5.7 Tumor Evolutie: Klinische Implicaties van Intratumor Heterogeniteit

Question 1

Welke veranderingen kunnen gevonden worden in tumorcellen?

Answer 1

• DNA mutaties (Genomisch)
• Hoeveelheid mRNA en Non-coding RNA’s (Transcriptie niveau)

Question 2

Welke typen genomische afwijkingen zijn er?

Answer 2

• Specifiek: oorzakelijk betrokken bij transformatie en/of progressie van tumorcel (Driver)
• Niet-specifiek: Geen direct effect en verdwijnen (Passenger/hitchhickers en age related genomic abberations)

Question 3

Wat is een proto-oncogen?

Answer 3

1 Activerende mutatie die leidt tot een tumor fenotype

Question 4

Wat is een tumor suppressor gen?

Answer 4

2 Inactiverende mutaties/deleties die leiden tot tumor fenotype

Question 5

Wat is clonaliteit?

Answer 5

Tumorcellen die exact dezelfde mutaties bevatten

Question 6

Wat is het gevolg van de genomische instabiliteit in tumoren?

Answer 6

Ongecontroleerd ontstaan van mutaties wat leidt tot infratumor heterogeniteit

Question 7

Welke allel frequentie van mutant tumorsuppressor DNA wordt er verwacht bij 100% tumorcellen?

Answer 7

100%, want er zijn 2 gemuteerde allelen nodig

Question 8

Welke allel frequentie van de mutant tumorsuppressor DNA wordt er verwacht bij 80% tumorcellen?

Answer 8

80x mutant allel (1 deletie, 1 mutatie)
20x2 normaal allel (Want er is geen deletie)
Dat geeft 80/(80+40) = 67%

Question 9

Wat is de covarge?

Answer 9

Aantal herhalingen/bepalingen
- Leidt tot deeper sequencing

Question 10

Wat kan er met een immunokleuring worden bepaald?

Answer 10

Of een tumor homogeen/clonaal of heterogeen/niet clonaal is:
- DNA, RNA of eiwit kleuren

Question 11

Welke allel frequentie van mutant oncogen DNA wordt er verwacht bij 100% tumorcellen?

Answer 11

50%, want er is maar 1 allel gemuteerd

Question 12

Welke allel frequentie van mutant oncogen DNA wordt er verwacht bij 80% tumorcellen?

Answer 12

80x mutant allel
80x + 20x2 normaal allel
Dat geeft -> Allel frequentie: 80/(80+80+40) is 40%

Question 13

Wat is erlotinib?

Answer 13

Een TKI dat EGFR remt

Question 14

Wat wordt er gegeven bij een resistentie tegen erlotinib?

Answer 14

Osimertinib

Question 15

Wat is gevolg van (Intratumor) heterogeniteit?

Answer 15

• Progressie
• Metastasering
• Resistentie

Question 16

Wat is het vogelstein model?

Answer 16

De relatie tussen het morfologische veranderingen en moleculaire veranderingen tijdens het proces van ontwikkeling van darmkanker

Question 17

In wat voor soort gen zit de mutatie bij FAP en Lynch Syndroom?

Answer 17

Tumorsuppressor gen

Question 18

Hoe ziet LOH eruit bij microsatelliet analyse?

Answer 18

1 piek in plaats van 2 pieken

Question 19

Hoe ziet de microsatelliet instabiliteit eruit bij microsatelliet analyse?

Answer 19

2 pieken, waarvan de grootste bij een lagere hoeveelheid bp ten opzichte van de hoeveelheid bp in een normale analyse

Question 20

Wat zijn microsatellieten?

Answer 20

Korte, repeterende DNA sequenties

Question 21

Hoe kunnen defecten in een DNA repair mechanismen worden aangetoond?

Answer 21

Immunohistochemische aankleuring buiten de kern