H2.3: Gevolgen van fouten bij DNA replicatie Flashcards
DNA-replicatie
Verdubbeling van de drager van de genetische informatie en instructies voor de cel
Bouwstenen nucleotide
- Fosfaat
- Deoxyribose (suiker)
- Base
Waar begint DNA-replicatie?
Replication origin
Door wie worden replication origins herkend?
Initiator proteïns welke op hun beurt andere eiwitten aantrekken zodat er een complex van eiwitten ontstaat die allemaal een andere functie hebben in DNA-replicatie
Functie DNA-helicase
Haalt dubbele helix uit elkaar
Functie single strand binding proteïn
Beschermt enkele streng
Functie sliding clamp
Zorgt ervoor dat DNA-polymerase goed aan DNA bindt
Richting van replicatie
5’ naar 3’ = leading strand
Mismatch reparatie
- Gaat werken als DNA-polymerase al weg is
- MSH2, MLH1, MSH6, PMS2 vinden mismatch
- EXO1 eet de foute nucleotide en aantal nucleotides eromheen
- Gat wordt weer door DNA-polymerase aangebuld
DNA-replicatie nauwkeurigheid
- Base selectie (voor inbouw nucleotide)
- Proofreading (na inbouw nucleotide, DNA-polymerase nog aanwezig)
- Mismatch reparatie (DNA-polymerase al weg)
Hoe ontstaat een mismatch?
- DNA-polymerase maakt niet goed onderscheid tussen de tautomeren waardoor de imino tautomeer wordt ingebouwd
- Tautomere vorm is instabiel en verandert weer terug naar normale vorm
Proofreading
- Door mismatch kan DNA-polymerase niet meer verder
- DNA-polymerase heeft 3’-5’ exonuclease activiteit
- DNA-polymerase knipt verkeerde base uit de streng
Lynch syndroom (HNPCC)
- Mismatch reparatiemechanisme werkt niet goed
- Darmepitheel heeft hoog proliferatieve activiteit, dus veel DNA-replicatie
- Foutenpercentage is hoger, dus veel poliepen ontstaan
Gevolg als mismatch reparatiesysteem niet goed werkt?
RER fenotype (replication error fenotype) dus veel replicatiefouten in DNA
Hoe is het RER fenotype aan te tonen?
- Microsatelliet analyse (MSI)
- Verspreid over chromosoom liggen er bepaalde hoeveelheden sequenties = gerepeteerde sequenties
- Microsatelliet lengten