(MICROBIO -4) LES GRANDS GROUPE DE MICROORGANISMES Flashcards
Qu’est-ce qu’une espèce, un genre et une famille de microorganisme ?
En microbiologie, une espèce est un groupe d’organismes ayant des caractéristiques génétiques et physiologiques similaires, capables de se reproduire entre eux. Un genre regroupe plusieurs espèces ayant des caractéristiques communes, mais qui peuvent être génétiquement différentes. Une famille regroupe plusieurs genres apparentés, partageant des traits généraux, mais présentant une diversité d’espèces et de genres au sein de cette catégorie.
Notez que pour une même espèce, il existe plusieurs souche (typage ou sérotype) pouvant être pathogène ou non.
Quels sont les trois domaines de la vie ?
Les trois domaines de la vie sont :
- Bactéries : Organismes unicellulaires procaryotes, généralement pathogènes ou non, présents dans divers environnements.
- Archées : Organismes unicellulaires procaryotes, souvent extrémophiles, vivant dans des conditions extrêmes comme des températures élevées ou des environnements salins.
- Eucaryotes : Organismes unicellulaires ou multicellulaires, avec des cellules ayant un noyau défini, incluant les plantes, les animaux, les champignons et les protistes.
Classez les Virue, Atomes, Euraryote, Bactérie, Archée et Protéine en ordre croissant de taille relative.
Nommvez les principaux procaryote et eucaryotes.
- Procaryote. Bactérie et archée (ne possède pas de noyau).
- Eucaryote. Protiste (protozoaire, ciliés, entamibes, diplomonadines), fungi (mycète ou mycota).
Existe-t-il des microorganisme pathogènes non-cellulaire ?
Oui, les virus et le prions qui sont acellulaires (donc non vivant).
Les virus sont des réplicons semi-autonome alors que les prions entraines des cascades de changement conformationnels chez des protéines apparentées saines.
Quelle est la différence entre les levures et les moisissures parmi les mycètes ?
es levures sont des mycètes unicellulaires qui se reproduisent par bourgeonnement et sont essentielles dans l’industrie alimentaire, tandis que les moisissures sont des mycètes multicellulaires, souvent filamenteuses, et peuvent causer des infections ou détériorer des aliments.
Quels sont les quatres familles de microbe ?
- Bactérie
- Fungi
- Protozoaires
- Virus
Identifiez les éléments suivant de la bactérie suivante.
Notez que la bactérie contient du matériel génétique, mais il n’est pas dans un noyau.
Chez quelle type de bactérie retrouve-t-on la capsule ?
La capsule se retrouve principalement chez les bactéries pathogènes, notamment chez certaines espèces de bactéries Gram-positives et Gram-négatives, comme Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae, et Escherichia coli. La capsule joue un rôle important dans la virulence, en protégeant la bactérie contre la phagocytose et en facilitant son adhésion aux surfaces.
Quelle est la différence entre une bactérie gram positive et négative ?
La différence principale entre une bactérie Gram-positive et Gram-négative réside dans la structure de leur paroi cellulaire :
- Gram-positive : Possède une paroi cellulaire épaisse constituée principalement de peptidoglycane, ce qui retient le colorant violet de cristal lors de la coloration de Gram, lui donnant une couleur violette.
- Gram-négative : A une paroi cellulaire plus mince et une membrane externe contenant des lipopolysaccharides. Le colorant violet de cristal est éliminé lors de la coloration, et ces bactéries prennent une couleur rose après application du colorant de contraste.
Pourquoi un patient pourrait faire un pic de fièvre au début d’un traitement antibiotique ?
Un patient pourrait faire un pic de fièvre au début d’un traitement antibiotique en raison de la réaction du corps à la lyse bactérienne rapide. Ce phénomène, appelé réaction de Jarisch-Herxheimer, se produit lorsque les bactéries mortes libèrent des toxines dans le sang, provoquant une réponse inflammatoire et une élévation de la température corporelle. Cela est souvent observé dans les infections graves, comme la syphilis ou la borréliose.
Sur les bactérie à gram négative on voit plus souvent se phénomène car elles contiennent des endotoxine (LPS/Antigène O).
Quelle bactérie est gram positive et négative ?
Quelle est le rôle de la capsule ?
