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{P3} µbiologie > Viro : CORONAVIRIDAE : Coronavirus > Flashcards

Viro : CORONAVIRIDAE : Coronavirus Flashcards

23/09/24 => Bousarghin

1
Q

Quels sont les différents coronavirus humains ?

A
  • HCoV-229E et HCoV-OC43
  • SARS-CoV (2003 : épidemie de SRAS)
  • HCoV-NL63
  • HCoV_HKU
  • MERS-CoV, virus du syndrome respiratoire du Moyen Orient, Arabie Saoudite, en 2012
  • SARS-CoV-2, coronavirus 2 du syndrome respiratoire aigu sévère, depuis 2019
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Q

Quelles sont les différents origines des coronavirus ?

A

Chauve souris :
- HCoV-229E
- Sars-CoV
- MERS-CoV
- HCoV-NL63
Rongeurs :
- HCoV-OC43
- HCoV-NL63

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3
Q

Quelles sont les différents genre de la sous famille coronavirinae ?

A

4 :
- alpha
- beta (SARS CoV 2)
- gamma
- delta

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4
Q

Caractéristiques du genre alpha des coronavirus ?

A

=> HCoV-229E et HCoV-NL63
* tous les continents
* provoquent des rhumes, des infections respiratoires et des infections digestives
* personnes à risque = jeunes enfants, personnes âgées + immunodéprimés

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Q

Caractéristiques du genre béta des coronavirus ?

A

=> HCoV-OC43 et HCoV-HKU1
* tous les continents
* induisent des rhumes, infections respiratoires et digestives

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6
Q

Caractéristiques épidémiologiques du SARS-CoV ?

A
  • 2002/2003
  • provoqué un syndrome respiratoire aigu sévère
  • taux de mortalité de 9,6%
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7
Q

Caractéristiques épidémiologiques du MERS CoV ?

A
  • Syndrome respiratoire du Moyen-Orient
  • 2254 personnes infectées
  • 800 décès
  • 27 pays
  • taux de mortalité de 35%
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8
Q

Différence entre SARS CoV 2 et Covid-19 ?

A
  • Le Covid 19 est la maladie
  • Le SARS-CoV 2 est le virus responsable de la maladie
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9
Q

Caractéristiques épidémiologiques du SARS-CoV 2 ?

A
  • 601 millions de cas dans le monde et
  • 6,4 millions de morts
  • taux de mortalité de 0,1% à + de 25% en fonction des pays
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10
Q

Caractéristiques structurale des coronaviridea ?

A
  • enveloppées => couronne visible au MET
  • 60 à 200 nm de diamètre
  • virus à ARN + simple brin (30 kb)
  • ARN protégé par nucléocapside (N)
  • Enveloppe composée de protéines M, E, et S
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11
Q

Caractéristiques du génome des coronaviridea ?

A
  • 14 ORF codant pour 27 protéines
  • ORF1a/b = polyprotéines dont RNA polymérase (21kb)
  • ORF S, ORF E, ORF M et ORF N
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12
Q

Comment expliqué le fort taux de mutation des coronaviridae ?

A

La polymérase prend une très grande partie du génome => beaucoup d’erreur au niveau des autres protéines => mutations du génome

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13
Q

Qu’engendre une mutation de la protéine S ?

A

Modifie le tropisme du virus

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14
Q

Localisation des infections au coronaviridae ?

A

essentiellement dans l’arbre respiratoire supérieur

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15
Q

Comment se fait l’entré des coronaviridae dans les cellules de l’organisme ?

A

glycoprotéine S du virus reconnaît l’acide sialique puis intervention d’une protéase comme corécepteur → fusion entre l’enveloppe et la membrane cytoplasmique

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16
Q

Localisation dans l’organisme du SARS CoV ?

