(BIO - 2) Biochimie des enzymes Flashcards
Qu’est-ce qu’une protéine ?
Un polymère d’acides aminés liés entre eux par des liaisons peptidiques. Elle peut posséder une structure primiare, secondaire, tertiaire et quaternaire.
Qu’est-ce qu’une liaison peptidique ?
Une liaison peptidique est un lien chimique qui unit deux acides aminés, formé entre le groupe amine de l’un et le groupe carboxyle de l’autre, avec libération d’une molécule d’eau.
Expliquer la structure primaire d’une protéine.
L’ordre dans lequel les acides aminés sont liés entre eux.
Expliquer la structure secondaire d’une protéine.
Arrangement régulier et répétitifs tel les hélices alpha et les feuillet beta.
Expliquer la structure tertiaire d’une protéine.
Le repliment complet de la protéine pouvant être causé par des liaison peptique, disulfure, hydrogène, hydrophobe et/ou électrostatique.
Expliquer la structure quaternaire d’une protéine.
L’agencement tri-dimensionnel de plusieurs protéines.
Qu’est-ce qu’une enzyme.
Il s’agit d’une protéine douée d’un pouvoir catalytique. Un biocatalyseur.
Expliquer le mécanisme d’action d’un biocatalyseur.
Il augmente la vitesse de réaction en réduisant l’énergie d’activation grâce a la favorisation de la formation de l’intermédiaire chimique par tension, pression et échange électronique.
Qu’est ce qu’une holoenzyme ?
Un enzyme qui requiert un cofacteur (ion métalique ou coenzyme) pour adopter sa forme active.
Comment nomme-t-on l’agencement d’une holoenzyme et d’un cofacteur ?
Une apoenzyme.
Quelle sont les coenzyme les plus commune ?
Les vitamines.
Quel est l’effet de la concentration de substrat sur la vitesse initiale.
Plus la concentration de substrat est élevée, plus la vitesse initiale est élevée. Lorsque le substrat sature l’enzyme, nous trouvons la vitesse maximale.
Que signifie la V_max ?
La vitesse maximale est atteinte lorsque toutes les molécules d’enzymes sont saturée par un substrat.
Définisser la constante de Michaelis (Km).
La concentration de substrat pour laquelle la vitesse initiale est égale à la moitié de la vitesse maximale.
Quel est le lien entre la Km et l’affinité d’une enzyme pour son substrat.
Plus le Km est élevé, moins l’affinité de l’enzyme pour le substrat est grande.
Quels sont les effets d’une variation de la concentration de l’enzyme sur la vitesse initiale ?
La vitesse vitesse initiale est plus grande (jusqu’à saturation des enzyme), mais la Km reste idem, car l’affinité ne change pas.
Quels sont les effets du pH et de la température du milieu sur une enzyme ?
Chaque enzyme à un pH et une température optimale pour opérer.
Quels sont les différents mécanismes de contrôle de certaines réactions enzymatiques par les cellules ?
Les contrôles peuvent être effectué en modifiant la quantité d’enzyme ou l’activité de l’enzyme.
Comment nomme-t-on le mécanisme qui augmente (ou diminu) la synthèse de la molécule d’enzyme ?
L’induction et la répression.
La synthèse de tout les types d’enzyme du corps est-elle sujette au contrôle ?
Non, les enzyme constitutive subisse une synthèse constante.
Nommez les deux mécanismes qui contrôlent l’efficacité catalytique d’une enzyme.
L’allostérie et la modification covalente.
Expliquer l’allostérie.
Mécanisme de régulation catalytique. Une molécule médiatrice effectrice se lie de façon covalente et non reversible pour donner un effet positif ou négatif. Elle se lie sur les site allostérique, et non pas sur les site enzymatiques.
Expliquer la modification covalente.
Mécanisme de régulation catalytique. La liaison d’une molécule de manière covalente afin de modifier la conformation du site actif.
Quel mécanisme de régulation enzymatique permet un contrôle rapide.
Surtout l’allostérie, mais aussi la modification covalente.
Quel mécanisme de régulation enzymatique permet une adaptation à long terme ?
L’induction et la repression.
Qu’est-ce qu’un inhibiteur compétitif et quel est son effet sur la vitesse de réaction ?
Un inhibiteur compétitif est une substance qui modifie l’affinité apparente d’une enzyme envers son substrat. La vitesse maximale ne change pas, mais la Km apparente est plus grande.
