9. VIROLOGIE 2 : PATHOGÉNÈSE ET DIAGNOSTIC Flashcards
complet
Qu’est-ce que la pathogénèse?
Interaction entre le virus et l’hôte dans une série d’étapes pour conduire à la maladie
VF? Majoritairement, ce n’est pas tous les virus qui reste dans le corps toute la vie
VRAI
Donner un exemple de virus qui reste à vie
Herpès, car s’intègre dans l’ADN
QSJ ? Interaction entre le virus et l’hôte dans une série d’étapes pour conduire à la maladie.
Pathogénèse
De quoi dépend le tropisme viral?
• Récepteur qui permet l’attachement
• Élément génétique qui favorise l’expression des gènes viraux qui peuvent êtres spécifiques à certains tissus
Le ___ ___ est le principal facteur de l’hôte influençant la pathogénèse.
statut immunitaire
VF? Il y a des virus qui ne cause aucun symptôme, mais c’est notre corps qui réagit.
VRAI - Des fois c’est la réaction inflammatoire de notre corps (pour se débarrasser du virus) qui rend le tout pire.
Quels facteurs de l’hôte influence la pathogénèse?
– Statut immunitaire
– Une infection peut-être banale pour un patient et mortelle pour un autre (ex: varicelle, virus respiratoire syncytial…)
– Femme enceinte et son fœtus
Pourquoi les femmes enceintes sont susceptibles aux infections de virus?
C’est comme s’il y avait eu un «shut down» de système immunitaire pour accepter du non soi (de son chum).
Pourquoi les bébés sont très susceptibles aux infections de virus?
Aucune mémoire, c’est comme s’ils étaient immunosupprimés
Exemple de statut immunitaire
Déficit congénital, VIH, traitements
immunosuppresseurs
Quelles sont les étapes de la pathogénèse?
– Entrée
– Réplication locale
– Dissémination
– Tropisme tissulaire
– 2e réplication tissulaire
– Dommage cellulaire
– Réponse immunitaire
🛑Nommer les 7 principaux modes de transmission des virus.
- Aérienne
- Gouttelettes
- Fécale-orale
- Percutanée
- Muqueuses
- Trans-placentaire (verticale)
- Arbovirus
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
«Le virus se déplace par micro-gouttelettes aériennes sur une longue distance »
Aérienne
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
«Le virus se déplace dans l’air sous forme de gouttelettes et la distance varie en fonction de la taille de la gouttelettes »
Gouttelettes
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Concerne surtout les virus causant la gastro-entérite. On les attrape en touchant du caca et le mettant dans notre bouche ou par de gros éclaboussures de vomis. »
Fécale-orale
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Le virus se transmet de la maman au bébé »
Trans-placentaire (verticale)
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Par le sang »
Percutanée
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Le virus se transmet par un arthropode (moustique). »
Arbovirus
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Le patient doit être placé dans une chambre à pression négative. »
Aérienne
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Nécessite une grande proximité »
Muqueuse
VF ? Les virus…
- peuvent être difficiles à diagnostiquer :
- peuvent tous être cultivés, mais difficilement :
- peuvent être cultivés dans tous les milieux :
Les virus…
- peuvent être difficiles à diagnostiquer : VRAI
- peuvent tous être cultivés, mais difficilement : FAUX, certains ne se cultivent pas
- peuvent être cultivés dans tous les milieux : FAUX, ne peuvent pas se cultiver dans les milieux artificiels
VF? Il est possible de voir les virus à l’oeil nu
FAUX - Microorganismes excessivement petits
Quels désavantages représentent le fait que les virus poussent seulement en présence de cellules vivantes?
- Expertise
- Coûts
- Risque de transmission
- Certains virus ne se cultivent pas (ex: hépatite C)
- Certains sont trop virulents (Ébola)
VF? À cause de la covid qui est capable de se répliquer dans les cellules on a plus le droit de faire de culture virale
VRAI
Nommer un exemple de milieu de transport du spécimen viral.
UTM : universal transport media
Diagnostic viral - Quand devons-nous faire le prélèvement du spécimen?
