Humane genoom en analyse van genexpressie met microarrays en NGS

Question 1

bepalen sequentie

Answer 1

1. Isoleren van DNA
2. Kloneren van het DNA (mbv bacterien)
3. Delen van DNA ordenen op plek van chromosoom
4. Een specifiek deel van DNA in stukjes knippen
5. Sequencen van de kleine stukjes DNA, waarna deze weer in volgorde worden gezet.

Question 2

genoom

Answer 2

complete set van DNA

Question 3

transcriptoom

Answer 3

complete set RNA

Question 4

proteoom

Answer 4

complete set van eiwitten

Question 5

metaboloom

Answer 5

complete set van metabolieten

Question 6

toepassing humane genoomsequentie

Answer 6

identificeren en klonen van ziektegenen, identificeren nieuwe genen die verwant zijn aan bekende drug targets, vinden van mutaties die overgevoeligheid voor medicijnen veroorzaken

Question 7

cDNA microarrays

Answer 7

Je kan RNA uit de tumor en gezond weefsel halen en analyseren met microarray analyse.

• Geen oplichting: genen niet tot expressie
• Gele uitslag: genen komen even hard tot expressie in beide weefsels
• Rode of groene: genen komen in ene weefsel meer tot expressie dan in andere weefsel.

Question 8

Wat is het doel van cDNA

Answer 8

krijgen van inzicht in genen en moleculaire processen is voor het verbeteren van diagnose, prognose en individuele behandeling.

Question 9

Wat kun je halen uit NGS met mRNA

Answer 9

 Gebruik van alternatieve promotoren
 Alternatieve splicing
 Allel-specifieke genexpressie (verschillen tussen de allelen van de ouders).
 Mutatie detectie
 Ontdekking van nieuwe exons, niet-coderende RNAs en microRNAs