Factores de transcripción

Question 1

la iniciacion de transcripcion es…

Answer 1

probablemnte el nivel mas frecuente de regulacion

Question 2

el control de la degradacion del mrna esta determinada por…

Answer 2

la longitud de la poli a

Question 3

region control/reguladora

Answer 3

-sitio de union de proteinas reguladoras que modifican la capacidad de expresion de un gen

Question 4

region codificante

Answer 4

-secuencia de nucleotidos que se corresponde con la secuencia de amionoacidos de la proteinas (promueve la expresion genica)

Question 5

inhibicion de la expresion genica
-de un solo alelo

Answer 5

-mutacion en la region codificante de dicho alelo
-mutacion en cis de la region control de dicho alelo

Question 6

inhibicion de la expresion genica
-de ambos alelos

Answer 6

-mutacion en trans del gen de la proteina reguladora

Question 7

interacciones dna proteina

Answer 7

-el exterior de la helice del dna puede ser leido por proteinas
-no es necesario acceder a los puentes de hidrogeno entre pares de bases en el interior abriendo la doble helice
-proteinas como los factores de transcripcion pueden unirse a secuencias especificas

Question 8

el borde e cada par de bases en la superficie presenta…

Answer 8

-un patron caracterisitico de aceptores y dadores de enlaces de hidrogeno y parches hidrofobicos

-en surco mayor y menor

Question 9

se dice que la hendidura mayor contiene mas info…

Answer 9

que la hendidura menor

Question 10

los extremos laterales de las bases son mas accesibles a traves…

Answer 10

de la hendidura mayor

Question 11

elementos de respuesta…

Answer 11

reguladores en cis localizados en un promotor o enhacer que permite que un gen responda a un factor de transcripcion necesario para la iniciacion de la rna pol

Question 12

el factor de transcripcion (proteina) esta activo solamente…

Answer 12

bajo condiciones en las cuales el gen regulado va a ser expresado

Question 13

cada evento regulador depende de…

Answer 13

la union de su propia proteina a un elemento de respuesta particular

Question 14

metalotioneina

Answer 14

-protege a la celula humana de metales pesados uniendose a ellos y extrayendolos de la celula

-se expresa a nivel basal (BLE- basal level enhacer- constitutiva) pero se induce su expresion cuando aumenta la concentracion de los iones de metales pesados

Question 15

enhacers (potenciadores)

Answer 15

modifican la producccion de mrna

Question 16

dos elemenos constitutivos del promotor:

Answer 16

cajas TATA Box y la GC Box

Question 17

TFBS

Answer 17

-pueden estar hacia el 5’,3’ o dentro de los intrones
-hasta 50kb de distancia de los genes que regulan
-responsables de parte del patron de expresion global de un gen
-la ausencia de un elemento necesario no afecta la activacion de otros modos

Question 18

factores de transcripcion

Answer 18

-determinan interacciones proteina: proteina que promueven la formacion del complejo de iniciacion

-algunas proteinas pueden participar en mas de un modulo regulador, incluso activador e inhibidor

-algunas interacciones proteina:proteina con demasiado debiles para ensamblar complejos en solucion, sin embargo son suficientes para producir el ensamble sobre DNA (centro de nucleacion)

Question 19

motivo proteico

Answer 19

-son el numero limitado de diferentes maneras de combinar helices a con laminas b para formar una estructura tridimensional

-algunos permiten interaccionar con otra estructura biologica (dna-proteina)

-varios motivos forman un dominio

ej. motivo-b-a-b, motivo en orquilla b

Question 20

dominio proteico

Answer 20

-unidad estructural basica de una proteina

-conjunto interconectado de laminas b, helices a o ambas que es estable independientemente del resto de la cadena polipeptidica

-unidad biologica funcional

Question 21

factores de transcripcion

Answer 21

-son elementos reguladores en trans que poseen estructuras de naturaleza basica cuyos motivos responsables de la union al dna pueden ser
+dedos de zinc
+helice-vuelta-h
+h-bucle-h (loop)
+laminas b

