectuer l’invasion cellulaire par des mécanismes qui sont propres à chaque
    genre bactérien
  • traverser la barrièreintestinal pour se disséminer dans le reste de l’organisme (jusqu’à la septicémie)
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27
Q

Quelles sont les pathologies dont Salmonella est l’agent ?

A
  • fièvre Typhoïde et Para-typhoïde
  • Gastro-entérites aigües
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28
Q

Classification de Salmonella ?

A
  • 2 espèces
  • 6 sous-espèces
  • Plus de 2500 sérovars existant
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29
Q

Quelles sont les Salmonella pathogènes de l’Ho ?

A

Salmonella enterica enterica

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30
Q

Quels sont les sérovars typhiques des Salmonella ?

A
  • S. Typhi
  • S. Paratyphi A
  • S. paratyphi B
  • S. paratyphi C
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31
Q

Quels sont les sérovars non-typhiques des Salmonella ?

A
  • Tout les autres sérovars
  • S. Typhimurium
  • S. Seftemberg
  • …
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32
Q

Qu’est-ce que le tableau de Kauffmann-White ?

A

Tableau qui permet d’identifier ou déterminer de nouveaux sérovars grâce :
tests d’agglutination effectuer sur les Ag :
* O
* H
* capsule (Vi)

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33
Q

Caractères culturaux et biochimiques de Salmonella ?

A
  • Caractères généraux entérobactéries (AAF,
    oxydase - …)
  • mobile
  • Colonie de 2-4 mm sur milieu minimum
  • Saccharose et Lactose –
  • H2S +
  • milieu Hektoen, colonies vertes avec
    parfois apparition d’un centre noir
  • Même chose sur gélose SS
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34
Q

Comment se fait la contamination indirecte à Salmonella ?

A
  • Large spectre d’animaux pouvant être porteurs
  • pdts alimentaires, consommés crus, peu cuits ou ayant fait l’objet d’une contamination post-cuisson
  • viande (volaille+++, produits carnés, œufs et produits laitiers)
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35
Q

Comment se fait la contamination directe à Salmonella ?

A
  • animal malade ou porteur sain par l’intermédiaire des mains
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36
Q

Epidémie de Salmonella ?

A

foyers sont importants : peut atteindre une échelle nationale voire internationale si un aliment commercialisé à large diffusion se trouve contaminé

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37
Q

Caractéristiques de la Typhoïde ?

A
  • Frappe principalement les pays en cours de développement : Afrique, Asie et Amérique du sud
  • Contamination par ingestion d’eau ou d’aliments contaminés
    • Après guérison d’une fièvre typhoïde, 2 à 5% des individus continuent d’héberger l’agent pathogène et sans signe clinique
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38
Q

Epidémiologie de la typhoïde ?

A
  • 20 millions de cas / an
  • 200 000 morts par an
  • Fr : maladies à déclaration obligatoire, quasi-exclusivement des cas importées
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39
Q

Sérotypes responsable de la typhoïde ?

A

Salmonella : Typhi et Paratyphi A, B ou C

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40
Q

Période d’incubation de la typhoïde ?

A

14 jours

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41
Q

Quels sont les symptômes court termes de la typhoïde ?

A

Fièvre oscillante, céphalées, douleurs abdominales, malaise, constipation, anorexie, abattement

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42
Q

Quels sont les symptômes long terme de la typhoïde ?

A

fièvre montant jusqu’à 39°C, typhos
(délire), septicémie
=> fatale en cas d’absence de traitement

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43
Q

Sérotypes des Salmonella responsables de gastro entérites ?

A

tous les autres sérotypes de Salmonella enterica enterica autres que Typhi et Paratyphi
=> Une des principales responsables de Toxi-infection alimentaire collective (TIAC) en France

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44
Q

Sérotype dominant de Salmonella en Fr ?

A

Salmonella enterica serovar Enteritidis (39%)

45
Q

Virulence de Salmonella ?

A
  1. atteint la surface des cellules épithéliales grâce aux flagelles (FliC)
  2. Adhésion grâce aux fimbriae (FimA)
  3. système de sécrétion de type 3 (SST3) mis en place (système de seringue) → effecteurs remodèlent le cytosquelette cellulaire (SipC, SipA, SopE, SopB)
  4. Invasion + inhibition de l’apoptose de la cellule
46
Q

Quelles sont les premières cibles des Salmonella ?

A

1ère : cellules M
2ème : macrophage ou elles ne sont pas phagocytées

47
Q

Pathogénicité de Shigella chez l’Ho ?

A
  • Responsable la Shigellose (dysenterie bacillaire)
  • 4 espèces responsables des infections ++
48
Q

Quelles sont les espèces infectieuses de Shigella ?

