HC.3.3 - Cytogenetische afwijkingen

Question 1

waarom wil je de chromosomale afwijking weten?

Answer 1

• voor de prognose
• staat ivm de reactie op chemotherapie
• geeft inzicht in nieuwe behandelingen

Question 2

welke chromosomale afwijkingen heeft AML?

Answer 2

• t(8;21)(q22;q22)
  inv(16)/t(16;16)

Question 3

welke chromosomale afwijkingen heeft MDS?

Answer 3

complex karyotype
5q-, 7q-

Question 4

met welke methodes kijken we naar chromosomale afwijkingen?

Answer 4

• klassieke cytogenetica (bandering)
• moleculaire cytogenetica (FISH, SNP array)
• moleculaire diagnostiek (sequencing, Q-PCR, RQ-PCR)

Question 5

hoe wordt het materiaal verkregen?

Answer 5

beenmerg of bloed met kweekmedium en groeifactoren blijven 1-2 dagen staan. mitose blok (colcemid) voor 30 minuten. tot slot hypotoon en fixatief zodat celmembraan breekt. op een glas

Question 6

welk typen chromosomale afwijkingen zijn er?

Answer 6

• numerieke afwijkingen (winst en verlies van chromosoom)
• structurele afwijkingen (gebalanceerd of niet-gebalanceerd)

Question 7

wat valt onder gebalanceerd?

Answer 7

translocatie, inversie en insertie

Question 8

wat valt onder niet-gebalanceerd?

Answer 8

deletie, amplificatie, niet-gebalanceerde translocatie, gen mutatie

Question 9

welke vormen van deletie zijn er?

Answer 9

terminaal: aan het einde
interstitiaal: binnen de arm

Question 10

welke vormen van inversie zijn er?

Answer 10

gedeelte draait 180 graden
- paracentrisch: binnen een arm, inv(3)
- pericentrisch: rond de centromeer, inv(16)

Question 11

hoe omschrijf je een missend chromosoom 7 uit een karyotype?

Answer 11

45, XY, -7(10)

45 van aantal chromosomen

Question 12

wat is een zeer slechte risico groep voor AML?

Answer 12

monosomaal karyotype
- 2 monosomieën: 2 missen
- 1 monosomie en een structurele afwijkingen als een inversie

Question 13

wat zijn de nadelen van FISH?

Answer 13

gelimiteerde sensitiviteit, alleen antwoord op gestelde vraag en beperkte target locations

Question 14

wat is fusie-probes?

Answer 14

om translocaties aan te tonen dus dan zou je 2x rood en 2 groen moeten zien

Question 15

wat zijn fusie-signalen?

Answer 15

rood en groen naast elkaar maakt geel en is dus een translocatie

Question 16

wat zijn break-apart probes?

Answer 16

geen translocatie geeft 2 geel en dus geen breuk
wel translocatie is er 1 geel en 1 rood en groen signaal en dus een breuk

Question 17

wat gebeurt er bij multiple myeloom

Answer 17

afwijkende cellen komen niet in deling. dit levert een normaal karyotype op met afwijkende FISH op interfase kernen maar de vraag is is dit fout positief of is dit een afwijking

Question 18

wat is de oplossing om MM te detecteren?

Answer 18

zuivering plasmacellen:
- rode bloedcellen verwijderd door rode bloedcel lysis
- buitenkant plasmacellen zit CD-138 marker
- anti-CD138 wordt aan beads (magneten) gekoppeld
- CD138 bindt en met een magneet blijven de plasmacellen hangen. wat niet plakt gooi je weg

Question 19

wat kan je met SNP-array (single nucelotide polymorphism)?

Answer 19

hiermee kan je deleties of duplicaties heel makkelijk opsporen
- 1 allel is deletie
- 3 is duplicatie

zie plaatjes

Question 20

wat is er speciaal aan FISH (alleen targetted)?

Answer 20

translocaties opsporen

Question 21

wat is er speciaal aan SNP array (alleen ongebalanceerd)?

Answer 21

verlies van heterzygotie (LOH)

Question 22

waarom wil je het LOH weten?

Answer 22

dit kan leiden tot een verandering van genexpressie omdat je de genetische variatie van een gen kwijt bent. het kan ook leiden tot veranderingen in eiwitstructuur en functie at de cellulaire processen kan verstoren