Cours 3 MICROBIOLOGIE ET CHAMPIGNONS I Flashcards
Nommer les 5 grandes catégories des microorganismes d’importance médicale
- Bactéries (le plus souvent chez les patients)
- Champignons
- Parasites
- Virus
- Prions
Bactéries
Structure: Unicellulaire (une seule cellule)
Reproduction: Fission binaire (Une cellule qui se sépare
pour en former 2)
Paroi: Paroi de peptidoglycanes (cible des antibiotiques)
Relation avec l’hôte: Free-living (Intracellulaire facultatif ou obligatoire) (Pas besoin de l’humain pour survivre - être humain bon milieu de culture (sang)
Champignons
Structure: Unicellulaire ou pluricellulaire
Reproduction: Fission binaire ou reproduction sexuée
Paroi: Paroi de chitine (cible Antifongiques)
Relation avec l’hôte: Free-living (intracellulaire facultatif) (survivent plus facilement encore que bactéries dans environnement)
Parasites
Structure: Unicellulaire ou pluricellulaire
Reproduction: Fission binaire ou reproduction sexuée
Paroi: Complexité variable jusqu’à petits animaux (paroi souvent cible anti-parasite)
Relation avec l’hôte: Free living
Virus
Structure: Acellulaire (Techniquement pas structure cellulaire, car n’ont pas tout matériel nécessaire pour se
reproduire de façon autonome)
Reproduction: Réplication via machinerie génétique de l’hôte
Paroi: Capside +/- enveloppée
Relation avec l’hôte: Intracellulaire obligatoire
Prions
Structure: Protéine (pas matériel génétique) (encore plus simple que virus)
Reproduction: Réplication via machinerie génétique de l’hôte
Paroi: Aucune
Relation avec l’hôte: Intracellulaire obligatoire
Nommer les 2 micro-organismes qui ont comme reproduction la 𝐫é𝐩𝐥𝐢𝐜𝐚𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐯𝐢𝐚 𝐥𝐚 𝐦𝐚𝐜𝐡𝐢𝐧𝐞𝐫𝐢𝐞 𝐠é𝐧é𝐭𝐢𝐪𝐮𝐞 𝐝𝐞 𝐥’𝐡ô𝐭𝐞.
- Virus
- Prions
Nommer les 2 micro-organismes qui ont comme reproduction la 𝐟𝐢𝐬𝐬𝐢𝐨𝐧 𝐛𝐢𝐧𝐚𝐢𝐫𝐞 OU la 𝐫𝐞𝐩𝐫𝐨𝐝𝐮𝐜𝐭𝐢𝐨𝐧 𝐬𝐞𝐱𝐮é𝐞.
- Champignons
- Parasites
Q1 : QSJ ? Je suis le seul micro-organisme qui peut se reproduire seulement par fission binaire.
Q2 : Donner la 𝐬𝐭𝐫𝐮𝐜𝐭𝐮𝐫𝐞 (unicellulaire ou pluri…) de ces micro-organismes.
- Bactéries : ???
- Champignons : ???
- Parasites : ???
- Virus : ???
- Prions : ???
Bactérie
Q2 :
- Bactéries : Unicellulaire
- Champignons : Uni ou pluri
- Parasites : Uni ou pluri
- Virus : Acellulaire
- Prions : Protéine
Quelle est la paroi de ces micro-organismes ?
- Bactérie :
- Prion :
- Champignon :
- Bactérie : Paroi de peptidoglycans
- Prion : Aucune
- Champignon : Paroi de chitine
Nommer les 2 micro-organismes qui ont une relation avec l’hôte 𝐢𝐧𝐭𝐫𝐚𝐜𝐞𝐥𝐥𝐮𝐥𝐚𝐢𝐫𝐞 𝐨𝐛𝐥𝐢𝐠𝐚𝐭𝐨𝐢𝐫𝐞.
- Virus
- Prions
Dire quelle est la relation de ces microbes avec leur hôte.
- parasite :
- champignon :
Q2 : Quelle est la paroi de ces micro-organismes ?
