Kolokwium II - synteza i przekształcanie RNA Flashcards
W jaki sposób odbywa się biosynteza deoksyrybonukleotydów?
poprzez redukcję zsyntetyzowanych rybonukleotydów
Jaką strukturę przypominają odcinki dwuniciowego RNA?
A-DNA
W jakiej formie zasadniczo występuje komórkowe RNA?
jako rybonukleoproteiny (RNA zasocjowane z białkami)
Dla jakiej długości fali RNA wykazuje charakterystyczną absorpcję?
260nm
Czy polimerazy RNA wymagają startera?
nie potrzebują
Z jakich podjednostek składa się polimeraza RNA?
α, β, β’ i σ
Które podjednostki stanowią rdzeń polimerazy RNA?
αββ’
Z jakich części składa się holoenzym polimerazy RNA?
z rdzenia i sigma faktora
Jaką funkcję pełni podjednostka β polimerazy RNA?
tworzy wiązania fosfodiestrowe
Jaką funkcję pełni podjednostka B’ polimerazy RNA?
wiąże nić matrycową DNA
Jaką funkcję pełni sigma faktor polimerazy RNA?
rozpoznaje promotor i ułatwia inicjację
Co to jest sekwencja Shine-Dalgarno (SD)?
sekwencja, która łączy się z komplementarną, bogatą w pirymidyny sekwencją w 16S rRNA ułatwiając inicjację translacji
W jakie nukleotydy bogata jest sekwencja Shine-Dalgarno?
purynowe
Co powstaje z laktozy pod wpływem działania β-galaktozydazy?
glukoza i galaktoza
Co wiąże promotor laktozowy E. coli?
CAP i polimerazę RNA
Co wiąże operator laktozowy E. coli?
represor lac
Jaką funkcję pełni operon laktozowy?
umożliwia produkcję enzymów niezbędnych do metabolizowania laktozy
Jaki rodzaj kontroli pełni operon laktozowy?
kontrola negatywna
Z jakich części składa się operon laktozowy?
promotor-operator
Z ilu podjednostek składa się lac represor?
z 4 (jest tetramerem)
Do czego prowadzi związanie lac represora z operatorem?
uniemożliwia przyłączenie polimerazy RNA do promotora
Jak nazywa się związek pośredni w hydrolizie laktozy?
allolaktoza
Co się dzieje z allolaktozą jeśli pojawia się w komórce?
wiąże się z podjednostkami lac represora
Co się dzieje z represorem podczas wiązania allolaktozy?
zmienia się jego konformacja i zmniejsza powinowactwo do operona
Kiedy represor lac oddysocjowuje od cząsteczki DNA?
gdy z wysztykimi podjednostkami zwiąże się allolaktoza
Jaki typ kontroli prezentuje operon laktozowy przy obecności laktozy a braku glukozy?
kontrola pozytywna
Co syntetyzują komórki gdy nie mają dostępu do glukozy?
cAMP
Co stanowi pozytywny regulator operonu katabolicznego (lac operon)?
cAMP
Co zwiększa powinowactwo CAP do promotora?
związanie z cAMP
Co ułatwia wiązanie polimerazy RNA do promotora?
związanie CAP
Kiedy operon laktozowy umożliwia transkrypcję i translację?
po związaniu CAP i polimerazy RNA
Ile typów polimeraz RNA występuje u eukariota?
trzy
Ile typów polimeraz RNA występuje u prokariota?
jedna
Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA I?
jądro i jąderko
Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA II?
jądro
Gdzie jest zlokalizowana polimeraza RNA III?
jądro
Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza I?
pre-rRNA (z wyjątkiem 5S rRNA)
Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza II?
pre-mRNA (hnRNA) i snRNA
Jaki rodzaj RNA syntetyzuje polimeraza III?
pre-tRNA, 5S rRNA, snRNA i scRNA
Jaką wrażliwość na α-amanitynę wykazują eukariotyczne polimerazy RNA?
polimeraza I - niewrażliwa
polimeraza II - bardzo wrażliwa
polimeraza III - wrażliwa
Skąd pochodzi α-amanityna?
od trującego grzyba: Amanita phalloides
Co transportuje hormony lipofilne?
białka osocza
Z czym wiążą się hormony lipofilne, które dyfundowały przez błonę plazmatyczną?
z wewnątrzkomórowym receptorem białkowym
Z czym wiąże się receptor po związaniu z hormonem lipofilnym?
regionem regulatorowym = sekwencją odpowiedzi hormonalnej (HRE)
Do czego prowadzi połączenie dimeru HR (hormon-receptor) do HRE?
pobudza transkrypcję określonych genów
Czym są paluszki cynkowe?
receptory hormonów steroidowych
Co to jest zamek leucynowy?
motyw strukturalny warunkujący oddziaływanie białko-białko
Z czym wiąże się zamek leucynowy?
DNA z wysoką zawartością zasadowych aminokwasów (Leu, Arg)
Z czym może oddziaływać zamek leucynowy?
z ujemnie naładowanymi resztami fosforanowymi w DNA
Kiedy jest przyłączana czapeczka do mRNA?
jeszcze przed zakończeniem transkrypcji
Z czym oddziałuje czapeczka mRNA?
z rybosomami
Jakie znaczenie funkcjonalne ma ogon poli(A)?
jest ważny dla przenoszeie mRNA z jądra do cytozolu
Co występuje na końcu 5’ tRNA?
zwykle koniec 5’ jest ufosforylowany
Co występuje na końcu 3’ tRNA?
sekwencja 5’-CCA-3’
Jaką funkcję pełni sekwencja 5’-CCA-3’ na końcu 3’ tRNA?
przyłącza aminokwas
Z jakich etapów składa się synteza pierwotnego transkryptu RNA?
inicjacja, elongacja i terminacja
Czy do syntezy RNA konieczny jest primer?
nie
Czy podczas kopiowania RNA musi zajść replikacja całej cząsteczki?
nie
Czy podczas transkrypcji RNA jest sprawdzana poprawność odczytu?
nie
W jakim kierunku odczytywana jest nić matrycowa DNA?
3’→5’
W jakim miejsce polimeraza RNA rozpoczyna trankrypcję?
na promotorze
Co to jest jednostka transkrypcji?
region DNA zawierający sygnały inicjacji, elongacji i terminacji
W którym miejscu od rozpoczęcia transkrypcji i jakie charakterystyczne sekwencje stanowią promotory?
- 35: 5’-TGTTGACA-3’
- 10: 5’-TATAAT-3’
Czym charakteryzuje się sekwencja 5’-TATAAT-3’ w pozycji -10 od miejsca rozpoczęcia transkrypcji na nici matrycowej?
ma niską temperaturę topnienia
Co to jest TATA box?
sekwencja 5’-TATAAT-3’ w pozycji -10 od miejsca rozpoczęcia transkrypcji na nici matrycowej
Co umożliwia niska temperatura topnienia TATA box?
uzyskanie dostępu do nici matrycowej bezpośrednio za sekwencją startu transkrypcji przez polimerazy RNA
Jaki enzym rozpoznaje sekwencje -35 i -10?
holopolimeraza RNA