(MICROBIO -12) Les virus

Question 1

Qu’est-ce qu’un virus ?

Answer 1

Un parasite intracellulaire obligatoire (qui dépend de la machinerie biochimique de la cellule hôte pour la réplication). C’est un agent filtrable.

Un virus est un agent filtrable car sa taille est extrêmement petite (généralement entre 20 et 300 nm), lui permettant de traverser les filtres utilisés pour retenir les bactéries. Historiquement, cette caractéristique a permis de différencier les virus des bactéries lors d’expériences de filtration, notamment avec les filtres de Chamberland en porcelaine.

Question 2

Quelles sont les trois étapes de l’infection virale qui permet au virus de se répliquez ?

Answer 2

1. Entrer dans la cellule
2. Se répliquer
3. Être libéré

Question 3

Est-ce qu’un virus peut être obsérvé au miscroscope optique ?

Answer 3

Non, le microscope électronique est nécessaire.

Question 4

Quels sont les trois éléments d’un virus ?

Answer 4

1. Le génome.
2. La capside.
3. L’enveloppe (le virus est nu s’il ne possède pas d’enveloppe).

Question 5

Quelles sont les formes possible du génome viral ?

Answer 5

Question 6

Ou se trouve les protéines d’attachement virale ?

Answer 6

Les protéines d’attachement virales se trouvent soit sur la capside pour les virus nus, soit sur l’enveloppe pour les virus enveloppés. Elles permettent la reconnaissance et la fixation aux récepteurs spécifiques des cellules hôtes, facilitant ainsi l’entrée du virus par fusion membranaire ou endocytose.

Question 7

Décrivez la capside

Answer 7

Faite de protéines, structure très rigide et résistante. Résistant à la sécheresse, l'acidité et les détergents.

**Peut être transmis par voie orale, car le virus peut survivre à l'acidité de l'estomac**.

Question 8

Quelles sont les formes de capsides ?

Answer 8

symétrique.
1. Isocahédrique.
2. Hélicoïdale (la plupart des virus).

Irrgulière/asymétrique.

Question 9

Un virus avec des spicules possède-t-il une enveloppe ?

Answer 9

Oui, un virus avec des spicules possède une enveloppe. Les spicules sont des glycoprotéines insérées dans l’enveloppe lipidique du virus, permettant l’attachement aux récepteurs cellulaires. Exemples : virus de la grippe (hémagglutinine et neuraminidase) et VIH (gp120/gp41).

Notez que l’enveloppe est moins résistante que la capside.

Question 10

Quels sont les deux éléments de classification des virus ?

Answer 10

1. En fonction de leurs génome
2. En fonction de la structure du virion

Question 11

La taxonomie de la classification internationale des virus nous permet de savoir la hiérarchie en fonction du nom. Identifiez l’ordre hiérarchique en fonction de la taxonomie :

1. viridae
2. virinae
3. virus

Answer 11

1. viridae = famille
2. virinae = sous-famille
3. virus = genre

Question 12

Comment sont classifiés les virus à ADN ?

Answer 12

Question 13

Comment sont classé les virus à ARN ?

Answer 13

Les virus à ARN single strand négatif sont TOUJOURS enveloppés.

Question 14

Quelles sont les 8 étapes de la réplication virale ?

Answer 14

1. Reconnaissance de la cellule cible
2. Attachement
3. Entrée dans la cellule à travers la membrane plasmique
4. Décapsisation
5. Synthèse des constituant viraux (multiplication virale)
6. Assemblage du virus
7. Bourgeonnement des virus enveloppés
8. Relâchement du virus hors de la cellules hôte

Question 15

Quel est le rôle de PAV ?

Protéines d’attachement viral.

Answer 15

Permet de se lier à des récepteurs spécifique de la cellules hôte.

Question 16

Expliquez le concept de tropisme cellulaire.