Protéger la bactérie de la phagocytose. Notez que les antigène capsulaire sont nommés antigène K.
Compléter le tableau.
Nommez la capsule intercellulaire permettant l’agglutination des bactéries.
La capsule intercellulaire permettant l’agglutination des bactéries est appelée glycocalys. Elle est présente chez certaines bactéries, comme Streptococcus pneumoniae, et joue un rôle dans la formation de biofilms et l’adhésion cellulaire, favorisant l’agglutination des bactéries entre elles et avec des surfaces.
Elle bloque sérieusement le contact des antibiotique. Nécessite parfois intervention Chx.
Identifier les couches suivantes.
- PG - Peptidoglycan
- CM - Membrane cytoplasmique
- OL - Couche externe
- Couche-S (protéine extra-cellulaire)
Définissez l’antigène H.
L’antigène H est une protéine de surface présente sur certaines bactéries, notamment les bactéries à flagelles, comme Escherichia coli. Il est lié à la structure du flagelle et joue un rôle dans la motilité bactérienne. Cet antigène est utilisé dans la classification des bactéries, en particulier dans le système de sérotypage des enterobacteries, où il permet de distinguer les différentes souches.
Qu’est-ce qu’un pili et un fimbriae?
Les pili et les fimbriae sont des structures protéiques présentes à la surface de nombreuses bactéries, servant principalement à l’adhésion aux surfaces ou aux cellules hôtes.
- Pili : Longs, moins nombreux, utilisés pour la conjugaison bactérienne (échange de matériel génétique) et parfois pour l’adhésion. Certains pili servent aussi à la motilité, comme les pili de type IV dans le processus appelé twitching.
- Fimbriae : Petites, nombreuses et généralement responsables de l’adhésion bactérienne aux cellules hôtes ou aux surfaces, comme dans le cas de certaines infections urinaires. Elles ne sont pas impliquées dans la conjugaison.
Définissez le spore (endospore) bactérien.
Le spore bactérien ou endospore est une forme de résistance dormante produite par certaines bactéries, notamment les bactéries Gram-positives comme Bacillus et Clostridium. L’endospore permet à la bactérie de survivre dans des conditions extrêmes (température, sécheresse, radiations) en raison de sa paroi cellulaire épaisse, de son faible métabolisme et de la protection de son matériel génétique. Lorsque les conditions deviennent favorables, l’endospore peut germer et se transformer en une cellule bactérienne active.
Expliquez la provenance des trois grand antigènes bactériens et comment ses dernier définissent le sérotype (souche).
- Antigène O (lipopolysaccharide - LPS) : Il est situé sur la membrane externe des bactéries Gram-négatives. L’antigène O est composé de polysaccharides et varie entre les différentes souches de bactéries, permettant ainsi leur classification en différents sérotypes. Par exemple, Escherichia coli peut être différenciée selon son antigène O.
- Antigène H (flagelle) : Cet antigène est présent sur le flagelle des bactéries à motilité. L’antigène H est une protéine qui varie selon les souches et peut être utilisée pour distinguer les sérotypes dans des bactéries comme Salmonella.
- Antigène K (capsule) : L’antigène K est un polysaccharide situé sur la capsule bactérienne. La variabilité de cet antigène permet de différencier des souches même très proches génétiquement. Par exemple, Klebsiella pneumoniae peut être sérotypée en fonction de ses antigènes K.
Quelles sont les composantes optionnelles de la bactérie ?
Une bactérie peut être classifiée par morphologie et arrangement spatial, nommez en quelques-uns.
Est-ce que la morphologie coloniale peut être utile (en plus de la morphologie bactérienne et l’aggregation bactérienne) pour identifier une bactérie ?
Oui, la morphologie coloniale peut être très utile pour identifier une bactérie. Elle comprend des caractéristiques observables à l’œil nu sur une boîte de Pétri, telles que la forme, la taille, la couleur, la texture, les bords et l’élévation des colonies bactériennes. Ces caractéristiques, combinées à la morphologie bactérienne (forme microscopique des cellules) et à l’agrégation bactérienne (arrangement des cellules), fournissent des indices précieux pour différencier et identifier les espèces bactériennes.
Avec la coloration de GRAM, comment distinguer les bactéries gram positive des bactérie gram négative.
Les gram positive sont bleu et la gram négative est rouge.
