31. Delenie a biochemicky významné reakcie aminokyselín (AMK) Flashcards
Charakteristika štruktúry AMK
=org. zlúčeniny, substitučné deriváty KK
-na alfa uhlíku -NH2 a COOH skupina
-ďalšie FS určujú kyslosť/zásaditosť
-všetky okrem GLY sú opticky aktívne
-prírodné AMK = bezfarebné a kryštalické
Charakteristika biologickej funkcie AMK
=základné stavebné jednotky peptidov a proteínov (21 proteinogénnych AMK v L- forme)
-východiskové látky pre biosyntézu neproteínových dusíkových látok
-medziprodukty metabolizmu
-v prírodných zdrojoch je až 250 AMK
Klasifikácie AMK
a) podľa charakteru a počtu FS
1. kyslé - 1x NH2, 2x COOH (Glu, Asp)
2. zásadité - 2x NH2, 1x COOH (His, Arg, Lys)
3. neutrálne - 1x NH2 aj COOH (Ala, Gly, Val, Leu, Ile)
b) podľa povahy bočného reťazca
1. cyklické/aromatické (fenylalanín, tyrozín)
2. heterocyklické (tryptofán, histidín)
3. hydroxy-AMK (serín, treonín, fenylalanín)
4. sírne-AMK (cysteín, metionín)
5. prolín (hydroxyprolín)
c) podľa schopnosti organizmu ich syntetizovať
1. esenciálne (Val, Leu, Ile, Phe, Thr…)
2. neesenciálne (Gly, Ala, Tyr, Pro…)
d) podľa metabolizmu v bu
1. ketogénne (leucín - metabolizuje sa len na ketolátky)
2. keto- aj glukogénne (jedna časť reťazca do ketotvornej metab. dráhy a druhá do tvorby GLU - Lys, Ile, Phe, Tyr, Trp)
3. glukogénne (po odstránení aminoskup. vzniká pyruvát/medziprodukty Krebsovho cyklu)
Vzorce kyslých AMK
Vzorce zásaditých AMK
pomôcka: všetky majú 6C
Vzorcami vyjadriť aspoň 4 typy reakcií AMK, uviesť názvy produktov, enzýmov, koenzýmov
-
DEKARBOXYLÁCIA
-uvoľnenie CO2
-produkt: primárny amín
-katalyzované dekarboxylázami
-koenzým: pyridoxalfosfát
-reakčný mechanizmus: tvorba Schiffovej zásady (NH2 AMK + karbonyl koenzýmu) -
DEAMINÁCIA
a) desaturačná
-produkt: nenasýtená kys., uvoľní sa amoniak
-mierne exergonická; prebehne len u niektorých AMK (napr. His)
-enzým: deamináza
b) oxidačná
-NH3 uvoľnený cez oxidačné procesy
AMK->iminokyselina -(+H2O)> oxokyselina + NH3
-oxidázy, FMN, NAD -
TRANSAMINÁCIA
AMK (donor N) + oxokyselina (akceptor)
-produkty: príslušná oxokyselina a aminokyselina
-enzým: transamináza
-koenzým: pyridoxalfosfát -
ACYLÁCIA
-substitúcia H+ v NH2 sk. jednej AMK acylom inej kyseliny
-naviazaním acylu inej AMK -> peptidová/amidová väzba (acylderiváty)
-peptidyltransferáza -
KARBAMÍNOVÉ KYSELINY
-tvorba karbamínových kys. naviazaním CO2
-slúži ako transport CO2 z tkanív do pľúc naviazaním na Hb
pozn.: v tejto karte sú len typy reakcií a ich podstata, na každý osobitne bude ďalšia flashkarta
Dekarboxylácia - schéma
Desatruačná deaminácia - schéma
Oxidačná deaminácia - schéma
Transaminácia - schéma
Acylácia - schéma
Karbamínové kyseliny - schéma
Tvorba a charakter peptidovej väzby
=väzba medzi NH2 koncom jednej AMK a COOH druhej AMK
-inak aj amidová väzba
-pri vzniku sa odštiepi voda
-charakter čiastočnej dvojitej väzby
