Kolokwium I - białka cz. 3 Flashcards
Jaką funkcję pełnią hemoproteiny? podaj przykłady
- transport tlenu (Hb)
- przechowywanie tlenu w mięśniach (Mob)
- transport elektronowy (cytrochromy)
- enzymy rozkładające H2O2 (peroksydazy)
Z ilu aminokwasów składa się mioglobina?
153
Jaki ciężar cząsteczkowy ma mioglobina?
16700 Da
Z jakich struktur drugorzędowych i w jakiej części składa się mioglobina?
75% łańuchy α-helisy, połączone β-zwrotami
osiem segmentów helikalnych A-H
Jakie aminokwasy w głównej mierze znajdują się we wnętrzu cząsteczki mioglobiny i czym się one charakteryzują?
hydrofobowe: Leu, Val, Met, Phe
Jak można nazwać wnętrze cząsteczki mioglobiny, w której tkwi hem?
“kieszeń” hydrofobowa
Czy mioglobina jest rozpuszczana w wodzie?
tak
Z jakich podjednostek i w jakiej konfiguracji składa się hemoglobina?
2α i 2β ułożone w narożnikach czworościanu tworząc układ dwóch protomerów αβ
Ile osi symetrii ma cząsteczka hemoglobiny?
dwie
Jaka cecha pierścienia hemoglobiny wpływa na jej aktywność biologiczną?
asymetria
Z jakich struktur drugorzędowych składa się podjednostka α hemoglobiny?
7 odcinków α-helisy A-H
N-Wal, C-Arg
Z jakich struktur drugorzędowych składa się podjednostka β hemoglobiny?
8 odcinków α-helisy A-H
N-Wal. C-His
Do czego analogiczna jest struktura podjednostki β hemoglobiny?
do mioglobiny
Jaki ciężar cząsteczkowy ma Hb?
65 000 Da
Ile układów hemowych posiada cząsteczka hemoglobiny?
cztery (w każdym łańcuchu peptydowym)
Ile wynosi stężenie Hb w krwinkach?
5 mM
Ile procent wagi krwinki czerwonej stanowi Hb?
33%
Ile hemoglobiny znajdziemy w 100 ml krwi?
12-18 g
W jakiej pozycji hemu znajduje się miejsce wiązania tlenu?
w 6-tej pozycji koordynacyjnej
Co stanowi przestrzenną zawadę w cząsteczce tlenu i w jakiej pozycji się znajduje?
dystalna His E7
Co znajduje się w proksymalnej pozycji w cząsteczce hemu?
His F8
Co się dzieje z jonem żelaza w momencie związania tlenu przez mioglobinę?
następuje jego przesunięcie o 0,06 nm
Jaką funkcję pełni przestrzenna zawada?
zabezpiecza jon żelaza przed utlenieniem i chroni przed wiązaniem tlenku węgla
Jak wypływa His dystalna na powinowactwo CO do układu hem-Fe2+?
obniża je tysiąckrotnie
Jakie czynniki pozwalają utrzymać jon żelaza na 2+ stopniu utlenienia?
- hydrofobowe otoczenie układu hemowego wewnątrz kieszeni globiny
- stabilizacja kompleksu hem-globina wiązaniami koordynacyjnymi z resztami His
- aktywność enzymów
Jakie enzymy mają znaczenie dla utrzymania jonu żelaza na 2+ stopniu utlenienia?
- reduktazy methemoglobiny (flawoproteina)
- reduktaza askorbinowa
- reduktaza glutationowa
Jaki enzym katalizuje przemianę MetHbFe3+ w HbFe2+?
jest to reakcja nieenzymatyczna
Jaką przemianę katalizuje reduktaza askorbinowa?
przemianę dehydroaskorbinianu (utleniony) do askorbinianu (zredukowanego = wit. C)
Jaką przemianę katalizuje reduktaza glutationowa?
GSSG (glutation utleniony) do GSH (glutation zredukowany)
Ile wynosi P50 dla mioglobiny?
1 torr = 1 mmHg
O czym mówi wartość P50?
o ciśnieniu O2, w którym wysycenie białka wynosi 50%
Jak nazywa się hemoglobina odtlenowana?
deoksyhemoglobina (Hb)
Jak nazywa się hemoglobina utlenowana?
oksyhemoglobina (HbO2)
Z ilu aminokwasów składa się podjednostka α hemoglobiny?
141
Z ilu aminokwasów składa się podjednostka β hemoglobiny?
146
Z jakich heterodimerów składa się tertamer hemoglobiny?
α1α2β1β2 = α1β1 + α2β2
Jakie wiązanie występuje pomiędzy podjednostkami αβ w cząsteczce hemoglobiny? Jaką siłą się one charakteryzują?
dość silne oddziaływania hydrofobowe
Jakie wiązanie występuje pomiędzy podjednostkami αα i ββ w cząsteczce hemoglobiny i czym się one charakteryzują?
słabsze wiązania jonowe
W momencie utlenowania jednej z podjednostek hemoglobiny następuje wysunięcie żelaza z płaszczyzny hemu czy wciągnięcie jonu w tę płaszczyznę?
wciągnięcie żelaza w płaszczyznę hemu
Która histydyna wpływa na przekształcenia struktury przestrzennej łańcucha peptydowego utlenieniu jednej z podjednostek hemoglobiny?
proksymalna
Na co wpływają zmiany struktury przestrzennej utlenowanej podjednostki hemoglobiny?
na konformację (strukturę trójwymiarową) pozostałych podjednostek
Co to jest allosteria?
zmiana powinowactwa chemicznego białka do cząsteczek przez zmianę konformacji
Co to jest efekt allosteryczny?
odwracalna zmiana konformacji białka i aktywności biologicznej na skutek przyłączenia efektora allosterycznego
Gdzie odgrywa ważną rolę efekt allosteryczny?
w regulacji aktywności enzymatycznej
Co to jest efektor allosteryczny?
związek chemiczny łączący się z centrami allosterycznymi podjednostek enzymatycznych
Na jaką strukturę białka ma wpływ efektor allosteryczny? Na co w ten sposób wpływa?
na strukturę przestrzenną wpływając na aktywność biologiczną
Jakiej struktury białka nie zmienia efektor allosteryczny?
pierwszorzędowej struktury białka!
Jaki wpływ mogą mieć efektory allosteryczne?
pozytywny lub negatyny
Którą formę białka stanowi Deoksy-Hb?
forma T (tense, tight)
Którą formę białka stanowi Oksy-Hb?
forma R (relaxed)
Jakie są interakcje niekowalencyjne pomiędzy heterodimerami w Deoksy-Hb w stosunku do Oksy-Hb?
silniejsze
Jaka jest nisza pomiędzy podjednostkami β w Deoksy-Hb w stosunku do Oksy-Hb? podaj wartości
Deoksy-Hb: His143β-His143β = 1,75 nm
Oksy-Hb: His143β-His143β = 0,86 nm