Épidémio INTRA Flashcards
Définis l’épidémiologie
Étude de la distribution des maladies dans les populations et des facteurs qui déterminent ou influencent cette distribution
Les études d’épidémio visent à
- Quantifier l’étendue d’une maladie dans une population selon le temps, le lieu et le type d’individus
- Déterminer ce qui influence la survenue de cette maladie en recherchant des associations causales
Qu’est-ce qu’une cause
Tout évènement, condition ou caractéristique qui précède et joue un rôle dans la survenue d’une maladie
Toute association n’est pas causale
Nomme les critères de causalité de Hill (9)
- force d’association
- constance des asssociations
- spécificité
- temporalité
- gradient biologique
- plausibilité
- cohérence
- preuve expérimentale
- analogie
Qui suis-je? Test qui respère tous les animaux malades et uniquement les animaux malades. Par exemple, pour la rage immunofluorescence ou culture virale sur le cerveau.
test de référence ou gold standard
Pourquoi en pratique on n’utilise pas tout le temps le test de référence pour diagnostiquer une condition?
souvent trop coûteux, trop invasif, trop lent, non applicable (ex. nécropsie) et souvent non disponibles
Complète
- Faux négatif : test _ chez animal _
- Faux positif : test _ chez animal _
- Faux négatif : test négatif chez animal malade
- Faux positif : test positifchez animal sain
Complète
La _ et la _ sont des études de validation qui comparent les résultats du test avec celui d’un _ (permet de déterminer le statut réel des animaux).
La sensibilité et la spécificité sont des études de validation qui comparent les résultats du test avec celui d’un test de référence (permet de déterminer le statut réel des animaux).
Qui suis-je? Probabilité qu’un individu malade ait un test positif, donc capacité du test à détecter les malades.
BONUS: formule
sensibilité
Se = VP/(VP+FN)
Complète
La sensibilité dépend de la _ (limite de détection) et de la prévalence des animaux ayant une faible concentration de la substance recherchée.
La sensibilité dépend de la sensibilité analytique (limite de détection) et de la prévalence des animaux ayant une faible concentration de la substance recherchée.
Qui suis-je? Probabilité qu’un individu sain ait un test négatif, donc capacité du test à détecter les individus sains.
BONUS: formule
spécificité
Sp = VN/(VN+FP)
Choisis le bon
La sensibilité et la spécificité sont des qualités (intrinsèques ou extrinsèques) d’un test, donc elles (dépendent ou ne dépendent pas) de la prévalence et elles sont (fluctuantes ou constantes) en conditions stables.
La sensibilité et la spécificité sont des qualités intrinsèques d’un test, donc elles ne dépendent pas de la prévalence et elles sont constantes en conditions stables.
Les animaux inclus dans l’étude de validation sont les plus faciles à détecter, la sensibilité peut être surestimée
Complète
Avec un test _ ou _, il est possible de faire varier la sensibilité et la spécificité selon les besoins en déplaçant la valeur du _
Avec un test ordinal ou quantitatif, il est possible de faire varier la sensibilité et la spécificité selon les besoins en déplaçant la valeur du seuil
Estime la sensibilité et la spécificité pour chacun des trois graphiques.
Identifie les axes d’une courbe ROC.
BONUS: estime la sensibilité et la spécificité pour chacun des points
VRAI ou FAUX. L’aire sous la courbe d’une courbe ROC est un index simple et quantitatif de la performance des tests permettant de pouvoir comparer le pouvoir discriminant de plusieurs tests.
VRAI
À partir de la courbe ROC, détermine le test le plus performant.
IgG
Dans quelle situation il faut prioriser la sensibilité?
- risque de propagation d’une maladie grave pouvant être contrôlée (ex. fièvre aphteuse, tuberculose bovine, influenza aviaire)
- risque d’évolution d’une maladie facile à traiter au stade initial (ex. listériose, haemonchose)
- en début de processus diagnostic pour
éliminer certains diagnostics (ex. diminuer FN, utile lorsque test négatif)
Dans quelle situation il faut prioriser la spécificité?