A
  • Dans les voies basses de l’arbre respiratoire ++ → forte présence des récepteurs ACE2
  • Récepteur ACE2 → première fixation → protéase
    TMPRSS2 → permettre la fusion
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17
Q

Localisation dans l’organisme du MERS CoV ?

A

fixe au récepteur DPP4 : cellules épithéliales rénales, alvéole, intestin grêle, foie et prostate

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18
Q

Localisation dans l’organisme du SARS CoV 2 ?

A
  • Récepteur ACE2 : poumons, foie, cœur, reins, intestin
  • corécepteur TMPRSS2 facilite la fusion du virus
  • interaction avec la protéine Spike et une fixation 10 à 20 x + importante que le SARS CoV
19
Q

Cycle de multiplication du SARS CoV 2 ?

A

entré dans la cellule hôte → libérer son génome considéré comme ARNm → traduit en 2 temps :
1) traduction 5’ : synthèse de la polymérase
2) polymérase va dupliquer le génome du virus et commettre des erreurs → synthèse des protéines de structures via néo ARN → formation du virus qui sera libéré dans le milieu extérieur

20
Q

Quels sont les symptômes caractéristiques du SARS CoV ?

A
  • Toux
  • céphalées
  • forte fièvre : ≥ 38°C
  • mal de gorge
  • pneumonies
  • diminution des lymphocytes
    => Symptômes 3 à 7 j après l’exposition
21
Q

Quelles sont les différentes étapes de l’infection au SARS Cov ?

A

Phase précoce et phase tardive

22
Q

Quelles sont les cellules cibles du SARS CoV dans les voies basses et l’impact de cette infection ?

A

infecter les pneumocytes de type I et II → réponse immunitaire → inflammation → œdème pulmonaire → détresse respiratoire

23
Q

Quels sont les différents tableau cliniques décrit lors d’une infection au MERS CoV ?

A
  • absence de symptômes
  • symptômes respiratoire bénins : fièvre, toux et difficultés respiratoires
  • maladie respiratoire aiguë grave ou décès
  • pneumonie fréquente : manquer d’oxygène et à souffrir de syndrome de détresse respiratoire aiguë (SDRA)
  • symptômes gastro-intestinaux (diarrhées), des vomissements et des nausées.
  • Certains malades souffrent également d’IR
24
Q

Quels sont les différents tableau cliniques d’une infection au SARS CoV 2 ?

A
  • asymptomatiques à 30%
  • symptomatiques à 70% :
  • maux de tête
  • fièvre
  • fatigue
25
Q

Caractéristiques des formes sévère d’infection au SARS CoV 2 ?

A
  • 15% contractées par des patients à risque
    (diabète, hypertension, cancer, obésité…)
  • Dues au développement du virus dans les reins, les poumons et le cœur
  • réponse immunitaire exagérée => induit libération anarchique de cytokines qui vont abîmer les tissus des personnes infectées
26
Q

Quelles sont les cytokines impliquées dans un infection à SARS CoV 2 ?

A
  • Principales cytokines associées à la forme sévère : IL-6, IL-10, TNF-alpha, et sIL-2R
  • Autres médiateurs solubles élevés : IL-7, G-CSF, IP-10, MCP-1 et MIP-1 alpha
27
Q

Classification des différentes formes d’infection à SARS CoV2 ?

A
  • Stade 1
  • Sade 2
  • Stade 3
  • Stade 4
28
Q

Caractéristiques du stade 1 d’une infection au SARS CoV 2 ?

A

Forme légère ou non compliquée : SANS pneumonie RADIOLOGIQUE

29
Q

Caractéristiques du stade 2 d’une infection au SARS CoV 2 ?

A

Forme modérée ou pneumonie non sévère : pneumonie clinique (anomalies auscultatoires) et/ou radiologiques +/- fièvre

30
Q

Caractéristiques du stade 3 d’une infection au SARS CoV 2 ?