Le plus tôt possible au début de la maladie
Acheminé le plus rapidement possible au laboratoire…
idéalement dans un milieu de transport
Les virus enveloppés (ex. herpès) sont plus ___ que les virus non-enveloppés. (enterovirus)
fragiles
QSJ ? Je suis une technique de référence qui permet une identification sommaire des virus.
Microscopie électronique
Comment fonctionne la microscopie électronique?
Formes caractéristiques
– Permettent une identification sommaire
Technique de référence
– Nécessite expertise
VF? La microscopie électronique est de moins en moins utilisé
VRAI - La technique cède le pas graduellement à la biologie moléculaire
Qu’est-ce qui est le plus précis entre la détection antigénique et la biologie moléculaire?
Biologie moléculaire, car la détection antigénique est moins sensible, il faut une bonne quantité d’antigène pour pouvoir être détecté.
À quel virus est principalement limitée la microscopie électronique ?
Gastro-entérites
La technique de microscopie électronique cède le pas graduellement à la ___ ___.
biologie moléculaire
Nommer deux méthodes de détection antigénique.
- Techniques immunologiques directes (EIA)
- Immunofluorescence
Comment fonctionne la technique immunologique directe et sur quoi utilisons-nous cela?
– Enzyme immunoassay(EIA)
* détecte ARN virale
• Utilisation clinique:
– Influenza
– Coronavirus
Quels sont les avantages et les désavantages de le technique immunologique directe - enzyme immunoassay?
• Avantages:
– Rapide et facile d’utilisation
– Peu coûteux
• Désavantages:
– Moins sensible, et moins
spécifique
VF? L’immuno-fluorescence…
- nécessite une expertise inférieure à l’EIA :
- se basent sur l’émission lumineuse des lipides viraux :
- peut causer une interférence possible avec d’autres infections :
L’immuno-fluorescence…
- nécessite une expertise inférieure à l’EIA : FAUX, supérieure
- se basent sur l’émission lumineuse des lipides viraux : FAUX, émission lumineuse des protéines
- peut causer une interférence possible avec d’autres infections : FAUX, ceci est vrai pour la sérologie
Exemple de virus pour lequel fonctionne l’immuno-fluorescnce
herpes
QSJ ? Je suis une méthode Dx qui constituait la pierre angulaire dans les laboratoires de virologie.
Culture cellulaire
La culture cellulaire comme méthode Dx utilise ___ pour l’identification finale.
immuno-fluorescence
VF? La culture cellulaire n’a pas de lignée cellulaire universelle
VRAI - plusieurs lignées cellulaires
Quelles sont les différentes lignées cellulaires?
– Inoculation sur plusieurs types de cellules différentes
– Effets observés
• Tropisme cellulaire
• Vitesse de croissance
• Effet cytopathique caractéristique à un type de virus
– Identification finale par immunofluorescence
VF? La culture cellulaire est maintenant proscrite dans les laboratoires clinique
VRAI - à cause du SARS-Co-V-2
Qu’est-ce que le multiplex ?
Possibilité de détecter 𝗽𝗹𝘂𝘀𝗶𝗲𝘂𝗿𝘀 virus dans un même prélèvement et une même réaction
VF ? La biologie moléculaire comme méthode Dx…
- est un procédé rapide :
- permet un multiplex :
- est peu coûteuse :
La biologie moléculaire comme méthode Dx…
- est un procédé rapide : VRAI
- permet un multiplex : VRAI
- est peu coûteuse : FAUX
Quelles sont les techniques de biologie moléculaire?
– Techniques d’amplification d’acides nucléiques (TAAN): ex: PCR (polymerase chain reaction)
– Sondes, micropuces, etc
Interprétation des résultats de la polymérase chain reaction
Plus la courbe lève tôt et plus il y avait de copies d’ADN cibles au départ. Notion de cycle de seuil
Quelle méthode Dx utilise la Polymerase chain reaction ?
Biologie moléculaire
La Polymerase chain reaction fait l’amplification de…
du brin d’ADN/ARN
Quels sont les avantages de la biologie moléculaire?
