Viro : CORONAVIRIDAE : Coronavirus

Question 1

Quels sont les différents coronavirus humains ?

Answer 1

• HCoV-229E et HCoV-OC43
• SARS-CoV (2003 : épidemie de SRAS)
• HCoV-NL63
• HCoV_HKU
• MERS-CoV, virus du syndrome respiratoire du Moyen Orient, Arabie Saoudite, en 2012
• SARS-CoV-2, coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère, depuis 2019

Question 2

Quelles sont les différents origines des coronavirus ?

Answer 2

Chauve souris :
- HCoV-229E
- Sars-CoV
- MERS-CoV
- HCoV-NL63
Rongeurs :
- HCoV-OC43
- HCoV-NL63

Question 3

Quelles sont les différents genre de la sous famille coronavirinae ?

Answer 3

4 :
- alpha
- beta (SARS CoV 2)
- gamma
- delta

Question 4

Caractéristiques du genre alpha des coronavirus ?

Answer 4

=> HCoV-229E et HCoV-NL63
* tous les continents
* provoquent des rhumes, des infections respiratoires et des infections digestives
* personnes à risque = jeunes enfants, personnes âgées + immunodéprimés

Question 5

Caractéristiques du genre béta des coronavirus ?

Answer 5

=> HCoV-OC43 et HCoV-HKU1
* tous les continents
* induisent des rhumes, infections respiratoires et digestives

Question 6

Caractéristiques épidémiologiques du SARS-CoV ?

Answer 6

• 2002/2003
• provoqué un syndrome respiratoire aigu sévère
• taux de mortalité de 9,6%

Question 7

Caractéristiques épidémiologiques du MERS CoV ?

Answer 7

• Syndrome respiratoire du Moyen-Orient
• 2254 personnes infectées
• 800 décès
• 27 pays
• taux de mortalité de 35%

Question 8

Différence entre SARS CoV 2 et Covid-19 ?

Answer 8

• Le Covid 19 est la maladie
• Le SARS-CoV 2 est le virus responsable de la maladie

Question 9

Caractéristiques épidémiologiques du SARS-CoV 2 ?

Answer 9

• 601 millions de cas dans le monde et
• 6,4 millions de morts
• taux de mortalité de 0,1% à + de 25% en fonction des pays

Question 10

Caractéristiques structurale des coronaviridea ?

Answer 10

• enveloppées => couronne visible au MET
• 60 à 200 nm de diamètre
• virus à ARN + simple brin (30 kb)
• ARN protégé par nucléocapside (N)
• Enveloppe composée de protéines M, E, et S

Question 11

Caractéristiques du génome des coronaviridea ?

Answer 11

• 14 ORF codant pour 27 protéines
• ORF1a/b = polyprotéines dont RNA polymérase (21kb)
• ORF S, ORF E, ORF M et ORF N

Question 12

Comment expliqué le fort taux de mutation des coronaviridae ?

Answer 12

La polymérase prend une très grande partie du génome => beaucoup d’erreur au niveau des autres protéines => mutations du génome

Question 13

Qu’engendre une mutation de la protéine S ?

Answer 13

Modifie le tropisme du virus

Question 14

Localisation des infections au coronaviridae ?

Answer 14

essentiellement dans l’arbre respiratoire supérieur

Question 15

Comment se fait l’entré des coronaviridae dans les cellules de l’organisme ?

Answer 15

glycoprotéine S du virus reconnaît l’acide sialique puis intervention d’une protéase comme corécepteur → fusion entre l’enveloppe et la membrane cytoplasmique

Question 16

Localisation dans l’organisme du SARS CoV ?

Answer 16

• Dans les voies basses de l’arbre respiratoire ++ → forte présence des récepteurs ACE2
• Récepteur ACE2 → première fixation → protéase
  TMPRSS2 → permettre la fusion

Question 17

Localisation dans l’organisme du MERS CoV ?

Answer 17

fixe au récepteur DPP4 : cellules épithéliales rénales, alvéole, intestin grêle, foie et prostate

Question 18

Localisation dans l’organisme du SARS CoV 2 ?

Answer 18

• Récepteur ACE2 : poumons, foie, cœur, reins, intestin
• corécepteur TMPRSS2 facilite la fusion du virus
• interaction avec la protéine Spike et une fixation 10 à 20 x + importante que le SARS CoV

Question 19

Cycle de multiplication du SARS CoV 2 ?

Answer 19

entré dans la cellule hôte → libérer son génome considéré comme ARNm → traduit en 2 temps :
1) traduction 5’ : synthèse de la polymérase
2) polymérase va dupliquer le génome du virus et commettre des erreurs
→ synthèse des protéines de structures via néo ARN → formation du virus qui sera libéré dans le milieu extérieur

Question 20

Quels sont les symptômes caractéristiques du SARS CoV ?

Answer 20

• Toux
• céphalées
• forte fièvre : ≥ 38°C
• mal de gorge
• pneumonies
• diminution des lymphocytes
  => Symptômes 3 à 7 j après l’exposition

Question 21

Quelles sont les différentes étapes de l’infection au SARS Cov ?

Answer 21

Phase précoce et phase tardive

Question 22

Quelles sont les cellules cibles du SARS CoV dans les voies basses et l’impact de cette infection ?

Answer 22

infecter les pneumocytes de type I et II → réponse immunitaire → inflammation → œdème pulmonaire → détresse respiratoire

Question 23

Quels sont les différents tableau cliniques décrit lors d’une infection au MERS CoV ?

Answer 23

• absence de symptômes
• symptômes respiratoire bénins : fièvre, toux et difficultés respiratoires
• maladie respiratoire aiguë grave ou décès
• pneumonie fréquente : manquer d’oxygène et à souffrir de syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA)
• symptômes gastro-intestinaux (diarrhées), des vomissements et des nausées.
• Certains malades souffrent également d’IR

Question 24

Quels sont les différents tableau cliniques d’une infection au SARS CoV 2 ?