- maladie difficile à guérir ou incurable
- éviter un traitement non nécessaire qui est coûteux ou risqué
- confirmation d’un diagnostic (diminuer FP, utile lorsque le test est positif)
Qui suis-je? Probabilité d’avoir la maladie lorsque le résultat d’un test est positif
BONUS: formule
valeur prédictive positive
VPP = VP/(VP+FP)
Qui suis-je? Probabilité d’être sain lorsque le résultat d’un test est négatif
BONUS: formule
valeur prédictive négative
VPN = VN/(VN+FN)
Qui suis-je? Probabilité que le test classifie correctement les animaux dans une population ayant une prévalence donnée.
BONUS: formule
efficience
E = (VP+VN)/(VP+FP+VN+FN)
ou E = (VP+VN)/n
VRAI ou FAUX. Les trois indicateurs de performance de l’évaluation clinique d’un test (VPP, VPN et efficience) doivent toujours être interprétés selon la prévalence.
VRAI
excepté si Se=100% et/ou Sp=100%
Quelles sont les formules de valeurs prédictives qui prennent compte de la prévalence?
Chosis le bon
(L’augmentation ou La diminution) de la sensibilité et de la spécificité (augmente ou diminue) la VPP, la VPN et l’efficience.
L’augmentation de la sensibilité et de la spécificité augmente la VPP, la VPN et l’efficience.
Choisis le bon
L’augmentation de la prévalence (augmente ou diminue) la VPP et (augmente ou diminue) la VPN.
L’augmentation de la prévalence augmente la VPP et diminue la VPN.
excepté si sensibilité ou spécificité = 100%
Complète
Le test de troupeau est caractérisé par le _, la _ et le _
Le test de troupeau est caractérisé par le nombre d’animaux testés par troupeau, la performance du test individuel et le seuil d’interprétation de troupeau
Choisis le bon pour favoriser la sensibilité de troupeau
- Prévalence (élevée ou faible) dans le troupeau
- Nombre (élevé ou faible) d’animaux testés par troupeau
- Seuil de troupeau (élevé ou faible)
- Sensibilité (élevée ou faible) du test individuel
- Spécificité (élevée ou faible) du test individuel
- Prévalence élevée dans le troupeau
- Nombre élevé d’animaux testés par
troupeau - Seuil de troupeau faible
- Sensibilité élevée du test individuel
- Spécificité faible du test individuel
Choisis le bon pour favoriser la spécificité de troupeau
- Nombre (élevé ou faible) d’animaux testés par troupeau
- Seuil de troupeau (élevé ou faible)
- Spécificité (élevée ou faible) du test individuel
- Nombre faible d’animaux testés par troupeau
- Seuil de troupeau élevé
- Spécificité élevée du test individuel
Aucun impact de la prévalence intra-ferme ou de la sensibilité du test individuel
Qui suis-je? Étroitesse de l’accord entre les résultats lorsqu’un test est répété
Répétabilité
Nomme trois source de variations
- intra-sujet: caractéristiques des animaux qui varient naturellement dans le temps (ex. TPR)
- intra-observateur: différence dans la lecture d’un même test réalisé par la même personne (augmente avec la subjectivité du test)
- inter-observateur: différence dans la lecture d’un même test réalisé par différentes personnes qui peut être influencée par l’expérience (ex. histologie, radiologie, examen de boiterie, test de fixation du complément)
Qui suis-je? Pourcentage des résultats concordants parmi tous les examens
coefficient de concordance
Qui suis-je? Mesure le degré d’accord entre deux observateurs au-delà de l’accord attendu par le hasard
BONUS: formule
coefficient kappa
Deux radiologistes obtiennent un coefficient kappa de 0.7, quelle est votre interprétation quant à leur accord?
accord important
Complète
Pour calculer la sensibilité/spécificité _, au lieu de comparer au vrai statut de l’animal (test de référence), un autre test _ est utilisé pour la comparaison.
Pour calculer la sensibilité/spécificité relative, au lieu de comparer au vrai statut de l’animal (test de référence), un autre test imparfait est utilisé pour la comparaison.
Se et Sp relatives = 100%
Se réelle = 92%
Complète
L’interprétation en parallèle des tests combinés favorise la _ alors que l’interprétation en série favorise la _.
L’interprétation en parallèle des tests combinés favorise la sensibilité alors que l’interprétation en série favorise la spécificité.