- Parasite :
- Virus :
parasite : Free living
champignon : Free living
Q2 : - Parasite : Complexité variable jusqu’à petits animaux
- Virus : Capside +/- enveloppé
Quelle est la relation du champignon avec son hôte ?
Free-living
(Intracellulaire facultatif)
Q1 : Quelles sont les deux grandes catégories des champignons ?
Q2 : Quelle est la relation de la bactérie avec son hôte ?
- Levures
- Filamenteux
Q2 : Free-living
(Intracellulaire facultatif ou obligatoire)
Q1 : Les champignons filamenteux se différencient principalement des levures par leurs ___
Q2 : VF ? Les champignons n’ont pas de noyau cellulaire
Q1 : hyphes
Q2 : FAUX
Q1 : Nommer les 4 catégories d’interaction hôte-agent infectieux
Q2 : En quoi consiste un prion ?
Q1 :
- Commensal
- Saprophyte
- Parasite
- Symbiose
Q2 : C’est une protéine déformée qui a la capacité de déformer d’autres protéines et ainsi les rendre malades.
Q1 : À quelle catégorie d’interaction hôte-agent infectieux cette description fait-elle référence ?
«Avantage autant pour l’hôte que pour l’agent. »
a) Commensal
b) Saprophyte
c) Parasite
d) Symbiose
Q2 : À quelle catégorie d’interaction hôte-agent infectieux cette description fait-elle référence ?
«Bénéfice pour l’agent infectieux sans dommage pour l’hôte. »
a) Commensal
b) Saprophyte
c) Parasite
d) Symbiose
Q1 : d) Symbiose
Q2 : b) Saprophyte
Q1 : À quelle catégorie d’interaction hôte-agent infectieux cette description fait-elle référence ?
«Avantage pour l’agent infectieux et dommage pour l’hôte. »
a) Commensal
b) Saprophyte
c) Parasite
d) Symbiose
Q2 : À quelle catégorie d’interaction hôte-agent infectieux cette description fait-elle référence ?
«Pas de dommage ou bénéfice ni pour l’hôte ni pour l’agent infectieux. »
a) Commensal
b) Saprophyte
c) Parasite
d) Symbiose
Q1 : c) Parasite
Q2 :
a) Commensal
Q1 : QSJ ? Nous sommes responsables de la dégradation des matières végétales.
Q2 : Les ___ ___ sont essentielles à la désintégration des tissus morts
Champignons
Q2 : bactéries carnivores
VF ? Les champignons …
- peuvent être unicellulaires:
- ont une diète végétarienne:
- ont tous des hyphes :
Les champignons …
- peuvent être unicellulaires: VRAI
- ont une diète végétarienne : VRAI
- ont tous des hyphes : FAUX, seuls les champignons filamenteux ont des hyphes
Q1 : Quelle est la grosse différence entre un colonisant et un pathogène ?
Q2 : Laquelle ou lesquelles de ces interactions hôte-agent infectieux ne peut 𝐏𝐀𝐒 indiquer un colonisant ?
a) Commensal
b) Saprophyte
c) Parasite
d) Symbiose
Q1 : Le colonisant n’entraîne pas de dommage pour l’hôte.
Q2 : c) Parasite
Où est-ce que le colonisant vie?
sur la peau ou dans le corps
Interaction hôte et agents infeciteux : commensal
Interaction neutre, personne en bénéficie (bactérie qui n’aide et nuit pas à l’humain et humain qui n’aide et nuit pas à la bactérie)
Interaction hôte et agents infeciteux : saprophyte
Relation qui bénéficie à l’agent infectieux sans dommage pour l’hôte (ex.: bactérie s’alimente de certains nutriments en petite quantité, mais lui cause aucun dommage)
Interaction hôte et agents infeciteux : parasite
Avantage pour l’agent infectieux et dommage pour l’hôte (ex.: bactérie s’alimente de certains nutriments en petite quantité et lui cause une carie)
Majorité pathogènes, microorganismes qui causent infections, sont des cette catégorie
Interaction hôte et agents infeciteux : symbiose
Avantages pour les 2
Dans les interaction hôte et agents infectieux qui est l’hôte?
