citronsyracykeln Flashcards
Hur är mitokondrier uppbyggda?
De har två membran, ett yttremembran och ett inre membran. Inre membranet är starkt veckat (cristae) och omsluter matrix som har högre pH (7.9) . Mellan yttre och inre membranet har vi intermembrana utrymmet. På inre membranet har vi protonpumpar och ATP-syntas.
Vilka metabola vägar finns i mitokondrier?
Citronsyracykeln i matrix och oxidativ fosforylering i intermembrana rummet.
Vad gör att CoA kan bilda en energirik bindning?
Den har en energirik tioesterbindning och är ej resonansstabiliserad och därför donerar den gärna elektroner.
I vilka metabola vägar finns acetyl-CoA?
Den kan antingen fortsätta i citronsyracykeln eller omvandlas till fett.
Vad gör pyruvatdehydrogenaskomplexet?
Den dekarboxylerar och oxiderar pyruvat och reducerar NAD+ till NADH .
Detta ger acetyl-CoA, NADH och en CO2.
Var finns pyruvatdehydrogenaskomplexet?
I mitokondriens matrix
Vilka prostetiska grupper finns i pyruvatdehydrogenaskomplexet och vilken funktion har de?
Tiaminpyrofosfat: En derivata från vitamin B1, katalyserar dekarboxylering
FAD: är involverad i redoxreaktioner
Liponsyra: används för att flytta substrat från ett enzym till en annan.
Hur regleras pyruvatdehydrogenaskomplexet?
- Fosforylering av PDH inaktiverar PDH och defosforyleringen aktiverar den. Ca2+ stimulerar defosforyleringen av PDH.
- ATP och ADP: allosterisk reglering
- NADH och acetyl-CoA: feedback inhibering av E3 resp E2
- Pyruvat: feedforward stimulering.
Vad händer med pyruvatdehydrogenaskomplexet vid arsenik och kvicksilverförgiftning?
Enzymet inhiberas på grund av arsenik och kvicksilvers höga affinitet för SH och binder till lipoamiden som är en prostetisk grupp i PDH.
Vilka är intermediärerna i citronsyracykeln?
- Oxaloacetat reagerar med acetyl-CoA och ger citrat
- Citrat omvandlas till isocitrat
- Isocitrat oxideras och dekarboxyleras till α-ketoglutarat
- α-ketoglutarat omvandlas till succinyl-CoA
- Succinyl-CoA omvandlas till succinat
- Succinat omvandlas till fumarat
- Fumarat omvandlas till malat
- Malat omvandlas tillbaka till oxaloacetat.
Vilka enzymer katalyserar reaktionerna i citronsyracykeln?
- Citratsyntas
- akonitas
- isocitratdehydrogenas
- α-ketoglutaratdehydrogenas
- succinatsyntas
- succinatdehydrogenas
- fumeras
- malatdehydrogenas
Vad sker i de åtta reaktionerna i citronsyracykeln?
- Aldol-kondensation
- Isomerisering
- Oxidativ dekarboxylering
- Oxidativ dekarboxylering
- Substratnivåöverföring
- Oxidation
- Isomerisering
- Dehydring och oxidation
Vad innebär dekarboxylering?
Att spjälka en karboxylgrupp från en molekyl i form av CO2.
Vilken är citronsyracykelns summaformel?
1 acetyl-CoA + 3NAD+ + FAD + ADP + Pi + 2H2O ⟶ CoA + 2CO2 + 3NADH + H+ + FADH2 + ATP
Hur många varv i citronsyracykeln behövs för att fullständigt oxidera en glukosmolekyl?
Två varv, varje glukosmolekyl ger två pyruvat i slutet av glykolysen
Hur många varv i citronsyracykeln behövs för att fullständigt oxidera en fettsyra?
ett varv
Hur regleras citronsyracykeln?
Den regleras genom att reglera aktiviteten av framförallt isocitratdehydrogenas och alfaketoglutaratdehydrogenas. Allosterisk reglering mha av cellens energikvot, ATP inhibitor, ADP stimulerar, Feedback reglering av NADH (inhiberar), Feedback inhibering av succinyl-CoA (gäller alfaketoglutaratdehydrogenas.)
Varför behövs syre för att citronsyracykeln ska kunna vara verksam?
Utan syre så kan inte oxidativ fosforylering ske vilket betyder att vi inte kommer kunna regenerera NAD+ → brist på NAD+ → citronsyracykeln stannar
Vilken funktion har HIF-1 och hur regleras den?
Den är en transkriptionsfaktor aktiveras vid syrebrist och kan:
- öka produktion av GLUT 1 & 3
- stimulera VEGF (vascular endotheial GF)
- öka glykolytiska enzymers aktivitet.
HIF-1 reglering:
- normalt vid icke syrebrist → HIF dehyroxyleras → dehydroxylering kommer PHL2 ( prolyhydroxylas 2) → HIF bryts ner
När kan succinat och fumarat påverka nivåerna av HIF-1 och hur sker det?
När vi har en mutation i succinatdehydrogenas eller fumaras så kan dessa ackumulera i mitokondrie och börja läcka till cytoplasma där den kan inhibera PHL2 som annars bryter ner HIF-1.
Beriberi
En sjukdom som beror på brist på vitamin B1 som är en viktig prostetisk grupp i PDH-komplexet.
Påverkar främst CNS
CoA (coenzym A)
- Består av pantotenat från vitamin B5 (pantotensyra)
- Har en reaktiv sulfhydryl-grupp
- Används vid transport av acylgrupper, t.ex: acetat.