Avec une interprétation en parallèle:
- sensibilité (plus grande ou plus petite) que sensibilité du test le plus sensible
- spécificité (plus grande ou plus petite) que spécificité du test le moins spécifique
Avec une interprétation en parallèle:
- sensibilité plus grande que sensibilité du test le plus sensible
- spécificité plus petite que spécificité du test le moins spécifique
Avec une interprétation en série:
- sensibilité (plus grande ou plus petite) que sensibilité du test le moins sensible
- spécificité (plus grande ou plus petite) que spécificité du test le plus spécifique
Avec une interprétation en série:
- sensibilité plus petite que sensibilité du test le moins sensible
- spécificité plus grande que spécificité du test le plus spécifique
Choisis le bon
Pour les tests séquentiels, on effectue d’abord le test le moins coûteux, le moins invasif ou le plus facile, pour ensuite confirmer le diagnostic en utilisant le second test sur les (positifs ou négatifs) (en série) ou les (positifs ou négatifs) (en parallèle).
Pour les tests séquentiels, on effectue d’abord le test le moins coûteux, le moins invasif ou le plus facile, pour ensuite confirmer le diagnostic en utilisant le second test sur les positifs (en série) ou les négatifs (en parallèle).
Qui suis-je? Unité d’intérêt de l’étude essentielle pour l’interprétation des mesures de fréquences; Animal ou groupe d’animaux partageant un même environnement
unité épidémiologique
Exemples:
- Animal individuel : Vers du cœur chez des chiens
- Portée : Épidermatite exsudative chez des portées de porcelets
- Troupeau: Infection à Salmonella Dublin dans les troupeaux laitiers
- Ruche : Ruches atteintes de varroase
- Bassin : Bassins d’élevage de saumons infectés par le virus de l’anémie
infectieuse du saumon
Pour interpréter des mesures de fréquence, il faut considérer les notions de _ (ex. maladie saisonière, en émergence ou en diminution), de _ (limitées à une zone climatique, avec propagation régionale, endémique) et d’ _ (ex. tropisme d’espèce, susceptibilité variable selon les caractéristiques individuelles, augmantation du risque de maladies chronique avec l’âge).
Pour interpréter des mesures de fréquence, il faut considérer les notions de temps (ex. maladie saisonière, en émergence ou en diminution), de lieu (ex. maladies limitées à une zone climatique, avec propagation régionale, endémique) et d’individu (ex. tropisme d’espèce, susceptibilité variable selon les caractéristiques individuelles, augmantation du risque de maladies chronique avec l’âge).
Associe le type de cas à la bonne définition
1) cas prévalent
2) cas incident
a) Nouveau cas d’une maladie dans une population, diagnostiqué au cours d’une période déterminée
b) Cas d’une maladie présent dans une population à un moment donné
1) b)
2) a)
Nomme une indication et une limite de l’utilisation du nombre de cas (compte) comme mesure de fréquence
- indication: évaluation du risque pour les interventions, planification des soins de santé, bassin potentiel pour les nouveaux
traitements - limite: comparaisons invalides du risque entre les populations de taille différentes
Qui suis-je? considère le nombre de cas prévalent et la population à risque
? = nb cas d’une maladie à un moment donné/nb d’animaux à risque à ce moment donné
prévalence
Qui suis-je?