Quels sont les trois type de champs en observation optique de bactérie ?
Le contraste de phase et le fond noir peuvent être très utile pour observer les bactéries non-colorable.
Expliquez la microscopie optique à fluorescence et confocale.
La microscopie optique à fluorescence utilise des fluorophores pour marquer des structures spécifiques dans les cellules. Lorsqu’ils sont excités par une lumière d’une certaine longueur d’onde, les fluorophores émettent une lumière de longueur d’onde plus longue, permettant la visualisation de structures spécifiques avec un contraste élevé.
La microscopie confocale est une amélioration de la microscopie à fluorescence. Elle utilise un laser pour illuminer un point focal précis dans l’échantillon, réduisant la lumière diffusée et améliorant la résolution. Un système de diaphragme permet de capturer uniquement la lumière provenant du plan focal, créant des images nettes en trois dimensions, très utiles pour observer des échantillons épais.
Quel est le test physicochimique utilisé pour identifiez les bactéries ?
La spectrométrie de masse de type MALDI-TOF.
Quels sont les principaux test immunologiques ?
Le test antigènes microbiens ou anticorps (réponse sérologique).
Quelles sont les trois principales méthodes d’identification des bactérie ?
Le test de séquencage génotypique est le plus fiable.
Qu’est-ce qui distingue les virus des autres microorganismes ?
Les virus se distinguent des autres microorganismes par plusieurs caractéristiques uniques :
- Taille très petite : Mesurés en nanomètres, bien plus petits que les bactéries.
- Acellulaires : Ils ne sont pas composés de cellules et sont considérés comme non vivants.
- Structure simple : Constitués uniquement d’un acide nucléique (ARN ou ADN, jamais les deux) entouré d’une capside protéique, parfois avec une enveloppe lipidique.
- Absence de métabolisme : Ils ne génèrent pas d’énergie et ne réalisent pas de fonctions métaboliques.
- Parasites obligatoires : Incapables de se reproduire sans infecter une cellule hôte.
- Cycle de réplication dans l’hôte : La réplication dépend entièrement de la machinerie cellulaire de l’hôte.
- Culture : Ils ne peuvent être cultivés que dans des cellules hôtes vivantes.
- Traitement : Seuls les agents antiviraux sont efficaces contre les virus, tandis que les antibiotiques, qui ciblent les bactéries, sont inefficaces.
Expliquer comment la nature du virion différencie les virus ?
Un virus porte soit de l’ADN, soit de l’ARN, mais pas les deux à la fois.
Quels sont les différents type de capside virale ? Sont-ils toujours présents ?
Les principaux types de capsides virales sont icosaédrique, hélicoïdale et complexe. Elles ne sont pas toujours présentes, car certains virus, comme les virus à ARN simples, n’ont pas de capside bien définie ou ont une forme irrégulière. La capside sert à protéger le matériel génétique viral.
Expliquez la classification virale selon le type d’acides nucléiques.
La classification virale selon le type d’acides nucléiques inclut :
- dsDNA : Virus à ADN double brin (ex. Herpèsvirus).
- ssDNA : Virus à ADN simple brin (ex. Parvovirus).
- dsDNA(RT) : Virus à ADN double brin avec transcriptase inverse (ex. Hépadnavirus).
- +ssRNA : ARN simple brin positif, qui sert directement de modèle pour la synthèse de protéines (ex. Poliovirus).
- -ssRNA : ARN simple brin négatif, qui doit être transcrit en ARN positif avant la traduction (ex. Influenza).
- dsRNA : Virus à ARN double brin (ex. Rotavirus).
Ces catégories reflètent la structure génétique et les mécanismes de réplication des virus.
Comment se présentent les levures vs les moisissures sur la gélose ?
La levures croit en colonies lisses et muqueuses alors que la moisissure croit en colonies chevelues et poudreuses.
Qu’est-ce qu’un protozoaire ?
Un protozoaire est un organisme unicellulaire eucaryote, souvent microscopique, qui peut être trouvé dans des environnements aquatiques ou humides. Les protozoaires sont généralement des hétérotrophes, se nourrissant de matière organique en ingérant des bactéries, des algues ou d’autres protozoaires. Ils se reproduisent par division cellulaire ou reproduction sexuée et peuvent être responsables de maladies comme la malaria.