A

4:
- Shigella dysenteriae : épidémique
- Shigella flexneri : endémique
- Shigella boydii : forme atténuée
- Shigella sonnei : forme atténuée

49
Q

Comment sont classés les sérogroupe de Shigella ?

A

Sérogroupes basés sur l’antigène O

50
Q

Caractères culturaux et biochimiques de Shigella ?

A
  • Caractères généraux entérobactéries (AAF, oxydase - …)
  • Non mobile
  • Saccharose et Lactose-
  • H2S-
  • Citrate-
  • LDC-
  • VP -
  • Uréase-
  • Gélatine-
51
Q

Différentiation de Shigella et E. coli ?

A

Shigelles caractérisées par de nombreuses réactions biochimiques négatives

52
Q

Epidémiologie de Shigella ?

A
  • L’homme et certains autres primates = seuls réservoirs
  • environ 100 millions de personnes/an
  • 200 000 décès => - 5ans +++
  • Infections endémiques dans zones tropicales d’Afrique, d’Amérique latine et d’Asie
53
Q

Infection à Shigella en Europe ?

A

Essentiellement des voyageurs internationaux pour quelques milliers de cas

54
Q

Comment se fait la transmission de Shigella ?

A
  • Transmission par voie fécale-orale
  • consommation d’aliments contaminés, infectés lorsqu’ils sont :
    • manipulés dans des conditions d’hygiènes médiocres
    • lavés avec de l’eau contaminée par des matières fécales
  • Liquides contaminés (eau des rivières, des lacs et d’autres eaux côtières)
  • Contact sexuel (-)
55
Q

Déclaration d’une infection à Shigella en Fr ?

A

Maladie à déclaration obligatoire

56
Q

Portage asymptomatiques de Shigella ?

A

=> TRES rare → Shigella = pathogène strict
sources de dissémination de l’infection

57
Q

Caractéristiques de Shigella dysenteriae ?

A
  • provoque la forme de shigellose la + grave
  • presque absente dans les pays développés
58
Q

Quelles sont les Shigella les + présentes dans les pays industrialisés ?

A

1) Shigella sonnei
2) Shigella flexneri

59
Q

Pics d’incidence des Shigella ?

A

Tranche d’âge :
* 0-9 ans
* 20-49 ans

60
Q

Période d’incubation de la shigellose ?

A

1 à 7 jours

61
Q

Symptômes des formes classique de la shigellose (Shigella non dysenteriae)

A
  • diarrhées légères (jusqu’à importantes)
  • crampes abdominales modérées
  • fièvre et malaise
  • nausées et vomissements
  • ulcérations muqueuses superficielles
  • Rémission au bout de qq jours dans la plupart des cas, peu de mortalité
62
Q

Caractéristiques c

A
  • Shigella dysenteriae +++
  • Dysenterie bacillaire
  • destruction de la muqueuse du côlon => forme la + grave de l’infection
63
Q

Symptôme de la forme sévère de shigellose ?

A
  • Diarrhées sanglantes /inflammation sévère
  • douleurs abdominales intenses
  • forte fièvre
  • Déshydratation rapide
  • Bactériémie
  • Syndrome urémique hémolytique (rare)
    Mort dans certains cas graves en 12-24h (5-15%
    de mortalité si abs ttt)
64
Q

Quelles sont les personnes qui contractent les formes graves de shigellose ?

A

majoritairement chez les personnes immunodéprimés et les enfants de moins de 5 ans (60%)

65
Q

Quels sont les facteurs de virulence de Shigella dysentariae ?

A
  • Endotoxine LPS (commun à toutes les
    entérobactéries)
  • Toutes les souches utilisent SST3 : explique pouvoir invasif
  • La particularité de S. dysenteriae : production d’une entérotoxine : Shigatoxine (Stx)
66
Q

Particularité de la Shigatoxine ?

A
  • Stx responsable de la forme grave de la Shigellose
  • explique la forte mortalité provoquée par cette espèce
  • une des toxines les + puissante
  • Portée par le chromosome ou plasmide
  • Ingérée majoritairement par l’alimentation
  • Responsables de diarrhées sanglantes,
    insuffisance rénale, syndrome urémique,
    syndrome hémolytique
67
Q

Quantité de Shigella dysenteriae à ingérer pour développer une pathologie ?

A

10 à 100 bactéries suffisent à provoquer une pathologie

68
Q

Quelles sont les pathologies causées par Escherichia coli chez l’Ho ?

A
  • Infection urinaire (++)
  • Infection entérique
  • Infection invasive (rare)
  • Infection à d’autres sites
69
Q

Quelles sont les espèce d’Escherichia ?

A

5 espèces :
* E. coli
* + 4 autres

70
Q

Caractéristiques d’Escherichia coli ?