Answer 16

Le tropisme cellulaire désigne la capacité d’un virus à infecter des cellules spécifiques en fonction de la présence de récepteurs particuliers sur la membrane cellulaire. Ce tropisme dépend de facteurs comme la spécificité des récepteurs, les conditions de l’hôte, et les mécanismes de pénétration du virus. Par exemple, le VIH cible principalement les cellules T CD4+, tandis que le virus de la grippe infecte les cellules des voies respiratoires.

Un virus peut avoir plusieurs tropisme. Pneumotrope, dermotrope, viscérotrope, neurotrope, etc.

Question 17

Le VIH à un PAV essentiel pour que le virus puisse infecté une cellule CD4+, quel est ce PAV ?

Protéines d’attachement viral.

Answer 17

Le gp120. Notez que certaine personne n’ont pas le récepteur pour ce PAV, et sont donc naturellement immunisé au VIH.

Question 18

Comment se fait l’entrée dans la cellules des cellules enveloppés et non-enveloppé ?

Answer 18

• Virus enveloppés : Ils pénètrent généralement par fusion membranaire. Leur enveloppe lipidique fusionne avec la membrane cellulaire, ce qui permet la libération de la capside virale dans la cellule. Ce processus est facilité par des protéines d’attachement sur l’enveloppe, qui se lient aux récepteurs de la cellule hôte.
• Virus non-enveloppés : Ils entrent par endocytose. Le virus est internalisé dans une vésicule, et la capside est libérée dans le cytoplasme après que la vésicule fusionne avec des compartiments intracellulaires, souvent des endosomes. Les protéines de la capside permettent la libération du matériel génétique dans la cellule.

Les virus enveloppé peuvent parfois entré par endocytose.

Question 19

Décrivez la décapsisation.

Answer 19

La décapsidation est le processus par lequel le virus libère son génome (ADN ou ARN) après son entrée dans la cellule. Pour les virus non-enveloppés, la décapsidation se produit généralement après l’endocytose, lorsque la capside est exposée à des conditions acides dans les endosomes, ce qui induit un changement conformationnel permettant à la capside de se désintégrer et de libérer le génome. Pour les virus enveloppés, la décapsidation peut également avoir lieu après fusion membranaire ou dans le cytoplasme, selon le mécanisme spécifique du virus. Ce processus est essentiel pour que le matériel génétique viral soit accessible pour la réplication et la transcription dans la cellule hôte.

Les virus à ARN reste dans le cytoplasme et les virus à ADN vont dans le noyau pour atteindre la polymérase et se répliquer.

Question 20

Pourquoi est-ce que le virus à ADN est généralement transporté dans le noyau alors que le virus à ARN reste dans le cytoplasme ?

Answer 20

Le virus à ADN est généralement transporté dans le noyau car son génome est constitué d’ADN, qui nécessite une réplication et transcription dans le noyau de la cellule hôte, où les enzymes nécessaires sont localisées. Le processus de transcription de l’ADN en ARN se produit dans le noyau avant que l’ARN ne soit transporté dans le cytoplasme pour la traduction.

En revanche, le virus à ARN reste souvent dans le cytoplasme car leur génome ARN peut être directement traduit en protéines dans le cytoplasme sans nécessiter de transcription dans le noyau. Certains virus à ARN (comme les rétrovirus) utilisent une enzyme spécifique, la reverse transcriptase, pour convertir leur ARN en ADN dans le cytoplasme, avant d’intégrer cet ADN dans le noyau de la cellule hôte.

Les virus à ADN peut modifier l’ADN alors que le virus à ARN ne modifie généralement pas l’ADN (sauf le VIH).

Question 21

Quelle sont les quatre étape de la multiplication virale ?

Answer 21

1. Transcription du génome en ARNm
2. Réplication du génome
3. Transcription du génome en ARN.
4. Modification post-traduction de la protéine.

Question 22

D’ou provient la polymérase pour les virus à ADN et ARN ?

