vc. pcr y sus variantes Flashcards

1
Q

pcr,puede amplificar selectivamente una secuencia deseasa de adn de copia unica que se encuentra presente en una mezcla compleja de

A

moleculas de adn sin purificacion previa de la secuencia de interes

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2
Q

sintesis de adn durante la pcr

los primers o cebadores (oligonucleotidos) logran que solo se amplifique una zona del adn en

A

la pcr

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3
Q

sintesis de adn durante la pcr

la adn polimerasa termoestable sintetiza la hebra complementaria incorporando los deoxinucleotidos trifosfato (dNTPs) libres (A T G C) del medio de reacción, inicialmente dirigida por

A

los primers o cebadores

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4
Q

sintesis de adn durante la pcr

ciclos controlados de temperaturas de desaturalizacion,

A

alineamiento y elongacion

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5
Q

mezcla de reaccion

A

dna
primers o cebadores (oligonucleotidos)
taq polimerasa
dNTPs (A T G C)

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6
Q

aumentos de t° para romper

A

los puentes de hidrogeno

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7
Q

la t° de desnaturalizacion usualmente es de

A

94 a 95°c

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8
Q

t° mayor o igual a 90°c evitan la

A

renaturalizacion del dna

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9
Q

oligonucleotidos especificos (20-23nt) cuya secuencia es complementaria a los extremos del fragmento (zona del DNA) que se desea amplificar

A

primers o cebadores

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10
Q

al disminuir la t° los primers hibridan especificamente en los extremos de la secuencia

A

blanco

*un primer en cada hebra

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11
Q

los primers dirigen a la adn polimerasa que sintetiza la hebra complementaria incorporando

A

los nucleotidos libres ( A T G C) del medio de reacción

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12
Q

al final del 1er ciclo se obtienen

A

2 moleculas de ADN doble cadena parcial que contienen la secuencia blanco

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13
Q

solo el ADN que contiene la secuencia blanco es copiado ya que la polimerasa solo puede

A

copiar moleculas que tienen el cebador unido

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14
Q

al final de 2do ciclo se han obtenido 4 moleculas de adn doble cadena parcial que contienen

A

la secuecia blanco

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15
Q

al final del 3er ciclo se han sintetizado 8 moleculas de ADN doble cadena que contienen la

A

secuencia blanco

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16
Q

al final del 4to ciclo se han sintetizado

A

16 moleculas de ADN doble cadena que contienen la secuencia blanco

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17
Q

al final de 5to ciclo se tienen

A

32 moleculas de ADN doble cadena que contienen la secuencia blanco

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18
Q

despues de 30 ciclos hay mas de

A

1x10*9 moleculas del producto especifico y solamente 60 moleculas parcialmente doble cadena mas largas

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19
Q

tiene la capacidad de mantener cambios de temperatura ciclicos de forma precisa

A

maquina de pcr

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20
Q

pcr punto final o convencional

podemos considerar que un mayor numero de copias de dna molde da una banda mas

A

intensa del amplificado (hasta cierto punto ya que cantidades excesivas de dna molde inhiben la reaccion)

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21
Q

a mayor numero de ciclos

A

mayor cantidad del producto de pcr (amplificado)

22
Q

variantes de la pcr

A

-con adaptadores
-inversa
-mutagenesis dirigida
-rt-pcr
-tiempo real
-rt.qpcr
-multiplex

23
Q

pcr, con adaptadores

amplificar una region de and de secuencia

A

desconocida

24
Q

pcr, con adaptadores

se unen adaptadores a los fragmentos de restricción de

A

extremos cohesivos

25
Q

pcr, con adaptadores

se añaden primers específicos para las secuencias

A

de los adaptadores

26
Q

pcr, inversa

permite amplificar secuencias desconocidas con la condición de que

A

se encuentran al lado de una secuencia desconocida

27
Q

se refiere a una amplia variedad de técnicas in vitro que modifican la secuencia silvestre

A

mutagenes dirigida

28
Q

mutagenes dirigida

p, ej. cuando no hay sitios de restricción localizados en

A

el lugar deseado, se puede emplear un enfoque de pcr

29
Q

mutagenes dirigida

se pueden cambiar de 1 a 3 bases en un segmento de dna determinado

A

sintetizando primers de pcr que lleven a estos cambios

30
Q

rt-pcr

se emplean

A

2 enzimas polimerasas

31
Q

rt-pcr

la dna polimerasa rna dependediente (retrotranscriptasa) realiza la

A

síntesis de cDNA a partir de mRNA

32
Q

rt-pcr

los clones de cDNA contienen secuencias codificantes que son

A

discontinuas (mayoría de genes eucariotas)

33
Q

rt-pcr

después el cDNA se amplifica por

A

PCR (dna pol dna dependiente)

34
Q

pcr tiempo real

fluorescencia

A

-syber green
-sondas taqman

35
Q

no es un agente intercalante sino que se asocia a la molecula de and interactuando con la hendidura MENOR

A

sybergreen

36
Q

el complejo resultante adn-syber green presenta el pico de absorción en 495nm y el de emisión en

A

522nm (zona verde del espectro, de ahí su nombre)

37
Q

qpcr

también conocida como pcr

A

cuantitativa

38
Q

qpcr

amplifica y simultaneamente cuantifica de forma absoluta el producto especifico de la

A

amplificación

39
Q

qpcr

a la mezcla de reacción se adiciona un fluoroforo que emite fluorescencia en función de

A

la abundancia del producto de amplificación

40
Q

qpcr

la medición de la fluorescencia se realiza luego de cada ciclo de amplificación y es

A

por esto que se le denomina pcr en tiempo real

41
Q

numero de ciclos requeridos para que la fluorescencia especifica sobrepase la fluorescencia de fondo inespecifica

A

ct

42
Q

ct
inversamente proporcional a la cantidad de adn

A

blanco inicial

43
Q

sondas taq man

el principio de la sonda taq man se basa en la

A

actividad 5’-3’ exonucleasa de la polimerasa

44
Q

sondas taq man

se aumenta significativamente la especificidad

A

de la detección

45
Q

sondas taq man

al igual que en los otros métodos de qPCR, la fluorescencia resultante de la acumulación del producto se mide durante

A

la fase exponencial de la pcr

46
Q

Rt-qPCR

la primera reacción de retrotranscripcion se lleva a cabo de la misma manera por la dna pol rna dependiente obteniendose el

A

cDNA a partir del mRNA

47
Q

Rt-qPCR

después de cDNA se amplifica por PCR

A

cuantitativa

48
Q

Rt-qPCR

los niveles de expresión de un gen en particular se normalizan con respecto al nivel de expresión de un gen

A

constitutivo para poder hacer la comparación entre muestras, tratamientos y/o condiciones de la célula

49
Q

pcr multiplex

se amplifica mas de una secuencia en una

A

misma reacción

50
Q

pcr multiplex

emplea 2 o + pares de primers en un unico tubo de reacción con el fin de

A

amplificar simultaneamente multiples segmentos de adna