Factores de transcripción Flashcards
la iniciacion de transcripcion es…
probablemnte el nivel mas frecuente de regulacion
el control de la degradacion del mrna esta determinada por…
la longitud de la poli a
region control/reguladora
-sitio de union de proteinas reguladoras que modifican la capacidad de expresion de un gen
region codificante
-secuencia de nucleotidos que se corresponde con la secuencia de amionoacidos de la proteinas (promueve la expresion genica)
inhibicion de la expresion genica
-de un solo alelo
-mutacion en la region codificante de dicho alelo
-mutacion en cis de la region control de dicho alelo
inhibicion de la expresion genica
-de ambos alelos
-mutacion en trans del gen de la proteina reguladora
interacciones dna proteina
-el exterior de la helice del dna puede ser leido por proteinas
-no es necesario acceder a los puentes de hidrogeno entre pares de bases en el interior abriendo la doble helice
-proteinas como los factores de transcripcion pueden unirse a secuencias especificas
el borde e cada par de bases en la superficie presenta…
-un patron caracterisitico de aceptores y dadores de enlaces de hidrogeno y parches hidrofobicos
-en surco mayor y menor
se dice que la hendidura mayor contiene mas info…
que la hendidura menor
los extremos laterales de las bases son mas accesibles a traves…
de la hendidura mayor
elementos de respuesta…
reguladores en cis localizados en un promotor o enhacer que permite que un gen responda a un factor de transcripcion necesario para la iniciacion de la rna pol
el factor de transcripcion (proteina) esta activo solamente…
bajo condiciones en las cuales el gen regulado va a ser expresado
cada evento regulador depende de…
la union de su propia proteina a un elemento de respuesta particular
metalotioneina
-protege a la celula humana de metales pesados uniendose a ellos y extrayendolos de la celula
-se expresa a nivel basal (BLE- basal level enhacer- constitutiva) pero se induce su expresion cuando aumenta la concentracion de los iones de metales pesados
enhacers (potenciadores)
modifican la producccion de mrna
dos elemenos constitutivos del promotor:
cajas TATA Box y la GC Box
TFBS
-pueden estar hacia el 5’,3’ o dentro de los intrones
-hasta 50kb de distancia de los genes que regulan
-responsables de parte del patron de expresion global de un gen
-la ausencia de un elemento necesario no afecta la activacion de otros modos
factores de transcripcion
-determinan interacciones proteina: proteina que promueven la formacion del complejo de iniciacion
-algunas proteinas pueden participar en mas de un modulo regulador, incluso activador e inhibidor
-algunas interacciones proteina:proteina con demasiado debiles para ensamblar complejos en solucion, sin embargo son suficientes para producir el ensamble sobre DNA (centro de nucleacion)
motivo proteico
-son el numero limitado de diferentes maneras de combinar helices a con laminas b para formar una estructura tridimensional
-algunos permiten interaccionar con otra estructura biologica (dna-proteina)
-varios motivos forman un dominio
ej. motivo-b-a-b, motivo en orquilla b
dominio proteico
-unidad estructural basica de una proteina
-conjunto interconectado de laminas b, helices a o ambas que es estable independientemente del resto de la cadena polipeptidica
-unidad biologica funcional
factores de transcripcion
-son elementos reguladores en trans que poseen estructuras de naturaleza basica cuyos motivos responsables de la union al dna pueden ser
+dedos de zinc
+helice-vuelta-h
+h-bucle-h (loop)
+laminas b
dedos de zinc
-reconocen secuencias palindromicas en el adn
-incorporan un atomo de zinc en su estructura
-agrupados con otros dedos de zinc (2-9) ej. 3 helices a se insertan en el surco mayor
-dimerizacion (n-t (lamina b), union al dna (c-t (helice a))
ej. tfllla requerido por la rna pol lll para transcribir los genes 5s rrna receptores de glucocorticoides y estrogenos
recetores a hormonas esteroideas
-activan la transcripcion de genes
-no son proteinas unidas a membrana
-son receptores en el mismo sentido que el represor lac (b-galactosido, la lactosa)
-las hormonas esteroideas son ligandos que requieren del receptores que requieren del receptor de unional dna
gre
elemento de respuesta al glucocorticoide
dominio de union a esteroides c-t de glucocorticoides (regulador interno negativo) evita…
que el n-t del recepetor promueva el reconocimiento del elemento de respuesta de forma constitutiva
el receptor a estrogeno el c-t activa…
la funcion a n-t
receptores esteroideos
-dedos de zinc controlan la especificidad de union al dna y de dimerizacion
-no actuan directamente sobre el aparato basal
-cbp/p300 promueve la acetilacion de las histonas
-homodimeros y heterodimero
homodimeros
-glucocorticoides, mineralocorticoides, progesterona, androgeno, estrogeno
heterodimero
-triyodotironina, vitamina d, retinoico
h-vuelta-h
-2 helices casi perpendiculares unidas por una vuelta corta
-helice a-surco mayor
-la otra por fuera de la doble helice haciendo contactos adicionales con el surco menor
-ej. represor trp, cap, homeodominio (dominio de 60 aa presente en factores de transcripcion de mamiferos y regulan desarrollo de drosophila)
las proteinas homeodominio pueden activar o …
reprimir la transcripcion
h-bulce-h
-helices anfipaticas de 40 a 60 aa conectadas por un bucle de 12 a 28 aa que permite que ambas helices queden alineadas
-helice a corta (dimerizacion) y una helice a larga (union al dna)
-pueden formar homodimeros o heterodimeros con diferente fierza de union entre los monomeros y reconocimiento de sitios diana en el dna
h-bulce-h
clase a
se expresa de forma ubicua (todos los tejidos)
h-bulce-h
clase b
tejido especifica
ej. myod, miogenina, myf5, implicados en miogenesis
-region basica contacta con el dna
h-bulce-h
proteina Id
-proteina Id (inhibidor de diferenciacion)
-heterodimeriza con myod previo a comenzar la miogenesis y no permite su union al DNA regulando de esta forma su fx
cremallera de leucina
-secuencia de aa ricos en residuos de leucina (hidrofobicos) que proporciona un motivo de dimerizacion
-region adyacente altamente basica
cremallera de leucina
puede formar homodimeros o heterodimeros…
entre ciertos tipos, lo que incrementa significativamente el repertorio con diferentes especificidades de union al dna
-3 especificidades a partir de 2 monomeros
-6 especificidades a partir de 3 monomeros
-ej.AP1 (c-jun, c-fos)
AP1 (c-jun, c-fos)
reguladores del desarrollo y procesos celulares como diferenciacion, proliferacion y apoptosis
Laminas B
-tambien pueden reconocer la info sobre la superficie del surco mayor
-dos laminas beta dirigidas hacia el dna
-ej. proteina dimerica represora met del operon metionina
reguladores transcripcionales es reguladas a traves de diferentes formas
-se sintetiza o no la proteina
-se une a un ligando que la activa
-al igual que muchas otras proteinas dentro de la celula se fosforila para que se active
-se une a una subunidad de activacion
-se disocia de un inhibidor
-se estimula su entrada al nuclepo
-se promueve su liberacion de la membrana