Question 22

dedos de zinc

Answer 22

-reconocen secuencias palindromicas en el adn
-incorporan un atomo de zinc en su estructura
-agrupados con otros dedos de zinc (2-9) ej. 3 helices a se insertan en el surco mayor
-dimerizacion (n-t (lamina b), union al dna (c-t (helice a))
ej. tfllla requerido por la rna pol lll para transcribir los genes 5s rrna receptores de glucocorticoides y estrogenos

Question 23

recetores a hormonas esteroideas

Answer 23

-activan la transcripcion de genes
-no son proteinas unidas a membrana
-son receptores en el mismo sentido que el represor lac (b-galactosido, la lactosa)
-las hormonas esteroideas son ligandos que requieren del receptores que requieren del receptor de unional dna

Question 24

gre

Answer 24

elemento de respuesta al glucocorticoide

Question 25

dominio de union a esteroides c-t de glucocorticoides (regulador interno negativo) evita…

Answer 25

que el n-t del recepetor promueva el reconocimiento del elemento de respuesta de forma constitutiva

Question 26

el receptor a estrogeno el c-t activa…

Answer 26

la funcion a n-t

Question 27

receptores esteroideos

Answer 27

-dedos de zinc controlan la especificidad de union al dna y de dimerizacion
-no actuan directamente sobre el aparato basal
-cbp/p300 promueve la acetilacion de las histonas
-homodimeros y heterodimero

Question 28

homodimeros

Answer 28

-glucocorticoides, mineralocorticoides, progesterona, androgeno, estrogeno

Question 29

heterodimero

Answer 29

-triyodotironina, vitamina d, retinoico

Question 30

h-vuelta-h

Answer 30

-2 helices casi perpendiculares unidas por una vuelta corta
-helice a-surco mayor
-la otra por fuera de la doble helice haciendo contactos adicionales con el surco menor
-ej. represor trp, cap, homeodominio (dominio de 60 aa presente en factores de transcripcion de mamiferos y regulan desarrollo de drosophila)

Question 31

las proteinas homeodominio pueden activar o …

Answer 31

reprimir la transcripcion

Question 32

h-bulce-h

Answer 32

-helices anfipaticas de 40 a 60 aa conectadas por un bucle de 12 a 28 aa que permite que ambas helices queden alineadas
-helice a corta (dimerizacion) y una helice a larga (union al dna)
-pueden formar homodimeros o heterodimeros con diferente fierza de union entre los monomeros y reconocimiento de sitios diana en el dna

Question 33

h-bulce-h
clase a

Answer 33

se expresa de forma ubicua (todos los tejidos)

Question 34

h-bulce-h
clase b

Answer 34

tejido especifica
ej. myod, miogenina, myf5, implicados en miogenesis
-region basica contacta con el dna

Question 35

h-bulce-h
proteina Id

Answer 35

-proteina Id (inhibidor de diferenciacion)
-heterodimeriza con myod previo a comenzar la miogenesis y no permite su union al DNA regulando de esta forma su fx

Question 36

cremallera de leucina

Answer 36

-secuencia de aa ricos en residuos de leucina (hidrofobicos) que proporciona un motivo de dimerizacion
-region adyacente altamente basica

Question 37

cremallera de leucina
puede formar homodimeros o heterodimeros…

Answer 37

entre ciertos tipos, lo que incrementa significativamente el repertorio con diferentes especificidades de union al dna

-3 especificidades a partir de 2 monomeros
-6 especificidades a partir de 3 monomeros

-ej.AP1 (c-jun, c-fos)

Question 38

AP1 (c-jun, c-fos)

Answer 38

reguladores del desarrollo y procesos celulares como diferenciacion, proliferacion y apoptosis

Question 39

Laminas B

Answer 39

-tambien pueden reconocer la info sobre la superficie del surco mayor
-dos laminas beta dirigidas hacia el dna
-ej. proteina dimerica represora met del operon metionina

Question 40

reguladores transcripcionales es reguladas a traves de diferentes formas

Answer 40

-se sintetiza o no la proteina
-se une a un ligando que la activa
-al igual que muchas otras proteinas dentro de la celula se fosforila para que se active
-se une a una subunidad de activacion
-se disocia de un inhibidor
-se estimula su entrada al nuclepo
-se promueve su liberacion de la membrana