L’humain
Qu’est-ce qu’un pathogène?
Causent des dommages qui peuvent être plus ou moins important à leur hôte
Quelle est la différence entre pathogène 𝐨𝐛𝐥𝐢𝐠𝐚𝐭𝐨𝐢𝐫𝐞 et pathogène 𝐨𝐩𝐩𝐨𝐫𝐭𝐮𝐧𝐢𝐬𝐭𝐞 ?
𝐨𝐛𝐥𝐢𝐠𝐚𝐭𝐨𝐢𝐫𝐞 : infection de tous les hôtes sans égard à l’état de leur système immunitaire
𝐨𝐩𝐩𝐨𝐫𝐭𝐮𝐧𝐢𝐬𝐭𝐞 : Infection seulement si l’hôte devient immuno-déprimé (système immunitaire très affaiblie)
À quoi servent les bactéries?
- Essentielle à la désintégration des tissus morts - Flore bactérienne digère les carnivores (notre corps)
- Industrie (yogourt
À quoi servent les champignons?
- Essentielle à la désintégration des matières végétales
- Industrie agroalimentaire (bière, pain et fromage)
Qu’est-ce que la virulence?
Le potentiel d’un microorganismes à être un parasite, donc un pathogène. (capacité à causer dommage chez son hôte)
VF? La même bactérie aura la même virulence chez deux hôtes différents
FAUX
Qu’est-ce qui affecte la virulence (capacité d’un microorganisme à cause des dommages chez l’humain)?
- Environnement de l’humain: tissu dans lequel le microorganisme va se trouver (ex.: peau vs circulation sanguin)
- Personne infectée: Immunité (dépend force système immunitaire)
- Microorganismes: Possède lui-même des facteurs de virulence
Quels sont les facteurs de virulence d’un microorganismes?
Les microorganismes n’ont pas tous les mêmes effets sur un même hôte
• Destruction des tissus de l’hôte (quel tissu - joue sur l’importance de l’infection)
• Évasion des défenses de l’hôte, destruction des tissus,
séquestration dans site inaccessible pour système
immunitaire (capsule)
• Engendre une sur-stimulation du système immunitaire
Qu’est-ce que la microbiologie?
•Spécialité médicale
– Microbiologie-infectiologie
Microbiologie: diagnostic laboratoire
Infectiologie: diagnostic clinique
Qu’est-ce que font les microbiologistes?
- Prévenir
- Diagnostiquer
- Traiter
Nommer les 4 grandes modalités diagnostiques en microbiologie pour identifier les microorganismes au laboratoire
- Examen direct
- Culture
- Immunodiagnostic
- Dx moléculaire
De quoi dépend le diagnostique microbiologique - examen direct?
- Caractéristiques des parois des microorganismes (surtout bactéries)
Q1 : À quel type de méthode Dx du diagnostique microbiologique correspond la coloration de gram ?
Q2 : Nommer les 3 grands facteurs de virulence
examen direct
Q2 :
- Environnement
- Hôte
- Microorganisme
Qu’est-ce que la coloration de Gram?
Permet de faire l’examen des bactéries au microscope et nous orienter vers quels microorganismes nous avons
- Quelle forme?
- Quelle gram?
Quelle est la différence entre une bactérie gram + et une bactérie gram - ?
Gram + : grosse couche externe de peptidoglycan
Gram - : mince couche intermédiaire de peptidoglycan.
Nommer les 4 étapes d’une coloration de Gram.
1- Application de crystal violet.
2- Application d’iode
3- Nettoyage à l’alcool
4- Application de safranine
VF ? Lors de la coloration de gram …
- toutes les bactéries prennent la coloration au crystal violet :
- les gram + sont décolorées par l’alcool :
- toutes les bactéries prennent la coloration de safranine :
Lors de la coloration de gram …
- toutes les bactéries prennent la coloration au crystal violet : VRAI
- les gram + sont décolorées par l’alcool : FAUX, les gram moins sont décolorées
- toutes les bactéries prennent la coloration de safranine : FAUX, seules les gram moins prennent la safranine
- Culture s’applique à?
