Traducción Flashcards
los ribosomas contienen mas…
rna que proteinas
sitio A
sitio aceptor para la entrada del aminoacil-tRNA
sitip P
sitio donante, ocupado por el peptidil-tRNA
sitio E
sitio de salida. En procariotas
subunidades ribosomicas libres
20%
los ribosomas liberados en la terminacion se disocian …
generando subunidades libres
factores de iniciacion
se encuentran en el complejo de iniciacion junto con 30s, se liberan al unirse la subunidad 50s
IF-2
estabilizacion del complejo de iniciacion
IF-2
une al tRNA especial de iniciacion
-se asocia al sitio p
-aseguraque solo el tRNA iniciador comience la traduccion
-actividad gtpasa
-hidrolisis del gtp cuando se une 50s
if-3
-estabilia a 30s libre (factor de antiasociacion)
-necesario para que 30s se una a los puntos de iniciacion en el mRNA
la sintesis de las proteinas comienza con la…
metionina
codon de iniciacion
AUG (GUG y UUG) en bacterias
2 tipos de met-t rna
una para el inicio y otro para la elongacion
t rna iniciador
unico capaz de entrar directamente al sitio p
desformilasa
elimina el grupo formilo de la proteina
aminopeptidasa
elimina la met (50% proteinas)
3’UTR
largo mayor a 1000 bases
esta despues del codon de paro
5’UTR
por lo general menor a 100 bases
AUG
se encuentra en la secuencia kosak
met-tRNA iniciador
-no se formila
-fosforilado en 2OH de la ribosa de la base 64, si se quita la fosforilacion puede servir en la elongacion
el arn m tiene 2 carcateristicas reconocidas por un ribosoma:
- la subunidad peqeuña se una al cap metilado
-la subunidad pequeña migra al punto de union
factores de iniciacion en eucariotas:
son al menos 9 y tienen varias funciones
eIF2
-participa en la formacion del complejo ternario (met- trna iniciador, eIF2 y GTP)
-consta de las subunidades alfa, beta y gamma
complejo ternario
-se asocia con la subunidad 40s libre formand el complejo de iniciacion
eIF-4F
multimerica
eif-4e
une al cap 5’
regulacion por fosforilacion (activacion)
eif-4g
-andamio
-union al complejo de iniciacion
-se une a PABP y facilita la circulacion (semiciclica) y estabilidad del mRNA
eif-4a
-helicasa/atpasa
-rna-dependiente
-quita estructura secundaria en 15 primeras bases
-se une a eif3 que esta unido al complejo ternario (met-tRNA iniciador, eif2 y gtp) en la subunidad 40s
eif-3
-8 a 10 subunidades
-mantienen disociada la subunidad 40s
eif-6
-estabiliza disociada a la subunidad 60s
eif-5
-gtp asa necesaria para unir al 60s, para la liberacion de eIF-3 y eIF-2
eif-4B
ayuda en el posterior desenrrollamiento
EF-TU-GTP
carga el aminoacil-trna en el sitio A y se libera como EF-Tu-GDP
EF-ts
sustituye GDP por gtp en ef-tu
-70000 ef-tu/celula (igual numero de trnas)
eEF-1alfa
analogo ef-tu en eucariotas
eEF-1betagamma
analogo ef-ts en eucariotas
peptidil transferasa
-actividad responsable de la formacion del enlace peptidico
-la subunidad grande (50s o 60s) es la encargada
aminoacil trna sintetasa
-carga (esterifica) un aa al trna
-clase l. 2 oh de la adenosina 3’
-clase ll. 3 oh de la adenosina 3’
aminoacil-trna-ef-tu-gtp y efg-gtp
son mutuamente excluyentes
eEF-2
analogo en eucariotas. si se detiene puede no continuar la transcripcion
puromicina
se parece al aminoacil-trna por lo que puede entrar al ribosoma y formar enlace peptidico con el peptido naciente, provocando su liberacion del ribosoma
codones de terminacion
uag
uaa
uga
uag
ambar
uaa
ocre
uga
opalo
factores de liberacion
-activan al ribosoma para hidrolizar el peptidil trna
-rf-1
-rf-2
-rf-3
-rff
if3
rf-1
uag y uaa
rf-2
uga y uaa
rf-3
libera a rf-1 y rf-2 del ribosoma
rrf
produce la disociacion de 50s y 30s
if3
retira trna de 30s, la mantiene disociada
estabiliza a la unidad menor
rf1 rf2 rf3
semejan al complejo ternario
if-1
estabilizacion del complejo de iniciacion
if-2
une al trna especial de iniciacion
se asocia al sitio p
asegura que solo el trna iniciador comience la traduccion
actividad gtpasa
hidrolisis del gtp cuando se une 50s
if-3
estabiliza a 30s libre (factor antiasociacion)
necesario para que 30s se una a los puntos de iniciacion en el mrna
modelo tmrna
-marcaje para la degradacion de proteinas
-etiqueta 11 aa (alaninas) marca a las proteinas para su degradacion (proteosoma)
-la proteina smpb se requiere para que tmrna pueda asociarse al ribosoma
en eucariotas los mRNAs truncos
no poseen el 3’ poli A necesario para su traduccion (se degradarian en el nucleo)
poli A daba
polilisina
poli C daba
poliprolina
cuantas cadenas polipeptidicas podria generar un duplex
6 cadenas polipeptidicas
polirribonucleotido fosforilasa
la particularidad de esta enzima es que en condicions concretas, es capaz de sintetizar cadenas de ARN in vitro sin necesidad de un molde de ADN
proteoma:
-grupo copleto de proteinas elaboradas por un organismo
-las proteinas se elaboran en cantidades y tiempos diferentes
-la info sobre el proteoma puede ayudar a encontrar las proteinas involucradas en enfermedades y producir farmacos que impidan su accion
5% del proteoma
son enzimmas que realizan mas de 200 modificaciones postraduccionales
fosforilacion
-realizada por protein cinasas
-principalmente en residuos de serina, treonina o tirosina
-enzimas fosfatas remueven los grupos fosfato
ubiquitina
-polipeptido de 76aa/8kda que se unen al epsilon-nh2 de la lisina de la proteina blanco a traves de su c-t-glicina
-reconocida por el proteosoma
proteina disulfuro isomoerasa
forma puentes disulfuro en el lumen del RE
transferasa de oligosacarido
transfiere un bloque preformando de 14 residuos de azucar
dolicol
lipido de la membrana del RE
-transporta oligosacaridos hasta una proteina que haya sido sintetizada en el RE