Answer 22

Pour les virus à ADN et à ARN, la polymérase provient de sources différentes :

• Virus à ADN : La polymérase est généralement fourni par la cellule hôte. Les virus à ADN utilisent l’ADN polymérase de la cellule hôte pour répliquer leur génome viral. Certains virus à ADN peuvent coder pour leur propre ADN polymérase si nécessaire (par exemple, les virus à ADN comme l’herpèsvirus).
• Virus à ARN : Les virus à ARN possèdent souvent leur propre ARN polymérase dépendante de l’ARN (souvent appelée ARN polymérase virale), car la cellule hôte n’a pas d’ARN polymérase pour copier directement un génome ARN. Cela leur permet de répliquer et de transcrire leur génome ARN. Les rétrovirus (comme le VIH) ont également la reverse transcriptase pour convertir l’ARN viral en ADN, qui sera ensuite intégré dans le génome de l’hôte.

Question 23

Est-ce que le virus enveloppé synthétise sa propre enveloppe ?

Answer 23

Oui, un virus enveloppé synthétise sa propre enveloppe à partir de la membrane de la cellule hôte. L’enveloppe virale est généralement constituée de lipides provenant de la membrane cellulaire, mais les protéines virales spécifiques (comme les glycoprotéines d’attachement) sont également insérées dans cette membrane. Ces protéines virales sont synthétisées par la cellule hôte à partir de l’ARNm viral, puis transportées vers la membrane cellulaire où elles s’incorporent dans l’enveloppe en cours de formation. Lorsque de nouveaux virions sont produits, l’enveloppe se forme lors du processus de bourgeonnement, où le virus est libéré de la cellule hôte avec son enveloppe dérivée de la membrane cellulaire.

Provient le plus souvent de la membrane plasmatique, mais peut également provenir de la membrane nucléaire, du ribosome, etc.

Question 24

Lors du relachement du virus, est-ce que la cellule est lysée ?

Answer 24

Le relâchement du virus peut ou non provoquer la lyse cellulaire, selon le type de virus et le mécanisme de libération utilisé.

• Virus enveloppés : Dans le cas des virus enveloppés, la libération se fait souvent par bourgeonnement, un processus où le virus s’extrude de la cellule sans la détruire immédiatement. Cela permet à la cellule de survivre un peu plus longtemps, mais elle peut éventuellement être endommagée ou mourir après plusieurs cycles de réplication virale.
• Virus non-enveloppés : Ces virus ont tendance à provoquer la lyse cellulaire lors de la libération. Après avoir assemblé de nouveaux virions dans le cytoplasme, la cellule est souvent détruite par une rupture de sa membrane cellulaire, permettant aux virus d’être libérés.

Les virus nue vont souvent tuer la cellules.

Question 25

Quels sont les modes de transmissions des virus ?

Answer 25

1. Aérosol (très inefficace).
2. Ingestion de nourriture et eau contaminé (virus nues)
3. Fomites (objet inanimés, p.ex. les jouets pour enfant)
4. Contact direct avec les sécrétions
5. Contact sexuel
6. Sang contaminé ou transplantation d’organe
7. Zoonose
8. De la mère à l’enfant (transmission verticale)

Question 26

Quel est le principal déterminant viral du mode de transmission d’un virus ?

Answer 26

Le principal déterminant viral du mode de transmission est la structure du virus, notamment sa capside ou enveloppe, qui influence sa stabilité environnementale, sa capacité à survivre sur différentes surfaces et son accès aux cellules hôtes.

Les virus enveloppé sont souvent transmis par mode fécale-orale & fomite. Les virus envelopés sont souvent transmis par gouttelettes, mucus, salive, sperme, sang et organe transplanté.

Question 27

Faites un résumés des principales différences entre les virus enveloppés et les virus nues.

Answer 27

Question 28

Nommez quelques façon de détecter les virus en laboratoire.

