HC.3.7 - Proteomics, metabolomics, miRNA's en RNAi screens Flashcards
wat reguleert genexpressie?
micro-RNA’s en siRNAs
waarvoor kan SiRNA voor gebruikt worden?
genexpressie te verminderen en zo drug targets te vinden
wat wordt gebruikt om inzicht in ziekte processen te krijgen?
gegevens van genomics, proteomics, metabolomics en micro-RNA expressiepatronen
wat zijn proteomics?
het bestudeert alle eiwitten van de cel. de hoeveelheid eiwit is een betere maat voor genexpressie dan mRNA, omdat mRNA zorgt voor meer dan alleen eiwitsynthese
waarvoor kan massaspectrometrie gebruikt worden?
- eiwit identificeren en kwantificeren
- bindende eiwitten identificeren
- eiwitmodificaties identificeren
wat knipt trypsine?
darmenzym knipt peptidebindingen op arginine en lysine plek. hierdoor ontstaat een triptisch fragment
wat voor grafiek krijg je bij eiwit identificeren en kwantificeren?
massa spectogram: de hoogte van de piek zegt iets over de relatieve hoeveelheid eiwit. molecuulmassa bepaalt welk eiwit het is
waarom willen we de eiwit-interacties weten?
meer weten over de complexe regulatiecircuits in cellen. en dit weer om genexpressie profielen te gebruiken
hoe weten dat een eiwit gemodificeerd is?
we weten de massa van fosfaat en dit komt dan in het massa spectrum er precies bij. dit zegt iets over de activiteit van een eiwit
wat is metabolomics?
analyseert welke metabolieten (suiker, nucelotide, aminozuren, lipides) voorkomen
hoe kan de translatie gereguleerd worden?
microRNA wordt gecodeerd in het DNA, op maat geknipt door Drosha en Dicer en dan in het RISC complex ingebouwd. dan bindt het aan zn complementaire mRNA waardoor dit niet meer wordt afgeschreven
wat is siRNA?
zelf kort stukje RNA inbrengen en dat bouwt die dit in RISC complex. dus zorgt voor mRNA afbraak
