Kolokwium II - synteza i przekształcanie RNA Flashcards

1
Q

W jaki sposób odbywa się biosynteza deoksyrybonukleotydów?

A

poprzez redukcję zsyntetyzowanych rybonukleotydów

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
2
Q

Jaką strukturę przypominają odcinki dwuniciowego RNA?

A

A-DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
3
Q

W jakiej formie zasadniczo występuje komórkowe RNA?

A

jako rybonukleoproteiny (RNA zasocjowane z białkami)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
4
Q

Dla jakiej długości fali RNA wykazuje charakterystyczną absorpcję?

A

260nm

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
5
Q

Czy polimerazy RNA wymagają startera?

A

nie potrzebują

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
6
Q

Z jakich podjednostek składa się polimeraza RNA?

A

α, β, β’ i σ

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
7
Q

Które podjednostki stanowią rdzeń polimerazy RNA?

A

αββ’

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
8
Q

Z jakich części składa się holoenzym polimerazy RNA?

A

z rdzenia i sigma faktora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
9
Q

Jaką funkcję pełni podjednostka β polimerazy RNA?

A

tworzy wiązania fosfodiestrowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
10
Q

Jaką funkcję pełni podjednostka B’ polimerazy RNA?

A

wiąże nić matrycową DNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
11
Q

Jaką funkcję pełni sigma faktor polimerazy RNA?

A

rozpoznaje promotor i ułatwia inicjację

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
12
Q

Co to jest sekwencja Shine-Dalgarno (SD)?

A

sekwencja, która łączy się z komplementarną, bogatą w pirymidyny sekwencją w 16S rRNA ułatwiając inicjację translacji

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
13
Q

W jakie nukleotydy bogata jest sekwencja Shine-Dalgarno?

A

purynowe

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
14
Q

Co powstaje z laktozy pod wpływem działania β-galaktozydazy?

A

glukoza i galaktoza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
15
Q

Co wiąże promotor laktozowy E. coli?

A

CAP i polimerazę RNA

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
16
Q

Co wiąże operator laktozowy E. coli?

A

represor lac

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
17
Q

Jaką funkcję pełni operon laktozowy?

A

umożliwia produkcję enzymów niezbędnych do metabolizowania laktozy

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
18
Q

Jaki rodzaj kontroli pełni operon laktozowy?

A

kontrola negatywna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
19
Q

Z jakich części składa się operon laktozowy?

A

promotor-operator

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
20
Q

Z ilu podjednostek składa się lac represor?

A

z 4 (jest tetramerem)

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
21
Q

Do czego prowadzi związanie lac represora z operatorem?

A

uniemożliwia przyłączenie polimerazy RNA do promotora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
22
Q

Jak nazywa się związek pośredni w hydrolizie laktozy?

A

allolaktoza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
23
Q

Co się dzieje z allolaktozą jeśli pojawia się w komórce?

A

wiąże się z podjednostkami lac represora

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
24
Q

Co się dzieje z represorem podczas wiązania allolaktozy?

A

zmienia się jego konformacja i zmniejsza powinowactwo do operona

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
25
Q

Kiedy represor lac oddysocjowuje od cząsteczki DNA?

A

gdy z wysztykimi podjednostkami zwiąże się allolaktoza

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
26
Q

Jaki typ kontroli prezentuje operon laktozowy przy obecności laktozy a braku glukozy?

A

kontrola pozytywna

How well did you know this?
1
Not at all
2
3
4
5
Perfectly
27
Q

Co syntetyzują komórki gdy nie mają dostępu do glukozy?

A

cAMP

28
Q

Co stanowi pozytywny regulator operonu katabolicznego (lac operon)?

A

cAMP

29
Q

Co zwiększa powinowactwo CAP do promotora?

A

związanie z cAMP

30
Q

Co ułatwia wiązanie polimerazy RNA do promotora?

A

związanie CAP

31
Q

Kiedy operon laktozowy umożliwia transkrypcję i translację?

A

po związaniu CAP i polimerazy RNA

32
Q

Ile typów polimeraz RNA występuje u eukariota?

A

trzy

33
Q

Ile typów polimeraz RNA występuje u prokariota?

A

jedna

34
Q

Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA I?