Pour les bactéries, microbactéries, champignons et rarement pour des virus
Comment effectuons-nous la culture?
On récolte le crachas puis on l’ensemence dans des milieux de culture (jello très dur avec éléments nutritifs) après un certain temps d’incubation à des conditions particulières, les bactéries vont pousser.
Comment analysons-nous les résultats de culture?
Tout dépendant ils ont poussés dans quel milieu et leurs caractéristiques, on peut déterminer à quoi nous avons à faire.
On peut les mettre sur une feuille et faire des tests plus poussés pour pouvoir les identifier.
Comment identifions-nous les microorganismes?
- Microscope avec des colorations (gram)
- Se baser sur des caractéristiques métaboliques biochimique des bactéries (chaque bactérie à une signature biochimique - différents mécanismes cellulaires, il est possible de les identifier)
- Moléculaire (de + en + populaire, car très sensible pas besoin d’une grande quantité de microorganisme, très précis et rapide, mais cher et on ne distingue pas si c’est guérit ou active) - Appareil détecte matériel génétique du microorganisme
- Sérologie : détection d’anticorps
VF? Il est inutile de savoir quelle est la bactérie si nous ne savons pas à quel antibiotique la bactérie est sensible
VRAI
En quoi consiste une identification par antibiogramme ?
On teste des antibiotique sur la bactérie sur gélose et on incube dans l’incubateur (après 24h) il va y avoir des zones grandes autour de l’antibiotique si les bactéries sont incapables de pousser en présence de l’antibiotique.
Surtout pour bactéries
Q1 : Pour quelle condition de micro-organismes l’immuno-diagnostic est-il surtout utilisé ?
Q2 : Nommer les 2 principales formes des bactéries
Pour les bactéries difficiles à faire pousser ou autre microorganisme qui ne paraîtra pas sur une gélose
Q2 : Cocci
Bacille
VF ? Le diagnostic moléculaire …
- est une méthode rapide :
- constitue une détection du matériel génétique :
- permet de détecter les antigènes et anticorps :
- est une méthode rapide : VRAI
- constitue une détection du matériel génétique : VRAI
- permet de détecter les antigènes et anticorps :FAUX, ceci est vrai pour l’immuno-diagnostic
Le diagnostic moléculaire peut être fait sur tous les microorganismes qui ont un ___ ___
Le diagnostic moléculaire est surtout utilisé pour la détection des pathogènes qui …
matériel génétique
ne peuvent être cultivés
Nommer une autre méthode diagnostique en microbiologie.
MALDI-TOF
Le MALDI-TOF permet la détection de ___ des microorganismes selon leur masse et leur charge. (parois)
Selon le MALDI-TOF, chaque microorganisme a son ___ spécifique.
protéines
profil
Q1 : Nommer 2 avantages du MALDI-TOF.
Q2 : Quelle méthode diagnostique utilise des puits avec chaque bactérie ?
– Plus discriminant que les tests biochimiques
– Rapide
Q2 : Identification biochimique (catégorie microbiologique)
LE MALDI-TOF est plus discriminant que les ___ ___
tests biochimiques
Q1 : Quelle modalité diagnostique est surtout utilisé pour les virus, ou pour tout autre microorganismes difficile à faire pousser ?
Q2 : L’immuno-diagnostic permet la détection de 2 éléments. Lesquels ?
Q1 : Immunodiagnostic
Q2 :
Antigène
Anticorps
Qu’est-ce que l’immunodiagnostic?
Façon d’éviter d’avoir à faire pousser les microorganismes lorsque c’est difficile ou impossible en détectant des anticorps chez l’humain.
On veut voir si le corps a déjà vu l’infection ou nou, est-ce qu’il la voit en ce moment ou non?
Comment fonction l’immunodiagnostic?
Après un certain temps, on peut prendre du sang et mesurer la présence d’anticorps que notre corps à développer en réponse à une maladie.
Ça ne dit pas quand on a eu l’infection, mais ça dit qu’on l’a eu.
VF? Sérologie est un test d’immunodiagnostic?
VRAI