? = nb de nouveaux cas dans une période définie/nb animaux-temps à risque dans une période définie
taux d’incidence
Qui suis-je? Probabilité qu’un animal contracte une infection à l’intérieur d’une période définie
? = nb d’animaux ayant développé la condition dans une période définie/nb d’animaux à risque dans la population
risque d’incidence
Qui suis-je? risque de mortalité à un temps donné parmi ceux ayant survécu jusque là
? = nb de nouveaux cas d’une maladie dans une période définie/nb d’animaux-temps à risque dans une période définie
risque instantané ou risque au temps t
Qui suis-je? Façon d’illustrer la probabilité cumulative de survie (probabilité qu’un animal atteint au temps 0 survive jusqu’au temps t)
courbe de survie
10,5 jours
Complète
prévalence = _ x _
Prévalence ≈ taux d′incidence × durée de la maladie
Pour chaque variation de durée de la maladie, détermine si la prévalence est faible, moyenne ou élevée:
- maladie endémique de courte durée et d’incidence moyenne = prévalence _
- maladie endémique de durée moyenne et d’incidence moyenne = prévalence
- maladie endémique de longue durée et d’incidence moyenne = prévalence _
- maladie endémique de courte durée et d’incidence moyenne = prévalence faible
- maladie endémique de durée moyenne et d’incidence moyenne = prévalence moyenne
- maladie endémique de longue durée et d’incidence moyenne = prévalence élevée
Pour chaque variation d’incidence de la maladie, détermine si la prévalence est faible, moyenne ou élevée:
- maladie endémique de courte durée et d’incidence faible = prévalence _
- maladie endémique de courte durée et d’incidence moyenne = prévalence _
- maladie endémique de courte durée et d’incidence élevée = prévalence _
- maladie endémique de courte durée et d’incidence faible = prévalence faible
- maladie endémique de courte durée et d’incidence moyenne = prévalence moyenne
- maladie endémique de courte durée et d’incidence élevée = prévalence élevée
Associe le type de devis d’étude à la bonne définition
1) étude transversale
2) étude de cohorte
a) Évaluation de la présence d’une condition parmi les individus d’une
population (recensement ou échantillon, portrait de la situation à un moment dans le temps, permet d’estimer une prévalence)
b) Recrutement d’une population d’individus suivie dans le temps pour noter les changements d’état (permet d’évaluer l’incidence d’une condition, prospectif ou rétrospectif)
1) a)
2) b)
Complète
Dans une étude de cohorte, la population à l’étude peut être _ (entrée et sortie possible des animaux pendant la période donnée, ex. mortalité ou réforme) ou _ (aucun nouvel animal ajouté et peu/pas de sorties une fois l’étude démarrée, ex. lot de veau de grain en tout plein tout vide).
Dans une étude de cohorte, la population à l’étude peut être ouverte (entrée et sortie possible des animaux pendant la période donnée, ex. mortalité ou réforme) ou fermée (aucun nouvel animal ajouté et peu/pas de sorties une fois l’étude démarrée, ex. lot de veau de grain en tout plein tout vide).
Complète
Pour évaluer une mesure de fréquence, un _ inclu l’ensemble de la population alors qu’un _ inclu un sous-groupe d’individu.
Pour évaluer une mesure de fréquence, un recensement inclu l’ensemble de la population alors qu’un échantillonage inclu un sous-groupe d’individu.
Dans cette situation, identifie l’échantillon, la population source et la population cible.
Parmi la cohorte de 3e année de 2024, le temps nécessaire pour compléter les exercices d’épidémio est déterminé à partir de 15 étudiants au hasard pour s’assurer que le temps alloué sera suffisant pour que la cohorte de 3e année de 2025.
échantillon: 15 étudiants de la cohorte de 3e 2024
population source: cohorte de 3e année 2024
population cible: cohorte de 3e année 2025
Complète
La _ est la capacité de l’étude à fournir des résultats qui représentent bien la réalité. Nécessite un échantillon _ , dépend surtout de la stratégie d’_ et possède deux niveaux, soit _ (population source) et _ (généralisation).
La validité est la capacité de l’étude à fournir des résultats qui représentent bien la réalité. Nécessite un échantillon représentatif, dépend surtout de la stratégie d’échantillonnage et possède deux niveaux, soit interne (population source) et externe (généralisation).
Parce que les mesures de fréquence sont basées sur le temps, le lieu et l’individu ce qui varie entre les régions, alors que les mesures d’association sont plutôt basées sur un lien de causalité qui peu persister dans le temps et être généralisé peu importe le contexte.
Complète
La précision est associée à un _ étroit et dépend surtout de la _.
La précision est associée à un intervalle de confiance étroit et dépend surtout de la taille d’échantillon.