A

jądro i jąderko

35
Q

Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA II?

A

jądro

36
Q

Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA III?

A

jądro

37
Q

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza I?

A

pre-rRNA (z wyjątkiem 5S rRNA)

38
Q

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza II?

A

pre-mRNA (hnRNA) i snRNA

39
Q

Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza III?

A

pre-tRNA, 5S rRNA, snRNA i scRNA

40
Q

Jaką wrażliwość na α-amanitynę wykazują eukariotyczne polimerazy RNA?

A

polimeraza I - niewrażliwa
polimeraza II - bardzo wrażliwa
polimeraza III - wrażliwa

41
Q

Skąd pochodzi α-amanityna?

A

od trującego grzyba: Amanita phalloides

42
Q

Co transportuje hormony lipofilne?

A

białka osocza

43
Q

Z czym wiążą się hormony lipofilne, które dyfundowały przez błonę plazmatyczną?

A

z wewnątrzkomórowym receptorem białkowym

44
Q

Z czym wiąże się receptor po związaniu z hormonem lipofilnym?

A

regionem regulatorowym = sekwencją odpowiedzi hormonalnej (HRE)

45
Q

Do czego prowadzi połączenie dimeru HR (hormon-receptor) do HRE?

A

pobudza transkrypcję określonych genów

46
Q

Czym są paluszki cynkowe?

A

receptory hormonów steroidowych

47
Q

Co to jest zamek leucynowy?

A

motyw strukturalny warunkujący oddziaływanie białko-białko

48
Q

Z czym wiąże się zamek leucynowy?

A

DNA z wysoką zawartością zasadowych aminokwasów (Leu, Arg)

49
Q

Z czym może oddziaływać zamek leucynowy?

A

z ujemnie naładowanymi resztami fosforanowymi w DNA

50
Q

Kiedy jest przyłączana czapeczka do mRNA?

A

jeszcze przed zakończeniem transkrypcji

51
Q

Z czym oddziałuje czapeczka mRNA?

A

z rybosomami

52
Q

Jakie znaczenie funkcjonalne ma ogon poli(A)?

A

jest ważny dla przenoszeie mRNA z jądra do cytozolu

53
Q

Co występuje na końcu 5’ tRNA?

A

zwykle koniec 5’ jest ufosforylowany

54
Q

Co występuje na końcu 3’ tRNA?

A

sekwencja 5’-CCA-3’

55
Q

Jaką funkcję pełni sekwencja 5’-CCA-3’ na końcu 3’ tRNA?

A

przyłącza aminokwas

56
Q

Z jakich etapów składa się synteza pierwotnego transkryptu RNA?

A

inicjacja, elongacja i terminacja

57
Q

Czy do syntezy RNA konieczny jest primer?

A

nie

58
Q

Czy podczas kopiowania RNA musi zajść replikacja całej cząsteczki?

A

nie

59
Q

Czy podczas transkrypcji RNA jest sprawdzana poprawność odczytu?

A

nie

60
Q

W jakim kierunku odczytywana jest nić matrycowa DNA?

A

3’→5’

61
Q

W jakim miejsce polimeraza RNA rozpoczyna trankrypcję?

A

na promotorze

62
Q

Co to jest jednostka transkrypcji?

A

region DNA zawierający sygnały inicjacji, elongacji i terminacji

63
Q

W którym miejscu od rozpoczęcia transkrypcji i jakie charakterystyczne sekwencje stanowią promotory?

A
  • 35: 5’-TGTTGACA-3’

- 10: 5’-TATAAT-3’

64
Q

Czym charakteryzuje się sekwencja 5’-TATAAT-3’ w pozycji -10 od miejsca rozpoczęcia transkrypcji na nici matrycowej?

A

ma niską temperaturę topnienia

65
Q

Co to jest TATA box?

A

sekwencja 5’-TATAAT-3’ w pozycji -10 od miejsca rozpoczęcia transkrypcji na nici matrycowej

66
Q

Co umożliwia niska temperatura topnienia TATA box?

A

uzyskanie dostępu do nici matrycowej bezpośrednio za sekwencją startu transkrypcji przez polimerazy RNA

67
Q

Jaki enzym rozpoznaje sekwencje -35 i -10?

A

holopolimeraza RNA