A
  • bactérie AAF la + abondante dans côlon humain, d’autres mammifères et oiseaux
  • souches commensales très bien adaptées à une
    coexistence pacifique avec l’hôte
71
Q

Comment se déclarent des infection intestinales à Escherichia coli ?

A
  • acquisition et combinaison de facteurs de virulence = modification de leur comportement
  • sérotypes particuliers ont été répertoriées comme étant des souches pathogènes responsables d’infections allant de la :
    • simple diarrhée
    • infections systémiques sévères voire mortelles
72
Q

Caractères culturaux et biochimiques d’Escherichia coli ?

A
  • Caractères généraux entérobactéries
  • Mobilité
  • Saccharose +
  • Lactose +
  • indole +
  • citrate -
  • VP -
  • urée -
  • Production de gaz
  • Parfois présence de capsule Ag K
73
Q

Comment sont classés les sérotypes des souches infectieuses d’Escherichia coli ?

A
  • Antigène O (+ 160)
  • Antigène K (+ 80)
  • Antigène H : (+ 50)
74
Q

Réservoir d’Escherichia coli ?

A
  • intestins des animaux à sang chauds : Humain, animaux d’élevages, chiens et chats
  • Oiseaux sauvages
  • Environnements aqueux : eau de surface, eaux usées et
    dans les sols
  • Aliments
  • Milieux hospitaliers
75
Q

Transmission d’Escherichia coli ?

A
  • Essentiellement par l’alimentation
  • Eau
  • Contact animaux-homme
76
Q

Que sont les IPEC ?

A

Infections par E. coli entéropathogènes

77
Q

Quelles sont les principaux pathovars E. coli entéropathogènes ?

A
  • les EIEC (Entéro-invasifs)
  • les EPEC (Entéropathogènes)
  • Les ETEC (Entérotoxinogènes)
  • Les EHEC (entérohémorragiques)
    => Possibilité de Bactériémie
78
Q

Caractéristiques des ETEC ?

A
  • libèrent des entérotoxines cytotoxiques
  • diarrhées chez les enfants dans les pays en voie de développement (“turista”)
79
Q

Caractéristiques des EPEC ?

A
  • “effacement” des microvillosités par une toxine altérant le cytosquelette cellulaire
  • Diarrhées sévères infantiles dans les pays en voie de développement
  • Physiopathologie mal connue
80
Q

Caractéristiques des EIEC ?

A
  • multiplication intracellulaire et toxinogènes
  • syndrome dysentérique :
    • fièvre
    • diarrhée sanglante et purulente
    • envahissement de l’épithélium colique
    • réaction inflammatoire locale intense
  • souches proches des Shigelles
81
Q

Caractéristiques des EHEC ?

A
  • quantité importante de cytotoxines dans le gros intestin agissant sur le cytosquelette :
    • diarrhées aqueuses
    • colites hémorragiques avec crampes abdominales sévères
    • diarrhées sanglantes
  • invasifs
  • Complication = SHU (syndrome urémique
    hémolytique)
  • adhérence aux entérocytes
  • production de vérotoxine = Shiga-Like toxine → inhibition de la synthèse protéique
  • d’hémolysine
82
Q

Point commun des ETEC et EPEC ?

A
  • Diarrhées hydriques
    => Symptômes « peu graves » avec rétablissement rapide
83
Q

Point commun des EIEC et EHEC ?

A
  • Diarrhées inflammatoires
    => Symptômes avec complications pouvant être graves amenant à la mort dans certains cas (EHEC ++)
84
Q

Pathologie dont Yersinia est l’agent chez l’Ho ?

A
  • La peste (Y. pestis)
  • Infection digestive (Y. enterocolitica et Y.
    pseudotuberculosis    )
85
Q

Taxonomie de Yersinia ?

A

3 espèces pathogènes pour l’Ho :
* Y. pestis
* Y. enterocolitica
* Y. pseudotuberculosis

86
Q

Caractères culturaux de Yersinia ?

A
  • Petits bacilles Gram –
  • Peut croître entre 4°C et 37°C et 20-30°C pour Y. pestis
  • lactose + , saccharose + pas pour Y. pestis
  • Mise en évidence sur gélose CIN (Cefsulodine-Irgasan-Novobiocine)
  • Y. entérocolitica = mobile à 27°C (abs à 37°C)
87
Q

Epidémiologie de Yersinia pestis ?

A
  • Europe au (14e siècle) : manifestée
    de façon récurrente durant plus de 300 ans
  • pandémie apparue en Asie centrale (milieu du 19e siècle et a essaimé dans le monde entier
  • Chaque pandémies aurait été causée par un biovar différent de Y. pestis
  • Existe cas de peste par an dans le monde
    (Madagascar, RDC, Ouganda…)
  • Dernier cas en France : 1945
88
Q

Réservoir de Yersinia enterocolitica ?