A

Forme sévère ou pneumonie sévère ou sepsis = 1 critère parmi :
- saturation en oxygène <93%
- tachypnée fréquence respiratoire > 30/min
- ou oxygénodépendance

31
Q

Caractéristiques du stade 4 d’une infection au SARS CoV 2 ?

A

Forme critique :
- Choc septique
- Détresse respiratoire aiguë, SDRA
- Défaillance multiviscérale

32
Q

R0 du SARS CoV 2 ?

A

R0 = 3
Une personne qui est atteinte du SARS-CoV-2 le transmet à 3 personnes

33
Q

2volution d’une épidémie selon le R0 d’un virus ?

A

Si R0 < 1 : nb de cas va diminuer dans le temps (disparition automatique)
Si R0=1: nb de cas va être stable
Si R0>1 : nb de cas va augmenter → transmission
exponentielle

34
Q

Caractéristiques du diagnostic du SARS CoV 2 par PCR ?

A

pic de réplication à 14 jours → optimal

35
Q

Quand peut se faire le diagnostic du SARS CoV 2 par sérologie ?

A

à partir du 7ème jour avec les IgM

36
Q

Que permettent de détecter les TROD dans le cadre du SARS Cov 2 ?

A

détection IgM/IgG anti-SARS-CoV-2

37
Q

Caractéristiques du TROD utilisé pour le diagnostic du SARS CoV 2 ?

A
  • méthode immunochromatographique
  • IgM/IgG anti SARS CoV 2 détectées par un Ag recombinant SARS CoV 2 et un AC de souris anti IgM /IgG humain
  • IgM/IgG anti-SARS-CoV-2 présentes dans l’échantillon réagissent avec l’Ag recombinant SARS-CoV-2 lié aux particules d’or
  • Complexe migre le long de la membrane et atteint la ligne de test IgM/IgG (T) → possède un AC souris anti IgM /IgG humain contre le complexe IgM/IgG SARS-CoV-2
  • Si résultat est positif : complexe Ag recombinant-AC SARS-CoV-2 marqué à l’or se lie à la ligne de test IgM/IgG (T) et une couleur rouge pourpre apparaît
  • Si ésultat est négatif, l’échantillon ne contient aucun complexe antigène recombinant-anticorps SARS-CoV-2 pouvant se lier à la ligne de test IgM/IgG (T) et aucune couleur n’apparaît
  • Apparition d’une ligne de contrôle rouge pourpre (C) garantit que l’application et la migration de l’échantillon se sont déroulées correctement et que le test a été correctement réalisé
38
Q

Quels sont les antiviraux utilisé dans le cadre d’une infection au SARS Cov 2 ?

A
  • PAXLOVID
  • molnupiravir (pas utilisé en Fr)
  • remdesivir (Veklury)
39
Q

Caractéristiques du PAXLOVID ?

A
  • Administré dans les 5 j suivant les premiers symptômes chez les adultes et adolescents présentant un risque accru d’évolution vers une forme grave de la maladie
  • Association du nirmatrelvir (inhibiteur de l’une des protéases virales 3 CL) et le ritonavir (↑ la biodisponibilité dans l’organisme) à faible C°
40
Q

Caractéristiques du remdesivir ?

A
  • Inhibe la réplication virale : prescription chez les patients qui ont contracté le virus et peuvent faire une forme grave
  • Analogue des nucléosides → empêche la
    réplication du virus
41
Q

Quels sont les AC monoclonaux utilisés dans le cadre d’une infection au SARS CoV 2 ?

A
  • EVUSHELD
  • sotrovimab
42
Q

Caractéristiques du sotrovimab ?

A

→ reconnaît un épitope de la protéine S hautement conservé dans le sous genre Sarbecovirus

43
Q

Caractéristiques de l’EVUSHELD ?

A
  • Recommandée chez les 18 ans et +, à très haut
    risque de forme sévère de Covid-19 et faiblement ou non répondeurs à la vaccination
  • Efficace contre les variants

{P3} µbiologie (42 decks)

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