Genomica fx y RNAs no codificantes

Question 1

genoma

Answer 1

la info genetica comun a todas las celulas del organismo

Question 2

transcriptoma

Answer 2

la parte del genoma que se transcribe en una celula en un momento especifico

Question 3

proteoma

Answer 3

las proteinas en la celula que le dan su caracter individual

Question 4

metaboloma

Answer 4

suma total de sustratos, metabolitos y moleculas pequeñas presentes en una poblacion de celulas

Question 5

planteamiento clasico

Answer 5

-dirigido por una hipotesis
-limitado numero de genes estudiados

Question 6

planteamiento genomico

Answer 6

-no hay hipotesis de partida
-info sobre miles de genes contendios en el genoma humano

Question 7

genomica funcional

Answer 7

determinacion de la fx biologica e interacciones de los genes y su regulacion -descubrimiento de genes-

Question 8

genomica estructural

Answer 8

identificacion y estudio de la estructura de la secuencia en el genoma
-polimorfismo, mutacion,repeticion,inserciones
-localizacion y contruccion de mapas

Question 9

genomica comparativa

Answer 9

estudio comparativo de los genomas estructural y funcionalmente para explicar las relaciones funcionales y evolutivas

Question 10

genomica fx

Answer 10

aspectos dinamicos de la info biologica

Question 11

transcriptoma

Answer 11

conjunto completo de transcritos

Question 11

proteoma

Answer 11

conjutno completo de proteinas

Question 12

herramientas moleculares

Answer 12

-knock down (rna de interferencia- rna i)
+silenciamiento de genes

-microarreglos de dna (expresion)
+niveles del mRNA
+perfiles de expresion genica
+redes de regulacion genica

-proteomica cuatitativa
+comparacion de los niveles de proteina

Question 13

descubrimiento de genes

Answer 13

-asociados a un fenotipo especifico
-funcion hasta entonces desconocida

Question 14

identificacion de marcadores geneticos

Answer 14

-competencia vectorial
-predictivos de la incidencia y evolucion de la enfermedad
-identificacion de grupos de poblaciones susceptibles
-desarrollo de estrategias de control (vacunas, terapia,etc)

Question 15

marcador genetico

Answer 15

-segmento de dna con una ubicacion fisica conocida en un cromosoma

-pueden ayudar a vincular una enfermedad hereditaria con un gen responsable

-se utilizan para rastrear la herencia de un gen cercano que aun no ha sido identificado, pero cuya localizacion aproximada es conocida

-si puede ser parte de un gen o puede no tener ninguna fx conocida

Question 16

los segmentos de dna que se encuentran cerca de un cromosoma tienden…

Answer 16

a heredarse juntos

Question 17

biomarcadores

Answer 17

-molecula biologica ue se encuentra en la sangre, otros liquidos o tejidos del cuerpo y es un signo de un proceso normal o anormal o de una afeccion o enfermedad

-para determinar la respuesta del cuerpo a un tratamiento para una enfermedad o afeccion

=marcador molecular o molecula distintiva

-regulacion positiva o negativa de la expresion de un gen puede ser por causa de una enfermedad

-genes regulados pueden ser utilizado como biomarcadores

Question 18

RNA i
procariotas

Answer 18

se observo en bacterias que moleculas pequeñas (100 nucleotidos) de rna pueden aparearse con secuencias complementarias e inhibir la sintesis de proteinas

Question 19

rna i
plantas

Answer 19

1990- intentando aumentar el color purpura de puteinas por introduccuon de un gen clonado que producia un pigmento

-gen introducido y homologo endogeno eran suprimidos= silenciamiento genico post-transcripcional

Question 20

RNA i
hongos

Answer 20

-en neuroespora crassa insertaron copias adicoonales del gen que codifica para el pigmento naranja que sintetiza el hongo