Answer 28

1. Culture virale : La culture virale consiste à isoler et multiplier le virus dans des cellules hôtes, permettant son identification par observation de l’effet cytopathique. Plus utilisé car compliqué et dangereux.
2. Détection du matériel génétique : Cette méthode identifie le génome viral (ADN ou ARN) par des techniques comme la PCR, permettant une détection précise même à faibles concentrations. PCR, la méthode la plus utilisée.
3. Détection d’anticorps spécifiques chez l’hôte infecté : Elle repose sur la détection d’anticorps produits par l’hôte en réponse à une infection virale, indiquant une exposition passée ou présente au virus.
4. Observation en microscopie électronique : Cette méthode permet d’observer directement les virions et leur structure, offrant une identification visuelle des virus en haute résolution.

Question 29

Quelles sont les trois méthodes de contrôle des infections virales ?

Answer 29

1. Lavage des mains et EPI (hygiène).
2. Vaccination.
3. Traitement antiviral.

Question 30

Quelles sont les 6 cibles des antiviraux ?

Answer 30

1. Inhibition de l’attachement du virus : Les anticorps neutralisants ou antagonistes de récepteurs empêchent la liaison du virus à la cellule hôte, bloquant ainsi l’infection avant l’entrée du virus.
2. Inhibition de l’entrée dans la cellule : Les inhibiteurs de fusion ou inhibiteurs de l’endocytose bloquent l’interaction du virus avec la membrane cellulaire, empêchant sa pénétration dans la cellule hôte.
3. Inhibition de la décapsidation : Les inhibiteurs de la décapsidation empêchent le virus de libérer son matériel génétique après l’entrée dans la cellule, bloquant la phase initiale de la réplication virale.
4. Inhibition de la réplication du génome : Les inhibiteurs de la polymérase virale (comme les analogues nucléotidiques) bloquent la réplication du génome viral, empêchant la multiplication du virus dans la cellule hôte.
5. Inhibition de l’assemblage du virus : Les inhibiteurs de l’assemblage empêchent l’assemblage des nouvelles particules virales à partir du génome et des protéines virales, réduisant ainsi la production de virions infectieux.
6. Inhibition du relâchement du virus : Les inhibiteurs de bourgeonnement (comme les inhibiteurs de la protéase virale) bloquent la libération des virions matures de la cellule hôte, empêchant la propagation de l’infection.

Les inhibiteur de la réplication du génomes sont les antiviraux les plus efficace. Médication contre le VIH en sont un exemple.

Question 31

Qu’est-ce qu’un analogue des nucléoside ?

Answer 31

Un analogue des nucléosides est une molécule qui ressemble à un nucléoside naturel (l’unité de base de l’ADN ou de l’ARN) mais avec des modifications chimiques. Ces analogues peuvent être intégrés dans le génome viral lors de la réplication, mais ils sont souvent non fonctionnels ou bloquent l’action de la polymérase virale, inhibant ainsi la réplication du virus. Par exemple, l’acyclovir est un analogue des nucléosides utilisé pour traiter les infections à herpès.

Les polymeras virales sont sensible à cela, mais pas les polymerase humaines.

Question 32

Qu’est-ce qu’un inhibiteur de protéase ?

Answer 32

Un inhibiteur de protéase est un médicament antiviral qui bloque l’activité des protéases virales, des enzymes essentielles pour la maturation des virus. Après la réplication du génome viral, ces protéases clivent les protéines virales précurseurs pour former des virions matures et infectieux. En inhibant cette étape, les inhibiteurs de protéase empêchent la formation de nouveaux virions. Par exemple, les inhibiteurs de protéase sont utilisés pour traiter les infections par le VIH et l’hépatite C.

Inhibe l’assemblage.

Question 33

Décrivez l’inhibiteur de la neuraminidase.

Answer 33

Un inhibiteur de la neuraminidase est un médicament antiviral qui bloque l’action de l’enzyme neuraminidase présente sur la surface des virus de la grippe. Cette enzyme aide le virus à libérer de nouveaux virions des cellules hôtes après leur assemblage, en clivant les acides sialiques des récepteurs cellulaires. En inhibant la neuraminidase, ces médicaments (comme oseltamivir et zanamivir) empêchent la propagation du virus dans l’organisme, réduisant ainsi la durée et la gravité de l’infection.