– Diagnostic viral plus rapide
– Méthodes spécifiques
– Multiplex : Possibilité de détecter plusieurs virus dans un même prélèvement et une même réaction
• Ex: PCR respiratoires de 15 virus, RSV/SARS-CoV-2/influenza A et B…
- Quantitatif ou qualitatif
Biologie moléculaire quantitatif vs. qualitatif?
• Quantitatif: lorsque la charge virale est requise pour le suivi du traitement
Ex: charge virale VIH, VHB, VHC, CMV, EBV
• Qualitatif: Ex: Influenza, SARS-CoV-2, RSV (inquantifiable en nombre de copies)
Quels sont les désavantages de la biologie moléculaire?
• Très sensible à la contamination
• Personnel avec expertise
• Coûteux
Dans quel sens la biologie moléculaire est-elle très sensible à la contamination?
– Exemple: un technicien avec une grippe pourrait sortir de nombreux tests positifs pour la grippe si il contamine les réactifs
– Peut demeurer positif après un traitement efficace: détection de matériel génétique viable ou non
Puisque la biologie moléculaire est très couteuse, pour qui effectuons-nous cette technique?
Seulement pour les patients à risque de complications graves
Ex.: Immunosupprimés
QSJ ? Je suis une méthode diagnostic qui détecte la réponse immunitaire suite à une infection.
Sérologie
En quoi consiste la sérologie?
Identifier les anticorps du patient dirigés contre des virus connus
Qu’est-ce qui permet habituellement de différencier entre une infection récente vs ancienne, respectivement?
Les IgM et les IgG
Nommer 3 désavantages de la biologie moléculaire comme méthode Dx.
• Très sensible à la 𝗰𝗼𝗻𝘁𝗮𝗺𝗶𝗻𝗮𝘁𝗶𝗼𝗻
• Personnel avec 𝗲𝘅𝗽𝗲𝗿𝘁𝗶𝘀𝗲
• Coûteux
Les tests sérologiques consistent à identifier les ____ du patient dirigés contre des virus connus.
anticorps
Lequel permet de différencier une infection récente vs ancienne ?
- IgM :
- IgG :
- IgM : récente
- IgG : ancienne
VF ? Les IgM se développent immédiatement après l’infection.
FAUX
Il y a quand même un temps de latence
VF ? La sérologie ..
- ne permet pas le traitement prophylactique :
- nécessite une grande expertise :
- demeure positive même si le patient a été traité :
La sérologie ..
- ne permet pas le traitement prophylactique :FAUX, prophylaxie dans certains cas
- nécessite une grande expertise : VRAI
- demeure positive même si le patient a été traité : VRAI
VF ? La sérologie…
- est simple à instaurer :
- donne un diagnostic rapide :
- utilise la polymerase chain reaction :
La sérologie…
- est simple à instaurer : VRAI
- donne un diagnostic rapide : FAUX, un dx tardif
- utilise la polymerase chain reaction : FAUX, ceci est vrai pour la biologie moléculaire
Quels sont les avantages de la sérologie?
– Seule méthode pour diagnostiquer certaines infections
– Assez simple à instaurer
– Trace les infections antérieures du patient et permet un traitement prophylactique dans certains cas (VZV, CMV…)
Quels sont les désavantages de la sérologie?
– Expertise nécessaire
– Diagnostic tardif (patient souvent traité avant l’obtention du résultat)
– Interférence possible avec d’autres infections (flavivirus: VNO, Dengue…)
– Demeure positive même si le patient a été traité
Les méthodes diagnostic que culture cellulaire sont habituellement confirmées par ___.
immuno-fluorescence
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Comprend notamment les virus transmis sexuellement. »
Muqueuses
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Se fait notamment via des aiguilles et des seringues.»
Percutanée
Associer la description au bon mode de transmission des virus.
« Correspond au mode de transmission du virus Ebola.»
Aérien-contact renforcé
En pratique quelle démarche suivons-nous par rapport à l’identification d’un virus?
- Diagnostic clinique
- Si nécessaire et si traitement antiviral requis: confirmation du diagnostic
o Test rapide en cabinet (Influenza, RSV, SARS-CoV-2)
o Laboratoire milieu hospitalier: biologie moléculaire, culture virale (cessée x 2020), sérologie - Début/modification du traitement (si nécessaire)