A
  • Réservoir : Porc ++, bovins, ovin
89
Q

Transmission de Yersinia enterocolitica ?

A

viande de porc contaminée insuffisamment cuite, lait cru, eau contaminée…

90
Q

Epidémiologie de Yersinia enterocolitica ?

A
  • 3ème cause d’infection digestive après Campylobacter et Salmonella.
  • Responsable de la yersiniose (98%)
  • 6 839 cas confirmé en Europe (30 000 cas estimé en France par an), sous estimé +++
91
Q
A
92
Q

Symptômes de la yersiniose ?

A
  • entérite aiguë
  • fièvre
  • diarrhées
  • douleurs abdominales
92
Q

Caractéristique de la yeriniose ?

A
  • toutes les classes d’âges (prédominance -10 ans)
  • Bactériémie possible chez immunodéprimés et personnes âgés principalement
  • petite épidémie familiale
  • spontanément résolutive
93
Q

Quels sont les facteurs de virulence des Yersinia ?

A

Nombreux facteurs de virulence

94
Q
A
95
Q

Quelles sont les géloses que l’on peut utiliser pour la culture des entérobactéries ?

A
  • Gélose drigalski (lactose)
  • Gélose Hektoen
  • Gélose SS
  • Gélose CIN
  • Gélose McConkey
    => autres géloses chromogènes sont également utilisées pour faciliter l’identification
96
Q

Quels sont les tests utilisés pour le diagnostic des entérobactéries ?

A
  • Test uréase
  • Test indole
  • Test VP
  • Galeries API => Automates lisent le résultat d’ID après 24h
    => PEU utilisé
97
Q

Quels sont les méthodes les + utilisées pour le diagnostic des entérobactéries ?

A
  • Spectrométrie de masse
  • Score d’identification précis et rapide +++
98
Q

Quels sont les diagnostics direct et indirect réalisables pour les entérobactéries ?

A
  • Sérogroupage (direct)
  • Test Gruber-Widal (indirect)
99
Q

Caractéristiques du sérogroupage des entérobactéries ?

A
  • Agglutination antigène/anticorps
  • Systématique pour Salmonella
  • Recherche des antigènes à l’aide d’un kit contenant les AC spécifiques des différents sérotypes
100
Q

Caractéristiques du Test Gruber-Widal ?

A
  • Agglutination Ag/AC
  • Recherche des AC dans le sérum dans le cadre de la fièvre Typhoïde et paratyphoïde
101
Q

Quels sont les différents types de PCR réalisables sur les entérobactéries ?

A

*PCR « universelle »
*PCR gènes spécifiques : (toxines, facteurs adhésion ou invasion…etc)

102
Q

Caractéristiques de la PCR “universelle” sur les entérobactéries ?

A

gène codant l’ARN16S (ADNr16S)
+ Séquençage
+ Analyse des séquences genre et espèce bactériens

103
Q

TTT ATB des EHEC ?

A

/!\EHEC ne devraient pas ê traitées par ATBthérapie → stimulation de la sécrétion de toxine
=> Ré-hydratation et ttt des symptomes
* SHU : épuration extra-rénale

104
Q

Comment se fait le choix du ttt des entérobactéries ?

A

*L’ATBgramme oriente le choix du ttt
* Le ttt ensuite adapté selon :
* les ATB restant actifs
* l’infection traitée (méningite, pneumonie..)
* Le patient (facteurs de risques?)

105
Q

Quels sont les mécanismes de résistance aux ATB des entérobactéries ?

A
  • Défaut de perméabilité (porines)
  • Excrétion de l’antibiotique (efflux)
  • Défaut d’affinité de la cible
  • Inactivation de l’antibiotique (production de β-lactamases)
    • Pénicillinase de Haut Niveau
    • β-Lactamase à Spectre Etendu → très pbmatique
106
Q

Prophylaxie contre les entérobactéries ?

A
  • 2 principaux vaccins :
    • Vaccin inactivé polysaccharidique : S. Typhi. → Typhim Vi (voie intra-musculaire)
  • Vaccin vivant atténué : forme affaiblie de Salmonella Typhi. → Vivotif (voie oral)
107
Q

Caractéristiques du vaccin anti-typhoïde ?

A
  • préparé à partir de polysaccharide capsulaire Vi (Typhim Vi) purifié de Salmonella Typhi
  • immunité apparaît 15 jours à 3 semaines après l’injection
  • La durée de la protection est d’au moins 3 ans
  • RESERVE A L’ADULTE ET L’ENFANT DE + DE 2 ANS qui voyagent en zone d’endémie

{P3} µbiologie (42 decks)

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