-producian hongos blanquecinos

-fenomenos llamado quelling o supresion

Question 21

RNA i
eucariotas

Answer 21

-1993, en el gusano C. elegans

-modelo de regulacion no era comun
-gran numero de moleculas pequeñas de RNA
-transcritos sin una señak de lectura OFF
-RNAs no codificantes (ncRNAs)
-variantes que pueden regular o silenciar a los genes codificantes

Question 22

sh rna

Answer 22

-se introduce mediante tecnicas de transfeccion un plasmico (o un vector viral) que transcriba una horquilla que semeje el pri-miRNA

-son procesados por drosha y dicer para generar siRNAs funcionales

Question 23

si rna

Answer 23

-facil de sintetizar
-facil de usar
-poco tiempo de silenciamiento

Question 24

sh rna/ vector-plasmido

Answer 24

-establece expresion del siRNA con mayor tiempo de duracion del silenciamiento

-dificiles de usar en celulas dificiles de transfectar como cultivos primarios

Question 25

sh rna/ vector lentiviral o retroviral

Answer 25

-estable expresion del siRNA con mayor tiempo de duracion de silenciamiento

-son introducidos a practicamente cualquier tipo de celula mediante infeccion

-mayor tiempo para obtener celulas de interes
-medidas de bioseguridad nivel 2, para la recoleccion de pseudo-particulas virales e infeccion de celulas blancas

Question 26

miRNAs

Answer 26

-pequeñas moleculas capaces de regular negativamente la expresion de un gen diana

-patrones de expresion independientes tiempo-tejido especificos

-fx de regulacion genetica post transcripcional

Question 27

fx de regulacion genetica post-transcripcional

Answer 27

-proliferacion y diferenciacion celular
-desarrollo embrionario, morfogenesis
-apoptosis
-iniciacion tumural
-promocion de metastasis

Question 28

mi RNA
2

Answer 28

-cromosomicos, endogenos, no codificantes, diversos en secuencia, intergenicos, exonicos, intronicos, evolutivamente conservados

-transcritos por la rna polimerasa ll

Question 29

drosha y dicer son…

Answer 29

-enzimas RNAasas lll que procesan los pri-miRNA, respectivamente

Question 30

-el resultante miRNA-duplex se carga en el complejo RISC induciendo…

Answer 30

el silenciamiento del mRNA mediante su degradacion o inhibicion de la traducción

Question 31

pre-micro RNA

Answer 31

70-100 nt

Question 32

Drosha

Answer 32

-endonucleasa especifica para rna de doble hebra
-deja 2-3 nt sobresaliendo (overhangs)
-posee:
1 dominio amino terminal RNA helicasa
2 dominios RNAasa lll
1 carboxilo terminal de union a dsRNA

Question 33

represion de la traduccion:

Answer 33

complementariedad con el mRNA menor al 100%

Question 34

degradacion del mRNA:

Answer 34

100% de complementariedad con el mRNA

Question 35

se estima que el 50% de los genes de miRNAs son controlados por…

Answer 35

la metilacion del ADN

Question 36

la expresion alrededor del 30% de todos los genes se cree que puede ser regulada…

Answer 36

mediante miRNAs

Question 37

miRNAs regulan la expresion de componentes importantes de mecanismo epieneticos, al:

Answer 37

-atacar enzimas modificadores de cromatina
-cambiando sutilmente el epigenoma
y s regula la expresion genica

Question 38

ej, se ha demostrado que varios miRNAs tienen como blanco a las DMNT…

Answer 38

promoviendo asi la perdida de la metilacion del ADN

Question 39

aplicaciones del RNA i

Answer 39

• su especificidas sobre la expresion genica hace de este mecanismo una valiosa herramienta de investigacion, ya que al introducirse en las celulas para inducir el silenciamiento selectivo de genes especificos
  -estudiar la fx de los genes en cultivos celulares e in vivo en organismos modelo
  -rna i puede no bloquear completamente la expresion del gen de interes, normalmente suele referirse a esta tecnica como “konck down”
  -terapia mediada geneticamente con aplicaciones en biotecnologia (ej. plantas alimenticias) y medicina