Answer 24

• asymptomatiques à 30%
• symptomatiques à 70% :
• maux de tête
• fièvre
• fatigue

Question 25

Caractéristiques des formes sévère d’infection au SARS CoV 2 ?

Answer 25

• 15% contractées par des patients à risque
  (diabète, hypertension, cancer, obésité…)
• Dues au développement du virus dans les reins, les poumons et le cœur
• réponse immunitaire exagérée => induit libération anarchique de cytokines qui vont abîmer les tissus des personnes infectées

Question 26

Quelles sont les cytokines impliquées dans un infection à SARS CoV 2 ?

Answer 26

• Principales cytokines associées à la forme sévère : IL-6, IL-10, TNF-alpha, et sIL-2R
• Autres médiateurs solubles élevés : IL-7, G-CSF, IP-10, MCP-1 et MIP-1 alpha

Question 27

Classification des différentes formes d’infection à SARS CoV2 ?

Answer 27

• Stade 1
• Sade 2
• Stade 3
• Stade 4

Question 28

Caractéristiques du stade 1 d’une infection au SARS CoV 2 ?

Answer 28

Forme légère ou non compliquée : SANS pneumonie RADIOLOGIQUE

Question 29

Caractéristiques du stade 2 d’une infection au SARS CoV 2 ?

Answer 29

Forme modérée ou pneumonie non sévère : pneumonie clinique (anomalies auscultatoires) et/ou radiologiques +/- fièvre

Question 30

Caractéristiques du stade 3 d’une infection au SARS CoV 2 ?

Answer 30

Forme sévère ou pneumonie sévère ou sepsis = 1 critère parmi :
- saturation en oxygène <93%
- tachypnée fréquence respiratoire > 30/min
- ou oxygénodépendance

Question 31

Caractéristiques du stade 4 d’une infection au SARS CoV 2 ?

Answer 31

Forme critique :
- Choc septique
- Détresse respiratoire aiguë, SDRA
- Défaillance multiviscérale

Question 32

R0 du SARS CoV 2 ?

Answer 32

R0 = 3
Une personne qui est atteinte du SARS-CoV-2 le transmet à 3 personnes

Question 33

2volution d’une épidémie selon le R0 d’un virus ?

Answer 33

Si R0 < 1 : nb de cas va diminuer dans le temps (disparition automatique)
Si R0=1: nb de cas va être stable
Si R0>1 : nb de cas va augmenter → transmission
exponentielle

Question 34

Caractéristiques du diagnostic du SARS CoV 2 par PCR ?

Answer 34

pic de réplication à 14 jours → optimal

Question 35

Caractéristiques du diagnostic du SARS CoV 2 par sérologie ?

Answer 35

à partir du 7ème jour avec les IgM

Question 36

Que permettent de détecter les TROD dans le cadre du SARS Cov 2 ?

Answer 36

détection IgM/IgG anti-SARS-CoV-2

Question 37

Caractéristiques du TROD utilisé pour le diagnostic du SARS CoV 2 ?

Answer 37

• méthode immunochromatographique
• IgM/IgG anti SARS CoV 2 détectées par un Ag recombinant SARS CoV 2 et un AC de souris anti IgM /IgG humain
• IgM/IgG anti-SARS-CoV-2 présentes dans l’échantillon réagissent avec l’Ag recombinant SARS-CoV-2 lié aux particules d’or
• Complexe migre le long de la membrane et atteint la ligne de test IgM/IgG (T) → possède un AC souris anti IgM /IgG humain contre le complexe IgM/IgG SARS-CoV-2
• Si résultat est positif : complexe Ag recombinant-AC SARS-CoV-2 marqué à l’or se lie à la ligne de test IgM/IgG (T) et une couleur rouge pourpre apparaît
• Si ésultat est négatif, l’échantillon ne contient aucun complexe antigène recombinant-anticorps SARS-CoV-2 pouvant se lier à la ligne de test IgM/IgG (T) et aucune couleur n’apparaît
• Apparition d’une ligne de contrôle rouge pourpre (C) garantit que l’application et la migration de l’échantillon se sont déroulées correctement et que le test a été correctement réalisé

Question 38

Quels sont les antiviraux utilisé dans le cadre d’une infection au SARS Cov 2 ?

Answer 38

• PAXLOVID
• molnupiravir (pas utilisé en Fr)
• remdesivir (Veklury)

Question 39

Caractéristiques du PAXLOVID ?

Answer 39

• Administré dans les 5 j suivant les premiers symptômes chez les adultes et adolescents présentant un risque accru d’évolution vers une forme grave de la maladie
• Association du nirmatrelvir (inhibiteur de l’une des protéases virales 3 CL) et le ritonavir (↑ la biodisponibilité dans l’organisme) à faible C°

Question 40

Caractéristiques du remdesivir ?

Answer 40

• Inhibe la réplication virale : prescription chez les patients qui ont contracté le virus et peuvent faire une forme grave
• Analogue des nucléosides → empêche la
  réplication du virus

Question 41

Quels sont les AC monoclonaux utilisés dans le cadre d’une infection au SARS CoV 2 ?

Answer 41

• EVUSHELD
• sotrovimab

Question 42

Caractéristiques du sotrovimab ?

Answer 42

→ reconnaît un épitope de la protéine S hautement conservé dans le sous genre Sarbecovirus

Question 43

Caractéristiques de l’EVUSHELD ?

Answer 43

• Recommandée chez les 18 ans et +, à très haut
  risque de forme sévère de Covid-19 et faiblement ou non répondeurs à la vaccination
• Efficace contre les variants