Associe chaque stratégie d’échantillonage à la bonne définition
1) aléatoire
2) systématique
3) à plusieurs degrés
4) en grappes
5) stratifiées
6) accommodement
a) Population divisée en strates mutuellement exclusives (ex. race, sexe, groupe d’âge, condition corporelle), échantillonnage réalisé de façon séparée pour chaque strate, peut être proportionnel ou non-proportionnel
b) Sélection au hasard de l’unité primaire (grappe) puis sélection des individus dans la grappe (deux étapes de sélection)
c) Méthode de référence pour assurer la représentativité, toutes les unités épidémiologiques ont la même probabilité d’être choisies (ex. tirage au sort, générateur de nombre pseudo-aléatoire)
d) Échantillonnage non probabiliste basé sur des critères d’ordre pratique, souvent la seule possibilité en absence d’une liste ou du nombre d’individus
formant la population source
e) Répartition de l’échantillon à travers la population source en utilisant un pas
d’échantillonnage à travers une liste ordonnée
f) Sélection au hasard de l’unité primaire (grappe) puis recensement des individus dans la grappe (deux étapes de sélection)
1) c)
2) e)
3) b)
4) f)
5) a)
6) d)
VRAI ou FAUX. Il est possible de calculer la probabilité de sélection de chaque individu de la population source avec les statégies d’échantillonage probabilistes, mais pas avec les non probabilistes (accommodement).
VRAI
Quelle est la stratégie d’échantillonage?
Estimation de la prévalence d’infection par Campylobacter, parmi les vaches participant à une grande exposition agricole ouverte au public
* Tirage au sort de 35 vaches parmi les 300 vaches enregistrées pour l’exposition
aléatoire
enregistrement de l’ensemble des bovins du pays
Quelle est la stratégie d’échantillonage?
systématique
Quelle est la stratégie d’échantillonage?
à plusieurs degrés
VRAI ou FAUX. Avec la stratégie d’échantillonnage à plusieurs degrés, l’échantillon est toujours représentatif.
FAUX
Comment peut-on assurer que notre échantillon soit représentatif avec la stratégie d’échantillonnage à plusieurs degrés?
chaque animal doit avoir la même probabilité d’être échantillonné, 2 options au moment de la sélection:
- Sélection aléatoirement des grappes, puis sélection aléatoire d’une fraction constante des unités dans chaque grappe
- Sélection des grappes avec une probabilité proportionnelle à leur taille,
puis sélection aléatoire d’un nombre fixe des unités dans chaque grappe
Quelle est la stratégie d’échantillonage?
en grappe
Quelle est la stratégie d’échantillonage?
aléatoire stratifié
Quelle est la stratégie d’échantillonage?
accommodement
Qui suis-je? Erreur systématique dans la sélection des unités épidémiologiques qui forment l’échantillon. Tous les animaux n’ont pas la même probabilité de faire partie de l’étude (sélection ou participation)
Biais de sélection
Qui suis-je? Type d’erreur qui survient lors de la collecte des données, classification erronée du statut des individus (test imparfait)
biais d’information
Associe le type de biais avec la bonne définition
1) biais s’entrée sélective
2) biais de non-réponse
3) biais de perte de suivi
4) biais de mémoire
5) biais de désirabilité sociale
a) Différence systématique entre la valeur d’un paramètre chez les participants d’une étude longitudinale et celle de la population source, lorsque cette différence est causée par des pertes au suivi
b) Probabilité de sélection qui diffère systématiquement entre les individus
présentant certaines caractéristiques désirables associées au paramètre
d’intérêt et les autres individus
c) Lorsque les données sur la fréquence d’une maladie sont collectées en utilisant la mémoire (études rétrospectives, absence de registres fiables de santé)
d) Différence systématique entre la valeur du paramètre d’intérêt chez les non-participants d’un échantillon sélectionné et les participants
e) vouloir se présenter sous un
jour favorable à ses interlocuteurs
1) b)
2) d)
3) a)
4) c)
5) e)
Quel type de biais?
biais d’entrée sélective
Quel type de biais?
biais de non-réponse
Quel type de biais?
biais de perte de suivi
Complète
La prévalence _ est la probabilité que la maladie soit présente dans une population alors que la prévalence _ est la probabilité qu’un test soit positif dans une population (estimation souvent biaisée de la prévalence due à l’imperfection des tests
diagnostiques).
La prévalence réelle est la probabilité que la maladie soit présente dans une population alors que la prévalence apparente est la probabilité qu’un test soit positif dans une population (estimation souvent biaisée de la prévalence due à l’imperfection des tests
diagnostiques).
Quel type de biais?
biais de mémoire
Quel type de biais?
Sondage téléphonique est réalisé auprès des propriétaires de chiens pour évaluer la prévalence de chien en surpoids
biais de désirabilité sociale
